EuRBPDB

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Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSRNOG00000018342 (Gene tree)
Gene ID: 364900
Gene Symbol: Ctif
Alias: Gm672|LOC364900
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Rattus_norvegicus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 366396 bases
Position: chr18:71463486-71829881
Accession: 1311887
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRNOP00000071241	MIF4G	PF02854.19	3.6e-28	1	1
ENSRNOP00000024716	MIF4G	PF02854.19	1.8e-26	1	1

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRNOT00000024716	-	1430	-	ENSRNOP00000024716	336 (aa)	-	D3ZD47
ENSRNOT00000088662	-	6035	-	ENSRNOP00000071241	598 (aa)	-	A0A0G2JZZ3

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSRNOG00000018342	Ctif	51	30.481	ENSRNOG00000003837	Mif4gd	82	33.690

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.144	ENSG00000134030	CTIF	100	94.203	Homo_sapiens
ENSRNOG00000018342	Ctif	98	63.953	ENSAPOG00000020192	ctif	99	59.641	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRNOG00000018342	Ctif	95	87.500	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	92.322	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRNOG00000018342	Ctif	51	30.481	ENSAMEG00000009313	MIF4GD	69	33.690	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRNOG00000018342	Ctif	90	66.456	ENSACIG00000017099	ctif	99	54.208	Amphilophus_citrinellus
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	54.532	ENSAOCG00000014275	ctif	99	54.745	Amphiprion_ocellaris
ENSRNOG00000018342	Ctif	98	62.356	ENSAPEG00000016975	ctif	99	57.227	Amphiprion_percula
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	56.140	ENSATEG00000016752	ctif	99	56.745	Anabas_testudineus
ENSRNOG00000018342	Ctif	76	75.277	ENSAPLG00000014486	-	100	76.753	Anas_platyrhynchos
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	77.391	ENSACAG00000018006	CTIF	100	74.961	Anolis_carolinensis
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.154	ENSANAG00000024925	CTIF	100	92.154	Aotus_nancymaae
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	56.029	ENSACLG00000005956	ctif	99	57.060	Astatotilapia_calliptera
ENSRNOG00000018342	Ctif	58	30.275	ENSAMXG00000038588	mif4gda	97	32.258	Astyanax_mexicanus
ENSRNOG00000018342	Ctif	76	65.950	ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.199	Astyanax_mexicanus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	89.632	ENSBTAG00000018901	CTIF	100	89.632	Bos_taurus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.013	ENSCJAG00000004729	CTIF	100	92.013	Callithrix_jacchus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	89.306	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	92.167	Canis_familiaris
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	89.017	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	92.000	Canis_lupus_dingo
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	89.018	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	89.018	Capra_hircus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	78.324	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	83.333	Carlito_syrichta
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	87.608	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	82.410	Cavia_aperea
ENSRNOG00000018342	Ctif	51	30.481	ENSCPOG00000027094	MIF4GD	82	34.225	Cavia_porcellus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	88.744	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	88.744	Cavia_porcellus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	91.847	ENSCCAG00000022758	CTIF	100	91.847	Cebus_capucinus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.311	ENSCATG00000038134	CTIF	100	93.311	Cercocebus_atys
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	91.653	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	91.653	Chinchilla_lanigera
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	90.879	ENSCSAG00000018021	CTIF	100	90.879	Chlorocebus_sabaeus
ENSRNOG00000018342	Ctif	61	83.333	ENSCHOG00000009041	-	71	85.000	Choloepus_hoffmanni
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	81.592	ENSCPBG00000025654	CTIF	100	81.592	Chrysemys_picta_bellii
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.833	ENSCANG00000030916	CTIF	100	93.267	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	94.983	ENSCGRG00001020158	Ctif	100	94.983	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	88.065	ENSCGRG00000000052	Ctif	100	88.065	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	62.464	ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.993	Cynoglossus_semilaevis
ENSRNOG00000018342	Ctif	94	63.061	ENSCVAG00000017158	ctif	99	56.785	Cyprinodon_variegatus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	54.533	ENSDARG00000090617	ctif	100	57.183	Danio_rerio
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	87.572	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	91.628	Dasypus_novemcinctus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.000	ENSDORG00000003221	Ctif	100	92.000	Dipodomys_ordii
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.140	ENSEASG00005016094	CTIF	100	92.140	Equus_asinus_asinus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.642	ENSECAG00000020473	CTIF	100	92.642	Equus_caballus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	81.792	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	82.222	Erinaceus_europaeus
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	62.780	ENSELUG00000008733	ctif	99	62.119	Esox_lucius
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.475	ENSFCAG00000000664	CTIF	100	92.475	Felis_catus
ENSRNOG00000018342	Ctif	97	80.862	ENSFALG00000008943	CTIF	97	80.862	Ficedula_albicollis
ENSRNOG00000018342	Ctif	51	30.481	ENSFDAG00000010687	MIF4GD	82	33.690	Fukomys_damarensis
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	90.016	ENSFDAG00000017379	CTIF	100	90.016	Fukomys_damarensis
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	56.650	ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.444	Fundulus_heteroclitus
ENSRNOG00000018342	Ctif	75	73.764	ENSGMOG00000003452	ctif	99	77.778	Gadus_morhua
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	77.632	ENSGALG00000035912	-	100	77.632	Gallus_gallus
ENSRNOG00000018342	Ctif	62	69.856	ENSGALG00000046886	-	97	69.737	Gallus_gallus
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	58.106	ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.528	Gambusia_affinis
ENSRNOG00000018342	Ctif	76	71.970	ENSGACG00000016514	ctif	99	75.758	Gasterosteus_aculeatus
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	79.104	ENSGAGG00000020663	CTIF	97	77.250	Gopherus_agassizii
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.833	ENSGGOG00000015204	CTIF	100	92.833	Gorilla_gorilla
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	56.176	ENSHBUG00000018092	ctif	99	57.205	Haplochromis_burtoni
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	91.820	ENSHGLG00000005663	CTIF	100	91.820	Heterocephalus_glaber_female
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	91.653	ENSHGLG00100006976	CTIF	100	91.653	Heterocephalus_glaber_male
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	54.754	ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.393	Hippocampus_comes
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	55.081	ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.339	Ictalurus_punctatus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	91.500	ENSSTOG00000001967	CTIF	100	91.500	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	90.307	ENSJJAG00000013706	Ctif	100	90.307	Jaculus_jaculus
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	54.290	ENSKMAG00000014651	ctif	99	55.473	Kryptolebias_marmoratus
ENSRNOG00000018342	Ctif	98	65.000	ENSLBEG00000018277	ctif	99	62.975	Labrus_bergylta
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	65.738	ENSLOCG00000011697	ctif	100	62.665	Lepisosteus_oculatus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	81.843	ENSLAFG00000016335	CTIF	100	95.506	Loxodonta_africana
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.311	ENSMFAG00000037903	CTIF	100	93.311	Macaca_fascicularis
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.311	ENSMMUG00000020898	CTIF	100	93.311	Macaca_mulatta
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.311	ENSMNEG00000039395	CTIF	100	93.311	Macaca_nemestrina
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.000	ENSMLEG00000041132	CTIF	100	93.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	57.903	ENSMAMG00000014741	ctif	99	58.407	Mastacembelus_armatus
ENSRNOG00000018342	Ctif	88	52.700	ENSMZEG00005019767	ctif	90	53.344	Maylandia_zebra
ENSRNOG00000018342	Ctif	88	51.099	ENSMGAG00000001378	CTIF	100	51.763	Meleagris_gallopavo
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.833	ENSMAUG00000000656	Ctif	100	93.833	Mesocricetus_auratus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.000	ENSMICG00000010167	CTIF	100	92.000	Microcebus_murinus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	95.000	ENSMOCG00000020507	Ctif	100	95.000	Microtus_ochrogaster
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	53.690	ENSMMOG00000000831	ctif	99	54.215	Mola_mola
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	80.636	ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.534	Monodelphis_domestica
ENSRNOG00000018342	Ctif	83	67.698	ENSMALG00000020553	ctif	99	56.069	Monopterus_albus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.237	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	100	93.237	Mus_caroli
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.258	ENSMUSG00000052928	Ctif	100	93.258	Mus_musculus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	96.160	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	100	96.160	Mus_pahari
ENSRNOG00000018342	Ctif	57	30.047	MGP_PahariEiJ_G0018542	Mif4gd	94	32.864	Mus_pahari
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.777	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	100	92.777	Mus_spretus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	91.833	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	91.833	Mustela_putorius_furo
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	91.806	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	91.806	Myotis_lucifugus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	95.000	ENSNGAG00000011452	Ctif	100	95.000	Nannospalax_galili
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	56.324	ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.891	Neolamprologus_brichardi
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.000	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	93.000	Nomascus_leucogenys
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	80.347	ENSMEUG00000000218	CTIF	100	75.707	Notamacropus_eugenii
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	87.333	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	87.333	Ochotona_princeps
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	87.762	ENSODEG00000018390	CTIF	100	87.762	Octodon_degus
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	63.355	ENSONIG00000007750	ctif	99	63.518	Oreochromis_niloticus
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	85.714	ENSOANG00000001337	CTIF	100	68.440	Ornithorhynchus_anatinus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	89.333	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	89.333	Oryctolagus_cuniculus
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	58.995	ENSORLG00000005786	ctif	99	59.547	Oryzias_latipes
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	58.699	ENSORLG00020005385	ctif	99	59.253	Oryzias_latipes_hni
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	58.401	ENSORLG00015011872	ctif	99	58.958	Oryzias_latipes_hsok
ENSRNOG00000018342	Ctif	99	55.244	ENSOMEG00000007917	ctif	99	55.605	Oryzias_melastigma
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.475	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	92.475	Otolemur_garnettii
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	90.000	ENSOARG00000003754	CTIF	100	90.000	Ovis_aries
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.833	ENSPPAG00000023554	CTIF	100	92.833	Pan_paniscus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.000	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	92.000	Panthera_pardus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	91.667	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	91.667	Panthera_tigris_altaica
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	92.667	ENSPTRG00000010009	CTIF	100	92.667	Pan_troglodytes
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.000	ENSPANG00000017087	CTIF	100	93.000	Papio_anubis
ENSRNOG00000018342	Ctif	51	30.108	ENSPKIG00000005974	MIF4GD	83	32.432	Paramormyrops_kingsleyae
ENSRNOG00000018342	Ctif	75	79.848	ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.137	Paramormyrops_kingsleyae
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	78.631	ENSPSIG00000006508	CTIF	100	78.631	Pelodiscus_sinensis
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	50.144	ENSPMGG00000022958	ctif	99	50.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSRNOG00000018342	Ctif	100	94.842	ENSPEMG00000022746	Ctif	100	94.842	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSRNOG00000018342	Ctif	97	81.707	ENSPCIG00000026247	CTIF	99	81.707	Phascolarctos_cinereus
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