EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000003207 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: CELF1
Alias: BRUNOL2|CUG-BP|CUGBP|CUGBP1|EDEN-BP|NAB50|NAPOR|hNab50
Full Name: CUGBP Elav-like family member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23937 bases
Position: chrGeneScaffold_5218:8878-32814
Accession: 2549
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000002897	RRM_1	PF00076.22	1.9e-42	1	3
ENSSARP00000002897	RRM_1	PF00076.22	1.9e-42	2	3
ENSSARP00000002897	RRM_1	PF00076.22	1.9e-42	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000003201	CELF1-201	1461	-	ENSSARP00000002897	486 (aa)	-	UPI00015812FD

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000003207's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000003207's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSARG00000003207	CELF1	56	40.741	ENSSARG00000010733	ELAVL4	62	40.741
ENSSARG00000003207	CELF1	57	41.975	ENSSARG00000005702	ELAVL2	65	41.975

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSG00000149187	CELF1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSARG00000003207	CELF1	100	79.513	ENSAPOG00000024000	celf1	100	79.108	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.827	ENSAMEG00000007596	CELF1	95	93.827	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000003207	CELF1	100	77.049	ENSACIG00000023843	celf1	100	75.410	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	79.513	ENSAOCG00000001252	celf1	100	79.108	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000003207	CELF1	100	79.716	ENSAPEG00000002340	celf1	97	79.310	Amphiprion_percula
ENSSARG00000003207	CELF1	100	78.439	ENSATEG00000010871	celf1	100	77.002	Anabas_testudineus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	89.754	ENSACAG00000002114	CELF1	95	89.506	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSANAG00000031770	CELF1	95	93.621	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000003207	CELF1	100	80.493	ENSACLG00000010181	-	100	74.385	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000003207	CELF1	100	77.579	ENSAMXG00000020576	celf1	93	78.770	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.210	ENSBTAG00000002520	CELF1	100	93.210	Bos_taurus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.608	ENSCJAG00000020133	CELF1	95	92.813	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSCAFG00000008452	CELF1	95	94.033	Canis_familiaris
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSCAFG00020025487	CELF1	100	89.571	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	ENSCHIG00000024582	CELF1	95	93.416	Capra_hircus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSTSYG00000003866	CELF1	100	93.621	Carlito_syrichta
ENSSARG00000003207	CELF1	99	72.708	ENSCAPG00000006787	CELF1	94	72.917	Cavia_aperea
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.813	ENSCPOG00000036381	CELF1	100	93.018	Cavia_porcellus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSCCAG00000033487	CELF1	100	93.621	Cebus_capucinus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSCATG00000040143	CELF1	100	93.621	Cercocebus_atys
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSCLAG00000011791	CELF1	100	92.813	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	ENSCSAG00000005786	CELF1	95	93.416	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000003207	CELF1	62	100.000	ENSCHOG00000004196	-	68	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000003207	CELF1	100	91.189	ENSCPBG00000022914	CELF1	100	90.389	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	ENSCANG00000032689	CELF1	100	91.581	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.210	ENSCGRG00001011274	Celf1	95	93.210	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.210	ENSCGRG00000015357	Celf1	95	93.210	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000003207	CELF1	100	70.021	ENSCSEG00000008675	celf1	100	68.994	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000003207	CELF1	100	78.854	ENSDARG00000005315	celf1	100	89.865	Danio_rerio
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSDNOG00000009523	CELF1	100	93.621	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	84.362	ENSDORG00000013721	Celf1	96	80.493	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000003207	CELF1	73	100.000	ENSETEG00000004507	CELF1	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSSARG00000003207	CELF1	100	85.216	ENSEASG00005010831	CELF1	94	85.421	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSECAG00000007741	CELF1	100	92.798	Equus_caballus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	83.539	ENSEEUG00000009782	CELF1	100	83.539	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	79.466	ENSELUG00000023173	celf1	100	78.439	Esox_lucius
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSFCAG00000002535	CELF1	100	94.033	Felis_catus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	88.957	ENSFALG00000006402	CELF1	95	88.912	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.210	ENSFDAG00000008517	CELF1	100	92.402	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000003207	CELF1	100	79.184	ENSGMOG00000012783	celf1	98	78.571	Gadus_morhua
ENSSARG00000003207	CELF1	100	89.366	ENSGALG00000008097	CELF1	100	89.322	Gallus_gallus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	74.008	ENSGACG00000014226	celf1	94	73.810	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	91.598	ENSGAGG00000011562	CELF1	100	90.535	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.608	ENSGGOG00000004106	CELF1	95	92.813	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000003207	CELF1	100	80.493	ENSHBUG00000017881	celf1	95	79.261	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000003207	CELF1	100	85.216	ENSHGLG00000019214	-	100	84.805	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.402	ENSHGLG00000006909	-	100	92.608	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.402	ENSHGLG00100013863	-	100	92.608	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000003207	CELF1	100	88.296	ENSHGLG00100017423	-	100	87.885	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000003207	CELF1	100	80.738	ENSHCOG00000000258	celf1	100	80.123	Hippocampus_comes
ENSSARG00000003207	CELF1	100	77.822	ENSIPUG00000023708	celf1	100	78.218	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSSTOG00000000613	CELF1	100	92.813	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.827	ENSJJAG00000020280	Celf1	95	93.827	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000003207	CELF1	64	85.897	ENSLBEG00000002047	-	90	83.974	Labrus_bergylta
ENSSARG00000003207	CELF1	100	82.136	ENSLBEG00000018296	celf1	93	80.972	Labrus_bergylta
ENSSARG00000003207	CELF1	69	73.314	ENSLACG00000018990	CELF1	85	73.607	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000003207	CELF1	100	81.673	ENSLOCG00000005966	celf1	94	79.681	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSLAFG00000003484	CELF1	95	93.621	Loxodonta_africana
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.608	ENSMFAG00000003505	CELF1	100	92.813	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	ENSMMUG00000011657	CELF1	99	91.581	Macaca_mulatta
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSMNEG00000022558	CELF1	100	93.621	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSMLEG00000040834	CELF1	100	91.581	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	77.664	ENSMAMG00000010052	celf1	100	76.025	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	80.493	ENSMZEG00005018307	celf1	100	74.385	Maylandia_zebra
ENSSARG00000003207	CELF1	100	88.980	ENSMGAG00000010629	CELF1	96	88.934	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.210	ENSMAUG00000009468	Celf1	100	92.402	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.608	ENSMICG00000045113	CELF1	95	92.813	Microcebus_murinus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	ENSMOCG00000012633	Celf1	100	92.608	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000003207	CELF1	100	78.074	ENSMMOG00000015460	celf1	95	77.664	Mola_mola
ENSSARG00000003207	CELF1	100	91.975	ENSMODG00000019913	CELF1	100	91.975	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	MGP_CAROLIEiJ_G0023949	Celf1	100	92.608	Mus_caroli
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	ENSMUSG00000005506	Celf1	100	93.416	Mus_musculus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	MGP_PahariEiJ_G0025385	Celf1	100	93.416	Mus_pahari
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.210	MGP_SPRETEiJ_G0024859	Celf1	100	92.402	Mus_spretus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSMPUG00000003960	CELF1	88	94.033	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.449	ENSMLUG00000016631	CELF1	95	92.041	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	91.564	ENSNGAG00000017390	Celf1	95	91.564	Nannospalax_galili
ENSSARG00000003207	CELF1	99	52.058	ENSNBRG00000023547	-	85	50.412	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	ENSNLEG00000014638	CELF1	100	91.581	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000003207	CELF1	100	91.770	ENSMEUG00000007763	CELF1	100	91.770	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.798	ENSOPRG00000003239	-	100	92.798	Ochotona_princeps
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSODEG00000015204	CELF1	95	93.621	Octodon_degus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	79.877	ENSONIG00000008300	celf1	95	79.713	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	91.170	ENSOANG00000007896	CELF1	94	91.376	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.210	ENSOCUG00000001311	CELF1	95	93.210	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	74.642	ENSOMEG00000002381	celf1	100	74.438	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.653	ENSOGAG00000011600	CELF1	95	92.245	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	ENSOARG00000006924	CELF1	100	93.416	Ovis_aries
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSPPAG00000033870	CELF1	100	93.621	Pan_paniscus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSPPRG00000002376	CELF1	100	94.033	Panthera_pardus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSPTIG00000003974	CELF1	100	94.033	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.608	ENSPTRG00000052299	CELF1	100	92.813	Pan_troglodytes
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.608	ENSPANG00000021676	CELF1	95	92.813	Papio_anubis
ENSSARG00000003207	CELF1	100	81.762	ENSPKIG00000012324	celf1	100	79.918	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000003207	CELF1	100	88.344	ENSPSIG00000003922	CELF1	95	88.548	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000003207	CELF1	100	72.222	ENSPMGG00000013192	celf1	95	72.279	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.416	ENSPEMG00000015644	Celf1	100	92.608	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000003207	CELF1	100	91.975	ENSPCIG00000022947	CELF1	97	91.975	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000003207	CELF1	64	69.132	ENSPFOG00000000961	-	92	66.238	Poecilia_formosa
ENSSARG00000003207	CELF1	88	64.035	ENSPLAG00000019373	-	85	61.453	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000003207	CELF1	100	69.672	ENSPREG00000022185	-	94	67.284	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.813	ENSPPYG00000003302	CELF1	95	92.813	Pongo_abelii
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSPCAG00000002631	CELF1	100	94.033	Procavia_capensis
ENSSARG00000003207	CELF1	100	87.885	ENSPCOG00000021865	CELF1	95	88.090	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000003207	CELF1	97	93.192	ENSPVAG00000007340	CELF1	100	93.192	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000003207	CELF1	78	66.864	ENSPNYG00000023719	-	88	63.717	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000003207	CELF1	100	77.822	ENSPNAG00000013418	celf1	93	79.010	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.197	ENSRNOG00000010379	Celf1	100	92.402	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	92.608	ENSRBIG00000042406	CELF1	95	92.813	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	ENSRROG00000032588	CELF1	95	93.621	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000003207	CELF1	100	84.189	ENSSBOG00000021912	CELF1	94	80.698	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000003207	CELF1	100	91.170	ENSSHAG00000017438	CELF1	100	91.376	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000003207	CELF1	100	82.377	ENSSFOG00015019353	celf1	93	81.010	Scleropages_formosus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	81.762	ENSSMAG00000013827	celf1	93	81.762	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	81.148	ENSSDUG00000011558	celf1	93	81.148	Seriola_dumerili
ENSSARG00000003207	CELF1	100	81.352	ENSSLDG00000012863	celf1	95	81.352	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000003207	CELF1	100	89.980	ENSSPUG00000004228	CELF1	95	90.184	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	79.513	ENSSPAG00000009569	celf1	100	79.108	Stegastes_partitus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSSSCG00000013233	CELF1	100	94.033	Sus_scrofa
ENSSARG00000003207	CELF1	100	90.779	ENSTGUG00000010377	CELF1	95	90.779	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000003207	CELF1	100	62.372	ENSTRUG00000000617	celf1	100	62.372	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000003207	CELF1	83	98.675	ENSTBEG00000005140	CELF1	83	98.675	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSTTRG00000014157	CELF1	100	94.033	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000003207	CELF1	90	93.349	ENSUAMG00000000223	CELF1	94	93.349	Ursus_americanus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSUMAG00000009218	CELF1	95	94.033	Ursus_maritimus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	80.658	ENSVPAG00000000336	CELF1	100	80.658	Vicugna_pacos
ENSSARG00000003207	CELF1	100	94.033	ENSVVUG00000023439	CELF1	100	94.033	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000003207	CELF1	100	82.495	ENSXETG00000009044	celf1	100	81.690	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000003207	CELF1	87	53.392	ENSXCOG00000017706	-	87	51.613	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000003207	CELF1	100	68.583	ENSXMAG00000029339	-	100	67.351	Xiphophorus_maculatus