EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSSARG00000007888 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 383734 bases
Position: chrGeneScaffold_725:4002-387735
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000007184	ResIII	PF04851.15	6.6e-08	1	1
ENSSARP00000007184	BRK	PF07533.16	1.1e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000007937	SMARCA2-201	4608	-	ENSSARP00000007184	1535 (aa)	-	UPI0001582821

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSARG00000007888	SMARCA2	59	90.741	ENSSARG00000013477	SMARCA4	71	91.250

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	75.862	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	86	84.526	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	78	96.842	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	94	96.842	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000007888	SMARCA2	84	84.526	ENSACIG00000015607	SMARCA2	86	84.526	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	82	84.526	ENSAOCG00000009647	-	86	84.526	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000007888	SMARCA2	90	75.287	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	85	84.526	Amphiprion_percula
ENSSARG00000007888	SMARCA2	88	78.808	ENSATEG00000006916	SMARCA2	92	74.233	Anabas_testudineus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	83	75.056	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	88	74.981	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	85.057	ENSACAG00000002423	SMARCA2	95	83.908	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.368	ENSANAG00000026498	SMARCA2	95	97.368	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	77.586	ENSACLG00000004248	SMARCA2	93	73.563	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	78.161	ENSAMXG00000012404	smarca2	93	79.141	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	98.276	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	95	98.276	Bos_taurus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	95	97.126	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.895	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	95	98.276	Canis_familiaris
ENSSARG00000007888	SMARCA2	71	98.913	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	88	98.913	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	98.421	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	95	98.421	Capra_hircus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.895	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	95	97.895	Carlito_syrichta
ENSSARG00000007888	SMARCA2	88	97.207	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	90	97.207	Cavia_aperea
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.154	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	95	97.126	Cavia_porcellus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	95	97.126	Cebus_capucinus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSCATG00000031470	SMARCA2	95	96.842	Cercocebus_atys
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	96.552	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	95	96.552	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000007888	SMARCA2	88	97.222	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	95	97.222	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	80	97.222	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	81	97.222	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	89.080	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	95	89.080	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.368	ENSCANG00000039597	SMARCA2	95	97.368	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSCGRG00001002323	Smarca2	95	97.126	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000007888	SMARCA2	86	78.808	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	86	76.987	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000007888	SMARCA2	79	72.337	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	95	66.975	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	93	78.523	ENSDARG00000008904	smarca2	93	76.163	Danio_rerio
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	96.552	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	95	96.552	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.895	ENSDORG00000014832	Smarca2	95	97.895	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000007888	SMARCA2	78	57.581	FBgn0000212	brm	62	67.110	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000007888	SMARCA2	86	75.410	ENSEBUG00000011442	-	83	77.371	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000007888	SMARCA2	75	70.370	ENSEBUG00000002449	-	79	77.528	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	98.276	ENSEASG00005010312	SMARCA2	95	98.276	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	58	76.923	ENSEEUG00000015540	-	58	76.831	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	87	89.130	ENSELUG00000010318	smarca2	87	93.846	Esox_lucius
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	95	97.126	Felis_catus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	90.805	ENSFALG00000010416	SMARCA2	95	90.805	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	94.624	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	94	96.648	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000007888	SMARCA2	93	78.808	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	93	71.839	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	92	80.132	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	92	79.141	Gadus_morhua
ENSSARG00000007888	SMARCA2	93	91.391	ENSGALG00000010164	SMARCA2	95	90.230	Gallus_gallus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	89	96.667	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	89	96.667	Gambusia_affinis
ENSSARG00000007888	SMARCA2	93	80.132	ENSGACG00000014488	SMARCA2	93	75.460	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	89.080	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	95	89.080	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.368	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	95	97.368	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000007888	SMARCA2	90	77.586	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	93	73.563	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000007888	SMARCA2	92	97.546	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	95	97.207	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.368	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	95	97.701	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000007888	SMARCA2	77	84.359	ENSHCOG00000015348	-	79	84.647	Hippocampus_comes
ENSSARG00000007888	SMARCA2	91	78.947	ENSIPUG00000011060	smarca2	95	77.439	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.895	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	95	97.895	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	98.324	ENSJJAG00000010867	Smarca2	95	98.276	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	90	75.581	ENSKMAG00000015844	-	93	70.930	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	93	73.158	ENSLOCG00000011499	smarca2	95	72.280	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	98.276	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	96	98.276	Loxodonta_africana
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	95	96.842	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	95	97.531	Macaca_mulatta
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	95	96.842	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	95	96.842	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	90	76.437	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	93	71.839	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	93	78.808	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	93	72.989	Maylandia_zebra
ENSSARG00000007888	SMARCA2	73	63.712	ENSMGAG00000005160	-	97	63.019	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.895	ENSMICG00000005162	SMARCA2	95	97.895	Microcebus_murinus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSMOCG00000001611	Smarca2	95	97.126	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000007888	SMARCA2	93	68.539	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	87	83.860	Mola_mola
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	93.678	ENSMODG00000003578	SMARCA2	95	93.678	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000007888	SMARCA2	89	79.470	ENSMALG00000009611	SMARCA2	92	73.620	Monopterus_albus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	96.316	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	96	95.977	Mus_caroli
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	95.263	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	95.263	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	96	95.977	Mus_pahari
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	95.263	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	96	95.402	Mus_spretus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	79	96.316	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	89	96.316	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000007888	SMARCA2	93	98.773	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	95	98.773	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	94.709	ENSNGAG00000000108	Smarca2	95	94.709	Nannospalax_galili
ENSSARG00000007888	SMARCA2	74	94.521	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.354	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	95	97.126	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000007888	SMARCA2	89	84.925	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	89	84.925	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	94.828	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	95	94.828	Ochotona_princeps
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	90.270	ENSODEG00000005452	SMARCA2	94	93.939	Octodon_degus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	88	79.470	ENSONIG00000014163	SMARCA2	92	74.847	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	97.126	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	95	97.126	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	90	74.144	ENSORLG00000020820	SMARCA2	88	84.859	Oryzias_latipes
ENSSARG00000007888	SMARCA2	90	74.207	ENSORLG00015006289	SMARCA2	88	84.859	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000007888	SMARCA2	89	92.391	ENSOMEG00000009736	-	89	92.391	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000007888	SMARCA2	91	95.930	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	95	95.930	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	96.552	ENSOARG00000013265	SMARCA2	95	96.552	Ovis_aries
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	97.126	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	95	97.368	Pan_paniscus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	95	97.126	Panthera_pardus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.368	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	95	97.368	Pan_troglodytes
ENSSARG00000007888	SMARCA2	89	96.842	ENSPANG00000025121	SMARCA2	90	96.842	Papio_anubis
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	74.138	ENSPKIG00000018469	-	95	72.414	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	89.080	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	95	89.080	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000007888	SMARCA2	89	71.046	ENSPMGG00000013696	-	92	65.991	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	96.842	ENSPEMG00000019821	Smarca2	95	97.126	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000007888	SMARCA2	88	87.805	ENSPMAG00000005337	-	84	86.154	Petromyzon_marinus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	94.828	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	95	94.828	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	74.713	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	93	70.115	Poecilia_formosa
ENSSARG00000007888	SMARCA2	93	78.146	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	86	82.030	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000007888	SMARCA2	93	78.146	ENSPMEG00000001815	-	88	82.030	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	74.713	ENSPREG00000013800	SMARCA2	93	70.115	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000007888	SMARCA2	94	94.828	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	95	94.828	Pongo_abelii
ENSSARG00000007888	SMARCA2	77	71.512	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	71.512	Procavia_capensis
ENSSARG00000007888	SMARCA2	95	97.368	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	95	97.368	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000007888	SMARCA2	87	98.421	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	90	98.421	Pteropus_vampyrus
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