EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000000426 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: LRPPRC
Alias: -
Full Name: leucine rich pentatricopeptide repeat containing
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 53250 bases
Position: chrGeneScaffold_3416:3104-56353
Accession: 15714
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000000394	PPR	PF01535.20	3.2e-33	1	6
ENSSARP00000000394	PPR	PF01535.20	3.2e-33	2	6
ENSSARP00000000394	PPR	PF01535.20	3.2e-33	3	6
ENSSARP00000000394	PPR	PF01535.20	3.2e-33	4	6
ENSSARP00000000394	PPR	PF01535.20	3.2e-33	5	6
ENSSARP00000000394	PPR	PF01535.20	3.2e-33	6	6

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000000435	LRPPRC-201	3525	-	ENSSARP00000000394	1175 (aa)	-	UPI0001580D2D

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000000426's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000000426's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.147	ENSAPOG00000016610	lrpprc	90	49.147	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	71.087	ENSAMEG00000005852	LRPPRC	92	69.430	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.501	ENSACIG00000009604	lrpprc	85	49.501	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.271	ENSAOCG00000005886	lrpprc	90	49.271	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000000426	LRPPRC	90	63.852	ENSAPEG00000002937	lrpprc	83	63.852	Amphiprion_percula
ENSSARG00000000426	LRPPRC	85	61.680	ENSATEG00000010555	lrpprc	81	61.680	Anabas_testudineus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	58.626	ENSACAG00000029278	LRPPRC	87	58.626	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	69.187	ENSANAG00000027440	LRPPRC	87	69.187	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000000426	LRPPRC	95	51.033	ENSACLG00000023712	lrpprc	85	51.033	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	68.940	ENSCJAG00000000794	LRPPRC	87	68.940	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	95	81.053	ENSCHIG00000020173	LRPPRC	89	81.053	Capra_hircus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	56.496	ENSCAPG00000013631	LRPPRC	89	56.496	Cavia_aperea
ENSSARG00000000426	LRPPRC	94	69.790	ENSCPOG00000000204	LRPPRC	95	69.790	Cavia_porcellus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	68.946	ENSCCAG00000031900	LRPPRC	87	68.946	Cebus_capucinus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	69.408	ENSCATG00000014187	LRPPRC	87	69.408	Cercocebus_atys
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	69.719	ENSCLAG00000005203	LRPPRC	87	69.719	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	69.597	ENSCSAG00000013233	LRPPRC	87	69.597	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	85	69.777	ENSCHOG00000003631	LRPPRC	71	69.777	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000000426	LRPPRC	91	79.646	ENSCANG00000034961	LRPPRC	81	79.646	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	66.639	ENSCGRG00001016261	Lrpprc	87	66.639	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	66.639	ENSCGRG00000004072	Lrpprc	87	66.639	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	42.964	ENSCSEG00000003850	lrpprc	86	42.964	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.616	ENSCVAG00000012967	lrpprc	86	48.616	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	47.130	ENSDARG00000043970	lrpprc	89	47.130	Danio_rerio
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	69.383	ENSDNOG00000012594	-	87	69.383	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	84	52.381	ENSDNOG00000032336	-	89	52.381	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	70.758	ENSDORG00000012233	Lrpprc	87	70.758	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	69.053	ENSETEG00000006657	LRPPRC	91	69.053	Echinops_telfairi
ENSSARG00000000426	LRPPRC	81	69.118	ENSEEUG00000012340	LRPPRC	74	69.118	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	90	60.290	ENSELUG00000012803	lrpprc	81	60.290	Esox_lucius
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	72.323	ENSFCAG00000013468	LRPPRC	91	72.323	Felis_catus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	52.693	ENSFALG00000012738	LRPPRC	90	52.693	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	67.519	ENSFDAG00000015328	LRPPRC	86	67.519	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.532	ENSFHEG00000019604	lrpprc	90	48.532	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	46.097	ENSGMOG00000008337	lrpprc	92	46.097	Gadus_morhua
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.307	ENSGAFG00000001455	lrpprc	90	49.307	Gambusia_affinis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.214	ENSGACG00000010679	lrpprc	96	48.214	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.715	ENSHBUG00000000393	lrpprc	88	49.715	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	68.673	ENSHGLG00000006123	LRPPRC	87	68.755	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000000426	LRPPRC	62	67.273	ENSHGLG00100005960	-	92	67.403	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.389	ENSHCOG00000002107	lrpprc	88	49.389	Hippocampus_comes
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.151	ENSIPUG00000009406	lrpprc	89	48.910	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	70.864	ENSSTOG00000011185	LRPPRC	87	70.864	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	69.415	ENSJJAG00000020475	Lrpprc	87	69.415	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	45.069	ENSKMAG00000003287	lrpprc	77	45.069	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	93	58.961	ENSLBEG00000023225	lrpprc	81	58.961	Labrus_bergylta
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	56.737	ENSLACG00000014030	LRPPRC	91	56.656	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	55.502	ENSLOCG00000016390	lrpprc	87	55.502	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	66.914	ENSLAFG00000008614	LRPPRC	87	66.914	Loxodonta_africana
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	69.243	ENSMFAG00000041560	LRPPRC	84	69.573	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	69.161	ENSMMUG00000019841	LRPPRC	93	69.161	Macaca_mulatta
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	69.490	ENSMNEG00000031613	LRPPRC	87	69.490	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000000426	LRPPRC	95	49.528	ENSMAMG00000021835	lrpprc	84	49.528	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.797	ENSMZEG00005027379	lrpprc	89	49.797	Maylandia_zebra
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	67.133	ENSMAUG00000012118	Lrpprc	90	66.310	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	71.276	ENSMICG00000010486	LRPPRC	91	71.276	Microcebus_murinus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	69.110	ENSMOCG00000006048	Lrpprc	87	69.110	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.873	ENSMMOG00000007830	lrpprc	89	49.873	Mola_mola
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	61.161	ENSMODG00000000648	LRPPRC	95	61.161	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.160	ENSMALG00000001271	lrpprc	85	48.160	Monopterus_albus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	71.053	ENSMPUG00000011800	LRPPRC	90	74.419	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	72.360	ENSMLUG00000010575	LRPPRC	87	72.360	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	68.204	ENSNGAG00000013069	Lrpprc	87	68.204	Nannospalax_galili
ENSSARG00000000426	LRPPRC	90	58.639	ENSNBRG00000013202	lrpprc	86	58.639	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	68.920	ENSNLEG00000016782	LRPPRC	87	68.920	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000000426	LRPPRC	84	80.269	ENSOPRG00000016774	LRPPRC	74	80.269	Ochotona_princeps
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	69.662	ENSODEG00000011211	LRPPRC	87	69.662	Octodon_degus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.552	ENSONIG00000000917	lrpprc	91	49.510	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	61	56.714	ENSOANG00000014670	-	99	56.714	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	71.829	ENSOCUG00000015046	LRPPRC	83	71.829	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	95	49.615	ENSORLG00000004605	lrpprc	85	48.946	Oryzias_latipes
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.653	ENSORLG00020012536	lrpprc	95	48.093	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000000426	LRPPRC	88	59.843	ENSORLG00015018270	lrpprc	83	59.843	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	68.616	ENSOGAG00000012798	LRPPRC	87	68.616	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	72.900	ENSOARG00000006522	LRPPRC	91	72.900	Ovis_aries
ENSSARG00000000426	LRPPRC	95	69.132	ENSPPAG00000040876	LRPPRC	84	69.218	Pan_paniscus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	71.911	ENSPPRG00000006578	LRPPRC	87	71.911	Panthera_pardus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	72.076	ENSPTIG00000000933	LRPPRC	87	72.076	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	68.482	ENSPTRG00000011880	LRPPRC	87	68.482	Pan_troglodytes
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	68.997	ENSPANG00000020731	LRPPRC	83	68.997	Papio_anubis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	89	59.530	ENSPKIG00000022232	lrpprc	98	46.404	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000000426	LRPPRC	64	58.376	ENSPSIG00000006830	-	91	58.608	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	61	44.754	ENSPMGG00000016597	lrpprc	82	44.754	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	43.009	ENSPMAG00000002147	lrpprc	92	43.009	Petromyzon_marinus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.611	ENSPFOG00000011227	lrpprc	92	48.938	Poecilia_formosa
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.284	ENSPLAG00000004018	lrpprc	90	48.651	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.856	ENSPMEG00000016425	lrpprc	90	49.141	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.856	ENSPREG00000003662	lrpprc	86	49.141	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000000426	LRPPRC	60	65.765	ENSPPYG00000029532	-	92	65.765	Pongo_abelii
ENSSARG00000000426	LRPPRC	78	78.684	ENSPCAG00000001430	LRPPRC	67	78.684	Procavia_capensis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	73.619	ENSPVAG00000002007	LRPPRC	87	73.619	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	95	50.303	ENSPNYG00000000756	lrpprc	83	50.303	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	51.292	ENSPNAG00000002895	lrpprc	86	51.009	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	68.616	ENSRNOG00000005877	Lrpprc	87	68.616	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	95	70.282	ENSRBIG00000031552	LRPPRC	83	70.282	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	69.909	ENSSBOG00000011807	LRPPRC	87	69.909	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	58.852	ENSSHAG00000018725	LRPPRC	90	58.852	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.237	ENSSFOG00015001042	lrpprc	90	49.237	Scleropages_formosus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.941	ENSSDUG00000019062	lrpprc	89	48.941	Seriola_dumerili
ENSSARG00000000426	LRPPRC	95	46.208	ENSSLDG00000023028	lrpprc	86	44.949	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	46.030	ENSSPAG00000000162	lrpprc	90	46.030	Stegastes_partitus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	100	72.795	ENSSSCG00000008452	LRPPRC	87	72.795	Sus_scrofa
ENSSARG00000000426	LRPPRC	95	53.879	ENSTGUG00000003759	LRPPRC	88	53.879	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000000426	LRPPRC	95	50.384	ENSTRUG00000008409	lrpprc	87	50.384	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	48.251	ENSTNIG00000007470	lrpprc	95	48.251	Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	70.520	ENSTTRG00000006403	LRPPRC	87	70.520	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	92	82.647	ENSVPAG00000008993	LRPPRC	80	82.647	Vicugna_pacos
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	55.510	ENSXETG00000009296	lrpprc	93	55.673	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000000426	LRPPRC	90	56.430	ENSXCOG00000013343	lrpprc	78	56.430	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000000426	LRPPRC	99	49.307	ENSXMAG00000018108	lrpprc	90	49.307	Xiphophorus_maculatus