EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000005804 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRP72
Alias: -
Full Name: signal recognition particle 72
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 30305 bases
Position: chrGeneScaffold_2751:26755-57059
Accession: 11303
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000005273	SRP72	PF08492.12	5.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000005818	SRP72-201	2016	-	ENSSARP00000005273	671 (aa)	-	UPI0001580FFB

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000005804's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000005804's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.158	ENSG00000174780	SRP72	82	93.158	Homo_sapiens
ENSSARG00000005804	SRP72	76	75.758	ENSAPOG00000019438	srp72	81	75.526	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000005804	SRP72	77	93.687	ENSAMEG00000008469	SRP72	76	93.687	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.937	ENSACIG00000000488	srp72	74	74.674	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000005804	SRP72	77	75.758	ENSAOCG00000011256	srp72	74	75.526	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000005804	SRP72	77	75.505	ENSAPEG00000001512	srp72	74	75.263	Amphiprion_percula
ENSSARG00000005804	SRP72	76	71.106	ENSATEG00000006781	srp72	74	78.426	Anabas_testudineus
ENSSARG00000005804	SRP72	75	84.383	ENSAPLG00000008751	SRP72	72	84.514	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000005804	SRP72	73	83.727	ENSACAG00000002381	SRP72	73	83.727	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000005804	SRP72	74	91.842	ENSANAG00000020836	-	100	82.490	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000005804	SRP72	76	76.322	ENSACLG00000014617	srp72	74	76.115	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.495	ENSAMXG00000004011	srp72	74	75.000	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	91.579	ENSBTAG00000010593	SRP72	74	91.579	Bos_taurus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.105	ENSCJAG00000017998	SRP72	100	83.268	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000005804	SRP72	77	93.939	ENSCAFG00000002244	SRP72	77	93.939	Canis_familiaris
ENSSARG00000005804	SRP72	77	93.939	ENSCAFG00020027338	SRP72	84	93.939	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.105	ENSCHIG00000021465	SRP72	74	92.105	Capra_hircus
ENSSARG00000005804	SRP72	73	93.684	ENSTSYG00000010571	-	100	84.436	Carlito_syrichta
ENSSARG00000005804	SRP72	57	84.211	ENSCAPG00000016668	SRP72	100	83.268	Cavia_aperea
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSCPOG00000000218	SRP72	82	92.895	Cavia_porcellus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	90.789	ENSCCAG00000030830	-	74	90.789	Cebus_capucinus
ENSSARG00000005804	SRP72	72	92.011	ENSCCAG00000030683	-	100	83.658	Cebus_capucinus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	76.240	ENSCATG00000045359	-	72	76.053	Cercocebus_atys
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSCATG00000008072	SRP72	82	92.895	Cercocebus_atys
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.158	ENSCLAG00000003571	SRP72	82	93.158	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000005804	SRP72	74	82.338	ENSCSAG00000005079	SRP72	74	82.338	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000005804	SRP72	77	92.929	ENSCHOG00000013240	SRP72	74	92.895	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000005804	SRP72	72	84.252	ENSCPBG00000015015	SRP72	74	84.252	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000005804	SRP72	55	36.735	ENSCING00000002417	-	56	38.265	Ciona_intestinalis
ENSSARG00000005804	SRP72	53	37.931	ENSCSAVG00000011288	-	60	39.589	Ciona_savignyi
ENSSARG00000005804	SRP72	67	73.600	ENSCANG00000037920	-	80	74.576	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSCANG00000041709	SRP72	82	92.895	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000005804	SRP72	77	91.414	ENSCGRG00001013548	Srp72	82	91.316	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000005804	SRP72	77	91.414	ENSCGRG00000003013	Srp72	81	91.316	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000005804	SRP72	65	89.189	ENSCSEG00000003616	srp72	64	89.189	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000005804	SRP72	67	76.923	ENSCVAG00000001520	srp72	74	76.923	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000005804	SRP72	61	79.487	ENSDARG00000014139	srp72	70	79.487	Danio_rerio
ENSSARG00000005804	SRP72	74	84.817	ENSDNOG00000039012	SRP72	62	85.340	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000005804	SRP72	73	92.105	ENSDORG00000000171	Srp72	74	92.105	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000005804	SRP72	52	36.667	FBgn0038810	Srp72	54	36.667	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000005804	SRP72	73	92.368	ENSETEG00000005191	SRP72	74	92.368	Echinops_telfairi
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.421	ENSEASG00005017747	SRP72	74	93.421	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.421	ENSECAG00000006920	SRP72	74	93.421	Equus_caballus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	73.815	ENSELUG00000022415	srp72	74	74.016	Esox_lucius
ENSSARG00000005804	SRP72	73	93.421	ENSFCAG00000027600	SRP72	82	93.421	Felis_catus
ENSSARG00000005804	SRP72	72	85.039	ENSFALG00000006713	SRP72	74	85.039	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.158	ENSFDAG00000002014	-	74	93.158	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000005804	SRP72	73	70.789	ENSFDAG00000009793	-	83	69.211	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.121	ENSFHEG00000017652	srp72	69	74.607	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000005804	SRP72	73	74.603	ENSGMOG00000005986	srp72	73	75.397	Gadus_morhua
ENSSARG00000005804	SRP72	72	83.684	ENSGALG00000011403	SRP72	74	84.211	Gallus_gallus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.874	ENSGAFG00000017762	srp72	73	75.066	Gambusia_affinis
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.623	ENSGACG00000016749	srp72	74	75.131	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000005804	SRP72	64	94.286	ENSGAGG00000024611	SRP72	69	94.286	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.158	ENSGGOG00000013234	-	100	83.658	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000005804	SRP72	76	76.071	ENSHBUG00000020723	srp72	74	75.853	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000005804	SRP72	52	73.988	ENSHGLG00000003496	-	97	74.412	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000005804	SRP72	74	68.865	ENSHGLG00000018597	-	72	68.947	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000005804	SRP72	74	86.316	ENSHGLG00000005029	-	74	85.526	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.368	ENSHGLG00000009791	SRP72	74	92.368	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000005804	SRP72	70	74.785	ENSHGLG00000003950	-	77	74.785	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000005804	SRP72	71	84.433	ENSHGLG00000010633	-	97	75.519	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000005804	SRP72	70	74.785	ENSHGLG00100017133	-	77	74.785	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000005804	SRP72	74	86.316	ENSHGLG00100011236	-	74	85.526	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.368	ENSHGLG00100009021	SRP72	74	92.368	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000005804	SRP72	74	72.368	ENSHGLG00100009346	-	79	75.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000005804	SRP72	76	76.768	ENSHCOG00000013760	srp72	74	76.842	Hippocampus_comes
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.495	ENSIPUG00000000210	srp72	74	74.211	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSSTOG00000007305	SRP72	82	92.895	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000005804	SRP72	72	92.348	ENSJJAG00000018324	Srp72	82	92.348	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.372	ENSKMAG00000003776	srp72	74	74.278	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	75.066	ENSLOCG00000002628	srp72	73	75.263	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.368	ENSLAFG00000018307	SRP72	74	92.368	Loxodonta_africana
ENSSARG00000005804	SRP72	74	76.762	ENSMFAG00000037164	-	72	77.513	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSMFAG00000031065	SRP72	82	92.895	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000005804	SRP72	75	92.969	ENSMMUG00000016368	SRP72	82	92.895	Macaca_mulatta
ENSSARG00000005804	SRP72	57	73.177	ENSMMUG00000021262	-	61	73.158	Macaca_mulatta
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSMNEG00000038065	-	82	92.895	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000005804	SRP72	72	89.807	ENSMLEG00000030140	-	71	88.705	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	75.567	ENSMAMG00000014989	srp72	66	75.328	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	76.322	ENSMZEG00005003325	srp72	74	76.115	Maylandia_zebra
ENSSARG00000005804	SRP72	65	87.805	ENSMGAG00000008567	SRP72	81	84.474	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000005804	SRP72	75	92.172	ENSMAUG00000001237	Srp72	82	92.105	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000005804	SRP72	72	90.358	ENSMICG00000008507	-	93	79.668	Microcebus_murinus
ENSSARG00000005804	SRP72	77	91.414	ENSMOCG00000020309	Srp72	82	91.316	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.811	ENSMMOG00000002627	srp72	74	75.066	Mola_mola
ENSSARG00000005804	SRP72	72	81.316	ENSMODG00000020697	SRP72	74	81.316	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000005804	SRP72	65	86.486	ENSMALG00000003747	srp72	69	86.486	Monopterus_albus
ENSSARG00000005804	SRP72	77	90.657	MGP_CAROLIEiJ_G0027323	Srp72	82	90.526	Mus_caroli
ENSSARG00000005804	SRP72	77	90.657	ENSMUSG00000036323	Srp72	82	90.526	Mus_musculus
ENSSARG00000005804	SRP72	75	91.414	MGP_PahariEiJ_G0017103	Srp72	82	91.316	Mus_pahari
ENSSARG00000005804	SRP72	77	90.657	MGP_SPRETEiJ_G0028317	Srp72	82	90.526	Mus_spretus
ENSSARG00000005804	SRP72	77	94.192	ENSMPUG00000004828	SRP72	77	94.192	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000005804	SRP72	75	92.929	ENSMLUG00000007344	SRP72	77	92.929	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000005804	SRP72	77	91.919	ENSNGAG00000012595	Srp72	82	91.842	Nannospalax_galili
ENSSARG00000005804	SRP72	76	70.277	ENSNBRG00000014492	srp72	73	69.816	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000005804	SRP72	74	82.850	ENSNLEG00000008806	-	100	83.658	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000005804	SRP72	75	76.515	ENSMEUG00000005164	SRP72	74	75.526	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000005804	SRP72	74	91.293	ENSOPRG00000012521	SRP72	74	91.293	Ochotona_princeps
ENSSARG00000005804	SRP72	63	97.561	ENSODEG00000012214	SRP72	74	93.158	Octodon_degus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	76.071	ENSONIG00000001446	srp72	74	75.853	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000005804	SRP72	73	63.446	ENSOANG00000008562	SRP72	73	63.281	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.404	ENSOCUG00000012226	SRP72	74	93.404	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	72.111	ENSORLG00000020418	srp72	81	70.157	Oryzias_latipes
ENSSARG00000005804	SRP72	76	71.859	ENSORLG00020009138	srp72	73	73.560	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000005804	SRP72	76	71.608	ENSORLG00015018251	srp72	74	73.298	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000005804	SRP72	74	72.135	ENSOMEG00000022008	srp72	75	72.251	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSOGAG00000003578	SRP72	74	92.895	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.105	ENSOARG00000004329	SRP72	74	92.105	Ovis_aries
ENSSARG00000005804	SRP72	58	80.000	ENSPPAG00000032490	-	91	65.158	Pan_paniscus
ENSSARG00000005804	SRP72	73	65.464	ENSPPAG00000011428	-	72	67.105	Pan_paniscus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.158	ENSPPAG00000042265	SRP72	100	83.658	Pan_paniscus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.421	ENSPPRG00000015991	SRP72	82	93.421	Panthera_pardus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.421	ENSPTIG00000018786	SRP72	82	93.421	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000005804	SRP72	73	65.722	ENSPTRG00000048100	-	70	67.895	Pan_troglodytes
ENSSARG00000005804	SRP72	56	80.000	ENSPTRG00000043609	-	95	65.438	Pan_troglodytes
ENSSARG00000005804	SRP72	74	93.158	ENSPTRG00000048466	-	100	83.658	Pan_troglodytes
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSPANG00000005495	SRP72	82	92.895	Papio_anubis
ENSSARG00000005804	SRP72	61	92.593	ENSPANG00000030230	-	64	92.593	Papio_anubis
ENSSARG00000005804	SRP72	63	85.564	ENSPSIG00000003003	SRP72	66	85.564	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000005804	SRP72	75	91.414	ENSPEMG00000012828	-	82	91.316	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000005804	SRP72	73	88.421	ENSPCIG00000000732	SRP72	74	88.421	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.750	ENSPFOG00000003480	srp72	73	74.934	Poecilia_formosa
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.874	ENSPLAG00000020122	srp72	73	75.066	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.500	ENSPMEG00000019988	srp72	73	74.670	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000005804	SRP72	77	74.121	ENSPREG00000006218	srp72	81	74.271	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000005804	SRP72	77	93.687	ENSPPYG00000014752	-	58	93.421	Pongo_abelii
ENSSARG00000005804	SRP72	56	78.010	ENSPPYG00000009152	-	95	76.702	Pongo_abelii
ENSSARG00000005804	SRP72	77	90.657	ENSPVAG00000005590	SRP72	76	90.657	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	76.574	ENSPNYG00000001916	srp72	74	76.378	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000005804	SRP72	76	75.000	ENSPNAG00000022424	srp72	74	74.737	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000005804	SRP72	77	88.384	ENSRNOG00000002100	LOC108348180	93	81.328	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSRBIG00000042069	SRP72	81	92.895	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000005804	SRP72	58	76.709	ENSRBIG00000029328	-	84	76.842	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSRROG00000035704	SRP72	82	92.895	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000005804	SRP72	63	92.683	ENSSHAG00000000614	SRP72	62	92.683	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000005804	SRP72	76	75.505	ENSSFOG00015002026	srp72	74	75.263	Scleropages_formosus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	73.750	ENSSMAG00000007639	srp72	74	73.698	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	75.819	ENSSDUG00000007345	srp72	73	76.378	Seriola_dumerili
ENSSARG00000005804	SRP72	76	75.819	ENSSLDG00000021819	srp72	74	76.378	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000005804	SRP72	72	83.158	ENSSPUG00000009740	SRP72	74	83.158	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000005804	SRP72	76	75.315	ENSSPAG00000011565	srp72	74	75.853	Stegastes_partitus
ENSSARG00000005804	SRP72	75	90.152	ENSSSCG00000008900	SRP72	75	90.526	Sus_scrofa
ENSSARG00000005804	SRP72	72	85.079	ENSTGUG00000004767	SRP72	74	85.079	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000005804	SRP72	76	75.253	ENSTRUG00000009831	srp72	74	75.263	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000005804	SRP72	76	76.574	ENSTNIG00000013073	srp72	74	76.378	Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000005804	SRP72	77	82.576	ENSTBEG00000007394	SRP72	77	82.576	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000005804	SRP72	63	97.561	ENSTTRG00000010945	SRP72	66	97.561	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000005804	SRP72	59	93.687	ENSUAMG00000001701	SRP72	100	93.421	Ursus_americanus
ENSSARG00000005804	SRP72	77	93.687	ENSUMAG00000008151	SRP72	77	93.687	Ursus_maritimus
ENSSARG00000005804	SRP72	74	92.895	ENSVPAG00000000458	SRP72	75	92.895	Vicugna_pacos
ENSSARG00000005804	SRP72	77	93.939	ENSVVUG00000006020	SRP72	77	93.939	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000005804	SRP72	65	80.151	ENSXETG00000010205	srp72	67	79.581	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000005804	SRP72	76	74.121	ENSXMAG00000018000	srp72	73	74.271	Xiphophorus_maculatus