EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000000762 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: CNOT1
Alias: AD-005|CDC39|KIAA1007|NOT1|NOT1H
Full Name: CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 81923 bases
Position: chrGeneScaffold_2606:14036-95958
Accession: 7877
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000000725	Not1	PF04054.15	1.7e-120	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000000791	CNOT1-201	6810	-	ENSSARP00000000725	2270 (aa)	-	UPI0001581869

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000000762's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000000762's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSG00000125107	CNOT1	100	99.281	Homo_sapiens
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSAPOG00000005042	cnot1	86	97.800	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSAMEG00000017298	CNOT1	84	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000000762	CNOT1	79	95.745	ENSACIG00000016003	cnot1	84	95.745	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSAPEG00000022342	cnot1	84	97.800	Amphiprion_percula
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSATEG00000012892	cnot1	86	97.800	Anabas_testudineus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSAPLG00000007162	CNOT1	84	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000000762	CNOT1	81	100.000	ENSACAG00000001602	CNOT1	84	100.000	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSANAG00000038198	CNOT1	85	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSACLG00000014234	cnot1	86	97.800	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSAMXG00000013170	cnot1	84	97.400	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSBTAG00000020782	CNOT1	86	100.000	Bos_taurus
ENSSARG00000000762	CNOT1	64	58.586	WBGene00002845	let-711	65	52.695	Caenorhabditis_elegans
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCJAG00000011318	CNOT1	84	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCAFG00000008426	CNOT1	84	100.000	Canis_familiaris
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCAFG00020010156	CNOT1	86	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCHIG00000010452	CNOT1	84	100.000	Capra_hircus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSTSYG00000006888	CNOT1	85	100.000	Carlito_syrichta
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCPOG00000013026	CNOT1	85	100.000	Cavia_porcellus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCCAG00000026333	CNOT1	85	100.000	Cebus_capucinus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCATG00000032625	CNOT1	85	100.000	Cercocebus_atys
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCLAG00000006289	CNOT1	84	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCSAG00000004731	CNOT1	84	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000000762	CNOT1	67	100.000	ENSCHOG00000009712	CNOT1	65	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000000762	CNOT1	87	100.000	ENSCPBG00000026222	CNOT1	86	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	81.437	ENSCING00000009149	-	83	81.437	Ciona_intestinalis
ENSSARG00000000762	CNOT1	81	79.772	ENSCSAVG00000002414	-	86	79.772	Ciona_savignyi
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCANG00000040534	CNOT1	85	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCGRG00001016365	Cnot1	85	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSCGRG00000001714	Cnot1	85	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSCVAG00000018930	cnot1	86	97.400	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.000	ENSDARG00000004174	cnot1	84	97.000	Danio_rerio
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSDNOG00000013250	CNOT1	84	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000000762	CNOT1	83	64.887	FBgn0085436	Not1	77	64.887	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000000762	CNOT1	74	96.800	ENSETEG00000012806	CNOT1	71	96.800	Echinops_telfairi
ENSSARG00000000762	CNOT1	74	82.000	ENSEBUG00000011534	cnot1	85	82.000	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSEASG00005005819	CNOT1	86	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSECAG00000009889	CNOT1	86	100.000	Equus_caballus
ENSSARG00000000762	CNOT1	77	99.600	ENSEEUG00000006015	CNOT1	73	99.600	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	95.745	ENSELUG00000014085	cnot1	83	95.745	Esox_lucius
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSFCAG00000025155	CNOT1	84	100.000	Felis_catus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSFALG00000007285	CNOT1	84	100.000	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSFDAG00000013399	CNOT1	85	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	96.600	ENSFHEG00000020574	cnot1	84	96.600	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000000762	CNOT1	81	97.688	ENSGMOG00000012864	cnot1	85	97.688	Gadus_morhua
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSGALG00000002301	CNOT1	84	100.000	Gallus_gallus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSGAFG00000015005	cnot1	83	97.400	Gambusia_affinis
ENSSARG00000000762	CNOT1	81	97.695	ENSGACG00000002606	cnot1	78	97.695	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSGAGG00000022646	CNOT1	84	100.000	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSGGOG00000009547	CNOT1	84	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSHBUG00000001729	cnot1	86	97.800	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSHGLG00000014322	CNOT1	85	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	96.806	ENSHCOG00000006501	cnot1	77	96.806	Hippocampus_comes
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	95.266	ENSIPUG00000011915	cnot1	83	95.266	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSSTOG00000005490	CNOT1	85	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSJJAG00000000633	Cnot1	85	100.000	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.600	ENSKMAG00000006149	cnot1	84	97.600	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000000762	CNOT1	85	95.833	ENSLBEG00000004740	cnot1	86	95.833	Labrus_bergylta
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	99.400	ENSLACG00000010869	CNOT1	84	99.400	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	98.000	ENSLOCG00000006324	cnot1	84	98.000	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSLAFG00000000098	CNOT1	84	100.000	Loxodonta_africana
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMFAG00000035888	CNOT1	85	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMMUG00000014625	CNOT1	94	100.000	Macaca_mulatta
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMNEG00000031820	CNOT1	85	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMLEG00000040933	CNOT1	85	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	95.745	ENSMAMG00000016524	cnot1	83	95.745	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSMZEG00005016210	cnot1	86	97.800	Maylandia_zebra
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMGAG00000001908	CNOT1	84	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMICG00000007071	CNOT1	85	100.000	Microcebus_murinus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMOCG00000017969	Cnot1	85	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	95.745	ENSMMOG00000019134	cnot1	86	95.745	Mola_mola
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMODG00000014199	CNOT1	84	100.000	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSMALG00000008645	cnot1	84	97.800	Monopterus_albus
ENSSARG00000000762	CNOT1	80	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0031430	Cnot1	76	100.000	Mus_caroli
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMUSG00000036550	Cnot1	85	100.000	Mus_musculus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	MGP_PahariEiJ_G0023028	Cnot1	85	100.000	Mus_pahari
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0032549	Cnot1	85	100.000	Mus_spretus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMPUG00000004830	CNOT1	84	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSMLUG00000003728	CNOT1	84	100.000	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSNGAG00000018628	Cnot1	85	100.000	Nannospalax_galili
ENSSARG00000000762	CNOT1	84	97.800	ENSNBRG00000019358	cnot1	86	97.800	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSNLEG00000003566	CNOT1	85	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000000762	CNOT1	75	100.000	ENSMEUG00000006145	CNOT1	73	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000000762	CNOT1	73	100.000	ENSOPRG00000005604	CNOT1	69	100.000	Ochotona_princeps
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSODEG00000016337	CNOT1	85	100.000	Octodon_degus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSONIG00000007358	cnot1	77	97.800	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000000762	CNOT1	81	100.000	ENSOANG00000012109	CNOT1	85	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSOCUG00000006911	CNOT1	84	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSORLG00000013734	cnot1	84	97.400	Oryzias_latipes
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSORLG00020017012	cnot1	85	97.400	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSORLG00015007091	cnot1	85	97.400	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSOMEG00000015124	cnot1	85	97.400	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSOGAG00000000543	CNOT1	84	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSOARG00000001567	CNOT1	84	100.000	Ovis_aries
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSPPAG00000022013	CNOT1	85	100.000	Pan_paniscus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSPPRG00000004867	CNOT1	84	100.000	Panthera_pardus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSPTIG00000012589	CNOT1	84	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSPTRG00000008183	CNOT1	85	100.000	Pan_troglodytes
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSPANG00000020901	CNOT1	85	100.000	Papio_anubis
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.600	ENSPKIG00000023538	CNOT1	84	97.600	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	94.400	ENSPKIG00000002914	CNOT1	86	94.400	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSPSIG00000005499	CNOT1	84	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	89.800	ENSPMAG00000009381	cnot1	84	89.800	Petromyzon_marinus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSPCIG00000007343	CNOT1	86	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSPFOG00000003497	cnot1	78	97.400	Poecilia_formosa
ENSSARG00000000762	CNOT1	85	95.745	ENSPLAG00000014018	cnot1	86	95.745	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000000762	CNOT1	85	95.745	ENSPMEG00000005868	cnot1	86	95.745	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000000762	CNOT1	85	95.745	ENSPREG00000018793	cnot1	86	95.745	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSPPYG00000007410	CNOT1	84	100.000	Pongo_abelii
ENSSARG00000000762	CNOT1	76	100.000	ENSPCAG00000003241	CNOT1	73	100.000	Procavia_capensis
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSPCOG00000027139	CNOT1	85	100.000	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSPVAG00000004243	CNOT1	84	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSPNYG00000012919	cnot1	86	97.800	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSPNAG00000000246	cnot1	84	97.400	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSRNOG00000012271	Cnot1	84	100.000	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSRBIG00000044598	CNOT1	85	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSRROG00000000906	CNOT1	85	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSSBOG00000029155	CNOT1	85	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSSHAG00000012187	CNOT1	84	100.000	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSSFOG00015017614	cnot1	85	97.800	Scleropages_formosus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSSMAG00000013844	cnot1	86	97.800	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.600	ENSSDUG00000021491	cnot1	86	97.600	Seriola_dumerili
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.600	ENSSLDG00000014816	cnot1	86	97.600	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.800	ENSSPAG00000018802	cnot1	84	97.800	Stegastes_partitus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSSSCG00000002799	CNOT1	86	100.000	Sus_scrofa
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSTGUG00000005919	CNOT1	84	100.000	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000000762	CNOT1	65	100.000	ENSTBEG00000000720	CNOT1	62	100.000	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000000762	CNOT1	82	100.000	ENSTTRG00000008460	CNOT1	79	100.000	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSUAMG00000009251	CNOT1	84	100.000	Ursus_americanus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSUMAG00000021291	CNOT1	84	100.000	Ursus_maritimus
ENSSARG00000000762	CNOT1	82	100.000	ENSVPAG00000008846	CNOT1	78	100.000	Vicugna_pacos
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSVVUG00000024037	CNOT1	86	100.000	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	100.000	ENSXETG00000015900	cnot1	84	100.000	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSXCOG00000013552	cnot1	83	97.400	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000000762	CNOT1	88	97.400	ENSXMAG00000006031	cnot1	83	97.400	Xiphophorus_maculatus