EuRBPDB

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Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSRNOG00000055915 (Gene tree)
Gene ID: 313594
Gene Symbol: Ago1
Alias: Eif2c1|LOC313594
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Rattus_norvegicus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30515 bases
Position: chr5:144448792-144479306
Accession: 1304619
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRNOP00000072144	PAZ	PF02170.22	9.5e-29	1	1
ENSRNOP00000072144	Piwi	PF02171.17	2.2e-110	1	1

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRNOT00000087697	-	2886	XM_008764025	ENSRNOP00000072144	857 (aa)	XP_008762247	D4AC38

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSRNOG00000055915	Ago1	68	85.595	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	85.595
ENSRNOG00000055915	Ago1	98	83.771	ENSRNOG00000008533	Ago2	95	83.671
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	83.699	ENSRNOG00000034269	Ago3	99	84.688

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSG00000092847	AGO1	100	99.883	Homo_sapiens
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSAPOG00000024299	ago1	98	96.797	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	99.883	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRNOG00000055915	Ago1	82	91.880	ENSACIG00000005298	ago1	98	91.880	Amphilophus_citrinellus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSAOCG00000017727	ago1	98	96.797	Amphiprion_ocellaris
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.797	Amphiprion_percula
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSATEG00000008523	ago1	98	96.797	Anabas_testudineus
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	93.677	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.677	Anas_platyrhynchos
ENSRNOG00000055915	Ago1	91	99.744	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.744	Anolis_carolinensis
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSANAG00000037711	AGO1	100	99.883	Aotus_nancymaae
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	95.804	ENSACLG00000000890	ago1	98	96.560	Astatotilapia_calliptera
ENSRNOG00000055915	Ago1	80	98.397	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.397	Astyanax_mexicanus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.767	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.767	Bos_taurus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	99.883	Callithrix_jacchus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	99.883	Canis_familiaris
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	98.016	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.405	Canis_lupus_dingo
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	98.956	ENSCHIG00000011848	-	100	98.956	Capra_hircus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	78.646	ENSTSYG00000032426	-	99	79.380	Carlito_syrichta
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	Carlito_syrichta
ENSRNOG00000055915	Ago1	89	93.776	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	92.902	Cavia_aperea
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	Cavia_porcellus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	99.883	Cebus_capucinus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.184	ENSCATG00000031521	AGO1	100	99.872	Cercocebus_atys
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	Chinchilla_lanigera
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	99.883	Chlorocebus_sabaeus
ENSRNOG00000055915	Ago1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.650	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.650	Chrysemys_picta_bellii
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSCANG00000039798	AGO1	100	99.883	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	99.883	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	99.882	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	99.882	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	94.664	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.988	Cynoglossus_semilaevis
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	95.804	ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.797	Cyprinodon_variegatus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.387	ENSDARG00000092644	ago1	98	96.805	Danio_rerio
ENSRNOG00000055915	Ago1	91	99.872	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	99.872	Dasypus_novemcinctus
ENSRNOG00000055915	Ago1	93	98.820	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSRNOG00000055915	Ago1	84	93.065	ENSETEG00000007626	AGO1	100	93.065	Echinops_telfairi
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSEASG00005012086	AGO1	100	99.883	Equus_asinus_asinus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSECAG00000024353	AGO1	100	99.883	Equus_caballus
ENSRNOG00000055915	Ago1	92	91.487	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.487	Erinaceus_europaeus
ENSRNOG00000055915	Ago1	91	96.931	ENSELUG00000016803	ago1	100	96.931	Esox_lucius
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	99.883	Felis_catus
ENSRNOG00000055915	Ago1	91	92.092	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.092	Ficedula_albicollis
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.767	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	Fukomys_damarensis
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	92.562	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.883	Fundulus_heteroclitus
ENSRNOG00000055915	Ago1	87	84.513	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.513	Gadus_morhua
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.767	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.767	Gallus_gallus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.154	ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.797	Gambusia_affinis
ENSRNOG00000055915	Ago1	87	97.071	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.071	Gasterosteus_aculeatus
ENSRNOG00000055915	Ago1	91	99.744	ENSGAGG00000012893	-	100	99.744	Gopherus_agassizii
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	99.883	Gorilla_gorilla
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	95.804	ENSHBUG00000010459	ago1	98	96.560	Haplochromis_burtoni
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	99.883	Heterocephalus_glaber_female
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	99.883	Heterocephalus_glaber_male
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	96.458	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.797	Hippocampus_comes
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.568	Ictalurus_punctatus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	99.883	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.767	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.767	Jaculus_jaculus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSKMAG00000019464	ago1	98	96.797	Kryptolebias_marmoratus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.154	ENSLBEG00000007694	ago1	98	96.797	Labrus_bergylta
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	93.404	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.506	Latimeria_chalumnae
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	93.939	ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.543	Lepisosteus_oculatus
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	99.882	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	Loxodonta_africana
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	99.883	Macaca_fascicularis
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	94.854	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.136	Macaca_mulatta
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	95.916	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	99.872	Macaca_nemestrina
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	99.883	Mandrillus_leucophaeus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSMAMG00000008381	ago1	98	96.797	Mastacembelus_armatus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	95.804	ENSMZEG00005007996	ago1	98	96.560	Maylandia_zebra
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	94.179	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.366	Meleagris_gallopavo
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	99.883	Mesocricetus_auratus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSMICG00000016147	AGO1	100	99.883	Microcebus_murinus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.767	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.767	Microtus_ochrogaster
ENSRNOG00000055915	Ago1	78	98.507	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.507	Mola_mola
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.533	ENSMODG00000023335	AGO1	100	99.533	Monodelphis_domestica
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	96.340	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.679	Monopterus_albus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	Mus_caroli
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.883	Mus_musculus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.883	Mus_pahari
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.883	Mus_spretus
ENSRNOG00000055915	Ago1	84	99.861	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	99.861	Mustela_putorius_furo
ENSRNOG00000055915	Ago1	61	99.617	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.617	Myotis_lucifugus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.650	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.650	Nannospalax_galili
ENSRNOG00000055915	Ago1	91	96.931	ENSNBRG00000010867	ago1	100	96.931	Neolamprologus_brichardi
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.767	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	Nomascus_leucogenys
ENSRNOG00000055915	Ago1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSRNOG00000055915	Ago1	93	99.696	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	99.696	Ochotona_princeps
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSODEG00000005321	AGO1	100	99.883	Octodon_degus
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	96.222	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.560	Oreochromis_niloticus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	90.888	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.860	Ornithorhynchus_anatinus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.767	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.767	Oryctolagus_cuniculus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSORLG00000014965	ago1	98	96.797	Oryzias_latipes
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSORLG00020018253	ago1	98	96.797	Oryzias_latipes_hni
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSORLG00015003287	ago1	98	96.797	Oryzias_latipes_hsok
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.037	ENSOMEG00000020528	ago1	98	96.797	Oryzias_melastigma
ENSRNOG00000055915	Ago1	99	99.882	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	99.882	Otolemur_garnettii
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.767	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.767	Ovis_aries
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	99.883	Pan_paniscus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	99.883	Panthera_pardus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.650	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.650	Panthera_tigris_altaica
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	99.883	Pan_troglodytes
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSPANG00000009060	AGO1	100	99.883	Papio_anubis
ENSRNOG00000055915	Ago1	98	98.931	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.931	Pelodiscus_sinensis
ENSRNOG00000055915	Ago1	80	97.238	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.238	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.533	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.533	Phascolarctos_cinereus
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.154	ENSPFOG00000005867	ago1	98	96.797	Poecilia_formosa
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.154	ENSPLAG00000002824	ago1	99	97.974	Poecilia_latipinna
ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.154	ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.974	Poecilia_mexicana
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