EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000002306 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MTRF1
Alias: MGC47721|MTTRF1|RF1
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 31611 bases
Position: chrGeneScaffold_5180:53341-84951
Accession: 101549353
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000002087	RF-1	PF00472.20	5.3e-34	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000002303	MTRF1-201	1320	XM_004604597	ENSSARP00000002087	439 (aa)	XP_004604654	UPI0001582AA9

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSARG00000002306	MTRF1	66	49.320	ENSSARG00000011089	MTRF1L	99	49.320

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.247	ENSG00000120662	MTRF1	100	82.247	Homo_sapiens
ENSSARG00000002306	MTRF1	77	57.471	ENSAPOG00000010181	mtrf1	86	57.471	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	83.146	ENSAMEG00000008696	MTRF1	100	83.146	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000002306	MTRF1	54	64.854	ENSACIG00000001495	mtrf1	96	64.854	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000002306	MTRF1	87	55.670	ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	55.670	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000002306	MTRF1	87	55.155	ENSAPEG00000014844	mtrf1	87	55.155	Amphiprion_percula
ENSSARG00000002306	MTRF1	79	57.550	ENSATEG00000017403	mtrf1	84	57.550	Anabas_testudineus
ENSSARG00000002306	MTRF1	99	61.239	ENSAPLG00000009317	MTRF1	99	61.239	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000002306	MTRF1	87	65.464	ENSACAG00000000897	MTRF1	88	65.464	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000002306	MTRF1	82	80.165	ENSANAG00000025310	-	97	80.165	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	73.826	ENSANAG00000023063	-	100	73.826	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000002306	MTRF1	87	56.298	ENSACLG00000023945	mtrf1	86	56.298	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000002306	MTRF1	52	66.234	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	66.234	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000002306	MTRF1	99	83.333	ENSBTAG00000012260	MTRF1	99	83.333	Bos_taurus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	79.372	ENSCJAG00000017739	MTRF1	100	83.908	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	80.942	ENSCAFG00000004795	MTRF1	100	80.942	Canis_familiaris
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	80.942	ENSCAFG00020018178	MTRF1	100	80.942	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	81.839	ENSCHIG00000011810	MTRF1	100	81.839	Capra_hircus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	80.717	ENSTSYG00000006976	MTRF1	100	80.717	Carlito_syrichta
ENSSARG00000002306	MTRF1	97	79.630	ENSCAPG00000013163	MTRF1	100	79.630	Cavia_aperea
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	78.924	ENSCPOG00000005264	MTRF1	100	78.924	Cavia_porcellus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	79.821	ENSCCAG00000035116	MTRF1	100	79.821	Cebus_capucinus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.247	ENSCATG00000009909	MTRF1	100	82.247	Cercocebus_atys
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	79.821	ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	79.821	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.022	ENSCSAG00000017835	MTRF1	100	82.022	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000002306	MTRF1	92	73.839	ENSCHOG00000011915	-	100	73.839	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000002306	MTRF1	99	64.865	ENSCPBG00000007969	MTRF1	99	64.865	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.247	ENSCANG00000040353	MTRF1	100	82.247	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	75.785	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	100	75.785	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	75.785	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	100	75.785	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000002306	MTRF1	86	54.830	ENSCSEG00000005667	mtrf1	86	54.830	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000002306	MTRF1	88	53.149	ENSCVAG00000021729	mtrf1	91	53.149	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000002306	MTRF1	53	58.120	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	58.120	Danio_rerio
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	80.804	ENSDNOG00000034196	MTRF1	100	87.097	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000002306	MTRF1	99	79.775	ENSDORG00000016429	Mtrf1	100	79.775	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	76.906	ENSETEG00000014811	MTRF1	100	76.906	Echinops_telfairi
ENSSARG00000002306	MTRF1	53	54.701	ENSEBUG00000000778	mtrf1	96	54.701	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	83.184	ENSEASG00005015715	MTRF1	100	83.184	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.287	ENSECAG00000014389	MTRF1	97	82.287	Equus_caballus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	64.430	ENSEEUG00000004450	-	100	64.877	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000002306	MTRF1	86	52.756	ENSELUG00000006544	mtrf1	88	52.756	Esox_lucius
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	81.390	ENSFCAG00000031635	MTRF1	100	81.390	Felis_catus
ENSSARG00000002306	MTRF1	88	65.296	ENSFALG00000008036	MTRF1	96	65.296	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	77.803	ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	77.803	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000002306	MTRF1	90	49.635	ENSFHEG00000019043	mtrf1	94	49.635	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000002306	MTRF1	83	51.351	ENSGMOG00000008608	mtrf1	97	51.351	Gadus_morhua
ENSSARG00000002306	MTRF1	87	68.490	ENSGALG00000016951	MTRF1	84	68.490	Gallus_gallus
ENSSARG00000002306	MTRF1	90	51.843	ENSGAFG00000007093	mtrf1	92	51.843	Gambusia_affinis
ENSSARG00000002306	MTRF1	83	55.435	ENSGACG00000013728	mtrf1	96	55.435	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000002306	MTRF1	70	74.598	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	74.598	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.022	ENSGGOG00000002529	MTRF1	100	82.022	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	79.596	ENSHGLG00000003210	MTRF1	100	79.596	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	79.821	ENSHGLG00100011843	MTRF1	100	79.821	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000002306	MTRF1	85	54.933	ENSHCOG00000009449	mtrf1	85	54.933	Hippocampus_comes
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	80.045	ENSSTOG00000021682	MTRF1	100	80.045	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	76.906	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	100	76.906	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000002306	MTRF1	86	54.545	ENSKMAG00000003231	mtrf1	85	54.545	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000002306	MTRF1	52	65.948	ENSLBEG00000027169	-	93	65.948	Labrus_bergylta
ENSSARG00000002306	MTRF1	52	65.948	ENSLBEG00000023151	mtrf1	93	65.948	Labrus_bergylta
ENSSARG00000002306	MTRF1	87	63.520	ENSLACG00000010582	MTRF1	88	63.520	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000002306	MTRF1	89	55.330	ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	55.330	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	80.045	ENSLAFG00000022177	-	100	80.045	Loxodonta_africana
ENSSARG00000002306	MTRF1	99	65.986	ENSLAFG00000030499	-	99	65.986	Loxodonta_africana
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.022	ENSMFAG00000037972	MTRF1	100	82.022	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.247	ENSMNEG00000035487	MTRF1	100	82.247	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.022	ENSMLEG00000033582	MTRF1	100	82.022	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000002306	MTRF1	83	56.334	ENSMAMG00000022048	mtrf1	83	56.334	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000002306	MTRF1	87	56.298	ENSMZEG00005017922	mtrf1	86	56.298	Maylandia_zebra
ENSSARG00000002306	MTRF1	87	68.146	ENSMGAG00000014971	MTRF1	92	68.146	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	76.682	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	100	76.682	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.697	ENSMICG00000033131	MTRF1	100	82.697	Microcebus_murinus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	76.009	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	100	76.009	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000002306	MTRF1	51	57.205	ENSMMOG00000013394	mtrf1	94	57.205	Mola_mola
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	68.820	ENSMODG00000014772	MTRF1	100	68.820	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000002306	MTRF1	84	55.645	ENSMALG00000013274	mtrf1	85	55.645	Monopterus_albus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	76.351	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	99	76.351	Mus_caroli
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	77.354	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	100	77.354	Mus_musculus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	77.079	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	100	77.079	Mus_pahari
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	77.130	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	100	77.130	Mus_spretus
ENSSARG00000002306	MTRF1	99	80.813	ENSMPUG00000001874	MTRF1	99	80.813	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	83.184	ENSMLUG00000017237	MTRF1	100	83.184	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	80.045	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	100	80.045	Nannospalax_galili
ENSSARG00000002306	MTRF1	51	66.376	ENSNBRG00000004634	mtrf1	97	66.376	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.697	ENSNLEG00000001236	MTRF1	100	82.697	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	64.143	ENSMEUG00000001846	MTRF1	100	64.143	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000002306	MTRF1	60	83.784	ENSOPRG00000006450	-	82	83.784	Ochotona_princeps
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	78.202	ENSODEG00000005782	MTRF1	100	78.202	Octodon_degus
ENSSARG00000002306	MTRF1	87	56.298	ENSONIG00000012476	mtrf1	100	56.298	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000002306	MTRF1	71	69.304	ENSOANG00000003383	-	100	69.304	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	79.372	ENSOCUG00000025207	MTRF1	100	79.372	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000002306	MTRF1	88	54.177	ENSORLG00000003225	mtrf1	89	54.177	Oryzias_latipes
ENSSARG00000002306	MTRF1	88	53.924	ENSORLG00020021048	mtrf1	89	53.924	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000002306	MTRF1	85	54.974	ENSORLG00015020957	mtrf1	87	54.974	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000002306	MTRF1	83	56.486	ENSOMEG00000002022	mtrf1	85	56.486	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000002306	MTRF1	74	73.538	ENSOGAG00000026411	-	100	73.538	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	75.561	ENSOGAG00000009719	-	100	75.561	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	81.839	ENSOARG00000006994	MTRF1	100	81.839	Ovis_aries
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.247	ENSPPAG00000000050	MTRF1	100	82.247	Pan_paniscus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.063	ENSPPRG00000009511	MTRF1	100	82.063	Panthera_pardus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.063	ENSPTIG00000006673	MTRF1	100	82.063	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.247	ENSPTRG00000005815	MTRF1	100	82.247	Pan_troglodytes
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	82.247	ENSPANG00000010809	MTRF1	100	82.247	Papio_anubis
ENSSARG00000002306	MTRF1	85	53.684	ENSPKIG00000015711	mtrf1	89	53.684	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000002306	MTRF1	99	62.749	ENSPSIG00000004773	MTRF1	99	62.749	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000002306	MTRF1	53	67.234	ENSPMGG00000006724	mtrf1	96	67.234	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	76.957	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	100	76.957	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000002306	MTRF1	72	53.412	ENSPMAG00000009849	mtrf1	97	53.412	Petromyzon_marinus
ENSSARG00000002306	MTRF1	100	67.857	ENSPCIG00000012940	MTRF1	100	67.857	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000002306	MTRF1	82	55.616	ENSPFOG00000000254	mtrf1	83	55.616	Poecilia_formosa
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