EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000003351 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: GPKOW
Alias: GPATC5|GPATCH5|Spp2|T54
Full Name: G-patch domain and KOW motifs
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 41019 bases
Position: chrGeneScaffold_498:20477-61495
Accession: 30677
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000003027	G-patch	PF01585.23	3.5e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000003340	GPKOW-201	1230	-	ENSSARP00000003027	409 (aa)	-	UPI0001581483

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000003351's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000003351's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	77.088	ENSG00000068394	GPKOW	88	77.088	Homo_sapiens
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	44.690	ENSAPOG00000004970	gpkow	86	43.430	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	75.467	ENSAMEG00000012303	GPKOW	88	75.467	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	43.046	ENSACIG00000010755	gpkow	86	43.172	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	43.584	ENSAOCG00000022818	gpkow	85	43.237	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	43.612	ENSAPEG00000021416	gpkow	87	43.612	Amphiprion_percula
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	44.035	ENSATEG00000023744	gpkow	87	42.795	Anabas_testudineus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	50.805	ENSACAG00000016598	GPKOW	86	50.805	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	67.780	ENSANAG00000033498	-	87	67.780	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	75.895	ENSANAG00000030473	-	88	75.895	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	71.429	ENSANAG00000036571	-	95	75.131	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000003351	GPKOW	59	43.825	ENSAMXG00000039266	gpkow	73	43.825	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	73.832	ENSBTAG00000002568	GPKOW	89	73.832	Bos_taurus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	73.206	ENSCJAG00000002656	GPKOW	88	74.463	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	75.878	ENSCAFG00000015794	GPKOW	88	75.878	Canis_familiaris
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	75.878	ENSCAFG00020020258	GPKOW	88	75.878	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	73.944	ENSCHIG00000013277	GPKOW	89	73.944	Capra_hircus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	71.122	ENSTSYG00000029374	-	88	71.122	Carlito_syrichta
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	78.043	ENSTSYG00000033182	-	88	78.043	Carlito_syrichta
ENSSARG00000003351	GPKOW	89	74.869	ENSCAPG00000011329	GPKOW	100	74.869	Cavia_aperea
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	74.353	ENSCPOG00000013270	GPKOW	88	74.353	Cavia_porcellus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	74.463	ENSCCAG00000034660	-	87	74.463	Cebus_capucinus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	68.281	ENSCCAG00000022161	-	87	68.281	Cebus_capucinus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	77.327	ENSCATG00000041433	GPKOW	88	77.327	Cercocebus_atys
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	65.023	ENSCLAG00000007117	-	83	65.023	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	72.535	ENSCLAG00000002220	-	88	72.535	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	77.804	ENSCSAG00000012926	GPKOW	88	77.804	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	49.213	ENSCPBG00000016609	GPKOW	87	50.112	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000003351	GPKOW	57	35.918	ENSCING00000020813	-	63	35.918	Ciona_intestinalis
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	77.566	ENSCANG00000037595	GPKOW	88	77.566	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	67.436	ENSCGRG00001016210	Gpkow	88	67.436	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	67.436	ENSCGRG00000013835	Gpkow	88	67.436	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	43.355	ENSCSEG00000020569	gpkow	88	42.358	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	43.792	ENSCVAG00000017066	gpkow	87	43.792	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	45.638	ENSDARG00000029612	gpkow	88	45.638	Danio_rerio
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	72.131	ENSDNOG00000016647	GPKOW	99	72.131	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	65.566	ENSDORG00000013663	Gpkow	88	65.566	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000003351	GPKOW	77	39.118	ENSEBUG00000001912	gpkow	82	39.118	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	70.644	ENSEASG00005019852	GPKOW	87	70.644	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	76.347	ENSECAG00000018251	GPKOW	88	76.347	Equus_caballus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	66.667	ENSEEUG00000008839	GPKOW	88	66.667	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	44.934	ENSELUG00000022223	gpkow	86	45.952	Esox_lucius
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	76.134	ENSFCAG00000003818	GPKOW	88	76.134	Felis_catus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	74.178	ENSFDAG00000001669	GPKOW	88	74.178	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	44.898	ENSFHEG00000022349	gpkow	85	44.898	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	44.762	ENSGMOG00000019661	gpkow	86	44.762	Gadus_morhua
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	42.952	ENSGACG00000012127	gpkow	87	43.612	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	50.490	ENSGAGG00000006302	GPKOW	100	50.490	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	77.327	ENSGGOG00000013685	GPKOW	88	77.327	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	43.982	ENSHBUG00000010655	gpkow	80	43.956	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	74.824	ENSHGLG00000002746	GPKOW	88	74.824	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	74.588	ENSHGLG00100014283	GPKOW	88	74.588	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000003351	GPKOW	87	58.772	ENSIPUG00000008342	gpkow	88	44.130	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	76.581	ENSSTOG00000014593	GPKOW	88	76.581	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	70.023	ENSJJAG00000013397	Gpkow	88	70.023	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	44.760	ENSKMAG00000006241	gpkow	87	43.640	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	44.565	ENSLBEG00000013238	gpkow	87	43.668	Labrus_bergylta
ENSSARG00000003351	GPKOW	59	53.937	ENSLACG00000003399	gpkow	91	53.640	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	45.033	ENSLOCG00000014776	gpkow	87	45.033	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	73.832	ENSLAFG00000005896	GPKOW	88	73.832	Loxodonta_africana
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	77.088	ENSMFAG00000035346	GPKOW	88	77.088	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	77.088	ENSMMUG00000020557	GPKOW	84	77.088	Macaca_mulatta
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	76.850	ENSMNEG00000004803	GPKOW	88	76.850	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	76.850	ENSMLEG00000033293	GPKOW	88	76.850	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	44.543	ENSMAMG00000024235	gpkow	87	44.543	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	43.764	ENSMZEG00005026357	gpkow	80	43.736	Maylandia_zebra
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	75.418	ENSMICG00000045083	GPKOW	88	75.418	Microcebus_murinus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	69.515	ENSMOCG00000019251	Gpkow	88	69.515	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	54.436	ENSMODG00000023705	-	84	54.436	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	54.436	ENSMODG00000011443	-	96	54.436	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	41.834	ENSMALG00000015148	gpkow	86	41.834	Monopterus_albus
ENSSARG00000003351	GPKOW	83	67.857	MGP_CAROLIEiJ_G0032893	Gpkow	100	61.111	Mus_caroli
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	68.360	ENSMUSG00000031148	Gpkow	99	62.632	Mus_musculus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	67.667	MGP_PahariEiJ_G0031441	Gpkow	100	63.684	Mus_pahari
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	73.364	ENSMPUG00000013808	GPKOW	88	73.364	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000003351	GPKOW	59	66.942	ENSMLUG00000009281	-	78	66.942	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	70.070	ENSNGAG00000005382	Gpkow	87	70.070	Nannospalax_galili
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	44.420	ENSNBRG00000008941	gpkow	86	44.176	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	76.611	ENSNLEG00000007998	GPKOW	87	76.611	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000003351	GPKOW	57	59.574	ENSMEUG00000007467	-	79	59.574	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000003351	GPKOW	77	64.506	ENSOPRG00000016412	-	68	64.506	Ochotona_princeps
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	44.201	ENSONIG00000016834	gpkow	80	44.176	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	64.965	ENSOCUG00000010422	GPKOW	88	64.965	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	43.013	ENSORLG00000014442	gpkow	87	43.355	Oryzias_latipes
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	43.013	ENSORLG00020012795	gpkow	87	43.355	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	43.013	ENSORLG00015006852	gpkow	87	43.355	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	45.022	ENSOMEG00000003236	gpkow	87	45.022	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	63.270	ENSOGAG00000003644	GPKOW	88	63.270	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	74.413	ENSOARG00000010927	GPKOW	89	74.413	Ovis_aries
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	76.372	ENSPPAG00000040116	GPKOW	88	76.372	Pan_paniscus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	76.134	ENSPPRG00000016972	GPKOW	88	76.134	Panthera_pardus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	74.707	ENSPTIG00000008398	GPKOW	88	74.707	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	76.611	ENSPTRG00000047603	GPKOW	88	76.611	Pan_troglodytes
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	77.327	ENSPANG00000013477	GPKOW	88	77.327	Papio_anubis
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	46.804	ENSPKIG00000008382	gpkow	85	47.032	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	45.133	ENSPMGG00000010880	gpkow	87	45.133	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	67.824	ENSPEMG00000009966	Gpkow	88	67.824	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	42.208	ENSPMAG00000003497	gpkow	87	42.981	Petromyzon_marinus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	45.089	ENSPFOG00000003065	gpkow	85	45.089	Poecilia_formosa
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	45.089	ENSPLAG00000023097	gpkow	85	45.089	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	45.312	ENSPMEG00000002762	gpkow	85	45.312	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000003351	GPKOW	72	46.483	ENSPREG00000002671	gpkow	99	44.615	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000003351	GPKOW	89	80.556	ENSPPYG00000020334	-	84	80.556	Pongo_abelii
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	75.179	ENSPCOG00000008505	GPKOW	88	75.179	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	44.201	ENSPNYG00000014523	gpkow	86	44.176	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	43.723	ENSPNAG00000008360	gpkow	88	44.783	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	69.195	ENSRNOG00000022939	Gpkow	88	69.195	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	77.088	ENSRBIG00000027885	GPKOW	92	77.088	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	77.088	ENSRROG00000037604	GPKOW	88	77.088	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	76.134	ENSSBOG00000032042	-	88	76.134	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	64.792	ENSSBOG00000024861	-	84	64.792	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000003351	GPKOW	60	53.629	ENSSHAG00000004719	-	98	53.629	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	46.429	ENSSFOG00015009901	gpkow	85	46.429	Scleropages_formosus
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	42.222	ENSSMAG00000013323	gpkow	86	44.592	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	45.376	ENSSDUG00000023134	gpkow	87	45.806	Seriola_dumerili
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	45.238	ENSSLDG00000024756	gpkow	88	46.022	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	44.796	ENSSPAG00000015503	gpkow	88	45.023	Stegastes_partitus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	75.758	ENSSSCG00000012291	GPKOW	95	70.346	Sus_scrofa
ENSSARG00000003351	GPKOW	98	41.950	ENSTRUG00000000616	gpkow	86	41.950	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000003351	GPKOW	97	44.393	ENSTNIG00000012502	gpkow	87	44.393	Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000003351	GPKOW	77	73.231	ENSTBEG00000004087	GPKOW	68	73.231	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	75.837	ENSTTRG00000008579	GPKOW	89	75.837	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000003351	GPKOW	89	75.789	ENSUAMG00000026502	GPKOW	86	75.789	Ursus_americanus
ENSSARG00000003351	GPKOW	89	75.781	ENSUMAG00000007072	GPKOW	76	75.781	Ursus_maritimus
ENSSARG00000003351	GPKOW	100	75.644	ENSVVUG00000017815	GPKOW	88	75.644	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	45.995	ENSXETG00000007727	gpkow	89	45.995	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	46.460	ENSXCOG00000014306	gpkow	87	45.233	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000003351	GPKOW	99	46.018	ENSXMAG00000018216	gpkow	86	45.011	Xiphophorus_maculatus