EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000008664 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29011 bases
Position: chrGeneScaffold_2883:42898-71908
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000007848	GTP_EFTU	PF00009.27	1.9e-45	1	1
ENSSARP00000007848	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	5.1e-13	1	1
ENSSARP00000007848	EFG_IV	PF03764.18	1.2e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000008671	EFTUD2-201	2901	-	ENSSARP00000007848	966 (aa)	-	UPI0001581392

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000008664's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000008664's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSARG00000008664	EFTUD2	71	42.757	ENSSARG00000005757	EEF2	77	40.406

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.255	ENSG00000108883	EFTUD2	100	97.973	Homo_sapiens
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.053	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	83.848	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.152	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	80.556	ENSACIG00000009096	eftud2	100	80.350	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	87	78.824	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	78.824	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.156	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	83.951	Amphiprion_percula
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.671	ENSATEG00000000457	eftud2	100	84.671	Anabas_testudineus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	99	86.715	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	86.715	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.095	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	89.095	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.152	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.259	ENSACLG00000001296	eftud2	100	84.053	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.419	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	83.521	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.049	Bos_taurus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	99	63.843	WBGene00001166	eftu-2	99	63.740	Caenorhabditis_elegans
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.152	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.152	Canis_familiaris
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.152	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.049	Capra_hircus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.741	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	90.741	Carlito_syrichta
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.329	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	90.329	Cavia_aperea
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.329	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.329	Cavia_porcellus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.152	Cebus_capucinus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.152	Cercocebus_atys
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.226	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	90.226	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.152	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	91	77.590	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	77.590	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.918	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	89.918	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	71.179	ENSCING00000009372	-	100	71.179	Ciona_intestinalis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	99	71.502	ENSCSAVG00000004985	-	100	71.604	Ciona_savignyi
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.152	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.049	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.049	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.848	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	83.642	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.362	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	84.362	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.025	ENSDARG00000012261	eftud2	100	83.128	Danio_rerio
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.535	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	90.535	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.947	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	90.947	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	68.821	FBgn0039566	CG4849	100	68.821	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000008664	EFTUD2	92	95.109	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	95.109	Echinops_telfairi
ENSSARG00000008664	EFTUD2	74	89.055	ENSEBUG00000004047	-	85	89.055	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.152	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.049	Equus_caballus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	83	93.220	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	93.220	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	82.922	ENSELUG00000017169	eftud2	100	82.922	Esox_lucius
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.049	Felis_catus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.300	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	89.300	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.741	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	90.741	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.362	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	84.362	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.230	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	83.436	Gadus_morhua
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.403	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	89.871	Gallus_gallus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.362	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	84.259	Gambusia_affinis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.745	ENSGACG00000009163	eftud2	100	83.539	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	94	98.956	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.156	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	83.951	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.329	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	90.329	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.329	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.329	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	82.922	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	82.922	Hippocampus_comes
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.230	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	84.156	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	85.185	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	85.185	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	96	90.705	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	90.705	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.642	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	83.436	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	95	83.387	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	83.647	Labrus_bergylta
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	86.434	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	86.434	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.053	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	84.053	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.844	Loxodonta_africana
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.152	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	93	100.000	Macaca_mulatta
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.152	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.152	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.568	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	84.568	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.259	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	84.053	Maylandia_zebra
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.425	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	89.425	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.049	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.152	Microcebus_murinus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	92	74.266	ENSMOCG00000017653	-	90	74.266	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSMOCG00000009039	-	100	91.152	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000008664	EFTUD2	87	84.706	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	84.706	Mola_mola
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	90.844	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000008664	EFTUD2	87	82.941	ENSMALG00000014501	eftud2	100	82.941	Monopterus_albus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	90.844	Mus_caroli
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	90.844	Mus_musculus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	90.844	Mus_pahari
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	90.844	Mus_spretus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	97	90.678	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	90.678	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.152	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.049	Nannospalax_galili
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.156	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	83.951	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000008664	EFTUD2	97	89.054	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.054	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	87.140	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.140	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000008664	EFTUD2	90	98.792	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	90	98.792	Ochotona_princeps
ENSSARG00000008664	EFTUD2	93	69.540	ENSODEG00000003385	-	100	69.540	Octodon_degus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.226	ENSODEG00000018041	-	100	90.226	Octodon_degus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.259	ENSONIG00000000912	eftud2	100	84.053	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.358	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.358	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.951	ENSORLG00000003109	eftud2	100	83.951	Oryzias_latipes
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.848	ENSORLG00020009865	eftud2	100	83.848	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.848	ENSORLG00015002611	eftud2	100	85.076	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	88.889	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	88.889	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.049	Ovis_aries
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.255	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	94	99.217	Pan_paniscus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.152	Panthera_pardus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.152	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.255	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	94	99.217	Pan_troglodytes
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.152	Papio_anubis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	93	87.982	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	87.982	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	76.646	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	76.646	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.049	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	90.844	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.362	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	84.259	Poecilia_formosa
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.362	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	84.259	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.362	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	84.259	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.712	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.712	Pongo_abelii
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	87.037	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.037	Procavia_capensis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.049	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	86.214	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.214	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.156	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	83.951	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.642	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	84.259	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	90.844	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.049	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.049	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000008664	EFTUD2	88	36.591	YKL173W	SNU114	89	35.000	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.152	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	96	90.512	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	90.512	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.539	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	83.539	Scleropages_formosus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.951	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	83.745	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.156	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	83.951	Seriola_dumerili
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.259	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	84.053	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	88.992	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	88.992	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.259	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	84.053	Stegastes_partitus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.947	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	90.947	Sus_scrofa
ENSSARG00000008664	EFTUD2	83	89.068	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	89.068	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.642	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	83.436	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	79.201	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	78.996	Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	85.494	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.494	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	82.510	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	82.510	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.041	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.041	Ursus_americanus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.152	Ursus_maritimus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	89	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.152	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000008664	EFTUD2	96	86.567	ENSXETG00000003394	eftud2	98	87.486	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000008664	EFTUD2	81	83.546	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	83.546	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.362	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	84.259	Xiphophorus_maculatus