EuRBPDB

Description

RBDs

Expression

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSRNOG00000007899 (Gene tree)
Gene ID: 85261
Gene Symbol: Mterf1
Alias: Mterf
Full Name: mitochondrial transcription termination factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Rattus_norvegicus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6997 bases
Position: chr4:27365376-27372372
Accession: 621318
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRNOP00000010425	mTERF	PF02536.14	1e-79	1	1

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRNOT00000010425	-	1501	XM_006236069	ENSRNOP00000010425	374 (aa)	XP_006236131	G3V6Z9

Gene Model

Click here to download ENSRNOG00000007899's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSRNOG00000007899's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.064	ENSG00000127989	MTERF1	99	76.064	Homo_sapiens
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	53.517	ENSAPOG00000022230	MTERF1	85	53.517	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	89	66.964	ENSAMEG00000007917	-	97	69.345	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	52.905	ENSACIG00000017700	MTERF1	84	52.905	Amphilophus_citrinellus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	52.905	ENSAOCG00000004345	MTERF1	85	52.905	Amphiprion_ocellaris
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	52.905	ENSAPEG00000005877	MTERF1	85	52.905	Amphiprion_percula
ENSRNOG00000007899	Mterf1	89	52.266	ENSATEG00000011055	MTERF1	86	52.266	Anabas_testudineus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	50.765	ENSACAG00000015777	MTERF1	83	50.765	Anolis_carolinensis
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	73.138	ENSANAG00000022640	MTERF1	97	75.000	Aotus_nancymaae
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	51.988	ENSACLG00000011571	MTERF1	84	51.988	Astatotilapia_calliptera
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	50.462	ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	50.462	Astyanax_mexicanus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	73.600	ENSBTAG00000045617	MTERF1	94	73.600	Bos_taurus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	72.267	ENSCJAG00000014169	MTERF1	95	73.936	Callithrix_jacchus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	73.333	ENSCAFG00000001908	MTERF1	95	74.734	Canis_familiaris
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	73.333	ENSCAFG00020015983	MTERF1	95	74.734	Canis_lupus_dingo
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	72.800	ENSCHIG00000013172	MTERF1	94	72.800	Capra_hircus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	76.000	ENSTSYG00000012629	MTERF1	95	76.000	Carlito_syrichta
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	72.533	ENSCPOG00000003510	MTERF1	92	72.533	Cavia_porcellus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	72.872	ENSCCAG00000026587	MTERF1	96	74.468	Cebus_capucinus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	77.128	ENSCATG00000039620	MTERF1	94	77.128	Cercocebus_atys
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	77.394	ENSCSAG00000012508	MTERF1	94	77.394	Chlorocebus_sabaeus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	30.699	ENSCPBG00000023194	MTERF2	82	30.699	Chrysemys_picta_bellii
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	53.846	ENSCPBG00000021801	MTERF1	93	53.846	Chrysemys_picta_bellii
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.596	ENSCANG00000030925	MTERF1	94	76.596	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	82.353	ENSCGRG00001009716	-	99	82.133	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	82.353	ENSCGRG00000018838	-	99	82.133	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRNOG00000007899	Mterf1	93	49.858	ENSCVAG00000007837	MTERF1	92	49.858	Cyprinodon_variegatus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	48.466	ENSDARG00000086107	MTERF1	89	48.466	Danio_rerio
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	56.533	ENSDNOG00000032229	MTERF1	82	56.533	Dasypus_novemcinctus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	75.332	ENSDORG00000028877	-	99	75.332	Dipodomys_ordii
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	77.660	ENSEASG00005019646	MTERF1	96	77.660	Equus_asinus_asinus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	77.067	ENSECAG00000018128	MTERF1	96	76.862	Equus_caballus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	86	74.224	ENSEEUG00000013448	MTERF1	81	73.994	Erinaceus_europaeus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	53.067	ENSELUG00000014952	MTERF1	82	53.067	Esox_lucius
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	72.800	ENSFCAG00000044797	MTERF1	94	74.202	Felis_catus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	89	50.437	ENSFHEG00000000224	MTERF1	89	50.437	Fundulus_heteroclitus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	47.879	ENSGMOG00000007262	-	97	47.879	Gadus_morhua
ENSRNOG00000007899	Mterf1	88	50.760	ENSGAFG00000008852	MTERF1	86	50.760	Gambusia_affinis
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	55.703	ENSGAGG00000025333	MTERF1	92	55.703	Gopherus_agassizii
ENSRNOG00000007899	Mterf1	92	31.519	ENSGAGG00000015709	MTERF2	86	31.322	Gopherus_agassizii
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.330	ENSGGOG00000025995	MTERF1	96	76.330	Gorilla_gorilla
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	51.988	ENSHBUG00000022218	MTERF1	84	51.988	Haplochromis_burtoni
ENSRNOG00000007899	Mterf1	90	49.271	ENSHCOG00000016064	MTERF1	89	49.271	Hippocampus_comes
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	51.692	ENSIPUG00000004017	mterf1	84	51.692	Ictalurus_punctatus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.800	ENSSTOG00000001846	MTERF1	96	76.800	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	77.540	ENSJJAG00000011811	-	99	77.540	Jaculus_jaculus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	48.160	ENSKMAG00000009695	MTERF1	85	48.160	Kryptolebias_marmoratus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	91	55.202	ENSLACG00000009880	MTERF1	87	55.202	Latimeria_chalumnae
ENSRNOG00000007899	Mterf1	88	55.152	ENSLOCG00000018348	MTERF1	85	55.152	Lepisosteus_oculatus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	74.536	ENSLAFG00000000054	MTERF1	100	74.536	Loxodonta_africana
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	77.394	ENSMFAG00000038723	MTERF1	94	77.394	Macaca_fascicularis
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	77.394	ENSMMUG00000015516	MTERF1	99	77.394	Macaca_mulatta
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	77.394	ENSMNEG00000041445	MTERF1	94	77.394	Macaca_nemestrina
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	74.468	ENSMLEG00000008543	MTERF1	94	76.064	Mandrillus_leucophaeus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	94	50.992	ENSMAMG00000015682	MTERF1	92	50.992	Mastacembelus_armatus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	51.988	ENSMZEG00005026659	MTERF1	84	51.988	Maylandia_zebra
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	81.383	ENSMAUG00000006025	-	99	81.383	Mesocricetus_auratus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	77.660	ENSMICG00000046314	MTERF1	95	77.660	Microcebus_murinus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	62	78.390	MGP_CAROLIEiJ_G0026941	-	96	78.390	Mus_caroli
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	89.710	ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	89.710	Mus_musculus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	89.446	ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	89.446	Mus_musculus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	89.182	MGP_PahariEiJ_G0021712	-	99	89.182	Mus_pahari
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	89.182	MGP_PahariEiJ_G0021713	-	99	89.182	Mus_pahari
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	89.182	MGP_SPRETEiJ_G0027937	-	100	89.182	Mus_spretus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	89.182	MGP_SPRETEiJ_G0027936	-	100	89.182	Mus_spretus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	74.734	ENSMPUG00000008568	MTERF1	94	74.734	Mustela_putorius_furo
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	73.262	ENSMLUG00000011330	MTERF1	94	73.067	Myotis_lucifugus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	79.310	ENSNGAG00000014383	-	98	79.310	Nannospalax_galili
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.596	ENSNLEG00000015192	MTERF1	94	76.596	Nomascus_leucogenys
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.800	ENSODEG00000014952	-	93	76.800	Octodon_degus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.800	ENSODEG00000000904	-	93	76.800	Octodon_degus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	95	49.448	ENSONIG00000019792	MTERF1	95	49.448	Oreochromis_niloticus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	82	54.754	ENSOANG00000004680	-	98	54.754	Ornithorhynchus_anatinus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	77.867	ENSOCUG00000010902	MTERF1	94	77.867	Oryctolagus_cuniculus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	50.920	ENSORLG00000027811	MTERF1	85	50.920	Oryzias_latipes
ENSRNOG00000007899	Mterf1	90	48.824	ENSOMEG00000023485	MTERF1	89	48.824	Oryzias_melastigma
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.000	ENSOGAG00000001378	MTERF1	94	76.000	Otolemur_garnettii
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	72.000	ENSOARG00000016682	MTERF1	94	72.000	Ovis_aries
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.596	ENSPPAG00000027361	MTERF1	96	76.596	Pan_paniscus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	74.202	ENSPPRG00000002171	MTERF1	94	74.202	Panthera_pardus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	72.872	ENSPTIG00000016254	MTERF1	94	74.468	Panthera_tigris_altaica
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.330	ENSPTRG00000019388	MTERF1	96	76.330	Pan_troglodytes
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.330	ENSPTRG00000052592	-	96	76.330	Pan_troglodytes
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	77.660	ENSPANG00000007445	MTERF1	94	78.438	Papio_anubis
ENSRNOG00000007899	Mterf1	92	51.594	ENSPKIG00000017849	MTERF1	93	51.594	Paramormyrops_kingsleyae
ENSRNOG00000007899	Mterf1	92	51.594	ENSPKIG00000017556	MTERF1	93	51.594	Paramormyrops_kingsleyae
ENSRNOG00000007899	Mterf1	75	30.742	ENSPKIG00000000498	mterf2	80	30.742	Paramormyrops_kingsleyae
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	54.111	ENSPSIG00000016905	MTERF1	94	54.111	Pelodiscus_sinensis
ENSRNOG00000007899	Mterf1	86	30.745	ENSPSIG00000001391	MTERF2	83	30.745	Pelodiscus_sinensis
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	84.533	ENSPEMG00000013884	-	99	84.309	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	38.889	ENSPMAG00000007898	MTERF1	97	38.889	Petromyzon_marinus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	88	52.584	ENSPFOG00000006919	MTERF1	85	52.584	Poecilia_formosa
ENSRNOG00000007899	Mterf1	88	52.280	ENSPLAG00000011584	MTERF1	85	52.280	Poecilia_latipinna
ENSRNOG00000007899	Mterf1	88	52.584	ENSPREG00000012369	MTERF1	86	52.584	Poecilia_reticulata
ENSRNOG00000007899	Mterf1	95	76.389	ENSPPYG00000017826	MTERF1	88	76.389	Pongo_abelii
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	76.923	ENSPCOG00000013179	MTERF1	95	76.923	Propithecus_coquereli
ENSRNOG00000007899	Mterf1	70	79.848	ENSPVAG00000006613	MTERF1	66	79.848	Pteropus_vampyrus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	51.682	ENSPNYG00000009120	MTERF1	84	51.682	Pundamilia_nyererei
ENSRNOG00000007899	Mterf1	88	52.584	ENSPNAG00000022366	MTERF1	86	52.584	Pygocentrus_nattereri
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.596	ENSRBIG00000027323	MTERF1	94	76.596	Rhinopithecus_bieti
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	76.596	ENSRROG00000031256	MTERF1	94	76.596	Rhinopithecus_roxellana
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	74.468	ENSSBOG00000034146	MTERF1	99	74.468	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	30.091	ENSSHAG00000014188	MTERF2	82	30.091	Sarcophilus_harrisii
ENSRNOG00000007899	Mterf1	88	53.659	ENSSFOG00015008650	mterf1	86	53.659	Scleropages_formosus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	51.682	ENSSMAG00000004934	MTERF1	71	51.682	Scophthalmus_maximus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	51.692	ENSSDUG00000013580	MTERF1	84	51.692	Seriola_dumerili
ENSRNOG00000007899	Mterf1	93	46.307	ENSSPUG00000017132	MTERF1	93	46.307	Sphenodon_punctatus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	53.211	ENSSPAG00000018734	MTERF1	85	53.211	Stegastes_partitus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	72.872	ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	72.872	Sus_scrofa
ENSRNOG00000007899	Mterf1	88	51.220	ENSTRUG00000013118	MTERF1	77	51.220	Takifugu_rubripes
ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	76.658	ENSTBEG00000005760	MTERF1	96	76.658	Tupaia_belangeri
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	75.200	ENSTTRG00000010321	MTERF1	94	75.000	Tursiops_truncatus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	74.933	ENSUAMG00000022225	MTERF1	94	76.862	Ursus_americanus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	74.667	ENSUMAG00000018642	MTERF1	94	76.596	Ursus_maritimus
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	74.734	ENSVPAG00000005202	MTERF1	95	74.734	Vicugna_pacos
ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	30.183	ENSVPAG00000008539	MTERF2	95	30.183	Vicugna_pacos
ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	73.333	ENSVVUG00000013841	MTERF1	94	74.734	Vulpes_vulpes
ENSRNOG00000007899	Mterf1	89	53.012	ENSXETG00000027398	mterf1	88	53.012	Xenopus_tropicalis

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0003690	double-stranded DNA binding	-	IEA	Function
GO:0003690	double-stranded DNA binding	-	ISO	Function
GO:0003690	double-stranded DNA binding	-	ISS	Function
GO:0005739	mitochondrion	-	IEA	Component
GO:0005739	mitochondrion	-	ISO	Component
GO:0005829	cytosol	-	ISO	Component
GO:0006353	DNA-templated transcription, termination	-	ISO	Process
GO:0006353	DNA-templated transcription, termination	-	ISS	Process
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-templated	-	IEA	Process
GO:0006393	termination of mitochondrial transcription	21873635.	IBA	Process
GO:0006393	termination of mitochondrial transcription	-	ISO	Process
GO:0006393	termination of mitochondrial transcription	-	ISS	Process
GO:0032392	DNA geometric change	-	ISO	Process
GO:0032392	DNA geometric change	-	ISS	Process
GO:0042645	mitochondrial nucleoid	-	ISO	Component