EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000002594 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 92246 bases
Position: chrGeneScaffold_3534:9536-101781
Accession: 22973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000002371	ResIII	PF04851.15	6.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000002619	SBNO1-201	4173	-	ENSSARP00000002371	1391 (aa)	-	UPI0001581991

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000002594's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000002594's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.382	ENSG00000139697	SBNO1	89	98.382	Homo_sapiens
ENSSARG00000002594	SBNO1	72	88.451	ENSAPOG00000003196	sbno1	85	88.451	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.867	ENSAMEG00000015151	SBNO1	89	98.867	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000002594	SBNO1	88	80.296	ENSACIG00000008088	sbno1	88	78.673	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	80.806	ENSAOCG00000014859	sbno1	88	80.323	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	80.806	ENSAPEG00000006069	sbno1	88	80.323	Amphiprion_percula
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.935	ENSATEG00000006667	sbno1	89	81.774	Anabas_testudineus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	91.987	ENSAPLG00000015674	SBNO1	89	91.987	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	91.100	ENSACAG00000015441	SBNO1	79	90.939	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.896	ENSANAG00000029958	-	90	98.399	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000002594	SBNO1	87	81.008	ENSACLG00000024913	sbno1	87	81.008	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	83.762	ENSAMXG00000019473	sbno1	89	83.601	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.865	ENSBTAG00000020505	SBNO1	89	98.865	Bos_taurus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.220	ENSCJAG00000016599	SBNO1	89	98.220	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.387	ENSCAFG00000007503	SBNO1	89	98.387	Canis_familiaris
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.280	ENSCAFG00020015363	SBNO1	91	95.907	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.865	ENSCHIG00000008382	SBNO1	91	98.039	Capra_hircus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.220	ENSTSYG00000012749	SBNO1	89	98.220	Carlito_syrichta
ENSSARG00000002594	SBNO1	85	98.058	ENSCAPG00000000384	SBNO1	90	97.865	Cavia_aperea
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.058	ENSCPOG00000008109	SBNO1	90	98.734	Cavia_porcellus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	96.320	ENSCCAG00000035316	SBNO1	89	96.320	Cebus_capucinus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.220	ENSCATG00000008239	SBNO1	89	98.220	Cercocebus_atys
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.896	ENSCLAG00000008995	SBNO1	90	98.734	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000002594	SBNO1	72	99.744	ENSCSAG00000002064	SBNO1	87	99.744	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000002594	SBNO1	85	96.604	ENSCHOG00000008814	SBNO1	85	96.604	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	92.407	ENSCPBG00000025968	SBNO1	88	92.246	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	92.173	ENSCANG00000042688	-	89	92.013	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.249	ENSCGRG00001017470	Sbno1	91	96.975	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.249	ENSCGRG00000004756	Sbno1	91	96.975	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	80.161	ENSCSEG00000011919	sbno1	89	80.837	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	80.937	ENSCVAG00000007038	sbno1	89	81.583	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	83.415	ENSDARG00000099080	sbno1	89	83.577	Danio_rerio
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	96.635	ENSDNOG00000017147	SBNO1	86	96.635	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.220	ENSDORG00000015261	Sbno1	89	98.220	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000002594	SBNO1	78	95.074	ENSETEG00000005620	SBNO1	78	94.840	Echinops_telfairi
ENSSARG00000002594	SBNO1	63	75.100	ENSEBUG00000013823	sbno1	75	76.327	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.382	ENSECAG00000006127	SBNO1	89	98.454	Equus_caballus
ENSSARG00000002594	SBNO1	72	98.993	ENSEEUG00000003793	SBNO1	72	98.993	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000002594	SBNO1	88	84.474	ENSELUG00000002886	sbno1	88	84.474	Esox_lucius
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	99.028	ENSFCAG00000015331	SBNO1	89	99.028	Felis_catus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	91.667	ENSFALG00000009273	SBNO1	89	91.761	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	95.513	ENSFDAG00000014232	SBNO1	89	95.513	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	80.998	ENSFHEG00000007360	sbno1	89	80.998	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000002594	SBNO1	83	80.976	ENSGMOG00000018229	sbno1	88	80.976	Gadus_morhua
ENSSARG00000002594	SBNO1	78	92.998	ENSGALG00000003392	SBNO1	87	92.560	Gallus_gallus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.422	ENSGAFG00000003960	sbno1	89	81.422	Gambusia_affinis
ENSSARG00000002594	SBNO1	82	82.155	ENSGACG00000015633	sbno1	86	82.155	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	92.892	ENSGAGG00000001065	SBNO1	89	94.575	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.382	ENSGGOG00000015000	SBNO1	91	98.043	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000002594	SBNO1	87	70.880	ENSHBUG00000011910	sbno1	86	71.040	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.058	ENSHGLG00000014165	-	90	98.399	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000002594	SBNO1	81	84.980	ENSHCOG00000003246	sbno1	85	84.980	Hippocampus_comes
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	83.441	ENSIPUG00000015830	Sbno1	88	82.742	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.382	ENSSTOG00000023221	SBNO1	91	97.865	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.411	ENSJJAG00000001741	Sbno1	89	97.411	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.656	ENSKMAG00000009696	sbno1	89	81.494	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	83.065	ENSLBEG00000007623	sbno1	89	82.903	Labrus_bergylta
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	84.211	ENSLACG00000017227	SBNO1	89	84.211	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	85.829	ENSLOCG00000005725	sbno1	86	86.144	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	96.926	ENSLAFG00000002135	SBNO1	89	96.926	Loxodonta_africana
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.058	ENSMFAG00000031429	SBNO1	89	98.058	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.058	ENSMMUG00000011496	SBNO1	89	98.058	Macaca_mulatta
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.220	ENSMLEG00000033260	SBNO1	91	97.865	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.745	ENSMAMG00000005473	sbno1	89	81.745	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	91.667	ENSMGAG00000003274	SBNO1	89	91.922	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.120	ENSMICG00000006573	-	89	97.120	Microcebus_murinus
ENSSARG00000002594	SBNO1	85	98.192	ENSMOCG00000009390	Sbno1	91	97.331	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.129	ENSMMOG00000008691	sbno1	87	80.738	Mola_mola
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	94.976	ENSMODG00000012470	SBNO1	88	95.138	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	80.161	ENSMALG00000001056	sbno1	89	80.161	Monopterus_albus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.731	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	99.561	Mus_caroli
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.731	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	99.561	Mus_musculus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.569	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	99.561	Mus_pahari
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.731	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	99.561	Mus_spretus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	99.029	ENSMPUG00000001658	SBNO1	89	99.029	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.382	ENSMLUG00000017159	SBNO1	89	98.382	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.058	ENSNGAG00000012620	Sbno1	89	98.058	Nannospalax_galili
ENSSARG00000002594	SBNO1	87	79.160	ENSNBRG00000019189	sbno1	87	78.824	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	96.635	ENSNLEG00000001502	SBNO1	89	96.635	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000002594	SBNO1	56	84.177	ENSMEUG00000008768	-	84	88.608	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	95.638	ENSOPRG00000011054	SBNO1	89	95.638	Ochotona_princeps
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.058	ENSODEG00000009997	SBNO1	90	98.734	Octodon_degus
ENSSARG00000002594	SBNO1	87	81.681	ENSONIG00000015348	sbno1	88	81.681	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000002594	SBNO1	88	96.635	ENSOCUG00000002441	SBNO1	84	96.635	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000002594	SBNO1	88	81.302	ENSORLG00000001593	sbno1	89	80.354	Oryzias_latipes
ENSSARG00000002594	SBNO1	88	81.302	ENSORLG00020015216	sbno1	89	80.354	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000002594	SBNO1	88	81.469	ENSORLG00015002726	sbno1	89	80.515	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000002594	SBNO1	88	81.407	ENSOMEG00000019313	sbno1	89	80.291	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.703	ENSOARG00000004404	SBNO1	89	98.703	Ovis_aries
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.382	ENSPPAG00000024635	SBNO1	91	97.865	Pan_paniscus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	99.028	ENSPPRG00000022092	SBNO1	89	99.028	Panthera_pardus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	99.029	ENSPTIG00000017803	SBNO1	89	99.029	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.544	ENSPTRG00000005597	SBNO1	91	98.043	Pan_troglodytes
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.220	ENSPANG00000011640	SBNO1	91	97.865	Papio_anubis
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	84.006	ENSPKIG00000001441	sbno1	89	83.495	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	91.465	ENSPSIG00000009572	-	89	91.761	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000002594	SBNO1	81	87.968	ENSPSIG00000009256	-	88	87.968	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.573	ENSPEMG00000016087	Sbno1	91	97.153	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	94.327	ENSPCIG00000010985	SBNO1	89	94.489	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.129	ENSPFOG00000005069	sbno1	89	81.290	Poecilia_formosa
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.129	ENSPLAG00000015015	sbno1	89	81.290	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.129	ENSPMEG00000021212	sbno1	89	81.290	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000002594	SBNO1	81	90.000	ENSPREG00000017746	sbno1	89	80.968	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.382	ENSPPYG00000005084	SBNO1	89	98.382	Pongo_abelii
ENSSARG00000002594	SBNO1	81	96.314	ENSPCAG00000008634	SBNO1	81	96.314	Procavia_capensis
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.058	ENSPCOG00000024277	SBNO1	90	98.364	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000002594	SBNO1	81	98.810	ENSPVAG00000015304	SBNO1	81	98.810	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000002594	SBNO1	87	81.681	ENSPNYG00000004291	sbno1	88	81.681	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	85.161	ENSPNAG00000015622	sbno1	89	85.161	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	97.731	ENSRNOG00000001064	Sbno1	91	97.683	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.220	ENSRROG00000034230	SBNO1	91	97.865	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000002594	SBNO1	86	91.826	ENSSBOG00000015422	SBNO1	88	91.826	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	84.006	ENSSFOG00015019025	sbno1	89	83.037	Scleropages_formosus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.613	ENSSMAG00000013640	sbno1	89	81.129	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	82.258	ENSSDUG00000023480	sbno1	89	81.935	Seriola_dumerili
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	82.097	ENSSLDG00000007928	sbno1	89	81.935	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	90.468	ENSSPUG00000012640	SBNO1	89	90.953	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	80.968	ENSSPAG00000016244	sbno1	89	80.645	Stegastes_partitus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.867	ENSSSCG00000009776	SBNO1	89	98.867	Sus_scrofa
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	91.748	ENSTGUG00000005380	SBNO1	89	92.084	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	82.114	ENSTRUG00000018490	sbno1	89	82.114	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.867	ENSUAMG00000019671	SBNO1	89	98.867	Ursus_americanus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.867	ENSUMAG00000004002	SBNO1	89	98.867	Ursus_maritimus
ENSSARG00000002594	SBNO1	84	95.652	ENSVPAG00000007024	SBNO1	84	95.652	Vicugna_pacos
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	98.867	ENSVVUG00000027807	SBNO1	89	98.867	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	89.888	ENSXETG00000031930	SBNO1	89	89.228	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000002594	SBNO1	77	81.027	ENSXCOG00000011607	sbno1	83	81.069	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000002594	SBNO1	89	81.129	ENSXMAG00000002140	sbno1	89	81.290	Xiphophorus_maculatus