EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000001994 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: CPEB3
Alias: KIAA0940
Full Name: cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 115108 bases
Position: chrGeneScaffold_2329:283473-398580
Accession: 21746
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000001805	RRM_1	PF00076.22	1.3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000001986	CPEB3-201	1092	-	ENSSARP00000001805	363 (aa)	-	UPI00015829F1

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000001994's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000001994's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSG00000107864	CPEB3	52	99.725	Homo_sapiens
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.172	ENSAPOG00000003625	cpeb3	55	88.172	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.263	ENSAMEG00000014204	CPEB3	58	95.263	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	86.842	ENSACIG00000001933	cpeb3	56	86.842	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	86.316	ENSAOCG00000015423	cpeb3	56	86.316	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	84.140	ENSATEG00000010649	cpeb3	54	84.140	Anabas_testudineus
ENSSARG00000001994	CPEB3	83	89.180	ENSAPLG00000014437	CPEB4	99	89.180	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	94.474	ENSACAG00000006335	CPEB3	56	94.474	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSANAG00000037406	CPEB3	52	99.725	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	86.842	ENSACLG00000018590	cpeb3	50	86.842	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	100.000	ENSBTAG00000015450	CPEB3	93	97.000	Bos_taurus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	97.043	ENSCJAG00000008495	CPEB3	53	97.043	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	91.129	ENSCAFG00000007423	CPEB3	51	91.129	Canis_familiaris
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.515	ENSCAFG00020001981	CPEB3	91	96.358	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	100.000	ENSCHIG00000017337	CPEB3	52	100.000	Capra_hircus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSTSYG00000003928	CPEB3	52	99.725	Carlito_syrichta
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSCCAG00000033267	CPEB3	52	99.725	Cebus_capucinus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.000	ENSCATG00000038447	CPEB3	53	95.000	Cercocebus_atys
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	97.043	ENSCLAG00000011817	CPEB3	76	97.043	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	90.860	ENSCSAG00000006579	CPEB3	51	90.860	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	90.358	ENSCHOG00000000272	-	100	90.358	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	96.505	ENSCPBG00000023779	CPEB3	56	96.505	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.000	ENSCANG00000040306	CPEB3	53	95.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.449	ENSCGRG00001003846	Cpeb3	52	99.449	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	96.774	ENSCGRG00000002839	Cpeb3	90	96.774	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	84.022	ENSCSEG00000008423	cpeb3	56	84.022	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	83.947	ENSCVAG00000005998	cpeb3	58	83.947	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	81.316	ENSDARG00000060103	cpeb3	61	81.316	Danio_rerio
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	92.896	ENSDNOG00000048639	CPEB3	52	92.896	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.000	ENSDORG00000028940	Cpeb3	53	95.000	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	90.909	ENSETEG00000000111	CPEB3	52	90.909	Echinops_telfairi
ENSSARG00000001994	CPEB3	99	78.125	ENSEBUG00000010745	cpeb3	50	78.125	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	97.312	ENSEASG00005011095	CPEB3	53	97.312	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	97.312	ENSECAG00000000077	CPEB3	53	97.312	Equus_caballus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.710	ENSELUG00000019251	cpeb3	57	88.710	Esox_lucius
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.263	ENSFCAG00000032380	CPEB3	53	95.263	Felis_catus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSFDAG00000016459	CPEB3	53	99.725	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	86.290	ENSFHEG00000021371	cpeb3	56	86.290	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000001994	CPEB3	79	84.918	ENSGMOG00000008307	cpeb3	51	84.918	Gadus_morhua
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	96.505	ENSGALG00000006912	CPEB3	55	96.505	Gallus_gallus
ENSSARG00000001994	CPEB3	99	85.942	ENSGACG00000002944	cpeb3	55	85.942	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	96.505	ENSGAGG00000008528	CPEB3	56	96.505	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	97.043	ENSGGOG00000016441	CPEB3	53	97.043	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.710	ENSHBUG00000004097	cpeb3	52	86.842	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSHGLG00000014022	CPEB3	52	99.725	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSHGLG00100005200	CPEB3	54	99.725	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	87.634	ENSHCOG00000005747	cpeb3	57	87.634	Hippocampus_comes
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.679	ENSIPUG00000018571	cpeb3	57	86.807	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSSTOG00000028061	CPEB3	53	99.725	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	97.043	ENSJJAG00000009135	Cpeb3	90	97.043	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.441	ENSLBEG00000025961	cpeb3	56	88.441	Labrus_bergylta
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	87.895	ENSLACG00000011307	CPEB3	52	87.895	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	86.579	ENSLOCG00000007131	cpeb3	58	86.579	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.263	ENSLAFG00000018716	CPEB3	74	89.211	Loxodonta_africana
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSMFAG00000025613	CPEB3	54	99.725	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.000	ENSMMUG00000015050	CPEB3	53	95.000	Macaca_mulatta
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.000	ENSMNEG00000045465	CPEB3	53	95.000	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSMLEG00000031794	CPEB3	61	99.725	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.710	ENSMAMG00000012794	cpeb3	55	88.710	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.710	ENSMZEG00005012068	cpeb3	56	86.842	Maylandia_zebra
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.684	ENSMGAG00000009148	CPEB3	54	88.684	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.000	ENSMAUG00000002789	Cpeb3	53	95.000	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	96.774	ENSMICG00000026866	CPEB3	52	96.774	Microcebus_murinus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSMOCG00000016486	Cpeb3	52	99.725	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.684	ENSMODG00000006673	CPEB3	50	88.684	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	91.185	ENSMALG00000009305	cpeb3	90	92.053	Monopterus_albus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	MGP_CAROLIEiJ_G0022910	Cpeb3	90	97.043	Mus_caroli
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSMUSG00000039652	Cpeb3	90	97.043	Mus_musculus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	MGP_PahariEiJ_G0014405	Cpeb3	90	97.043	Mus_pahari
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	MGP_SPRETEiJ_G0023829	Cpeb3	90	97.043	Mus_spretus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	89.211	ENSMPUG00000017227	CPEB3	52	89.211	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	96.774	ENSNGAG00000015621	Cpeb3	53	96.774	Nannospalax_galili
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	82.804	ENSNBRG00000018343	cpeb3	50	82.804	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.000	ENSNLEG00000012600	CPEB3	53	95.000	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	93.113	ENSMEUG00000009948	-	52	93.113	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSODEG00000004591	CPEB3	51	99.725	Octodon_degus
ENSSARG00000001994	CPEB3	86	93.333	ENSOANG00000015723	-	100	93.333	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.000	ENSOCUG00000010454	CPEB3	53	95.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	81.818	ENSORLG00000000726	cpeb3	56	81.818	Oryzias_latipes
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	82.796	ENSORLG00020004475	cpeb3	56	82.796	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	86.364	ENSORLG00015011683	cpeb3	58	86.364	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	81.720	ENSOMEG00000018265	cpeb3	52	81.720	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	90.323	ENSOGAG00000002002	CPEB3	51	90.323	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	91.129	ENSOARG00000016671	CPEB3	51	91.129	Ovis_aries
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.449	ENSPPAG00000031528	CPEB3	61	99.449	Pan_paniscus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	91.129	ENSPPRG00000015654	CPEB3	51	91.129	Panthera_pardus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	100.000	ENSPTIG00000012018	CPEB3	99	97.973	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSPTRG00000002753	CPEB3	52	99.725	Pan_troglodytes
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.725	ENSPANG00000021561	CPEB3	52	99.725	Papio_anubis
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.710	ENSPKIG00000015878	cpeb3	55	88.710	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	81.720	ENSPMGG00000022722	cpeb3	58	81.720	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.000	ENSPEMG00000008448	Cpeb3	53	95.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	96.505	ENSPCIG00000017302	CPEB3	51	96.505	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	80.526	ENSPFOG00000011231	cpeb3	58	80.526	Poecilia_formosa
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	86.828	ENSPLAG00000002852	cpeb3	56	86.828	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	86.559	ENSPMEG00000021572	cpeb3	56	86.559	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	86.559	ENSPREG00000003085	cpeb3	56	86.559	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	93.113	ENSPCAG00000012417	CPEB3	51	93.113	Procavia_capensis
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	94.737	ENSPCOG00000023690	CPEB3	53	94.737	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	99.449	ENSPVAG00000007664	CPEB3	52	99.449	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.710	ENSPNYG00000005300	cpeb3	56	86.842	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.140	ENSPNAG00000012111	cpeb3	56	86.280	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.000	ENSRBIG00000041079	CPEB3	53	95.000	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	97.043	ENSRROG00000031558	CPEB3	53	97.043	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	90.358	ENSSBOG00000035843	CPEB3	83	90.054	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000001994	CPEB3	60	98.174	ENSSHAG00000018596	-	96	98.174	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	77.596	ENSSFOG00015018275	-	85	77.596	Scleropages_formosus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	83.602	ENSSFOG00015004974	cpeb3	54	83.602	Scleropages_formosus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.978	ENSSMAG00000013924	cpeb3	55	88.978	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	84.140	ENSSDUG00000019766	cpeb3	53	84.140	Seriola_dumerili
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.710	ENSSLDG00000021438	cpeb3	54	88.710	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000001994	CPEB3	83	95.695	ENSSPUG00000003601	CPEB3	94	98.174	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	88.710	ENSSPAG00000004725	cpeb3	54	88.710	Stegastes_partitus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	97.312	ENSSSCG00000010468	CPEB3	52	97.312	Sus_scrofa
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	94.474	ENSTGUG00000008988	CPEB3	56	94.474	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000001994	CPEB3	61	91.855	ENSTRUG00000011309	cpeb3	88	91.855	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	92.287	ENSTBEG00000013125	-	52	92.287	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.317	ENSTTRG00000012334	CPEB3	51	95.317	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	95.515	ENSUAMG00000010827	CPEB3	85	94.783	Ursus_americanus
ENSSARG00000001994	CPEB3	88	92.212	ENSUMAG00000001870	-	97	99.301	Ursus_maritimus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	91.129	ENSVVUG00000021375	CPEB3	51	91.129	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	86.579	ENSXETG00000012190	cpeb3	56	86.579	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	82.258	ENSXCOG00000006122	cpeb3	56	82.258	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000001994	CPEB3	100	87.879	ENSXMAG00000007652	cpeb3	98	88.217	Xiphophorus_maculatus