EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000011520 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 80223 bases
Position: chrGeneScaffold_2821:200744-280966
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000010420	PAZ	PF02170.22	5e-29	1	1
ENSSARP00000010420	Piwi	PF02171.17	4.5e-42	1	2
ENSSARP00000010420	Piwi	PF02171.17	4.5e-42	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000011535	AGO1-201	2574	-	ENSSARP00000010420	857 (aa)	-	UPI0001582942

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSARG00000011520	AGO1	52	90.196	ENSSARG00000011504	AGO4	53	90.196
ENSSARG00000011520	AGO1	61	80.392	ENSSARG00000007232	-	70	80.392
ENSSARG00000011520	AGO1	74	93.137	ENSSARG00000011549	AGO3	72	93.137

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSG00000092847	AGO1	74	100.000	Homo_sapiens
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSAPOG00000024299	ago1	74	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	74	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000011520	AGO1	56	100.000	ENSACIG00000005298	ago1	70	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSAOCG00000017727	ago1	74	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSAPEG00000004458	ago1	74	100.000	Amphiprion_percula
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSATEG00000008523	ago1	74	100.000	Anabas_testudineus
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSAPLG00000010440	AGO1	72	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000011520	AGO1	65	100.000	ENSACAG00000029174	AGO1	71	100.000	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	74	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSACLG00000000890	ago1	74	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000011520	AGO1	54	100.000	ENSAMXG00000001917	ago1	66	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSBTAG00000012253	AGO1	74	100.000	Bos_taurus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCJAG00000032023	AGO1	74	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	74	100.000	Canis_familiaris
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCAFG00020009251	AGO1	79	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCHIG00000011848	-	74	100.000	Capra_hircus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSTSYG00000009767	-	74	100.000	Carlito_syrichta
ENSSARG00000011520	AGO1	74	84.615	ENSTSYG00000032426	-	75	84.615	Carlito_syrichta
ENSSARG00000011520	AGO1	63	100.000	ENSCAPG00000010228	AGO1	69	100.000	Cavia_aperea
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCPOG00000011568	AGO1	74	100.000	Cavia_porcellus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	74	100.000	Cebus_capucinus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCATG00000031521	AGO1	76	100.000	Cercocebus_atys
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCLAG00000011507	AGO1	74	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	74	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000011520	AGO1	60	100.000	ENSCHOG00000011591	AGO1	61	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCPBG00000018594	AGO1	74	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	76	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	74	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	73	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSCSEG00000001051	ago1	72	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSCVAG00000018173	ago1	74	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSDARG00000092644	ago1	74	100.000	Danio_rerio
ENSSARG00000011520	AGO1	65	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	71	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	81	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000011520	AGO1	57	100.000	ENSETEG00000007626	AGO1	67	100.000	Echinops_telfairi
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	74	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	74	100.000	Equus_caballus
ENSSARG00000011520	AGO1	66	100.000	ENSEEUG00000005349	AGO1	66	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000011520	AGO1	65	100.000	ENSELUG00000016803	ago1	71	100.000	Esox_lucius
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	77	100.000	Felis_catus
ENSSARG00000011520	AGO1	65	100.000	ENSFALG00000000790	AGO1	71	100.000	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSFDAG00000017210	AGO1	74	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSFHEG00000017927	ago1	73	100.000	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000011520	AGO1	61	98.462	ENSGMOG00000019413	ago1	70	98.462	Gadus_morhua
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSGALG00000002249	AGO1	74	100.000	Gallus_gallus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSGAFG00000009775	ago1	74	100.000	Gambusia_affinis
ENSSARG00000011520	AGO1	61	100.000	ENSGACG00000012443	ago1	70	100.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000011520	AGO1	65	100.000	ENSGAGG00000012893	-	71	100.000	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	74	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSHBUG00000010459	ago1	74	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSHGLG00000011540	AGO1	74	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	74	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSHCOG00000005708	ago1	73	100.000	Hippocampus_comes
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSIPUG00000023216	ago1	74	100.000	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	74	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSJJAG00000019449	Ago1	74	100.000	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSKMAG00000019464	ago1	74	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSLBEG00000007694	ago1	74	100.000	Labrus_bergylta
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSLACG00000017009	AGO1	73	100.000	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000011520	AGO1	74	95.279	ENSLOCG00000000504	AGO1	74	95.279	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	73	100.000	Loxodonta_africana
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSMFAG00000002846	AGO1	76	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSMMUG00000006251	AGO1	76	100.000	Macaca_mulatta
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSMNEG00000028881	AGO1	75	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSMLEG00000038388	AGO1	75	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSMAMG00000008381	ago1	74	100.000	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSMZEG00005007996	ago1	74	100.000	Maylandia_zebra
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSMGAG00000003822	AGO1	73	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSMAUG00000015189	Ago1	74	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSMICG00000016147	AGO1	74	100.000	Microcebus_murinus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSMOCG00000000537	Ago1	74	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000011520	AGO1	52	100.000	ENSMMOG00000018459	ago1	62	100.000	Mola_mola
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSMODG00000023335	AGO1	74	100.000	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSMALG00000011057	ago1	73	100.000	Monopterus_albus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	74	100.000	Mus_caroli
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSMUSG00000041530	Ago1	74	100.000	Mus_musculus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	74	100.000	Mus_pahari
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	74	100.000	Mus_spretus
ENSSARG00000011520	AGO1	58	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	69	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000011520	AGO1	53	99.781	ENSMLUG00000009628	AGO1	87	99.781	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSNGAG00000017448	Ago1	74	100.000	Nannospalax_galili
ENSSARG00000011520	AGO1	65	100.000	ENSNBRG00000010867	ago1	71	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSNLEG00000011181	AGO1	75	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000011520	AGO1	58	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	63	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	74	100.000	Ochotona_princeps
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSODEG00000005321	AGO1	74	100.000	Octodon_degus
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSONIG00000016345	ago1	73	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSOANG00000002080	AGO1	74	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSOCUG00000023116	AGO1	74	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSORLG00000014965	ago1	74	100.000	Oryzias_latipes
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSORLG00020018253	ago1	74	100.000	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSORLG00015003287	ago1	74	100.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSOMEG00000020528	ago1	74	100.000	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	ENSOGAG00000010279	AGO1	73	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSOARG00000019591	AGO1	74	100.000	Ovis_aries
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	74	100.000	Pan_paniscus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPPRG00000006475	AGO1	74	100.000	Panthera_pardus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPTIG00000020991	AGO1	74	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPTRG00000000528	AGO1	74	100.000	Pan_troglodytes
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPANG00000009060	AGO1	75	100.000	Papio_anubis
ENSSARG00000011520	AGO1	72	100.000	ENSPSIG00000017482	AGO1	74	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000011520	AGO1	54	100.000	ENSPMGG00000024099	ago1	66	100.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPEMG00000023313	Ago1	74	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPCIG00000000172	AGO1	74	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPFOG00000005867	ago1	74	100.000	Poecilia_formosa
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPLAG00000002824	ago1	74	100.000	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPMEG00000001787	ago1	74	100.000	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	ENSPREG00000006534	ago1	74	100.000	Poecilia_reticulata
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