EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000003205 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17316 bases
Position: chrGeneScaffold_841:1501-18816
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000002890	RRM_1	PF00076.22	5.4e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000003192	-	1155	-	ENSSARP00000002890	384 (aa)	-	UPI00015804F3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSG00000086589	RBM22	52	100.000	Homo_sapiens
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSAMEG00000004544	RBM22	52	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSAPLG00000016408	RBM22	52	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSACAG00000014750	RBM22	52	100.000	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSANAG00000033743	-	52	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000003205	-	56	98.347	ENSANAG00000019688	-	58	98.347	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000003205	-	52	98.148	ENSAMXG00000038080	rbm22	56	89.256	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSBTAG00000030366	RBM22	52	100.000	Bos_taurus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCJAG00000020963	RBM22	52	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCAFG00000018082	RBM22	51	100.000	Canis_familiaris
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCAFG00020023671	RBM22	52	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCHIG00000015561	RBM22	52	100.000	Capra_hircus
ENSSARG00000003205	-	52	94.872	ENSTSYG00000037586	-	52	95.238	Carlito_syrichta
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSTSYG00000003939	-	52	100.000	Carlito_syrichta
ENSSARG00000003205	-	57	100.000	ENSCAPG00000002598	RBM22	53	100.000	Cavia_aperea
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCPOG00000001946	RBM22	52	100.000	Cavia_porcellus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCCAG00000033546	RBM22	52	100.000	Cebus_capucinus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCATG00000042133	RBM22	53	100.000	Cercocebus_atys
ENSSARG00000003205	-	52	100.000	ENSCLAG00000014221	-	50	92.857	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCLAG00000010842	-	52	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCHOG00000013522	-	52	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCHOG00000001041	-	52	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCPBG00000010094	RBM22	55	99.174	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCANG00000025232	RBM22	52	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSCGRG00001015110	Rbm22	52	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000003205	-	57	100.000	ENSCGRG00000011751	Rbm22	53	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000003205	-	55	96.296	ENSCVAG00000010670	rbm22	54	96.296	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000003205	-	53	96.296	ENSDARG00000010238	rbm22	52	96.296	Danio_rerio
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSDNOG00000011166	RBM22	52	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000003205	-	53	100.000	ENSDORG00000005329	Rbm22	58	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSEASG00005002681	RBM22	52	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000003205	-	56	98.347	ENSEEUG00000005638	-	52	98.347	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSEEUG00000009778	-	50	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSFCAG00000018845	RBM22	52	100.000	Felis_catus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSFALG00000008051	RBM22	52	100.000	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSFDAG00000020067	RBM22	52	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSGALG00000004555	RBM22	54	100.000	Gallus_gallus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSGAGG00000024305	RBM22	52	100.000	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSGGOG00000012947	RBM22	52	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSHGLG00000008488	RBM22	52	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSHGLG00100006872	RBM22	52	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSSTOG00000027197	RBM22	60	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000003205	-	54	90.083	ENSSTOG00000029346	-	50	90.083	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSJJAG00000009565	Rbm22	52	100.000	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000003205	-	52	100.000	ENSLOCG00000010989	rbm22	52	100.000	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSLAFG00000006638	RBM22	52	100.000	Loxodonta_africana
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMFAG00000004034	RBM22	55	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMMUG00000020683	RBM22	52	100.000	Macaca_mulatta
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMNEG00000035500	RBM22	52	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMLEG00000034825	RBM22	52	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMGAG00000006298	RBM22	52	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMAUG00000001133	Rbm22	52	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMICG00000033712	RBM22	52	100.000	Microcebus_murinus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMOCG00000018311	Rbm22	53	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMODG00000009574	-	52	100.000	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000003205	-	56	92.683	ENSMODG00000006398	-	51	92.683	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0022307	Rbm22	52	100.000	Mus_caroli
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMUSG00000024604	Rbm22	52	100.000	Mus_musculus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	MGP_PahariEiJ_G0019037	Rbm22	52	100.000	Mus_pahari
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0023219	Rbm22	52	100.000	Mus_spretus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMPUG00000013760	RBM22	52	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSMLUG00000009040	RBM22	52	100.000	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000003205	-	55	100.000	ENSMLUG00000003461	-	52	100.000	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSNGAG00000018233	Rbm22	52	100.000	Nannospalax_galili
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSNLEG00000010397	-	52	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000003205	-	53	97.727	ENSMEUG00000009348	-	50	97.727	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSOPRG00000008481	-	52	100.000	Ochotona_princeps
ENSSARG00000003205	-	54	80.000	ENSOPRG00000016612	-	51	80.000	Ochotona_princeps
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSODEG00000005016	RBM22	52	100.000	Octodon_degus
ENSSARG00000003205	-	54	100.000	ENSOANG00000002314	RBM22	52	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSOCUG00000011532	RBM22	52	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000003205	-	55	94.444	ENSORLG00000004975	rbm22	52	94.444	Oryzias_latipes
ENSSARG00000003205	-	55	94.444	ENSORLG00020012969	rbm22	54	94.444	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000003205	-	55	94.444	ENSORLG00015022508	rbm22	52	94.444	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000003205	-	55	94.444	ENSOMEG00000004904	rbm22	54	94.444	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSOGAG00000011086	RBM22	52	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000003205	-	57	100.000	ENSOARG00000007633	RBM22	51	100.000	Ovis_aries
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSPPAG00000034432	RBM22	52	100.000	Pan_paniscus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSPPRG00000011577	RBM22	52	100.000	Panthera_pardus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSPTIG00000004453	RBM22	52	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSPTRG00000017423	RBM22	52	100.000	Pan_troglodytes
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSPANG00000011297	RBM22	52	100.000	Papio_anubis
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSPSIG00000012818	RBM22	52	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSPEMG00000001753	Rbm22	52	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000003205	-	53	100.000	ENSPCIG00000015088	RBM22	52	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000003205	-	55	96.296	ENSPFOG00000005625	rbm22	52	96.296	Poecilia_formosa
ENSSARG00000003205	-	55	96.296	ENSPLAG00000006344	rbm22	54	96.296	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSPPYG00000015955	RBM22	52	100.000	Pongo_abelii
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSPVAG00000014231	RBM22	52	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSRNOG00000019235	Rbm22	52	100.000	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSRBIG00000041683	RBM22	52	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSRROG00000041637	RBM22	52	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSSBOG00000035400	-	52	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSSHAG00000017734	-	52	100.000	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSSPUG00000003986	RBM22	52	100.000	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSSSCG00000023231	RBM22	54	100.000	Sus_scrofa
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSTGUG00000000850	RBM22	52	100.000	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000003205	-	55	96.296	ENSTRUG00000004724	rbm22	54	96.296	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSTTRG00000012778	RBM22	52	100.000	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSUAMG00000025133	RBM22	52	100.000	Ursus_americanus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSUMAG00000003651	RBM22	52	100.000	Ursus_maritimus
ENSSARG00000003205	-	56	100.000	ENSVVUG00000007193	RBM22	52	100.000	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000003205	-	52	100.000	ENSXETG00000020435	rbm22	52	100.000	Xenopus_tropicalis