EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000003684 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: NELFE
Alias: D6S45|NELF-E|RD|RDBP|RDP
Full Name: negative elongation factor complex member E
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4582 bases
Position: chrGeneScaffold_7051:34757-39338
Accession: 13974
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000003345	RRM_1	PF00076.22	3.5e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000003697	NELFE-201	1062	-	ENSSARP00000003345	353 (aa)	-	UPI000158186C

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000003684	NELFE	94	92.537	ENSG00000204356	NELFE	93	90.986	Homo_sapiens
ENSSARG00000003684	NELFE	97	92.219	ENSAMEG00000002062	NELFE	92	92.437	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000003684	NELFE	94	92.537	ENSANAG00000038256	NELFE	93	90.986	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000003684	NELFE	97	86.589	ENSBTAG00000007453	NELFE	93	91.785	Bos_taurus
ENSSARG00000003684	NELFE	94	93.134	ENSCJAG00000002368	-	92	91.549	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	93.003	ENSCAFG00020000938	NELFE	93	92.068	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000003684	NELFE	97	86.667	ENSCHIG00000013713	NELFE	93	91.218	Capra_hircus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	89.859	ENSTSYG00000012132	-	92	83.616	Carlito_syrichta
ENSSARG00000003684	NELFE	100	89.636	ENSCAPG00000015145	NELFE	94	90.196	Cavia_aperea
ENSSARG00000003684	NELFE	97	89.337	ENSCPOG00000031829	NELFE	93	90.196	Cavia_porcellus
ENSSARG00000003684	NELFE	94	90.855	ENSCCAG00000014945	NELFE	93	89.694	Cebus_capucinus
ENSSARG00000003684	NELFE	94	92.492	ENSCATG00000028969	NELFE	93	92.068	Cercocebus_atys
ENSSARG00000003684	NELFE	97	89.504	ENSCLAG00000009684	NELFE	93	89.802	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000003684	NELFE	94	90.746	ENSCSAG00000008969	NELFE	93	90.704	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000003684	NELFE	52	47.059	ENSCSAVG00000004231	-	67	47.059	Ciona_savignyi
ENSSARG00000003684	NELFE	94	89.796	ENSCANG00000022451	NELFE	93	90.986	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000003684	NELFE	95	88.012	ENSCGRG00001016608	Nelfe	93	88.068	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000003684	NELFE	97	88.352	ENSCGRG00000014034	Nelfe	95	88.068	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000003684	NELFE	95	62.500	ENSCVAG00000003087	nelfe	93	64.943	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000003684	NELFE	100	78.470	ENSDNOG00000006996	-	100	78.470	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	90.490	ENSDNOG00000041886	-	93	91.597	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000003684	NELFE	95	44.214	ENSEBUG00000017070	nelfe	84	68.293	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000003684	NELFE	97	88.827	ENSEASG00005015538	NELFE	94	90.489	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000003684	NELFE	68	90.000	ENSEEUG00000005004	NELFE	66	90.000	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000003684	NELFE	95	54.701	ENSELUG00000005830	nelfe	92	50.000	Esox_lucius
ENSSARG00000003684	NELFE	97	93.043	ENSFCAG00000004518	NELFE	93	92.676	Felis_catus
ENSSARG00000003684	NELFE	95	82.635	ENSFDAG00000011589	NELFE	93	82.558	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000003684	NELFE	95	60.534	ENSGALG00000045676	NELFE	91	75.591	Gallus_gallus
ENSSARG00000003684	NELFE	93	63.030	ENSGAGG00000005411	NELFE	86	81.890	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000003684	NELFE	94	91.592	ENSGGOG00000002265	NELFE	93	90.085	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000003684	NELFE	77	84.559	ENSHGLG00000016601	NELFE	92	82.182	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000003684	NELFE	97	91.837	ENSSTOG00000027409	NELFE	93	91.501	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000003684	NELFE	100	86.402	ENSJJAG00000014005	Nelfe	96	86.119	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	91.014	ENSLAFG00000028155	NELFE	93	91.268	Loxodonta_africana
ENSSARG00000003684	NELFE	94	92.239	ENSMFAG00000036108	-	93	90.704	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000003684	NELFE	94	92.239	ENSMMUG00000000735	-	93	90.704	Macaca_mulatta
ENSSARG00000003684	NELFE	94	91.445	ENSMNEG00000032542	NELFE	93	91.501	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000003684	NELFE	94	92.793	ENSMLEG00000030245	NELFE	93	92.351	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000003684	NELFE	64	84.536	ENSMGAG00000001297	NELFE	77	71.429	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000003684	NELFE	92	82.716	ENSMAUG00000016812	Nelfe	93	80.814	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	90.087	ENSMICG00000003287	NELFE	93	89.518	Microcebus_murinus
ENSSARG00000003684	NELFE	95	89.583	ENSMOCG00000003723	Nelfe	93	89.306	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000003684	NELFE	78	91.971	ENSMODG00000015063	NELFE	92	90.062	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000003684	NELFE	95	88.166	MGP_CAROLIEiJ_G0021478	Nelfe	93	88.506	Mus_caroli
ENSSARG00000003684	NELFE	95	89.521	MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	93	89.826	Mus_pahari
ENSSARG00000003684	NELFE	95	88.166	MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	93	88.506	Mus_spretus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	90.778	ENSMPUG00000010581	NELFE	92	91.036	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000003684	NELFE	100	81.972	ENSMLUG00000030380	-	93	81.690	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000003684	NELFE	94	73.373	ENSMLUG00000028808	-	89	76.036	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000003684	NELFE	94	87.688	ENSNGAG00000016248	Nelfe	93	87.500	Nannospalax_galili
ENSSARG00000003684	NELFE	90	86.646	ENSMEUG00000006053	NELFE	84	86.025	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000003684	NELFE	97	88.889	ENSOPRG00000003942	NELFE	94	89.474	Ochotona_princeps
ENSSARG00000003684	NELFE	95	91.667	ENSODEG00000017670	NELFE	93	91.040	Octodon_degus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	90.435	ENSOGAG00000009574	NELFE	92	90.141	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000003684	NELFE	94	91.691	ENSPPAG00000039942	NELFE	93	90.196	Pan_paniscus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	92.464	ENSPPRG00000004421	NELFE	93	92.113	Panthera_pardus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	92.464	ENSPTIG00000003753	NELFE	93	92.113	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000003684	NELFE	94	91.395	ENSPTRG00000017996	NELFE	93	89.916	Pan_troglodytes
ENSSARG00000003684	NELFE	94	92.793	ENSPANG00000019366	NELFE	93	92.351	Papio_anubis
ENSSARG00000003684	NELFE	95	66.369	ENSPKIG00000012048	nelfe	93	67.246	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000003684	NELFE	96	62.464	ENSPFOG00000003019	nelfe	93	63.977	Poecilia_formosa
ENSSARG00000003684	NELFE	96	62.464	ENSPMEG00000006918	nelfe	90	63.977	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000003684	NELFE	97	91.066	ENSPPYG00000016471	NELFE	93	91.317	Pongo_abelii
ENSSARG00000003684	NELFE	73	90.234	ENSPCAG00000004108	NELFE	68	90.234	Procavia_capensis
ENSSARG00000003684	NELFE	97	92.711	ENSPCOG00000024944	NELFE	93	92.918	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000003684	NELFE	95	89.521	ENSRNOG00000000420	Nelfe	93	89.826	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000003684	NELFE	94	89.565	ENSRBIG00000028593	-	93	81.870	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000003684	NELFE	94	91.395	ENSRROG00000041993	NELFE	93	90.756	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000003684	NELFE	94	92.836	ENSSBOG00000035865	NELFE	92	91.268	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000003684	NELFE	97	85.755	ENSSHAG00000008908	NELFE	93	83.934	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000003684	NELFE	95	60.497	ENSSFOG00015017039	nelfe	93	67.045	Scleropages_formosus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	94.461	ENSSSCG00000001423	NELFE	93	94.618	Sus_scrofa
ENSSARG00000003684	NELFE	97	91.931	ENSUAMG00000024338	NELFE	93	92.157	Ursus_americanus
ENSSARG00000003684	NELFE	97	91.931	ENSUMAG00000012674	NELFE	93	92.157	Ursus_maritimus
ENSSARG00000003684	NELFE	95	55.457	ENSXETG00000010931	nelfe	63	76.991	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000003684	NELFE	96	59.467	ENSXCOG00000019513	nelfe	92	61.095	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000003684	NELFE	96	65.680	ENSXMAG00000014078	nelfe	93	67.147	Xiphophorus_maculatus