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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSRROG00000041076 (Gene tree)
Gene ID: 104666250
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Rhinopithecus_roxellana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 22654 bases
Position: chrKN296311.1:3097162-3119815
Accession: 104666250
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRROP00000035121	RRM_1	PF00076.22	4.2e-29	1	2
ENSRROP00000035121	RRM_1	PF00076.22	4.2e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRROT00000059574	MSI1-201	1065	XM_010368287	ENSRROP00000035121	354 (aa)	XP_010366589	A0A2K6R275

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
rro03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSRROG00000041076	MSI1	53	40.741	ENSRROG00000037347	DAZAP1	53	40.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSG00000135097	MSI1	94	99.697	Homo_sapiens
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSAPOG00000023458	-	94	85.152	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.152	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	81.365	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.365	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRROG00000041076	MSI1	90	81.703	ENSACIG00000017754	-	78	81.703	Amphilophus_citrinellus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	85.152	Amphiprion_ocellaris
ENSRROG00000041076	MSI1	93	76.364	ENSAOCG00000009031	-	95	76.970	Amphiprion_ocellaris
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	85.152	Amphiprion_percula
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSAPEG00000006857	-	79	85.152	Amphiprion_percula
ENSRROG00000041076	MSI1	93	82.424	ENSATEG00000023779	-	93	82.424	Anabas_testudineus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.106	ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.848	Anabas_testudineus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	96.667	ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.667	Anolis_carolinensis
ENSRROG00000041076	MSI1	97	97.085	ENSANAG00000027151	MSI1	94	99.697	Aotus_nancymaae
ENSRROG00000041076	MSI1	80	90.000	ENSANAG00000027901	-	89	90.000	Aotus_nancymaae
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSACLG00000000117	-	100	84.545	Astatotilapia_calliptera
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSACLG00000011230	MSI1	94	84.545	Astatotilapia_calliptera
ENSRROG00000041076	MSI1	93	83.891	ENSAMXG00000038960	msi1	81	79.661	Astyanax_mexicanus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	99.697	Bos_taurus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSCJAG00000008578	MSI1	94	99.697	Callithrix_jacchus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.394	ENSCAFG00000010283	MSI1	94	99.394	Canis_familiaris
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSRROG00000041076	MSI1	93	93.769	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	93.769	Capra_hircus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	100.000	Cavia_aperea
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	99.697	Cavia_porcellus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSCCAG00000035567	MSI1	94	99.697	Cebus_capucinus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSCATG00000030019	MSI1	94	99.697	Cercocebus_atys
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	99.697	Chinchilla_lanigera
ENSRROG00000041076	MSI1	72	89.219	ENSCSAG00000002265	MSI1	93	89.219	Chlorocebus_sabaeus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	95.758	ENSCPBG00000011349	MSI1	94	95.758	Chrysemys_picta_bellii
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSCGRG00001018883	Msi1	94	99.697	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.848	ENSCSEG00000005834	-	94	84.848	Cynoglossus_semilaevis
ENSRROG00000041076	MSI1	93	83.636	ENSCSEG00000008352	-	94	83.636	Cynoglossus_semilaevis
ENSRROG00000041076	MSI1	93	77.273	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	77.273	Cynoglossus_semilaevis
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	85.152	Cyprinodon_variegatus
ENSRROG00000041076	MSI1	65	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	81.402	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSRROG00000041076	MSI1	82	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSRROG00000041076	MSI1	98	87.931	ENSDNOG00000005713	MSI1	96	87.931	Dasypus_novemcinctus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	Dipodomys_ordii
ENSRROG00000041076	MSI1	93	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSEASG00005004736	MSI1	94	99.697	Equus_asinus_asinus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSECAG00000017526	MSI1	94	99.697	Equus_caballus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	80.303	ENSELUG00000023280	-	100	80.000	Esox_lucius
ENSRROG00000041076	MSI1	93	79.429	ENSELUG00000023219	MSI1	92	79.429	Esox_lucius
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSFCAG00000011007	MSI1	94	99.697	Felis_catus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSFHEG00000003560	-	94	85.152	Fundulus_heteroclitus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.455	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	85.455	Fundulus_heteroclitus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	76.667	ENSGMOG00000017838	-	91	76.667	Gadus_morhua
ENSRROG00000041076	MSI1	93	82.727	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.424	Gadus_morhua
ENSRROG00000041076	MSI1	93	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	96	86.072	Gallus_gallus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	84.545	Gambusia_affinis
ENSRROG00000041076	MSI1	93	68.485	ENSGAFG00000005860	-	89	68.485	Gambusia_affinis
ENSRROG00000041076	MSI1	93	83.939	ENSGACG00000012679	MSI1	94	83.939	Gasterosteus_aculeatus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	80.909	ENSGACG00000008674	-	94	80.909	Gasterosteus_aculeatus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	95.758	ENSGAGG00000016037	MSI1	91	95.758	Gopherus_agassizii
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	84.545	Haplochromis_burtoni
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSHBUG00000011841	-	94	84.545	Haplochromis_burtoni
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.394	ENSHGLG00000012782	MSI1	94	99.394	Heterocephalus_glaber_female
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSRROG00000041076	MSI1	93	80.000	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.000	Hippocampus_comes
ENSRROG00000041076	MSI1	93	83.891	ENSHCOG00000012067	-	89	83.891	Hippocampus_comes
ENSRROG00000041076	MSI1	93	83.030	ENSIPUG00000001976	msi1	95	83.030	Ictalurus_punctatus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSRROG00000041076	MSI1	98	78.814	ENSJJAG00000010643	-	98	78.531	Jaculus_jaculus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSJJAG00000010463	Msi1	94	99.697	Jaculus_jaculus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.242	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	84.242	Kryptolebias_marmoratus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	82.727	ENSKMAG00000019877	-	100	82.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSLBEG00000001375	-	94	84.545	Labrus_bergylta
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	84.545	Labrus_bergylta
ENSRROG00000041076	MSI1	93	86.747	ENSLACG00000018287	MSI1	100	86.667	Latimeria_chalumnae
ENSRROG00000041076	MSI1	99	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	99.697	Macaca_fascicularis
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSMMUG00000031527	MSI1	91	99.697	Macaca_mulatta
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSMNEG00000040034	MSI1	94	99.697	Macaca_nemestrina
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	83.939	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	83.939	Mastacembelus_armatus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSMAMG00000018426	-	94	85.152	Mastacembelus_armatus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSMZEG00005000340	-	94	84.545	Maylandia_zebra
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.545	Maylandia_zebra
ENSRROG00000041076	MSI1	58	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSRROG00000041076	MSI1	65	99.567	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.567	Mesocricetus_auratus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.697	ENSMICG00000033181	MSI1	94	99.697	Microcebus_murinus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.394	ENSMOCG00000002286	Msi1	98	95.522	Microtus_ochrogaster
ENSRROG00000041076	MSI1	93	75.152	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	75.152	Mola_mola
ENSRROG00000041076	MSI1	93	82.067	ENSMMOG00000012265	-	96	82.067	Mola_mola
ENSRROG00000041076	MSI1	93	67.771	ENSMODG00000003189	-	100	67.771	Monodelphis_domestica
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.242	ENSMALG00000001426	-	100	84.242	Monopterus_albus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.545	Monopterus_albus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.091	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	99.091	Mus_caroli
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.091	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	99.091	Mus_musculus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	98.788	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	98.788	Mus_pahari
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.091	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	99.091	Mus_spretus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSRROG00000041076	MSI1	93	90.179	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	90.179	Myotis_lucifugus
ENSRROG00000041076	MSI1	99	98.023	ENSNGAG00000014508	Msi1	98	98.023	Nannospalax_galili
ENSRROG00000041076	MSI1	90	77.432	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.432	Neolamprologus_brichardi
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSNBRG00000000841	-	94	84.545	Neolamprologus_brichardi
ENSRROG00000041076	MSI1	93	89.634	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	Nomascus_leucogenys
ENSRROG00000041076	MSI1	93	77.744	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	77.744	Notamacropus_eugenii
ENSRROG00000041076	MSI1	89	92.063	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	Ochotona_princeps
ENSRROG00000041076	MSI1	93	100.000	ENSODEG00000006328	MSI1	100	100.000	Octodon_degus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.545	ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.545	Oreochromis_niloticus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	84.848	ENSONIG00000019452	-	94	84.848	Oreochromis_niloticus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.678	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	99.678	Oryctolagus_cuniculus
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSORLG00000019978	-	94	85.152	Oryzias_latipes
ENSRROG00000041076	MSI1	100	79.452	ENSORLG00000029593	MSI1	94	85.152	Oryzias_latipes
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSORLG00020001208	-	67	85.152	Oryzias_latipes_hni
ENSRROG00000041076	MSI1	100	79.452	ENSORLG00020008266	MSI1	99	82.121	Oryzias_latipes_hni
ENSRROG00000041076	MSI1	100	79.452	ENSORLG00015003916	MSI1	99	82.121	Oryzias_latipes_hsok
ENSRROG00000041076	MSI1	93	85.152	ENSORLG00015013672	-	71	81.515	Oryzias_latipes_hsok
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