EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000003679 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ZMAT4
Alias: FLJ13842
Full Name: zinc finger matrin-type 4
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 277197 bases
Position: chrGeneScaffold_5126:91506-368702
Accession: 101542745
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000003318	zf-met	PF12874.7	4.6e-22	1	3
ENSSARP00000003318	zf-met	PF12874.7	4.6e-22	2	3
ENSSARP00000003318	zf-met	PF12874.7	4.6e-22	3	3
ENSSARP00000003318	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.7e-19	1	2
ENSSARP00000003318	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.7e-19	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000003665	ZMAT4-201	687	XM_004606922	ENSSARP00000003318	228 (aa)	XP_004606979	UPI00015827FA

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000003679's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000003679's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSARG00000003679	ZMAT4	72	33.929	ENSSARG00000004901	ZMAT3	52	33.929

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSG00000165061	ZMAT4	100	90.995	Homo_sapiens
ENSSARG00000003679	ZMAT4	88	55.000	ENSAPOG00000007448	zmat4a	97	55.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	88.288	ENSAMEG00000002758	ZMAT4	99	88.288	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	68.750	ENSACIG00000009080	zmat4a	99	68.750	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.869	ENSAOCG00000004416	zmat4a	87	69.869	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.432	ENSAPEG00000018565	zmat4a	87	69.432	Amphiprion_percula
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	69.027	ENSATEG00000012630	zmat4a	95	72.993	Anabas_testudineus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	75.546	ENSAPLG00000006106	ZMAT4	100	75.546	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000003679	ZMAT4	84	83.333	ENSACAG00000005388	ZMAT4	92	83.333	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSANAG00000027926	ZMAT4	100	87.773	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.432	ENSACLG00000005038	zmat4a	87	70.423	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	65.333	ENSAMXG00000035337	zmat4a	99	66.518	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSBTAG00000017420	ZMAT4	100	88.210	Bos_taurus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSCAFG00000005744	ZMAT4	100	88.210	Canis_familiaris
ENSSARG00000003679	ZMAT4	71	82.209	ENSCAFG00020002716	ZMAT4	95	82.209	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSCHIG00000022017	ZMAT4	100	88.210	Capra_hircus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	72	83.030	ENSTSYG00000031413	ZMAT4	100	83.030	Carlito_syrichta
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	86.026	ENSCAPG00000014401	ZMAT4	100	86.026	Cavia_aperea
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	86.026	ENSCPOG00000015224	ZMAT4	100	86.026	Cavia_porcellus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSCCAG00000027437	ZMAT4	100	87.773	Cebus_capucinus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSCATG00000044978	ZMAT4	100	87.773	Cercocebus_atys
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.336	ENSCLAG00000000923	ZMAT4	100	87.336	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	87.838	ENSCSAG00000015108	ZMAT4	99	87.838	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	75.109	ENSCHOG00000003755	ZMAT4	100	75.109	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000003679	ZMAT4	51	90.598	ENSCPBG00000002781	ZMAT4	75	90.598	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000003679	ZMAT4	85	85.641	ENSCANG00000032136	ZMAT4	100	85.641	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	85.590	ENSCGRG00001016583	Zmat4	100	85.590	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	85.590	ENSCGRG00000002696	Zmat4	100	85.590	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	68.996	ENSCSEG00000013707	zmat4a	97	68.996	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	67.686	ENSCVAG00000000113	zmat4a	87	67.686	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	60.965	ENSDARG00000061419	zmat4b	97	67.358	Danio_rerio
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	67.686	ENSDARG00000092987	zmat4a	99	67.257	Danio_rerio
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	87.387	ENSDNOG00000001045	ZMAT4	99	87.387	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSDORG00000009300	Zmat4	100	87.773	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000003679	ZMAT4	69	94.937	ENSETEG00000010474	ZMAT4	81	94.937	Echinops_telfairi
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.336	ENSEASG00005010447	ZMAT4	100	87.336	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSECAG00000021550	ZMAT4	100	88.210	Equus_caballus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	75.225	ENSEEUG00000002565	ZMAT4	99	75.225	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.432	ENSELUG00000005097	zmat4a	99	70.536	Esox_lucius
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSFCAG00000012775	ZMAT4	100	88.210	Felis_catus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	72.926	ENSFALG00000006455	ZMAT4	100	72.926	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	86.026	ENSFDAG00000015258	ZMAT4	97	86.026	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	69.196	ENSFHEG00000022872	zmat4b	99	69.196	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	68.750	ENSGMOG00000007950	zmat4a	100	68.750	Gadus_morhua
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	75.546	ENSGALG00000003470	ZMAT4	100	75.546	Gallus_gallus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	68.122	ENSGAFG00000013149	zmat4a	100	67.982	Gambusia_affinis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.432	ENSGACG00000005515	zmat4a	100	69.432	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	77.729	ENSGAGG00000004799	ZMAT4	92	85.827	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSGGOG00000006633	ZMAT4	100	87.773	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.432	ENSHBUG00000012634	zmat4a	87	69.432	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	84.279	ENSHGLG00000003246	ZMAT4	100	84.279	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000003679	ZMAT4	69	89.873	ENSHGLG00100000081	ZMAT4	100	89.873	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000003679	ZMAT4	50	83.478	ENSHCOG00000006516	zmat4b	92	83.478	Hippocampus_comes
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	64.935	ENSIPUG00000022248	zmat4	99	66.372	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	84.716	ENSJJAG00000013484	Zmat4	100	84.716	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	56	58.915	ENSLACG00000005109	-	84	58.915	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000003679	ZMAT4	99	72.368	ENSLACG00000006206	-	99	72.368	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	69.643	ENSLOCG00000015435	zmat4b	98	69.643	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	86.099	ENSLAFG00000014753	ZMAT4	99	86.099	Loxodonta_africana
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSMFAG00000043475	ZMAT4	100	87.773	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	85	85.641	ENSMMUG00000000776	ZMAT4	100	85.641	Macaca_mulatta
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSMNEG00000042102	ZMAT4	100	87.773	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSMLEG00000034448	ZMAT4	100	87.773	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	68.261	ENSMAMG00000019914	zmat4a	76	81.739	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.432	ENSMZEG00005004946	zmat4a	87	69.432	Maylandia_zebra
ENSSARG00000003679	ZMAT4	99	73.246	ENSMGAG00000002288	ZMAT4	99	73.246	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000003679	ZMAT4	85	85.641	ENSMICG00000047837	ZMAT4	100	85.641	Microcebus_murinus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	85.153	ENSMOCG00000015996	Zmat4	100	85.153	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	70.614	ENSMMOG00000012619	zmat4a	99	73.881	Mola_mola
ENSSARG00000003679	ZMAT4	83	72.917	ENSMODG00000010499	ZMAT4	96	72.917	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	67.672	ENSMALG00000015056	zmat4a	87	67.672	Monopterus_albus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	85.153	MGP_CAROLIEiJ_G0030909	Zmat4	100	97.917	Mus_caroli
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	85.153	ENSMUSG00000037492	Zmat4	100	97.917	Mus_musculus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	85.153	MGP_PahariEiJ_G0021380	Zmat4	100	97.917	Mus_pahari
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	85.153	MGP_SPRETEiJ_G0032028	Zmat4	100	97.917	Mus_spretus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	88.288	ENSMPUG00000005832	ZMAT4	79	88.288	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000003679	ZMAT4	56	93.750	ENSMLUG00000014209	ZMAT4	96	93.750	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	85.590	ENSNGAG00000015545	Zmat4	100	85.590	Nannospalax_galili
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	70.222	ENSNBRG00000011844	zmat4a	99	70.222	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSNLEG00000012564	ZMAT4	100	87.773	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	76.786	ENSMEUG00000000558	ZMAT4	99	76.786	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSOPRG00000009257	ZMAT4	100	88.210	Ochotona_princeps
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSODEG00000006439	ZMAT4	100	87.773	Octodon_degus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	80	63.784	ENSONIG00000016086	zmat4a	99	63.784	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	93	35.102	ENSONIG00000020374	-	52	35.102	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	60	81.752	ENSOANG00000022431	ZMAT4	100	81.752	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSOCUG00000000977	ZMAT4	100	87.773	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	50	84.071	ENSORLG00000016169	zmat4b	77	84.071	Oryzias_latipes
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.264	ENSORLG00020019602	zmat4a	98	69.264	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.264	ENSORLG00015009006	zmat4a	98	69.264	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.264	ENSOMEG00000003441	zmat4a	76	69.264	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	87.387	ENSOGAG00000012558	ZMAT4	99	87.387	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	88.288	ENSOARG00000002354	ZMAT4	83	88.288	Ovis_aries
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	87.387	ENSPPAG00000042573	ZMAT4	99	87.387	Pan_paniscus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSPPRG00000007023	ZMAT4	100	88.210	Panthera_pardus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSPTIG00000019738	ZMAT4	100	88.210	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.336	ENSPTRG00000020191	ZMAT4	100	87.336	Pan_troglodytes
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSPANG00000014196	ZMAT4	100	87.773	Papio_anubis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.432	ENSPKIG00000000048	zmat4a	87	69.432	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000003679	ZMAT4	75	57.647	ENSPKIG00000021792	zmat4b	99	57.647	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	77.293	ENSPSIG00000004847	ZMAT4	100	77.293	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	63.274	ENSPMGG00000001436	zmat4b	99	63.274	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	96	47.297	ENSPMAG00000004582	zmat4a	96	47.297	Petromyzon_marinus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	75.758	ENSPCIG00000028706	ZMAT4	92	75.758	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	68.559	ENSPFOG00000006742	zmat4a	87	68.559	Poecilia_formosa
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	68.750	ENSPLAG00000019268	zmat4a	99	59.565	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	68.559	ENSPMEG00000007870	zmat4a	98	68.559	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	68.559	ENSPREG00000014914	zmat4a	87	68.559	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.336	ENSPPYG00000018540	ZMAT4	100	87.336	Pongo_abelii
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	86.026	ENSPCAG00000004820	ZMAT4	100	86.026	Procavia_capensis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSPCOG00000007717	ZMAT4	100	88.210	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000003679	ZMAT4	84	95.312	ENSPVAG00000011393	ZMAT4	84	95.312	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	70.175	ENSPNYG00000006173	zmat4a	81	70.175	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	67.249	ENSPNAG00000009604	zmat4a	87	67.249	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	61.304	ENSPNAG00000023764	zmat4b	100	61.304	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	82.684	ENSRNOG00000042690	Zmat4	100	82.684	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSRBIG00000031887	ZMAT4	100	87.773	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSRROG00000040877	ZMAT4	100	87.773	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	87.773	ENSSBOG00000017391	ZMAT4	100	87.773	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	80	64.078	ENSSHAG00000011847	ZMAT4	100	64.078	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	70.435	ENSSFOG00015013158	zmat4	99	70.870	Scleropages_formosus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.869	ENSSMAG00000017693	zmat4a	99	69.163	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.869	ENSSDUG00000005878	zmat4a	87	69.869	Seriola_dumerili
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	69.869	ENSSLDG00000012934	zmat4a	87	69.869	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	70.089	ENSSPAG00000021408	zmat4a	83	70.089	Stegastes_partitus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSSSCG00000007010	ZMAT4	100	88.210	Sus_scrofa
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	76.577	ENSTGUG00000005159	ZMAT4	99	76.577	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	70.614	ENSTRUG00000005170	zmat4a	76	70.614	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000003679	ZMAT4	98	62.832	ENSTNIG00000018863	zmat4b	99	62.832	Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	74.672	ENSTBEG00000016172	ZMAT4	100	74.672	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	80.349	ENSTTRG00000009606	ZMAT4	100	80.349	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	88.288	ENSUMAG00000025578	ZMAT4	99	88.288	Ursus_maritimus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	75.546	ENSVPAG00000009783	ZMAT4	100	75.546	Vicugna_pacos
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	88.210	ENSVVUG00000020407	ZMAT4	100	88.210	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000003679	ZMAT4	97	38.767	ENSXCOG00000010189	-	99	39.474	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	57	58.394	ENSXCOG00000015061	zmat4b	98	58.394	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000003679	ZMAT4	100	68.559	ENSXMAG00000010461	zmat4a	87	68.559	Xiphophorus_maculatus