EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSRROG00000042925 (Gene tree)
Gene ID: 104654729
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Rhinopithecus_roxellana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46399 bases
Position: chrKN299518.1:949519-995917
Accession: 104654729
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRROP00000039240	GTP_EFTU	PF00009.27	4.9e-45	1	1
ENSRROP00000039258	GTP_EFTU	PF00009.27	1.8e-33	1	1
ENSRROP00000039258	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	2.1e-12	1	1
ENSRROP00000039240	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	2.1e-12	1	1
ENSRROP00000039258	EFG_IV	PF03764.18	3.7e-23	1	1
ENSRROP00000039240	EFG_IV	PF03764.18	3.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRROT00000063717	EFTUD2-201	4199	XM_010353997	ENSRROP00000039240	972 (aa)	XP_010352299	A0A2K6RE22
ENSRROT00000063736	EFTUD2-202	2880	-	ENSRROP00000039258	959 (aa)	-	A0A2K6RDY4

Gene Model

Click here to download ENSRROG00000042925's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
rro03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSRROG00000042925's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSRROG00000042925	EFTUD2	87	39.061	ENSRROG00000019319	EEF2	98	46.364
ENSRROG00000042925	EFTUD2	56	34.074	ENSRROG00000036459	GFM2	65	34.815

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.794	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.181	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.691	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	88.683	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.477	Amphilophus_citrinellus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.284	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.078	Amphiprion_percula
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.593	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.387	Anabas_testudineus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	99	94.233	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.233	Anas_platyrhynchos
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.634	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	Anolis_carolinensis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.897	Aotus_nancymaae
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.181	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	Astatotilapia_calliptera
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.607	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	Astyanax_mexicanus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.383	Bos_taurus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.897	Callithrix_jacchus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.691	Canis_familiaris
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	Canis_lupus_dingo
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	Capra_hircus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.486	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.486	Carlito_syrichta
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.074	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	99.074	Cavia_aperea
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.074	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	Cavia_porcellus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.897	Cebus_capucinus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.897	Cercocebus_atys
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.765	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	Chinchilla_lanigera
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.897	Chlorocebus_sabaeus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	91	86.712	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	Choloepus_hoffmanni
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.560	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	Chrysemys_picta_bellii
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	99	78.004	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.897	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.383	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.770	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	Cynoglossus_semilaevis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.181	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	Cyprinodon_variegatus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	90.956	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	Danio_rerio
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.280	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.280	Dasypus_novemcinctus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.280	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	Dipodomys_ordii
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSRROG00000042925	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSRROG00000042925	EFTUD2	75	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.691	Equus_asinus_asinus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.588	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.588	Equus_caballus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	90.844	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.844	Esox_lucius
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.588	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	Felis_catus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.840	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	Ficedula_albicollis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.074	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	Fukomys_damarensis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.284	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.078	Fundulus_heteroclitus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.152	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.564	Gadus_morhua
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.942	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	Gallus_gallus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.975	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.872	Gambusia_affinis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.667	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	Gasterosteus_aculeatus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.897	Gorilla_gorilla
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.078	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	Haplochromis_burtoni
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.663	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.663	Heterocephalus_glaber_female
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.663	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	Heterocephalus_glaber_male
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	90.947	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.947	Hippocampus_comes
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.255	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	Ictalurus_punctatus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	96	99.359	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.359	Jaculus_jaculus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.667	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.461	Kryptolebias_marmoratus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	95	91.694	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	94.239	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	Latimeria_chalumnae
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.078	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.078	Lepisosteus_oculatus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.177	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	Loxodonta_africana
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.897	Macaca_fascicularis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.897	Macaca_nemestrina
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.897	Mandrillus_leucophaeus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.593	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.387	Mastacembelus_armatus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.181	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.975	Maylandia_zebra
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.947	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.947	Meleagris_gallopavo
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.383	Mesocricetus_auratus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.897	Microcebus_murinus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	92	81.685	ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	Microtus_ochrogaster
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.486	ENSMOCG00000009039	-	100	99.486	Microtus_ochrogaster
ENSRROG00000042925	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.486	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	Monodelphis_domestica
ENSRROG00000042925	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.177	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.177	Mus_caroli
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.177	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.177	Mus_musculus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.177	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.177	Mus_pahari
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.177	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.177	Mus_spretus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	97	99.470	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.470	Mustela_putorius_furo
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.691	Myotis_lucifugus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.383	Nannospalax_galili
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.078	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	Neolamprologus_brichardi
ENSRROG00000042925	EFTUD2	97	98.087	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.087	Nomascus_leucogenys
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	95.885	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.885	Notamacropus_eugenii
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.358	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSRROG00000042925	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.457	ENSODEG00000018041	-	100	98.457	Octodon_degus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.181	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.975	Oreochromis_niloticus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	Oryctolagus_cuniculus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	Oryzias_latipes_hni
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.464	Oryzias_latipes_hsok
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.634	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.634	Otolemur_garnettii
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.383	Ovis_aries
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.794	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.794	Pan_paniscus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.691	Panthera_pardus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.691	Panthera_tigris_altaica
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.794	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.794	Pan_troglodytes
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.897	Papio_anubis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	93	97.023	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.023	Pelodiscus_sinensis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	84.465	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.362	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.383	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.588	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.588	Phascolarctos_cinereus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.975	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.872	Poecilia_formosa
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.975	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.872	Poecilia_latipinna
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.975	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.872	Poecilia_mexicana
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.457	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.457	Pongo_abelii
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	95.576	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	Procavia_capensis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.794	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.794	Propithecus_coquereli
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	94.753	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.753	Pteropus_vampyrus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.078	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.872	Pundamilia_nyererei
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.872	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	Pygocentrus_nattereri
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.177	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	Rattus_norvegicus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	100.000	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSRROG00000042925	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.202	Saccharomyces_cerevisiae
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.897	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	97	99.574	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.574	Sarcophilus_harrisii
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.564	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.564	Scleropages_formosus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.975	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.770	Scophthalmus_maximus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.284	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	Seriola_dumerili
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.387	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.181	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.049	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	Sorex_araneus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.531	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	Sphenodon_punctatus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.387	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.181	Stegastes_partitus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.486	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	Sus_scrofa
ENSRROG00000042925	EFTUD2	84	97.202	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	Taeniopygia_guttata
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.358	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	Takifugu_rubripes
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	86.885	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	Tetraodon_nigroviridis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	94.239	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.239	Tupaia_belangeri
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.563	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	Ursus_americanus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.691	Ursus_maritimus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.691	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.691	Vulpes_vulpes
ENSRROG00000042925	EFTUD2	97	94.776	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.756	Xenopus_tropicalis
ENSRROG00000042925	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.975	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	Xiphophorus_maculatus