EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000004748 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POP4
Alias: RPP29
Full Name: POP4 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6395 bases
Position: chrscaffold_248565:6825-13219
Accession: 101555688
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000004304	UPF0086	PF01868.16	5.3e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000004735	POP4-201	654	XM_004600695	ENSSARP00000004304	217 (aa)	XP_004600752	UPI00015802BF

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.175	ENSG00000105171	POP4	100	91.667	Homo_sapiens
ENSSARG00000004748	POP4	98	74.419	ENSAMEG00000003172	-	97	74.419	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000004748	POP4	100	84.793	ENSAMEG00000018329	-	99	84.793	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000004748	POP4	98	60.849	ENSACIG00000008358	pop4	99	60.849	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000004748	POP4	90	64.975	ENSAOCG00000010116	pop4	96	63.959	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000004748	POP4	100	59.817	ENSAPEG00000002829	pop4	92	58.904	Amphiprion_percula
ENSSARG00000004748	POP4	95	61.722	ENSATEG00000013028	pop4	94	61.058	Anabas_testudineus
ENSSARG00000004748	POP4	91	73.604	ENSAPLG00000014051	POP4	95	73.604	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000004748	POP4	99	86.111	ENSANAG00000020295	POP4	98	86.111	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000004748	POP4	94	62.136	ENSACLG00000000526	pop4	92	60.294	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000004748	POP4	99	59.070	ENSAMXG00000002899	pop4	100	59.545	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000004748	POP4	100	91.244	ENSBTAG00000002223	POP4	99	91.244	Bos_taurus
ENSSARG00000004748	POP4	99	83.871	ENSCJAG00000046750	POP4	100	87.222	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000004748	POP4	84	90.659	ENSCAFG00000007630	POP4	100	90.659	Canis_familiaris
ENSSARG00000004748	POP4	99	90.233	ENSCHIG00000016743	POP4	98	90.233	Capra_hircus
ENSSARG00000004748	POP4	100	88.940	ENSTSYG00000003488	POP4	99	88.940	Carlito_syrichta
ENSSARG00000004748	POP4	100	63.134	ENSCAPG00000011105	POP4	100	63.134	Cavia_aperea
ENSSARG00000004748	POP4	100	84.793	ENSCPOG00000002992	POP4	99	84.793	Cavia_porcellus
ENSSARG00000004748	POP4	99	72.685	ENSCCAG00000034244	-	98	72.685	Cebus_capucinus
ENSSARG00000004748	POP4	99	86.111	ENSCCAG00000020285	-	98	86.111	Cebus_capucinus
ENSSARG00000004748	POP4	100	87.097	ENSCATG00000036022	POP4	100	93.750	Cercocebus_atys
ENSSARG00000004748	POP4	100	85.714	ENSCLAG00000013162	POP4	99	85.714	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.636	ENSCSAG00000004868	POP4	99	86.636	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000004748	POP4	99	65.741	ENSCHOG00000002071	POP4	99	65.741	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000004748	POP4	100	74.194	ENSCPBG00000016132	POP4	99	74.194	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000004748	POP4	85	32.461	ENSCING00000023871	-	94	30.102	Ciona_intestinalis
ENSSARG00000004748	POP4	93	88.614	ENSCANG00000005924	POP4	100	88.614	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000004748	POP4	100	85.714	ENSCGRG00001017185	Pop4	99	84.332	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000004748	POP4	100	85.714	ENSCGRG00000008155	Pop4	99	84.332	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000004748	POP4	95	55.981	ENSCSEG00000002946	pop4	94	55.288	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000004748	POP4	94	46.117	ENSCVAG00000018602	POP4	88	45.146	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000004748	POP4	94	66.667	ENSDARG00000101472	pop4	88	69.072	Danio_rerio
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.636	ENSDNOG00000047663	POP4	87	86.636	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000004748	POP4	79	83.140	ENSDORG00000008577	Pop4	100	83.140	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000004748	POP4	81	34.946	FBgn0035831	CG8038	70	37.241	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000004748	POP4	100	70.968	ENSETEG00000003607	POP4	100	70.968	Echinops_telfairi
ENSSARG00000004748	POP4	99	40.611	ENSEBUG00000004305	pop4	98	40.175	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000004748	POP4	99	42.857	ENSEBUG00000008575	pop4	98	42.857	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000004748	POP4	91	47.143	ENSEBUG00000010447	pop4	82	46.667	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000004748	POP4	100	88.462	ENSECAG00000020206	POP4	81	88.462	Equus_caballus
ENSSARG00000004748	POP4	92	68.000	ENSEEUG00000013109	POP4	100	68.000	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000004748	POP4	94	64.706	ENSELUG00000019812	pop4	93	63.725	Esox_lucius
ENSSARG00000004748	POP4	100	87.097	ENSFCAG00000001619	POP4	99	87.097	Felis_catus
ENSSARG00000004748	POP4	99	68.056	ENSFALG00000000206	POP4	96	68.056	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.175	ENSFDAG00000017859	POP4	99	86.175	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000004748	POP4	88	59.794	ENSFHEG00000012745	pop4	91	57.921	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000004748	POP4	88	62.371	ENSGMOG00000000335	pop4	96	62.371	Gadus_morhua
ENSSARG00000004748	POP4	100	68.664	ENSGALG00000041972	POP4	91	68.664	Gallus_gallus
ENSSARG00000004748	POP4	79	52.299	ENSGAFG00000003571	pop4	96	52.299	Gambusia_affinis
ENSSARG00000004748	POP4	95	61.722	ENSGACG00000014510	pop4	93	67.442	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000004748	POP4	100	73.733	ENSGAGG00000024544	POP4	78	73.733	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.636	ENSGGOG00000038346	POP4	99	86.636	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000004748	POP4	94	62.136	ENSHBUG00000021821	pop4	92	60.294	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.175	ENSHGLG00000015798	POP4	99	86.175	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.175	ENSHGLG00100009737	POP4	99	86.175	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000004748	POP4	95	61.353	ENSHCOG00000020937	pop4	94	61.353	Hippocampus_comes
ENSSARG00000004748	POP4	96	60.577	ENSIPUG00000013652	pop4	95	60.577	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000004748	POP4	100	89.401	ENSSTOG00000011016	POP4	99	89.401	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000004748	POP4	100	88.018	ENSJJAG00000013376	Pop4	99	88.018	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000004748	POP4	99	62.844	ENSKMAG00000012250	pop4	98	61.927	Kryptolebias_marmoratus
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ENSSARG00000004748	POP4	100	57.991	ENSLBEG00000018846	-	98	57.991	Labrus_bergylta
ENSSARG00000004748	POP4	100	66.359	ENSLACG00000008581	POP4	98	66.359	Latimeria_chalumnae
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ENSSARG00000004748	POP4	100	87.097	ENSMLEG00000043454	POP4	99	87.097	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000004748	POP4	86	67.021	ENSMAMG00000011716	pop4	93	62.981	Mastacembelus_armatus
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ENSSARG00000004748	POP4	100	68.664	ENSMGAG00000005337	POP4	97	68.664	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.636	ENSMAUG00000020110	Pop4	99	86.636	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000004748	POP4	100	84.332	ENSMICG00000035730	POP4	97	84.332	Microcebus_murinus
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ENSSARG00000004748	POP4	99	78.704	ENSMODG00000029406	POP4	94	78.704	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000004748	POP4	95	63.768	ENSMALG00000012571	pop4	94	63.768	Monopterus_albus
ENSSARG00000004748	POP4	99	85.253	MGP_CAROLIEiJ_G0029600	Pop4	98	85.714	Mus_caroli
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ENSSARG00000004748	POP4	99	85.648	MGP_SPRETEiJ_G0030699	Pop4	98	84.259	Mus_spretus
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.636	ENSMPUG00000008041	-	99	86.636	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000004748	POP4	100	73.394	ENSMPUG00000008063	-	99	73.394	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000004748	POP4	100	67.431	ENSMLUG00000010774	POP4	99	67.431	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000004748	POP4	58	81.600	ENSMEUG00000003636	-	100	81.600	Notamacropus_eugenii
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ENSSARG00000004748	POP4	100	85.714	ENSODEG00000013025	POP4	100	86.321	Octodon_degus
ENSSARG00000004748	POP4	100	56.682	ENSONIG00000003458	pop4	96	56.682	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.636	ENSOCUG00000015974	POP4	99	86.636	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000004748	POP4	92	60.199	ENSORLG00000020317	pop4	90	59.204	Oryzias_latipes
ENSSARG00000004748	POP4	95	58.173	ENSORLG00015011624	pop4	93	57.212	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000004748	POP4	95	60.096	ENSOMEG00000002538	pop4	93	59.135	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000004748	POP4	100	85.253	ENSOGAG00000011168	POP4	99	85.253	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000004748	POP4	99	89.815	ENSOARG00000004041	POP4	98	89.815	Ovis_aries
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.636	ENSPPAG00000040372	POP4	99	86.636	Pan_paniscus
ENSSARG00000004748	POP4	100	87.097	ENSPPRG00000010502	POP4	99	87.097	Panthera_pardus
ENSSARG00000004748	POP4	100	87.097	ENSPTIG00000016598	POP4	99	87.097	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.636	ENSPTRG00000010779	POP4	99	86.636	Pan_troglodytes
ENSSARG00000004748	POP4	100	86.636	ENSPANG00000008546	POP4	99	86.636	Papio_anubis
ENSSARG00000004748	POP4	90	70.707	ENSPKIG00000004468	pop4	89	68.627	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000004748	POP4	100	75.576	ENSPSIG00000015690	POP4	98	79.293	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000004748	POP4	91	58.128	ENSPMGG00000008608	pop4	97	57.635	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000004748	POP4	100	85.714	ENSPEMG00000014034	-	95	85.714	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000004748	POP4	100	71.429	ENSPEMG00000019982	-	99	71.429	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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