EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSRROG00000001347 (Gene tree)
Gene ID: 104656100
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Rhinopithecus_roxellana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11756 bases
Position: chrKN299716.1:1052915-1064670
Accession: 104656100
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRROP00000000412	SYF2	PF08231.12	3e-54	1	1
ENSRROP00000000410	SYF2	PF08231.12	8.2e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRROT00000001560	SYF2-201	1674	XM_010355717	ENSRROP00000000410	243 (aa)	XP_010354019	A0A2K6N810
ENSRROT00000001586	SYF2-202	606	-	ENSRROP00000000412	201 (aa)	-	A0A2K6N813

Gene Model

Click here to download ENSRROG00000001347's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
rro03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSRROG00000001347's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.531	ENSG00000117614	SYF2	100	97.531	Homo_sapiens
ENSRROG00000001347	SYF2	90	83.562	ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.085	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRROG00000001347	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRROG00000001347	SYF2	98	92.116	ENSAMEG00000010115	-	99	92.116	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.822	ENSACIG00000023688	syf2	88	80.822	Amphilophus_citrinellus
ENSRROG00000001347	SYF2	88	78.995	ENSAOCG00000010912	syf2	68	78.995	Amphiprion_ocellaris
ENSRROG00000001347	SYF2	98	79.412	ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.412	Amphiprion_ocellaris
ENSRROG00000001347	SYF2	95	80.508	ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.508	Amphiprion_percula
ENSRROG00000001347	SYF2	89	82.488	ENSATEG00000007745	syf2	99	78.814	Anabas_testudineus
ENSRROG00000001347	SYF2	82	88.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	Anas_platyrhynchos
ENSRROG00000001347	SYF2	79	74.843	ENSACAG00000026777	-	95	74.843	Anolis_carolinensis
ENSRROG00000001347	SYF2	84	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.119	ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.119	Aotus_nancymaae
ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.365	ENSACLG00000019916	syf2	100	76.050	Astatotilapia_calliptera
ENSRROG00000001347	SYF2	90	82.569	ENSAMXG00000004051	syf2	92	82.569	Astyanax_mexicanus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.837	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.644	Bos_taurus
ENSRROG00000001347	SYF2	86	51.905	WBGene00019402	syf-2	99	47.210	Caenorhabditis_elegans
ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.531	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.531	Callithrix_jacchus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	92.623	ENSCAFG00000012895	-	99	92.623	Canis_familiaris
ENSRROG00000001347	SYF2	100	82.305	ENSCAFG00000030331	-	100	82.305	Canis_familiaris
ENSRROG00000001347	SYF2	95	86.316	ENSCAFG00020021094	-	97	86.316	Canis_lupus_dingo
ENSRROG00000001347	SYF2	99	92.623	ENSCAFG00020021091	-	99	92.623	Canis_lupus_dingo
ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.887	Capra_hircus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.004	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	Carlito_syrichta
ENSRROG00000001347	SYF2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.033	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.033	Cavia_porcellus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.531	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	97.531	Cebus_capucinus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	99.588	ENSCATG00000026917	SYF2	100	99.588	Cercocebus_atys
ENSRROG00000001347	SYF2	100	94.262	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.262	Chinchilla_lanigera
ENSRROG00000001347	SYF2	100	99.588	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	99.588	Chlorocebus_sabaeus
ENSRROG00000001347	SYF2	72	77.586	ENSCHOG00000005273	-	96	77.586	Choloepus_hoffmanni
ENSRROG00000001347	SYF2	92	89.286	ENSCPBG00000025073	SYF2	93	87.879	Chrysemys_picta_bellii
ENSRROG00000001347	SYF2	87	53.991	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSRROG00000001347	SYF2	96	46.392	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSRROG00000001347	SYF2	100	86.420	ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.420	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	89.712	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.712	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRROG00000001347	SYF2	81	95.408	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRROG00000001347	SYF2	90	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.605	Cynoglossus_semilaevis
ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.822	ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.215	Cyprinodon_variegatus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	77.917	ENSDARG00000004706	syf2	100	77.917	Danio_rerio
ENSRROG00000001347	SYF2	99	93.416	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	93.416	Dasypus_novemcinctus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	91.736	ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.736	Dipodomys_ordii
ENSRROG00000001347	SYF2	90	55.909	FBgn0033556	CG12343	97	54.091	Drosophila_melanogaster
ENSRROG00000001347	SYF2	94	76.419	ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.293	Echinops_telfairi
ENSRROG00000001347	SYF2	89	54.945	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSRROG00000001347	SYF2	100	81.070	ENSEASG00005004232	-	100	81.070	Equus_asinus_asinus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.020	ENSEASG00005004224	-	100	91.020	Equus_asinus_asinus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.429	ENSECAG00000012023	-	100	91.429	Equus_caballus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	92.149	ENSECAG00000010440	-	96	95.633	Equus_caballus
ENSRROG00000001347	SYF2	75	80.328	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	Erinaceus_europaeus
ENSRROG00000001347	SYF2	96	79.412	ENSELUG00000003465	syf2	100	79.412	Esox_lucius
ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.469	ENSFCAG00000010324	-	85	93.469	Felis_catus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	93.033	ENSFCAG00000043095	-	99	93.033	Felis_catus
ENSRROG00000001347	SYF2	84	84.314	ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.172	Ficedula_albicollis
ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.004	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.004	Fukomys_damarensis
ENSRROG00000001347	SYF2	90	66.364	ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.364	Fundulus_heteroclitus
ENSRROG00000001347	SYF2	90	82.569	ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	Gadus_morhua
ENSRROG00000001347	SYF2	92	87.054	ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.200	Gallus_gallus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	74.689	ENSGAFG00000019435	syf2	99	73.444	Gambusia_affinis
ENSRROG00000001347	SYF2	88	82.791	ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	Gasterosteus_aculeatus
ENSRROG00000001347	SYF2	92	88.839	ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.446	Gopherus_agassizii
ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.942	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	97.942	Gorilla_gorilla
ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.365	ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.050	Haplochromis_burtoni
ENSRROG00000001347	SYF2	93	83.260	ENSHGLG00000004304	-	99	79.583	Heterocephalus_glaber_female
ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.443	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.443	Heterocephalus_glaber_female
ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.443	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.443	Heterocephalus_glaber_male
ENSRROG00000001347	SYF2	98	77.178	ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	Hippocampus_comes
ENSRROG00000001347	SYF2	91	82.353	ENSIPUG00000019859	syf2	93	82.353	Ictalurus_punctatus
ENSRROG00000001347	SYF2	60	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSRROG00000001347	SYF2	82	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	76.250	ENSKMAG00000013856	syf2	99	76.250	Kryptolebias_marmoratus
ENSRROG00000001347	SYF2	90	82.192	ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	Labrus_bergylta
ENSRROG00000001347	SYF2	99	80.417	ENSLACG00000012064	SYF2	99	80.417	Latimeria_chalumnae
ENSRROG00000001347	SYF2	97	80.000	ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.000	Lepisosteus_oculatus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	92.245	ENSLAFG00000023150	-	100	92.245	Loxodonta_africana
ENSRROG00000001347	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSRROG00000001347	SYF2	100	100.000	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSRROG00000001347	SYF2	100	99.588	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	99.588	Macaca_mulatta
ENSRROG00000001347	SYF2	100	100.000	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSRROG00000001347	SYF2	100	99.588	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	99.588	Mandrillus_leucophaeus
ENSRROG00000001347	SYF2	89	80.645	ENSMAMG00000010403	syf2	100	73.770	Mastacembelus_armatus
ENSRROG00000001347	SYF2	95	77.119	ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	Maylandia_zebra
ENSRROG00000001347	SYF2	82	88.442	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	Meleagris_gallopavo
ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.123	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.123	Mesocricetus_auratus
ENSRROG00000001347	SYF2	89	96.629	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.947	Microtus_ochrogaster
ENSRROG00000001347	SYF2	90	78.995	ENSMMOG00000002396	syf2	92	78.995	Mola_mola
ENSRROG00000001347	SYF2	93	88.106	ENSMODG00000013951	-	99	88.106	Monodelphis_domestica
ENSRROG00000001347	SYF2	95	77.637	ENSMALG00000010706	syf2	98	77.215	Monopterus_albus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	90.947	Mus_caroli
ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	90.947	Mus_musculus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	90.947	Mus_pahari
ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	90.947	Mus_spretus
ENSRROG00000001347	SYF2	98	93.333	ENSMPUG00000015801	-	98	93.333	Mustela_putorius_furo
ENSRROG00000001347	SYF2	99	93.033	ENSMPUG00000015802	-	99	93.033	Mustela_putorius_furo
ENSRROG00000001347	SYF2	98	92.857	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.857	Myotis_lucifugus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.870	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.870	Nannospalax_galili
ENSRROG00000001347	SYF2	97	70.833	ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.833	Neolamprologus_brichardi
ENSRROG00000001347	SYF2	100	98.354	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.354	Nomascus_leucogenys
ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.947	Ochotona_princeps
ENSRROG00000001347	SYF2	96	84.979	ENSODEG00000014338	-	98	84.979	Octodon_degus
ENSRROG00000001347	SYF2	96	94.850	ENSODEG00000017664	-	98	94.850	Octodon_degus
ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.365	ENSONIG00000008213	syf2	100	76.050	Oreochromis_niloticus
ENSRROG00000001347	SYF2	83	89.604	ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	Ornithorhynchus_anatinus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	94.672	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	Oryctolagus_cuniculus
ENSRROG00000001347	SYF2	90	81.735	ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	Oryzias_latipes
ENSRROG00000001347	SYF2	99	76.667	ENSORLG00020018333	syf2	100	76.667	Oryzias_latipes_hni
ENSRROG00000001347	SYF2	99	76.250	ENSORLG00015014665	syf2	100	76.250	Oryzias_latipes_hsok
ENSRROG00000001347	SYF2	96	78.151	ENSOMEG00000013911	syf2	100	78.151	Oryzias_melastigma
ENSRROG00000001347	SYF2	99	93.802	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.802	Otolemur_garnettii
ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.903	ENSOARG00000006348	-	100	91.903	Ovis_aries
ENSRROG00000001347	SYF2	80	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	66.154	Ovis_aries
ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.942	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	97.942	Pan_paniscus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	93.033	ENSPPRG00000001651	-	99	93.033	Panthera_pardus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.089	ENSPPRG00000001638	-	100	93.089	Panthera_pardus
ENSRROG00000001347	SYF2	93	96.018	ENSPTIG00000005711	-	82	96.018	Panthera_tigris_altaica
ENSRROG00000001347	SYF2	99	92.623	ENSPTIG00000007036	-	99	92.623	Panthera_tigris_altaica
ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.942	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.942	Pan_troglodytes
ENSRROG00000001347	SYF2	100	100.000	ENSPANG00000008139	SYF2	100	100.000	Papio_anubis
ENSRROG00000001347	SYF2	95	79.828	ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	Paramormyrops_kingsleyae
ENSRROG00000001347	SYF2	96	85.408	ENSPSIG00000011816	SYF2	90	86.147	Pelodiscus_sinensis
ENSRROG00000001347	SYF2	97	77.119	ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.535	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.535	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSRROG00000001347	SYF2	93	93.333	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	92.576	Phascolarctos_cinereus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	75.417	ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.417	Poecilia_formosa
ENSRROG00000001347	SYF2	99	75.417	ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.417	Poecilia_latipinna
ENSRROG00000001347	SYF2	100	72.016	ENSPMEG00000011684	syf2	100	71.605	Poecilia_mexicana
ENSRROG00000001347	SYF2	89	80.093	ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	Poecilia_reticulata
ENSRROG00000001347	SYF2	100	98.354	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.354	Pongo_abelii
ENSRROG00000001347	SYF2	100	76.617	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.617	Propithecus_coquereli
ENSRROG00000001347	SYF2	99	81.070	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.070	Pteropus_vampyrus
ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.365	ENSPNYG00000004979	syf2	100	76.050	Pundamilia_nyererei
ENSRROG00000001347	SYF2	100	79.012	ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	Pygocentrus_nattereri
ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	90.947	Rattus_norvegicus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.119	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	97.119	Rhinopithecus_bieti
ENSRROG00000001347	SYF2	100	96.296	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	96.296	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSRROG00000001347	SYF2	93	91.556	ENSSHAG00000015630	-	92	90.789	Sarcophilus_harrisii
ENSRROG00000001347	SYF2	82	94.472	ENSSHAG00000007152	-	97	94.472	Sarcophilus_harrisii
ENSRROG00000001347	SYF2	93	80.617	ENSSFOG00015023647	syf2	96	80.617	Scleropages_formosus
ENSRROG00000001347	SYF2	95	77.119	ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.119	Scophthalmus_maximus
ENSRROG00000001347	SYF2	90	82.569	ENSSDUG00000013072	syf2	98	78.059	Seriola_dumerili
ENSRROG00000001347	SYF2	90	82.569	ENSSLDG00000012677	syf2	98	78.059	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSRROG00000001347	SYF2	100	73.770	ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.770	Sorex_araneus
ENSRROG00000001347	SYF2	95	86.147	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.147	Sphenodon_punctatus
ENSRROG00000001347	SYF2	95	79.237	ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	Stegastes_partitus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	90.947	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	90.947	Sus_scrofa
ENSRROG00000001347	SYF2	64	66.165	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.429	Taeniopygia_guttata
ENSRROG00000001347	SYF2	100	73.663	ENSTRUG00000001499	syf2	88	80.275	Takifugu_rubripes
ENSRROG00000001347	SYF2	90	79.358	ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	Tetraodon_nigroviridis
ENSRROG00000001347	SYF2	100	71.193	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	Tupaia_belangeri
ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.803	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.623	Tursiops_truncatus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	91.803	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.803	Ursus_americanus
ENSRROG00000001347	SYF2	99	92.213	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	92.213	Ursus_maritimus
ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.803	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	Vicugna_pacos
ENSRROG00000001347	SYF2	99	92.623	ENSVVUG00000027175	-	99	92.623	Vulpes_vulpes
ENSRROG00000001347	SYF2	84	96.098	ENSVVUG00000027181	-	100	89.113	Vulpes_vulpes
ENSRROG00000001347	SYF2	96	81.545	ENSXETG00000022797	syf2	94	81.545	Xenopus_tropicalis
ENSRROG00000001347	SYF2	88	80.465	ENSXMAG00000022698	syf2	100	74.074	Xiphophorus_maculatus