EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000003290 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 77630 bases
Position: chrGeneScaffold_5409:3438-81067
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000003012	CPSF_A	PF03178.15	9.8e-40	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000003324	-	3255	-	ENSSARP00000003012	1085 (aa)	-	UPI000158130B

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000003290's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000003290's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSG00000167986	DDB1	81	100.000	Homo_sapiens
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSAPOG00000005036	ddb1	69	94.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSAMEG00000016518	DDB1	70	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000003290	-	62	94.340	ENSACIG00000020624	ddb1	69	94.340	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSAOCG00000003066	ddb1	70	94.340	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSAPEG00000000092	ddb1	71	94.340	Amphiprion_percula
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSATEG00000020571	ddb1	70	94.340	Anabas_testudineus
ENSSARG00000003290	-	66	100.000	ENSAPLG00000007174	DDB1	64	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000003290	-	72	98.182	ENSACAG00000017758	DDB1	70	98.182	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSANAG00000021878	DDB1	70	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSACLG00000012401	ddb1	70	94.340	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSBTAG00000021569	DDB1	65	100.000	Bos_taurus
ENSSARG00000003290	-	55	47.170	WBGene00010890	ddb-1	54	47.170	Caenorhabditis_elegans
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCJAG00000019319	DDB1	70	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCAFG00000016264	DDB1	71	100.000	Canis_familiaris
ENSSARG00000003290	-	71	100.000	ENSCAFG00020012722	DDB1	71	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCHIG00000014969	DDB1	70	100.000	Capra_hircus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSTSYG00000008027	DDB1	70	100.000	Carlito_syrichta
ENSSARG00000003290	-	66	100.000	ENSCAPG00000010786	DDB1	65	100.000	Cavia_aperea
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCPOG00000009956	DDB1	71	100.000	Cavia_porcellus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCCAG00000035883	DDB1	70	100.000	Cebus_capucinus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCATG00000044495	DDB1	70	100.000	Cercocebus_atys
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCLAG00000004126	DDB1	70	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCSAG00000006392	DDB1	70	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000003290	-	56	100.000	ENSCHOG00000011377	DDB1	57	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000003290	-	72	99.091	ENSCPBG00000017728	DDB1	70	99.091	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000003290	-	72	62.264	ENSCING00000007437	-	70	62.264	Ciona_intestinalis
ENSSARG00000003290	-	62	68.571	ENSCSAVG00000004783	-	68	68.571	Ciona_savignyi
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCANG00000019948	DDB1	70	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCGRG00001016599	Ddb1	70	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSCGRG00000013427	Ddb1	70	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000003290	-	70	96.226	ENSCSEG00000012499	ddb1	67	96.226	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000003290	-	71	92.453	ENSCVAG00000019531	ddb1	72	92.453	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000003290	-	72	92.453	ENSDARG00000074431	ddb1	70	92.453	Danio_rerio
ENSSARG00000003290	-	71	100.000	ENSDNOG00000014884	DDB1	70	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000003290	-	64	100.000	ENSDORG00000000127	Ddb1	75	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000003290	-	72	60.952	FBgn0260962	pic	70	60.952	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000003290	-	54	83.019	ENSEBUG00000014593	ddb1	65	83.019	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSEASG00005008184	DDB1	70	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSECAG00000012136	DDB1	70	100.000	Equus_caballus
ENSSARG00000003290	-	61	100.000	ENSEEUG00000003194	DDB1	58	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSELUG00000023868	ddb1	70	94.340	Esox_lucius
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSFCAG00000029716	DDB1	70	100.000	Felis_catus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSFALG00000011981	DDB1	70	100.000	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSFDAG00000005128	DDB1	70	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000003290	-	70	92.453	ENSFHEG00000022133	ddb1	73	92.453	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000003290	-	54	100.000	ENSGMOG00000019386	ddb1	62	100.000	Gadus_morhua
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSGALG00000042333	DDB1	70	100.000	Gallus_gallus
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSGAFG00000013142	ddb1	72	94.340	Gambusia_affinis
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSGACG00000017182	ddb1	72	94.340	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000003290	-	66	99.115	ENSGAGG00000014124	DDB1	67	99.115	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSGGOG00000004052	DDB1	70	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSHBUG00000008873	ddb1	70	94.340	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSHGLG00000018430	DDB1	72	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSHGLG00100014475	DDB1	72	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSHCOG00000018670	ddb1	71	94.340	Hippocampus_comes
ENSSARG00000003290	-	72	88.679	ENSIPUG00000005612	DDB1	70	88.679	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSSTOG00000007552	DDB1	70	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSJJAG00000017769	Ddb1	70	100.000	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000003290	-	71	90.566	ENSKMAG00000002315	ddb1	72	90.566	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000003290	-	56	94.340	ENSLBEG00000017065	ddb1	63	94.340	Labrus_bergylta
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSLACG00000017611	DDB1	70	100.000	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000003290	-	67	94.340	ENSLOCG00000000012	ddb1	71	94.340	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSLAFG00000011513	DDB1	70	100.000	Loxodonta_africana
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSMFAG00000042035	DDB1	70	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSMMUG00000002691	DDB1	70	100.000	Macaca_mulatta
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSMNEG00000031559	DDB1	70	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSMLEG00000044136	DDB1	71	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSMAMG00000014372	ddb1	70	94.340	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSMZEG00005013835	ddb1	70	94.340	Maylandia_zebra
ENSSARG00000003290	-	66	100.000	ENSMGAG00000004990	DDB1	68	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSMAUG00000012926	Ddb1	70	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSMICG00000013703	DDB1	70	100.000	Microcebus_murinus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSMOCG00000020499	Ddb1	70	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000003290	-	62	94.340	ENSMMOG00000001758	ddb1	69	94.340	Mola_mola
ENSSARG00000003290	-	55	100.000	ENSMODG00000020353	DDB1	55	100.000	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSMALG00000014071	ddb1	70	94.340	Monopterus_albus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0022695	Ddb1	70	100.000	Mus_caroli
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSMUSG00000024740	Ddb1	70	100.000	Mus_musculus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	MGP_PahariEiJ_G0014189	Ddb1	70	100.000	Mus_pahari
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0023609	Ddb1	70	100.000	Mus_spretus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSMPUG00000014200	DDB1	69	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSMLUG00000013232	DDB1	70	100.000	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSNGAG00000009384	Ddb1	70	100.000	Nannospalax_galili
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSNBRG00000019581	ddb1	70	94.340	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSNLEG00000002022	DDB1	71	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000003290	-	64	100.000	ENSMEUG00000001099	DDB1	63	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000003290	-	62	100.000	ENSOPRG00000008254	DDB1	60	100.000	Ochotona_princeps
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSODEG00000002419	DDB1	70	100.000	Octodon_degus
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSONIG00000005804	ddb1	70	94.340	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000003290	-	62	98.667	ENSOANG00000004897	DDB1	67	98.667	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSOCUG00000001667	DDB1	70	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSORLG00000001399	ddb1	71	94.340	Oryzias_latipes
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSORLG00020001277	ddb1	71	94.340	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSORLG00015002080	ddb1	74	94.340	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSOMEG00000006181	ddb1	70	94.340	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSOGAG00000016103	DDB1	70	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSOARG00000011716	DDB1	69	100.000	Ovis_aries
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSPPAG00000035343	DDB1	70	100.000	Pan_paniscus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSPPRG00000013300	DDB1	70	100.000	Panthera_pardus
ENSSARG00000003290	-	66	100.000	ENSPTIG00000006909	DDB1	64	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSPTRG00000003737	DDB1	70	100.000	Pan_troglodytes
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSPANG00000000242	DDB1	70	100.000	Papio_anubis
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSPKIG00000019213	ddb1	68	94.340	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000003290	-	66	100.000	ENSPSIG00000013275	DDB1	65	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000003290	-	62	94.340	ENSPMGG00000021179	ddb1	69	94.340	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSPEMG00000012241	Ddb1	70	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000003290	-	61	90.265	ENSPMAG00000008479	ddb1	65	90.265	Petromyzon_marinus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSPCIG00000002643	DDB1	72	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSPFOG00000002768	ddb1	70	94.340	Poecilia_formosa
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSPLAG00000017227	ddb1	71	94.340	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSPMEG00000011398	ddb1	71	94.340	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSPREG00000004440	ddb1	74	94.340	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSPPYG00000003193	DDB1	70	100.000	Pongo_abelii
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSPCOG00000015176	DDB1	70	100.000	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSPVAG00000003847	DDB1	70	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000003290	-	71	90.566	ENSPNAG00000006635	ddb1	70	90.566	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSRNOG00000020715	Ddb1	70	100.000	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSRBIG00000033611	DDB1	70	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSRROG00000041407	DDB1	70	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSSBOG00000019775	DDB1	70	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000003290	-	66	100.000	ENSSHAG00000011600	DDB1	68	100.000	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSSFOG00015011151	ddb1	70	94.340	Scleropages_formosus
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSSMAG00000009495	ddb1	70	94.340	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSSDUG00000004642	ddb1	70	94.340	Seriola_dumerili
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSSLDG00000015804	ddb1	70	94.340	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSSPUG00000019338	DDB1	70	100.000	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000003290	-	72	94.340	ENSSPAG00000009888	ddb1	72	94.340	Stegastes_partitus
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSSSCG00000013094	DDB1	70	100.000	Sus_scrofa
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSTGUG00000006414	DDB1	70	100.000	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSTRUG00000016682	ddb1	71	94.340	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000003290	-	59	94.340	ENSTNIG00000009565	ddb1	66	94.340	Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000003290	-	66	100.000	ENSTTRG00000011055	DDB1	65	100.000	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000003290	-	71	100.000	ENSUAMG00000017793	DDB1	67	100.000	Ursus_americanus
ENSSARG00000003290	-	71	100.000	ENSUMAG00000011788	DDB1	70	100.000	Ursus_maritimus
ENSSARG00000003290	-	57	100.000	ENSVPAG00000007963	DDB1	56	100.000	Vicugna_pacos
ENSSARG00000003290	-	72	100.000	ENSVVUG00000004987	DDB1	70	100.000	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000003290	-	72	96.226	ENSXETG00000008820	ddb1	70	96.226	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000003290	-	62	94.340	ENSXCOG00000013956	ddb1	69	94.340	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000003290	-	71	94.340	ENSXMAG00000000022	ddb1	72	94.340	Xiphophorus_maculatus