EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSRROG00000030082 (Gene tree)
Gene ID: 104682925
Gene Symbol: APOBEC2
Alias: ARCD1|ARP1
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Rhinopithecus_roxellana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14552 bases
Position: chrKN299263.1:6390596-6405147
Accession: 104682925
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRROP00000011489	APOBEC_N	PF08210.11	5.2e-51	1	1
ENSRROP00000011489	APOBEC_C	PF05240.14	3.3e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRROT00000035593	APOBEC2-201	4469	XM_010389748	ENSRROP00000011489	224 (aa)	XP_010388050	A0A2K6P4P4

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSRROG00000030082	APOBEC2	88	31.429	ENSRROG00000028773	APOBEC3G	97	30.288
ENSRROG00000030082	APOBEC2	88	33.668	ENSRROG00000029045	APOBEC3C	98	33.333
ENSRROG00000030082	APOBEC2	81	33.523	ENSRROG00000029996	-	98	32.961
ENSRROG00000030082	APOBEC2	87	33.166	ENSRROG00000028557	-	98	32.178
ENSRROG00000030082	APOBEC2	77	35.028	ENSRROG00000032866	AICDA	86	31.792

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	97.321	ENSG00000124701	APOBEC2	100	97.321	Homo_sapiens
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	54.751	ENSAPOG00000019390	apobec2b	69	59.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	82.292	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	76	82.292	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	55.208	ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.208	Amphilophus_citrinellus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	97	55.505	ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	60.209	Amphilophus_citrinellus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	53.571	ENSAOCG00000003291	apobec2a	77	57.732	Amphiprion_ocellaris
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	59.686	ENSAOCG00000023355	apobec2b	69	59.686	Amphiprion_ocellaris
ENSRROG00000030082	APOBEC2	97	55.046	ENSAPEG00000003630	apobec2a	77	57.732	Amphiprion_percula
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	59.686	ENSAPEG00000004591	apobec2b	69	59.686	Amphiprion_percula
ENSRROG00000030082	APOBEC2	98	55.455	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	Anabas_testudineus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	98	54.545	ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	60.209	Anabas_testudineus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	84	82.632	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	93	76.526	Anas_platyrhynchos
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	73.298	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	77.222	Anolis_carolinensis
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	96.875	ENSANAG00000026993	APOBEC2	100	96.875	Aotus_nancymaae
ENSRROG00000030082	APOBEC2	80	52.778	ENSACLG00000026736	-	97	52.778	Astatotilapia_calliptera
ENSRROG00000030082	APOBEC2	97	55.046	ENSACLG00000007634	APOBEC2	69	59.686	Astatotilapia_calliptera
ENSRROG00000030082	APOBEC2	96	50.901	ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.556	Astyanax_mexicanus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	97	58.065	ENSAMXG00000015966	apobec2b	75	57.944	Astyanax_mexicanus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	90.625	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	72	90.625	Bos_taurus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	96.875	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	96.875	Callithrix_jacchus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	93.750	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	100	93.750	Canis_familiaris
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	94.196	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	100	94.196	Canis_lupus_dingo
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	91.964	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	100	91.964	Capra_hircus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	96.190	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	93	96.190	Carlito_syrichta
ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	90.995	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	93	90.995	Cavia_aperea
ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	90.995	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	93	90.995	Cavia_porcellus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	97.321	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	100	97.321	Cebus_capucinus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	96.875	ENSCATG00000010691	APOBEC2	100	96.875	Cercocebus_atys
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	89.035	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	93	91.943	Chinchilla_lanigera
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	99.107	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	100	99.107	Chlorocebus_sabaeus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	80	93.333	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	93.333	Choloepus_hoffmanni
ENSRROG00000030082	APOBEC2	83	79.679	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	95	75.829	Chrysemys_picta_bellii
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	99.554	ENSCANG00000035072	APOBEC2	100	99.554	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	91.518	ENSCGRG00001014983	Apobec2	100	91.518	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	91.518	ENSCGRG00000007835	Apobec2	100	91.518	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	57.592	ENSCSEG00000000690	-	69	57.592	Cynoglossus_semilaevis
ENSRROG00000030082	APOBEC2	98	55.656	ENSCSEG00000020201	apobec2a	75	59.067	Cynoglossus_semilaevis
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	56.306	ENSCVAG00000012342	apobec2b	75	59.420	Cyprinodon_variegatus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	95	57.604	ENSDARG00000113992	apobec2b	77	58.491	Danio_rerio
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	61.658	ENSDARG00000018881	apobec2a	76	59.809	Danio_rerio
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	65.939	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	100	65.066	Dasypus_novemcinctus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	90.393	ENSDORG00000006447	Apobec2	92	92.417	Dipodomys_ordii
ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	89.100	ENSETEG00000000624	APOBEC2	92	89.100	Echinops_telfairi
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	93.229	ENSEASG00005002937	APOBEC2	100	93.229	Equus_asinus_asinus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	92.857	ENSECAG00000006576	APOBEC2	100	92.857	Equus_caballus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	88.839	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	100	88.839	Erinaceus_europaeus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	57.812	ENSELUG00000003736	apobec2a	69	56.219	Esox_lucius
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	93.304	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	100	93.304	Felis_catus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	60.619	ENSFALG00000003910	APOBEC2	94	62.441	Ficedula_albicollis
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	90.222	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	100	90.222	Fukomys_damarensis
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	63.351	ENSFHEG00000005492	apobec2b	79	63.351	Fundulus_heteroclitus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	80	60.556	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	60.556	Gadus_morhua
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	56.545	ENSGMOG00000006819	apobec2b	76	56.545	Gadus_morhua
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	81.152	ENSGALG00000003226	APOBEC2	95	76.168	Gallus_gallus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	97	58.065	ENSGAFG00000007634	apobec2b	60	62.827	Gambusia_affinis
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	58.549	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	58.549	Gasterosteus_aculeatus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	58.031	ENSGACG00000009663	apobec2b	83	58.031	Gasterosteus_aculeatus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	83	79.144	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.000	Gopherus_agassizii
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	95.217	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	100	95.217	Gorilla_gorilla
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	54.505	ENSHBUG00000015890	apobec2a	75	59.067	Haplochromis_burtoni
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	54.505	ENSHBUG00000005993	apobec2b	69	60.209	Haplochromis_burtoni
ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	90.047	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	93	90.047	Heterocephalus_glaber_female
ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	90.047	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	93	90.047	Heterocephalus_glaber_male
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	60.622	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	71	60.622	Hippocampus_comes
ENSRROG00000030082	APOBEC2	89	55.779	ENSHCOG00000020319	apobec2a	78	55.779	Hippocampus_comes
ENSRROG00000030082	APOBEC2	95	56.221	ENSIPUG00000013784	Apobec2	78	57.075	Ictalurus_punctatus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	57.949	ENSIPUG00000017355	apobec2a	54	57.949	Ictalurus_punctatus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	92.411	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	100	92.411	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	88.839	ENSJJAG00000009733	Apobec2	100	88.839	Jaculus_jaculus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	60.526	ENSKMAG00000020631	apobec2b	69	60.526	Kryptolebias_marmoratus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	98	52.968	ENSLBEG00000009422	-	66	58.639	Labrus_bergylta
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	52.679	ENSLBEG00000025214	apobec2a	83	54.502	Labrus_bergylta
ENSRROG00000030082	APOBEC2	93	65.072	ENSLACG00000015985	APOBEC2	89	65.072	Latimeria_chalumnae
ENSRROG00000030082	APOBEC2	90	61.194	ENSLOCG00000012415	apobec2b	71	61.194	Lepisosteus_oculatus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	94.313	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	100	93.304	Loxodonta_africana
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	99.107	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	100	99.107	Macaca_fascicularis
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	99.107	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	100	99.107	Macaca_mulatta
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	99.107	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	100	99.107	Macaca_nemestrina
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	99.107	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	100	99.107	Mandrillus_leucophaeus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	98	56.364	ENSMAMG00000023685	apobec2a	74	59.585	Mastacembelus_armatus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	98	57.014	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	68	61.257	Mastacembelus_armatus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	54.054	ENSMZEG00005005240	-	94	55.233	Maylandia_zebra
ENSRROG00000030082	APOBEC2	97	55.046	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	69	59.686	Maylandia_zebra
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	81.152	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	80.663	Meleagris_gallopavo
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	92.411	ENSMAUG00000011016	Apobec2	100	92.411	Mesocricetus_auratus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	92.411	ENSMICG00000043339	APOBEC2	100	92.411	Microcebus_murinus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	92.857	ENSMOCG00000001904	Apobec2	100	92.857	Microtus_ochrogaster
ENSRROG00000030082	APOBEC2	52	46.552	ENSMMOG00000009531	-	67	46.154	Mola_mola
ENSRROG00000030082	APOBEC2	96	53.488	ENSMMOG00000008681	apobec2b	76	54.808	Mola_mola
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	87.054	ENSMODG00000013090	APOBEC2	95	89.474	Monodelphis_domestica
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	57.732	ENSMALG00000020523	apobec2a	76	57.732	Monopterus_albus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	59.686	ENSMALG00000013779	APOBEC2	72	59.686	Monopterus_albus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	90.179	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	100	90.179	Mus_caroli
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	90.179	ENSMUSG00000040694	Apobec2	100	90.179	Mus_musculus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	90.625	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	90.625	Mus_pahari
ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	90.521	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	90	90.952	Mustela_putorius_furo
ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	90.521	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	91	90.476	Myotis_lucifugus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	91.964	ENSNGAG00000013717	Apobec2	100	91.964	Nannospalax_galili
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	54.505	ENSNBRG00000018806	apobec2b	66	57.005	Neolamprologus_brichardi
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	59.896	ENSNBRG00000021776	apobec2a	75	59.896	Neolamprologus_brichardi
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	97.768	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	97.768	Nomascus_leucogenys
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	87.054	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	95	89.048	Notamacropus_eugenii
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	90.351	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	100	91.667	Ochotona_princeps
ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	92.417	ENSODEG00000016183	APOBEC2	92	92.417	Octodon_degus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	86	59.585	ENSONIG00000004644	-	75	59.585	Oreochromis_niloticus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	54.505	ENSONIG00000012289	apobec2b	74	57.488	Oreochromis_niloticus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	77	85.465	ENSOANG00000000824	APOBEC2	98	82.873	Ornithorhynchus_anatinus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	92.070	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	100	92.070	Oryctolagus_cuniculus
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ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	59.686	ENSORLG00000022372	APOBEC2	69	59.686	Oryzias_latipes
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ENSRROG00000030082	APOBEC2	95	53.521	ENSORLG00020004153	apobec2a	79	56.995	Oryzias_latipes_hni
ENSRROG00000030082	APOBEC2	95	53.521	ENSORLG00015021781	apobec2a	79	56.995	Oryzias_latipes_hsok
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	60.733	ENSORLG00015022089	-	69	60.733	Oryzias_latipes_hsok
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	61.257	ENSOMEG00000015449	APOBEC2	76	61.257	Oryzias_melastigma
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	52.252	ENSOMEG00000001311	apobec2a	83	54.902	Oryzias_melastigma
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	93.304	ENSOGAG00000002632	APOBEC2	100	93.304	Otolemur_garnettii
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ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	54.506	ENSPKIG00000005395	apobec2a	78	59.184	Paramormyrops_kingsleyae
ENSRROG00000030082	APOBEC2	83	79.144	ENSPSIG00000013480	APOBEC2	97	71.300	Pelodiscus_sinensis
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ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	92.381	ENSPEMG00000005724	Apobec2	100	91.071	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSRROG00000030082	APOBEC2	96	57.273	ENSPNAG00000013666	apobec2b	75	58.491	Pygocentrus_nattereri
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ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	96.875	ENSSBOG00000028496	APOBEC2	100	96.875	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSRROG00000030082	APOBEC2	99	84.821	ENSSHAG00000017771	APOBEC2	95	87.143	Sarcophilus_harrisii
ENSRROG00000030082	APOBEC2	78	50.000	ENSSFOG00015005437	-	71	50.000	Scleropages_formosus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	98	58.904	ENSSFOG00015022920	apobec2	68	63.731	Scleropages_formosus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	60.209	ENSSMAG00000005110	APOBEC2	73	56.190	Scophthalmus_maximus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	97	55.300	ENSSMAG00000001011	apobec2a	56	59.585	Scophthalmus_maximus
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ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	57.547	ENSSLDG00000020199	apobec2a	80	58.173	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	58.639	ENSTNIG00000015038	apobec2b	70	58.639	Tetraodon_nigroviridis
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ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	85.526	ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	88.571	Ursus_americanus
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ENSRROG00000030082	APOBEC2	94	95.238	ENSVVUG00000026617	APOBEC2	100	93.750	Vulpes_vulpes
ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	50.420	ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	Xenopus_tropicalis
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	62.827	ENSXCOG00000007398	apobec2b	73	62.827	Xiphophorus_couchianus
ENSRROG00000030082	APOBEC2	85	62.304	ENSXMAG00000008134	apobec2b	68	62.304	Xiphophorus_maculatus