EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000005193 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 30499 bases
Position: chrGeneScaffold_1237:37284-67782
Accession: 5276
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000004706	RRM_1	PF00076.22	1.2e-16	1	2
ENSSARP00000004706	RRM_1	PF00076.22	1.2e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000005192	HTATSF1-201	2151	-	ENSSARP00000004706	716 (aa)	-	UPI000158109E

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	63.179	ENSG00000102241	HTATSF1	98	85.833	Homo_sapiens
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	57.820	ENSAPOG00000009823	htatsf1	91	57.820	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	64.829	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	99	64.239	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	61.499	ENSACIG00000020459	htatsf1	92	57.506	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	61.358	ENSAOCG00000020994	htatsf1	90	57.583	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	61.358	ENSAPEG00000016432	htatsf1	91	57.277	Amphiprion_percula
ENSSARG00000005193	HTATSF1	58	55.427	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	55.556	Anabas_testudineus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	50	66.486	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	90	66.486	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000005193	HTATSF1	94	52.479	ENSANAG00000027986	-	97	54.092	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000005193	HTATSF1	93	60.993	ENSANAG00000025458	-	99	61.810	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	56.381	ENSACLG00000008096	htatsf1	92	56.381	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	62.240	ENSAMXG00000008387	htatsf1	82	62.500	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	64.026	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	99	64.645	Bos_taurus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	99	60.474	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	99	62.334	Bos_taurus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	64.026	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	99	64.645	Bos_taurus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	65.726	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	98	65.188	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	66.038	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	99	65.559	Canis_familiaris
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	64.652	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	99	64.202	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	64.714	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	99	65.217	Capra_hircus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	61.905	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	99	63.612	Carlito_syrichta
ENSSARG00000005193	HTATSF1	99	63.564	ENSCCAG00000022701	-	98	64.151	Cebus_capucinus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	61.664	ENSCCAG00000025329	-	99	61.989	Cebus_capucinus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	62.748	ENSCATG00000029963	HTATSF1	99	63.055	Cercocebus_atys
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	60.662	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	61.333	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	62.880	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	99	63.185	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	68.351	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	86	66.938	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	42.246	ENSCSAVG00000000371	-	78	41.444	Ciona_savignyi
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	62.748	ENSCANG00000028495	HTATSF1	99	63.316	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	81	66.343	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	98	59.197	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000005193	HTATSF1	74	59.717	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	99	53.333	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000005193	HTATSF1	52	60.870	ENSCVAG00000014070	htatsf1	90	58.313	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	55	57.109	ENSDARG00000056649	htatsf1	92	56.635	Danio_rerio
ENSSARG00000005193	HTATSF1	81	68.233	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	99	63.316	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	47.689	ENSETEG00000006377	-	68	43.086	Echinops_telfairi
ENSSARG00000005193	HTATSF1	82	69.036	ENSEASG00005003440	HTATSF1	99	64.767	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	82	68.878	ENSECAG00000009156	HTATSF1	99	64.637	Equus_caballus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	58.301	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	99	59.044	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	58.466	ENSELUG00000005486	htatsf1	73	59.788	Esox_lucius
ENSSARG00000005193	HTATSF1	99	64.581	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	99	64.324	Felis_catus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	60.241	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	61.346	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000005193	HTATSF1	56	58.432	ENSFHEG00000020286	htatsf1	93	58.432	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	52	64.948	ENSGALG00000006410	HTATSF1	89	62.899	Gallus_gallus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	54	58.881	ENSGAFG00000003041	htatsf1	89	58.881	Gambusia_affinis
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	56.471	ENSGACG00000020459	htatsf1	95	56.279	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	63.046	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	99	63.351	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	56.381	ENSHBUG00000004392	htatsf1	92	56.381	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000005193	HTATSF1	96	60.729	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	98	61.148	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	59.318	ENSHCOG00000009056	htatsf1	94	55.035	Hippocampus_comes
ENSSARG00000005193	HTATSF1	53	58.549	ENSIPUG00000017828	htatsf1	83	58.763	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	62.948	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	63.540	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	57.309	ENSKMAG00000007622	htatsf1	92	57.309	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	52	60.870	ENSLBEG00000001154	htatsf1	93	57.710	Labrus_bergylta
ENSSARG00000005193	HTATSF1	53	61.832	ENSLACG00000015989	HTATSF1	88	61.832	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000005193	HTATSF1	52	39.637	ENSLOCG00000015118	htatsf1	81	39.221	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	62.994	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	98	62.517	Loxodonta_africana
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	62.616	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	99	62.924	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	62.616	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	99	62.924	Macaca_mulatta
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	62.978	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	99	63.023	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	62.865	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	99	63.041	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	61.399	ENSMAMG00000021225	htatsf1	85	61.719	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	56.381	ENSMZEG00005000485	htatsf1	92	56.381	Maylandia_zebra
ENSSARG00000005193	HTATSF1	52	65.722	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	90	65.722	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000005193	HTATSF1	81	65.635	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	98	59.157	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	64.201	ENSMICG00000009348	HTATSF1	99	64.391	Microcebus_murinus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	62.813	ENSMOCG00000022370	-	94	62.963	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000005193	HTATSF1	83	66.881	ENSMOCG00000023007	-	98	60.397	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	57.243	ENSMMOG00000011013	htatsf1	93	57.243	Mola_mola
ENSSARG00000005193	HTATSF1	53	66.240	ENSMODG00000014087	-	86	66.240	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000005193	HTATSF1	54	57.531	ENSMALG00000019977	htatsf1	88	57.531	Monopterus_albus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	59.814	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	61.260	Mus_caroli
ENSSARG00000005193	HTATSF1	78	69.031	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	99	60.634	Mus_musculus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	78	69.031	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	99	60.474	Mus_spretus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	64.474	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	99	64.173	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	61.892	ENSMLUG00000028418	-	99	62.029	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	87	66.980	ENSMLUG00000009234	-	98	62.759	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	93	63.534	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	62.634	Nannospalax_galili
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	56.944	ENSNBRG00000003818	htatsf1	92	56.944	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	63.600	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	99	63.947	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000005193	HTATSF1	50	68.595	ENSMEUG00000004133	-	87	69.022	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	57.506	ENSONIG00000008638	htatsf1	92	57.506	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	52	66.667	ENSOANG00000011674	-	93	66.667	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	62.533	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	99	63.818	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	61.979	ENSORLG00000002356	htatsf1	87	59.360	Oryzias_latipes
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	62.176	ENSORLG00020017818	htatsf1	84	59.559	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000005193	HTATSF1	54	59.852	ENSORLG00015002268	htatsf1	87	59.852	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	62.760	ENSOMEG00000007564	htatsf1	83	62.760	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000005193	HTATSF1	96	63.094	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	98	63.515	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	63.766	ENSOARG00000011215	-	99	63.683	Ovis_aries
ENSSARG00000005193	HTATSF1	99	61.240	ENSOARG00000000481	-	99	59.796	Ovis_aries
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	63.179	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	99	63.482	Pan_paniscus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	99	65.113	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	99	64.854	Panthera_pardus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	92	63.989	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	63.714	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	63.179	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	99	63.482	Pan_troglodytes
ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	50.854	ENSPANG00000010946	HTATSF1	99	51.299	Papio_anubis
ENSSARG00000005193	HTATSF1	54	60.298	ENSPKIG00000024852	htatsf1	90	60.298	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000005193	HTATSF1	54	59.367	ENSPMGG00000006172	htatsf1	89	59.367	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	96	58.498	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	60.578	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000005193	HTATSF1	56	62.531	ENSPCIG00000018896	-	90	62.531	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	50	67.663	ENSPCIG00000030173	-	84	67.663	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	55	59.277	ENSPFOG00000007871	htatsf1	88	59.277	Poecilia_formosa
ENSSARG00000005193	HTATSF1	55	58.795	ENSPLAG00000007532	htatsf1	91	58.795	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000005193	HTATSF1	55	59.277	ENSPMEG00000000352	htatsf1	91	59.277	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	60.724	ENSPREG00000007811	htatsf1	88	60.349	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000005193	HTATSF1	82	68.065	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	84	67.081	Pongo_abelii
ENSSARG00000005193	HTATSF1	83	62.314	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	99	57.981	Procavia_capensis
ENSSARG00000005193	HTATSF1	99	61.538	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	99	65.073	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	63.536	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	63.251	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000005193	HTATSF1	57	56.944	ENSPNYG00000016693	htatsf1	92	56.944	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	62.162	ENSPNAG00000006166	htatsf1	83	61.214	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000005193	HTATSF1	78	68.465	ENSRNOG00000027761	Htatsf1	98	59.481	Rattus_norvegicus
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ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	62.533	ENSRROG00000021939	HTATSF1	99	62.973	Rhinopithecus_roxellana
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