EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000004271 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SNRPD1
Alias: HsT2456|SNRPD|Sm-D1
Full Name: small nuclear ribonucleoprotein D1 polypeptide
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17523 bases
Position: chrGeneScaffold_4604:5192-22714
Accession: 11158
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000003844	LSM	PF01423.22	1.3e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000004234	SNRPD1-201	201	-	ENSSARP00000003844	67 (aa)	-	UPI00015813D1

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000004271's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000004271's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	33.333	ENSSARG00000002357	SNRPD3	55	33.333
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	32.836	ENSSARG00000004211	LSM10	54	32.836

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSG00000167088	SNRPD1	57	100.000	Homo_sapiens
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSAMEG00000002576	SNRPD1	57	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	96.923	ENSACIG00000011263	snrpd1	58	96.923	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSAOCG00000007406	snrpd1	56	97.015	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	89.552	ENSAPEG00000014961	snrpd1	54	89.552	Amphiprion_percula
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	96.923	ENSAPEG00000012539	SNRPD1	58	96.923	Amphiprion_percula
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSATEG00000014399	snrpd1	58	96.923	Anabas_testudineus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSAPLG00000012256	SNRPD1	56	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSACAG00000006364	SNRPD1	56	100.000	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSANAG00000025641	SNRPD1	56	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	96.923	ENSACLG00000017406	snrpd1	58	96.923	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSAMXG00000004589	snrpd1	56	97.015	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	98.507	ENSBTAG00000055316	-	58	98.507	Bos_taurus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSBTAG00000008292	SNRPD1	56	100.000	Bos_taurus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSBTAG00000047266	-	56	97.015	Bos_taurus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSBTAG00000012376	-	50	97.015	Bos_taurus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	83.582	WBGene00004916	snr-3	53	83.582	Caenorhabditis_elegans
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCJAG00000042955	SNRPD1	56	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCAFG00000018247	SNRPD1	56	100.000	Canis_familiaris
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCAFG00020015914	SNRPD1	52	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCHIG00000005557	SNRPD1	56	100.000	Capra_hircus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSTSYG00000030028	SNRPD1	56	100.000	Carlito_syrichta
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCAPG00000008103	SNRPD1	58	100.000	Cavia_aperea
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCPOG00000004679	SNRPD1	58	100.000	Cavia_porcellus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	98.507	ENSCCAG00000020611	-	56	98.507	Cebus_capucinus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	94.030	ENSCCAG00000005390	-	56	94.030	Cebus_capucinus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	95.522	ENSCCAG00000016652	-	56	95.522	Cebus_capucinus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCCAG00000032658	SNRPD1	56	100.000	Cebus_capucinus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCATG00000039978	SNRPD1	56	100.000	Cercocebus_atys
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCLAG00000008691	SNRPD1	56	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCSAG00000017654	SNRPD1	56	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCPBG00000023143	SNRPD1	57	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	88.060	ENSCING00000024100	-	54	88.060	Ciona_intestinalis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	86.567	ENSCSAVG00000004578	-	54	86.567	Ciona_savignyi
ENSSARG00000004271	SNRPD1	81	87.037	ENSCGRG00001009945	-	55	87.037	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCGRG00001021055	-	56	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSCGRG00000000490	-	56	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000004271	SNRPD1	81	87.037	ENSCGRG00000006224	-	55	87.037	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	95.522	ENSCSEG00000018141	snrpd1	56	95.522	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSCVAG00000000534	snrpd1	56	97.015	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSDARG00000011648	snrpd1	71	97.015	Danio_rerio
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSDNOG00000040310	SNRPD1	56	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSDORG00000008349	Snrpd1	56	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	89.552	FBgn0261933	SmD1	54	89.552	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	95.522	ENSEBUG00000003170	snrpd1	66	95.522	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	100.000	ENSEASG00005002433	SNRPD1	58	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	100.000	ENSECAG00000014373	SNRPD1	58	100.000	Equus_caballus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSEEUG00000004987	SNRPD1	75	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	95.522	ENSELUG00000000088	snrpd1	56	95.522	Esox_lucius
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSFCAG00000012352	SNRPD1	56	100.000	Felis_catus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	100.000	ENSFALG00000002646	SNRPD1	58	100.000	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSGMOG00000015607	snrpd1	56	97.015	Gadus_morhua
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSGALG00000041334	SNRPD1	56	100.000	Gallus_gallus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSGAFG00000011171	snrpd1	56	97.015	Gambusia_affinis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSGACG00000005201	SNRPD1	56	97.015	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSGAGG00000011197	SNRPD1	56	100.000	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	92.537	ENSGGOG00000026706	-	56	92.537	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSGGOG00000041053	SNRPD1	56	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSHBUG00000003236	snrpd1	56	97.015	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSHGLG00000007152	SNRPD1	56	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSHGLG00100008618	SNRPD1	56	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSIPUG00000003576	snrpd1	56	97.015	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSSTOG00000000485	SNRPD1	57	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSJJAG00000017698	Snrpd1	56	100.000	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSKMAG00000005987	snrpd1	56	97.015	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSLBEG00000003327	snrpd1	56	97.015	Labrus_bergylta
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSLACG00000001955	SNRPD1	56	100.000	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	98.507	ENSLOCG00000002003	snrpd1	57	98.507	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSLAFG00000005819	SNRPD1	57	100.000	Loxodonta_africana
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMFAG00000042080	SNRPD1	56	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMMUG00000003992	SNRPD1	57	100.000	Macaca_mulatta
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMNEG00000041296	SNRPD1	56	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMLEG00000028659	SNRPD1	56	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSMAMG00000012971	snrpd1	56	97.015	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSMZEG00005004685	snrpd1	56	97.015	Maylandia_zebra
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMGAG00000011598	SNRPD1	55	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	80.597	ENSMAUG00000016502	-	60	80.597	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	80.597	ENSMAUG00000016467	-	60	80.597	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMICG00000044066	SNRPD1	56	100.000	Microcebus_murinus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMOCG00000017367	Snrpd1	56	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSMMOG00000019089	snrpd1	56	97.015	Mola_mola
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMODG00000021487	SNRPD1	58	100.000	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSMALG00000014459	snrpd1	56	97.015	Monopterus_albus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0021994	Snrpd1	56	100.000	Mus_caroli
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMUSG00000002477	Snrpd1	56	100.000	Mus_musculus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0018731	Snrpd1	56	100.000	Mus_pahari
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0022910	Snrpd1	56	100.000	Mus_spretus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	98.507	ENSMPUG00000020041	-	56	98.507	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMPUG00000005567	-	57	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSMLUG00000009124	SNRPD1	52	100.000	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSNGAG00000023946	Snrpd1	56	100.000	Nannospalax_galili
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSNBRG00000012119	snrpd1	55	97.015	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	95.522	ENSNLEG00000031430	SNRPD1	55	95.522	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSODEG00000005764	SNRPD1	56	100.000	Octodon_degus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSONIG00000002486	snrpd1	56	97.015	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	92.537	ENSOANG00000004638	-	56	92.537	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSOCUG00000023761	-	57	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	98.507	ENSOCUG00000014399	-	56	98.507	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	96.923	ENSORLG00000012516	snrpd1	58	96.923	Oryzias_latipes
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSORLG00020005743	snrpd1	56	97.015	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSORLG00015013402	snrpd1	56	97.015	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSOMEG00000011571	snrpd1	56	97.015	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSOGAG00000007833	SNRPD1	56	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSOARG00000003413	-	50	100.000	Ovis_aries
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSPPAG00000042593	SNRPD1	56	100.000	Pan_paniscus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSPPRG00000002399	SNRPD1	56	100.000	Panthera_pardus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSPTIG00000013206	SNRPD1	59	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	92.537	ENSPTRG00000050159	-	57	92.537	Pan_troglodytes
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSPTRG00000009909	SNRPD1	56	100.000	Pan_troglodytes
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSPANG00000023478	SNRPD1	56	100.000	Papio_anubis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	96.923	ENSPKIG00000021610	snrpd1	58	96.923	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	98.507	ENSPKIG00000003985	SNRPD1	56	98.507	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSPMGG00000001862	snrpd1	56	97.015	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSPEMG00000014773	-	56	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	85.507	ENSPMAG00000003938	-	57	85.507	Petromyzon_marinus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSPCIG00000020320	SNRPD1	58	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSPFOG00000012448	SNRPD1	59	97.015	Poecilia_formosa
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSPLAG00000006738	snrpd1	59	97.015	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSPMEG00000021942	snrpd1	59	97.015	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSPREG00000007094	snrpd1	56	97.015	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSPPYG00000025874	SNRPD1	56	100.000	Pongo_abelii
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSPCOG00000013327	SNRPD1	56	100.000	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSPNAG00000017824	snrpd1	56	97.015	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSRNOG00000013714	Snrpd1	56	100.000	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSRBIG00000022996	SNRPD1	56	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSRROG00000027640	SNRPD1	56	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSSBOG00000020998	SNRPD1	56	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSSHAG00000011791	SNRPD1	56	100.000	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	95.522	ENSSFOG00015022253	-	56	95.522	Scleropages_formosus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	95.522	ENSSFOG00015008809	-	56	95.522	Scleropages_formosus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	95.522	ENSSMAG00000008765	snrpd1	58	95.385	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSSDUG00000010521	snrpd1	57	97.015	Seriola_dumerili
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSSLDG00000011858	snrpd1	56	97.015	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSSPUG00000002824	SNRPD1	56	100.000	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	96.923	ENSSPAG00000015229	snrpd1	58	96.923	Stegastes_partitus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSSSCG00000003701	SNRPD1	58	100.000	Sus_scrofa
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSTGUG00000005095	SNRPD1	56	100.000	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	95.385	ENSTRUG00000008977	snrpd1	58	95.385	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000004271	SNRPD1	84	89.286	ENSTNIG00000001224	snrpd1	54	89.286	Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSTTRG00000002654	SNRPD1	58	100.000	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSUAMG00000013431	SNRPD1	70	100.000	Ursus_americanus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	100.000	ENSUMAG00000019740	SNRPD1	56	100.000	Ursus_maritimus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	97	100.000	ENSVVUG00000004009	SNRPD1	58	100.000	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSXETG00000027354	snrpd1	56	97.015	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSXCOG00000020108	snrpd1	56	97.015	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000004271	SNRPD1	100	97.015	ENSXMAG00000003368	snrpd1	56	97.015	Xiphophorus_maculatus