EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSSARG00000012099 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
RPP38
Alias
-
Full Name
ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type
protein_coding
Species
Sorex_araneus
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
804 bases
Position
chrscaffold_148578:341-1144
Accession
30329
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSSARP00000010921Ribosomal_L7AePF01248.263.1e-1111
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSSART00000012093RPP38-201738-ENSSARP00000010921245 (aa)-UPI000158014E
Gene Model
Click here to download ENSSARG00000012099's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000012099's network
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSSARG00000012099RPP3810056.184ENSG00000152464RPP3810056.537Homo_sapiens
ENSSARG00000012099RPP389338.745ENSAPOG00000001240rpp389639.130Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000012099RPP3810058.363ENSAMEG00000018832RPP3810058.363Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000012099RPP389337.132ENSACIG00000011592rpp389838.267Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000012099RPP389338.489ENSAOCG00000017293rpp389938.832Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000012099RPP389338.491ENSAPEG00000002315rpp389938.849Amphiprion_percula
ENSSARG00000012099RPP389540.000ENSATEG00000000731rpp389840.000Anabas_testudineus
ENSSARG00000012099RPP388939.689ENSAPLG00000002054RPP389641.328Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000012099RPP386944.000ENSACLG00000016958rpp389941.328Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000012099RPP386943.500ENSACLG00000016962rpp389940.959Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000012099RPP388738.174ENSAMXG00000025023rpp389439.535Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000012099RPP3810056.383ENSBTAG00000007702RPP3810056.383Bos_taurus
ENSSARG00000012099RPP3810055.872ENSCAFG00000024373RPP3810056.228Canis_familiaris
ENSSARG00000012099RPP3810055.872ENSCAFG00020008008RPP3810056.228Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000012099RPP3810056.383ENSCHIG00000012484RPP3810056.383Capra_hircus
ENSSARG00000012099RPP3810053.521ENSCPOG00000003981RPP3810054.225Cavia_porcellus
ENSSARG00000012099RPP3810055.986ENSCLAG00000010194RPP3810055.986Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000012099RPP389354.545ENSCSAG00000019055RPP3810056.028Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000012099RPP3810054.930ENSCHOG00000004335RPP3810055.282Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000012099RPP3810053.047ENSCGRG00001001395Rpp3810054.122Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000012099RPP3810053.047ENSCGRG00000017441Rpp3810054.122Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000012099RPP389336.194ENSCSEG00000001721rpp389936.918Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000012099RPP389437.091ENSCVAG00000001676rpp389737.589Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000012099RPP388940.310ENSDARG00000040350rpp389639.927Danio_rerio
ENSSARG00000012099RPP3810054.610ENSDNOG00000040314RPP3810054.610Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000012099RPP3810054.513ENSDORG00000009783Rpp3810054.513Dipodomys_ordii
ENSSARG00000012099RPP3810056.429ENSETEG00000002839RPP3810056.429Echinops_telfairi
ENSSARG00000012099RPP389855.596ENSEASG00005019783RPP389855.957Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000012099RPP3810055.319ENSEEUG00000014677RPP3810055.319Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000012099RPP388638.376ENSELUG00000010160rpp389439.146Esox_lucius
ENSSARG00000012099RPP3810057.295ENSFCAG00000022449RPP3810057.651Felis_catus
ENSSARG00000012099RPP388941.634ENSFALG00000014804RPP389443.173Ficedula_albicollis
ENSSARG00000012099RPP3810053.521ENSFDAG00000018669RPP3810053.521Fukomys_damarensis
ENSSARG00000012099RPP389438.351ENSFHEG00000013741rpp389938.488Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000012099RPP389042.636ENSGALG00000008794RPP389243.704Gallus_gallus
ENSSARG00000012099RPP385242.675ENSGACG00000009258rpp389742.675Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000012099RPP386943.000ENSHBUG00000010937rpp389740.377Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000012099RPP3810054.225ENSHGLG00000012144RPP3810054.225Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000012099RPP388640.086ENSIPUG00000022879rpp389640.784Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000012099RPP3810054.064ENSSTOG00000025699RPP389854.417Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000012099RPP3810056.338ENSJJAG00000007523Rpp3810056.338Jaculus_jaculus
ENSSARG00000012099RPP388737.647ENSKMAG00000003986rpp389039.245Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000012099RPP388737.698ENSLBEG00000006853rpp389238.492Labrus_bergylta
ENSSARG00000012099RPP389442.806ENSLACG00000006502RPP3810043.493Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000012099RPP389542.857ENSLOCG00000018347rpp389542.857Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000012099RPP3810055.124ENSLAFG00000000509RPP3810055.124Loxodonta_africana
ENSSARG00000012099RPP389354.167ENSMMUG00000007679RPP3810055.674Macaca_mulatta
ENSSARG00000012099RPP389539.259ENSMAMG00000012774rpp389639.259Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000012099RPP386944.000ENSMZEG00005003189rpp389741.132Maylandia_zebra
ENSSARG00000012099RPP386944.000ENSMZEG00005003200rpp389941.328Maylandia_zebra
ENSSARG00000012099RPP389041.860ENSMGAG00000008217RPP389242.804Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000012099RPP3810054.480ENSMAUG00000003644Rpp3810054.480Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000012099RPP3810053.381ENSMOCG00000007020Rpp3810053.381Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000012099RPP389238.846ENSMMOG00000003446rpp389437.548Mola_mola
ENSSARG00000012099RPP389446.269ENSMODG00000024091RPP3810047.163Monodelphis_domestica
ENSSARG00000012099RPP389336.691ENSMALG00000002356rpp389736.691Monopterus_albus
ENSSARG00000012099RPP3810054.643MGP_CAROLIEiJ_G0023133Rpp3810054.643Mus_caroli
ENSSARG00000012099RPP3810055.000ENSMUSG00000049950Rpp3810055.000Mus_musculus
ENSSARG00000012099RPP3810053.929MGP_PahariEiJ_G0019193Rpp3810053.929Mus_pahari
ENSSARG00000012099RPP3810055.357MGP_SPRETEiJ_G0024051Rpp3810055.357Mus_spretus
ENSSARG00000012099RPP389955.914ENSMPUG00000018523RPP389956.631Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000012099RPP3810056.228ENSMLUG00000002153RPP3810056.228Myotis_lucifugus
ENSSARG00000012099RPP3810053.684ENSNGAG00000011066Rpp3810054.035Nannospalax_galili
ENSSARG00000012099RPP386943.500ENSNBRG00000006994rpp389840.755Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000012099RPP389437.931ENSONIG00000020467rpp389740.449Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000012099RPP389354.104ENSOCUG00000024367-10056.294Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000012099RPP389354.478ENSOCUG00000022768-10056.643Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000012099RPP388939.526ENSORLG00000009219rpp389639.623Oryzias_latipes
ENSSARG00000012099RPP388639.921ENSORLG00020011503rpp389638.462Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000012099RPP388737.945ENSORLG00015017702rpp389139.080Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000012099RPP388640.000ENSOMEG00000005414rpp389939.161Oryzias_melastigma
ENSSARG00000012099RPP3810055.674ENSOGAG00000008059RPP3810056.028Otolemur_garnettii
ENSSARG00000012099RPP3810056.738ENSOARG00000004534RPP3810056.738Ovis_aries
ENSSARG00000012099RPP3810056.184ENSPPAG00000041577RPP389156.537Pan_paniscus
ENSSARG00000012099RPP3810057.295ENSPPRG00000015329RPP3810057.651Panthera_pardus
ENSSARG00000012099RPP3810057.295ENSPTIG00000007188RPP3810057.651Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000012099RPP3810056.537ENSPTRG00000002318RPP389156.890Pan_troglodytes
ENSSARG00000012099RPP389241.912ENSPKIG00000025652rpp389441.818Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000012099RPP389645.848ENSPSIG00000001527RPP389745.848Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000012099RPP3810054.643ENSPEMG00000008375Rpp3810055.000Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000012099RPP3810048.582ENSPCIG00000009096RPP389448.582Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000012099RPP387045.143ENSPFOG00000016823rpp388245.143Poecilia_formosa
ENSSARG00000012099RPP389635.357ENSPLAG00000007626rpp389835.357Poecilia_latipinna
ENSSARG00000012099RPP388539.640ENSPMEG00000020392rpp389838.057Poecilia_mexicana
ENSSARG00000012099RPP388736.822ENSPREG00000017744rpp389336.822Poecilia_reticulata
ENSSARG00000012099RPP3810056.537ENSPPYG00000002113RPP3810056.890Pongo_abelii
ENSSARG00000012099RPP3810056.028ENSPVAG00000007155RPP3810056.028Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000012099RPP386944.000ENSPNYG00000004293rpp389741.132Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000012099RPP388643.277ENSPNAG00000010633rpp389943.820Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000012099RPP389855.762ENSRNOG00000038025Rpp389955.762Rattus_norvegicus
ENSSARG00000012099RPP3810049.645ENSSHAG00000015529RPP389849.817Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000012099RPP389639.259ENSSMAG00000018276rpp389839.259Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000012099RPP389337.218ENSSDUG00000001651rpp389839.483Seriola_dumerili
ENSSARG00000012099RPP389337.970ENSSLDG00000014355rpp389838.376Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000012099RPP389643.066ENSSPUG00000008560-9843.066Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000012099RPP3810045.775ENSSPUG00000005237-10045.775Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000012099RPP389945.035ENSSPUG00000018363-9945.035Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000012099RPP389339.700ENSSPAG00000020387rpp389640.074Stegastes_partitus
ENSSARG00000012099RPP3810057.895ENSSSCG00000027110RPP3810057.895Sus_scrofa
ENSSARG00000012099RPP388940.856ENSTGUG00000001366RPP389742.435Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000012099RPP389336.264ENSTNIG00000001334rpp389636.264Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000012099RPP3810057.092ENSTTRG00000004420RPP3810057.092Tursiops_truncatus
ENSSARG00000012099RPP3810056.940ENSUAMG00000002618RPP3810057.651Ursus_americanus
ENSSARG00000012099RPP3810056.890ENSUMAG00000012382RPP3810057.597Ursus_maritimus
ENSSARG00000012099RPP3810056.228ENSVVUG00000005272RPP3810056.584Vulpes_vulpes
ENSSARG00000012099RPP389138.971ENSXETG00000003419rpp389739.858Xenopus_tropicalis

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us