EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000004540 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TRIT1
Alias: FLJ20061|IPT
Full Name: tRNA isopentenyltransferase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 48258 bases
Position: chrGeneScaffold_299:57962-106219
Accession: 20286
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000004111	IPPT	PF01715.17	6.8e-63	1	1
ENSSARP00000004111	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000004524	TRIT1-201	1413	-	ENSSARP00000004111	470 (aa)	-	UPI0001582398

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000004540's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000004540's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	86.526	ENSG00000043514	TRIT1	99	89.266	Homo_sapiens
ENSSARG00000004540	TRIT1	92	61.416	ENSAPOG00000020918	trit1	90	62.529	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	84.421	ENSAMEG00000004342	TRIT1	97	84.449	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000004540	TRIT1	87	61.369	ENSACIG00000017409	trit1	94	59.556	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000004540	TRIT1	92	61.416	ENSAOCG00000009850	trit1	86	62.207	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000004540	TRIT1	92	61.416	ENSAPEG00000001481	trit1	86	62.207	Amphiprion_percula
ENSSARG00000004540	TRIT1	94	58.705	ENSATEG00000005426	trit1	89	59.404	Anabas_testudineus
ENSSARG00000004540	TRIT1	69	69.789	ENSAPLG00000011421	TRIT1	94	69.789	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000004540	TRIT1	94	68.694	ENSACAG00000002280	TRIT1	89	68.694	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	84.421	ENSANAG00000030732	TRIT1	100	83.503	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000004540	TRIT1	98	56.211	ENSACLG00000004920	trit1	95	56.867	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000004540	TRIT1	94	58.758	ENSAMXG00000010959	trit1	95	59.184	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	85.263	ENSBTAG00000013832	TRIT1	97	85.313	Bos_taurus
ENSSARG00000004540	TRIT1	85	33.333	WBGene00001740	gro-1	95	33.489	Caenorhabditis_elegans
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	84.000	ENSCJAG00000002620	TRIT1	93	89.790	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	85.684	ENSCAFG00000003048	TRIT1	97	85.745	Canis_familiaris
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	84.200	ENSCAFG00020003875	TRIT1	93	93.814	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000004540	TRIT1	98	84.120	ENSCHIG00000013259	TRIT1	97	84.233	Capra_hircus
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	84.665	ENSTSYG00000004363	TRIT1	97	84.665	Carlito_syrichta
ENSSARG00000004540	TRIT1	81	76.227	ENSCAPG00000017001	TRIT1	99	76.227	Cavia_aperea
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	80.632	ENSCPOG00000012820	TRIT1	96	81.441	Cavia_porcellus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	83.368	ENSCCAG00000031271	TRIT1	97	83.369	Cebus_capucinus
ENSSARG00000004540	TRIT1	99	81.646	ENSCATG00000034344	TRIT1	93	89.489	Cercocebus_atys
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	80.842	ENSCLAG00000009828	TRIT1	97	81.304	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000004540	TRIT1	88	83.294	ENSCSAG00000001137	TRIT1	100	83.294	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	82.505	ENSCHOG00000000435	TRIT1	97	82.505	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000004540	TRIT1	89	43.124	ENSCSAVG00000002050	-	92	43.124	Ciona_savignyi
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	83.368	ENSCANG00000043008	TRIT1	93	88.889	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	83.158	ENSCGRG00001001894	Trit1	97	83.333	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000004540	TRIT1	89	82.660	ENSCGRG00000007059	Trit1	91	82.494	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000004540	TRIT1	89	58.080	ENSCSEG00000009574	trit1	88	59.524	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000004540	TRIT1	95	58.057	ENSDARG00000032876	trit1	97	61.747	Danio_rerio
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	75.194	ENSDNOG00000001994	TRIT1	98	75.194	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000004540	TRIT1	96	77.778	ENSDORG00000012449	Trit1	97	77.728	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000004540	TRIT1	91	39.693	FBgn0043799	CG31381	95	39.355	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000004540	TRIT1	88	86.747	ENSETEG00000008733	TRIT1	97	86.893	Echinops_telfairi
ENSSARG00000004540	TRIT1	93	53.620	ENSEBUG00000012845	trit1	96	53.620	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000004540	TRIT1	98	86.052	ENSECAG00000010597	TRIT1	90	86.177	Equus_caballus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	67.368	ENSEEUG00000009269	TRIT1	97	67.171	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000004540	TRIT1	94	53.587	ENSELUG00000017278	trit1	89	53.587	Esox_lucius
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	85.961	ENSFCAG00000006029	TRIT1	97	85.961	Felis_catus
ENSSARG00000004540	TRIT1	82	75.711	ENSFALG00000000532	TRIT1	95	75.711	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000004540	TRIT1	90	83.450	ENSFDAG00000003098	TRIT1	95	83.450	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000004540	TRIT1	70	51.360	ENSFHEG00000022274	trit1	96	51.360	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000004540	TRIT1	92	60.998	ENSGMOG00000006522	trit1	96	62.085	Gadus_morhua
ENSSARG00000004540	TRIT1	93	73.636	ENSGALG00000003851	TRIT1	90	76.190	Gallus_gallus
ENSSARG00000004540	TRIT1	78	58.152	ENSGAFG00000018636	trit1	95	61.194	Gambusia_affinis
ENSSARG00000004540	TRIT1	91	60.046	ENSGACG00000008493	trit1	98	60.369	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000004540	TRIT1	83	76.471	ENSGAGG00000000522	TRIT1	95	76.471	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	86.316	ENSGGOG00000010070	TRIT1	93	90.663	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000004540	TRIT1	98	56.632	ENSHBUG00000018999	trit1	95	57.296	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	74.398	ENSHGLG00000009564	-	97	74.398	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	83.188	ENSHGLG00000010308	-	96	83.664	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000004540	TRIT1	99	83.298	ENSHGLG00100015382	-	97	83.664	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000004540	TRIT1	64	80.000	ENSHGLG00100018159	-	90	80.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000004540	TRIT1	89	61.737	ENSHCOG00000006755	trit1	83	62.233	Hippocampus_comes
ENSSARG00000004540	TRIT1	93	60.682	ENSIPUG00000021822	trit1	86	61.737	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	83.158	ENSSTOG00000006446	TRIT1	95	83.153	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000004540	TRIT1	98	74.678	ENSJJAG00000000300	-	97	74.730	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000004540	TRIT1	96	77.753	ENSJJAG00000000316	-	99	77.753	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000004540	TRIT1	93	60.959	ENSKMAG00000021788	trit1	89	61.201	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000004540	TRIT1	96	58.874	ENSLBEG00000024262	trit1	91	59.333	Labrus_bergylta
ENSSARG00000004540	TRIT1	93	65.324	ENSLACG00000013861	TRIT1	86	67.681	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000004540	TRIT1	95	59.333	ENSLOCG00000002057	trit1	90	60.369	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	82.316	ENSLAFG00000016876	TRIT1	97	82.289	Loxodonta_africana
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	84.211	ENSMFAG00000001316	TRIT1	93	89.489	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	84.211	ENSMMUG00000016220	TRIT1	93	89.489	Macaca_mulatta
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	84.211	ENSMNEG00000023137	TRIT1	93	89.489	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000004540	TRIT1	99	84.177	ENSMLEG00000035296	TRIT1	93	89.489	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000004540	TRIT1	93	59.226	ENSMAMG00000005868	trit1	90	58.636	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000004540	TRIT1	98	56.000	ENSMZEG00005011506	trit1	95	56.652	Maylandia_zebra
ENSSARG00000004540	TRIT1	80	75.198	ENSMGAG00000005516	TRIT1	99	75.198	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	84.000	ENSMAUG00000000399	Trit1	97	84.199	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	84.881	ENSMICG00000016294	TRIT1	97	84.881	Microcebus_murinus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	82.947	ENSMOCG00000008173	Trit1	97	83.333	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000004540	TRIT1	83	60.870	ENSMMOG00000021140	trit1	89	60.870	Mola_mola
ENSSARG00000004540	TRIT1	91	79.254	ENSMODG00000017650	TRIT1	93	79.254	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000004540	TRIT1	93	57.859	ENSMALG00000017843	trit1	92	55.921	Monopterus_albus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	82.947	MGP_CAROLIEiJ_G0026428	Trit1	97	83.117	Mus_caroli
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	82.947	ENSMUSG00000028653	Trit1	97	83.117	Mus_musculus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	82.947	MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	83.117	Mus_pahari
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	82.947	MGP_SPRETEiJ_G0027408	Trit1	97	83.117	Mus_spretus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	86.105	ENSMPUG00000014291	TRIT1	97	86.177	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000004540	TRIT1	98	82.618	ENSMLUG00000000334	TRIT1	97	82.721	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	85.895	ENSNLEG00000012038	TRIT1	93	90.390	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000004540	TRIT1	96	67.615	ENSMEUG00000005217	TRIT1	96	67.615	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000004540	TRIT1	71	68.681	ENSOPRG00000003205	-	71	68.681	Ochotona_princeps
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	79.958	ENSODEG00000006117	TRIT1	97	80.392	Octodon_degus
ENSSARG00000004540	TRIT1	99	56.604	ENSONIG00000015407	trit1	96	57.419	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000004540	TRIT1	81	75.462	ENSOANG00000002779	TRIT1	97	73.590	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	84.017	ENSOCUG00000002054	TRIT1	97	84.017	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000004540	TRIT1	92	60.544	ENSORLG00000005802	trit1	94	60.407	Oryzias_latipes
ENSSARG00000004540	TRIT1	92	61.327	ENSORLG00020005519	trit1	92	61.327	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000004540	TRIT1	92	61.327	ENSORLG00015018715	trit1	92	61.327	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000004540	TRIT1	96	59.519	ENSOMEG00000006569	trit1	92	61.432	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	82.112	ENSOGAG00000009571	TRIT1	97	82.112	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000004540	TRIT1	98	84.764	ENSOARG00000020140	TRIT1	97	84.881	Ovis_aries
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	86.316	ENSPPAG00000023930	TRIT1	93	90.691	Pan_paniscus
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	85.961	ENSPPRG00000009680	TRIT1	97	85.961	Panthera_pardus
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	85.961	ENSPTIG00000021134	TRIT1	97	85.961	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	86.316	ENSPTRG00000000579	TRIT1	93	90.691	Pan_troglodytes
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	84.421	ENSPANG00000018125	TRIT1	93	89.790	Papio_anubis
ENSSARG00000004540	TRIT1	81	59.162	ENSPKIG00000024527	trit1	96	59.162	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000004540	TRIT1	59	81.633	ENSPSIG00000017073	TRIT1	90	81.633	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000004540	TRIT1	84	60.705	ENSPMGG00000018445	trit1	95	60.957	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	84.000	ENSPEMG00000022418	Trit1	97	84.416	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000004540	TRIT1	82	57.468	ENSPMAG00000008892	trit1	97	57.468	Petromyzon_marinus
ENSSARG00000004540	TRIT1	91	77.803	ENSPCIG00000020666	TRIT1	94	78.402	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000004540	TRIT1	93	58.916	ENSPFOG00000014626	trit1	92	57.978	Poecilia_formosa
ENSSARG00000004540	TRIT1	72	60.294	ENSPLAG00000011669	trit1	93	61.280	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000004540	TRIT1	56	61.217	ENSPMEG00000023788	trit1	92	61.217	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000004540	TRIT1	72	61.765	ENSPREG00000018182	trit1	89	62.883	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	85.474	ENSPPYG00000001499	TRIT1	97	85.745	Pongo_abelii
ENSSARG00000004540	TRIT1	76	71.389	ENSPCAG00000014680	TRIT1	99	71.389	Procavia_capensis
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	84.816	ENSPCOG00000014150	TRIT1	96	84.967	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	74.737	ENSPVAG00000003344	TRIT1	97	74.514	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000004540	TRIT1	67	59.561	ENSPNYG00000001003	trit1	97	60.645	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000004540	TRIT1	93	58.028	ENSPNAG00000009466	trit1	87	62.216	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	82.328	ENSRNOG00000014274	Trit1	97	82.479	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	83.789	ENSRBIG00000043179	TRIT1	93	88.589	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	83.789	ENSRROG00000042670	TRIT1	93	88.589	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000004540	TRIT1	86	34.204	YOR274W	-	91	34.204	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSARG00000004540	TRIT1	100	83.789	ENSSBOG00000024417	TRIT1	93	88.323	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000004540	TRIT1	88	74.645	ENSSHAG00000018363	TRIT1	99	74.645	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000004540	TRIT1	92	59.217	ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.017	Scleropages_formosus
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	57.883	ENSSMAG00000020730	trit1	94	58.370	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000004540	TRIT1	96	57.849	ENSSDUG00000001683	trit1	94	57.849	Seriola_dumerili
ENSSARG00000004540	TRIT1	96	57.419	ENSSLDG00000008379	trit1	94	57.419	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000004540	TRIT1	83	73.846	ENSSPUG00000003472	TRIT1	78	73.846	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000004540	TRIT1	88	62.260	ENSSPAG00000020745	trit1	88	63.119	Stegastes_partitus
ENSSARG00000004540	TRIT1	81	72.135	ENSTGUG00000001242	TRIT1	100	72.135	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000004540	TRIT1	94	60.360	ENSTRUG00000013936	trit1	94	60.880	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000004540	TRIT1	92	60.091	ENSTNIG00000009240	trit1	91	60.941	Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000004540	TRIT1	82	89.286	ENSTBEG00000001317	TRIT1	80	89.109	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	84.233	ENSTTRG00000005064	TRIT1	97	84.233	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000004540	TRIT1	57	86.517	ENSUAMG00000000522	-	95	86.517	Ursus_americanus
ENSSARG00000004540	TRIT1	97	84.665	ENSUMAG00000017299	TRIT1	88	84.665	Ursus_maritimus
ENSSARG00000004540	TRIT1	98	79.185	ENSVPAG00000003008	TRIT1	97	79.266	Vicugna_pacos
ENSSARG00000004540	TRIT1	94	63.556	ENSXETG00000010952	trit1	95	63.556	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000004540	TRIT1	72	61.176	ENSXMAG00000016302	trit1	87	62.654	Xiphophorus_maculatus