EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000012434 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRPRA
Alias: SR-alpha|SRP-alpha|SRPR|Sralpha
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5385 bases
Position: chrGeneScaffold_6855:123854-129238
Accession: 11307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000011240	SRP54	PF00448.22	1.7e-35	1	1
ENSSARP00000011240	SRP54_N	PF02881.19	2.3e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000012443	SRPRA-201	1803	-	ENSSARP00000011240	601 (aa)	-	UPI0001581B65

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000012434's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000012434's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSG00000182934	SRPRA	85	100.000	Homo_sapiens
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSAPOG00000017588	srpra	83	82.927	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSAMEG00000000117	SRPRA	81	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	80.488	ENSACIG00000021588	srpra	82	80.488	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSAOCG00000018884	srpra	82	82.927	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSAPEG00000022286	srpra	80	82.927	Amphiprion_percula
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	78.049	ENSATEG00000023578	srpra	82	78.049	Anabas_testudineus
ENSSARG00000012434	SRPRA	80	72.951	ENSAPLG00000016079	SRPRA	80	73.045	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	83.333	ENSACAG00000000108	SRPRA	81	83.333	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSANAG00000020346	SRPRA	85	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSACLG00000000518	srpra	81	82.927	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSAMXG00000009975	srpra	83	82.927	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSBTAG00000014105	SRPRA	81	100.000	Bos_taurus
ENSSARG00000012434	SRPRA	77	51.153	WBGene00009521	F38A1.8	72	52.220	Caenorhabditis_elegans
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCJAG00000008752	SRPRA	85	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000012434	SRPRA	85	91.494	ENSCAFG00000010474	SRPRA	80	91.286	Canis_familiaris
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCAFG00020010608	SRPRA	81	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCHIG00000012423	SRPRA	81	100.000	Capra_hircus
ENSSARG00000012434	SRPRA	75	100.000	ENSTSYG00000005187	SRPRA	82	100.000	Carlito_syrichta
ENSSARG00000012434	SRPRA	80	83.299	ENSCAPG00000007098	SRPRA	92	94.776	Cavia_aperea
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCPOG00000014976	SRPRA	92	94.776	Cavia_porcellus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCCAG00000025602	SRPRA	85	100.000	Cebus_capucinus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCATG00000039354	SRPRA	85	100.000	Cercocebus_atys
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCLAG00000016839	SRPRA	81	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCSAG00000002271	SRPRA	81	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000012434	SRPRA	57	96.939	ENSCHOG00000010015	-	72	96.939	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	83.333	ENSCPBG00000011128	SRPRA	82	83.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	73.171	ENSCING00000008954	-	85	73.171	Ciona_intestinalis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	70.732	ENSCSAVG00000005602	-	82	70.732	Ciona_savignyi
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCANG00000032337	SRPRA	85	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCGRG00001017670	Srpr	81	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	94.815	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	80.488	ENSCSEG00000002374	srpra	82	80.488	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	ENSCVAG00000019881	srpra	81	85.366	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	80.488	ENSDARG00000061124	srpra	82	80.488	Danio_rerio
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSDNOG00000010821	SRPRA	81	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSDORG00000016719	Srpr	81	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000012434	SRPRA	79	52.965	FBgn0010391	Gtp-bp	75	53.170	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSETEG00000013956	SRPRA	81	100.000	Echinops_telfairi
ENSSARG00000012434	SRPRA	59	67.778	ENSEBUG00000002602	srpra	83	66.667	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSEASG00005022980	SRPRA	81	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSECAG00000014692	SRPRA	81	100.000	Equus_caballus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSEEUG00000007920	SRPRA	81	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSELUG00000017643	srpra	82	82.927	Esox_lucius
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSFCAG00000011274	-	85	100.000	Felis_catus
ENSSARG00000012434	SRPRA	71	100.000	ENSFCAG00000030894	-	84	100.000	Felis_catus
ENSSARG00000012434	SRPRA	80	72.222	ENSFALG00000005048	SRPRA	76	72.016	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	96.970	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSFHEG00000016959	srpra	82	82.927	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	80.488	ENSGMOG00000013244	srpra	81	80.488	Gadus_morhua
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	80.952	ENSGALG00000030759	SRPRA	81	80.952	Gallus_gallus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	ENSGAFG00000000453	srpra	81	85.366	Gambusia_affinis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSGACG00000006550	srpra	81	82.927	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	83.333	ENSGAGG00000021157	SRPRA	82	83.333	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSGGOG00000012962	SRPRA	85	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSHBUG00000000119	srpra	81	82.927	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	96.970	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	96.970	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSHCOG00000010749	srpra	82	82.927	Hippocampus_comes
ENSSARG00000012434	SRPRA	79	61.303	ENSIPUG00000000867	srpra	79	60.692	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSSTOG00000009897	SRPRA	81	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSJJAG00000020272	Srpr	81	100.000	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSKMAG00000002280	srpra	81	82.927	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	ENSLBEG00000009608	srpra	82	85.366	Labrus_bergylta
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	87.179	ENSLACG00000017781	SRPRA	81	87.179	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSLOCG00000002733	srpra	82	82.927	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSLAFG00000010252	SRPRA	81	100.000	Loxodonta_africana
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMFAG00000032606	SRPRA	85	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMMUG00000007938	SRPRA	85	100.000	Macaca_mulatta
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMNEG00000030709	SRPRA	85	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMLEG00000043404	SRPRA	85	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSMAMG00000000473	srpra	81	82.927	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSMZEG00005013432	srpra	81	82.927	Maylandia_zebra
ENSSARG00000012434	SRPRA	80	72.840	ENSMGAG00000000732	SRPRA	80	72.840	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMAUG00000015648	Srpr	81	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMICG00000015981	SRPRA	85	100.000	Microcebus_murinus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMOCG00000008311	Srpr	81	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSMMOG00000005019	srpra	81	82.927	Mola_mola
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMODG00000004576	-	83	100.000	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSMALG00000011343	srpra	82	82.927	Monopterus_albus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	95.455	Mus_caroli
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	96.212	Mus_musculus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	96.212	Mus_pahari
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	82	100.000	Mus_spretus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMPUG00000006626	SRPRA	81	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSMLUG00000017334	SRPRA	81	100.000	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSNGAG00000015686	Srpr	81	100.000	Nannospalax_galili
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSNBRG00000017311	srpra	81	82.927	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000012434	SRPRA	80	90.664	ENSNLEG00000007467	SRPRA	82	90.456	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000012434	SRPRA	80	85.685	ENSMEUG00000004956	SRPRA	80	85.685	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSOPRG00000013160	SRPRA	81	100.000	Ochotona_princeps
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSODEG00000004730	SRPRA	81	100.000	Octodon_degus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSONIG00000005324	srpra	81	82.927	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSOCUG00000017057	SRPRA	81	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSORLG00000014676	srpra	84	82.927	Oryzias_latipes
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSORLG00020009240	srpra	81	82.927	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSORLG00015015405	srpra	81	82.927	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSOMEG00000005872	srpra	81	82.927	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSOGAG00000008926	SRPRA	81	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000012434	SRPRA	84	91.423	ENSOARG00000012397	SRPRA	79	91.841	Ovis_aries
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSPPAG00000030813	SRPRA	85	100.000	Pan_paniscus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSPPRG00000001542	SRPRA	85	100.000	Panthera_pardus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSPTIG00000006989	SRPRA	85	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSPTRG00000028360	SRPRA	85	100.000	Pan_troglodytes
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSPANG00000010858	SRPRA	85	100.000	Papio_anubis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	80.488	ENSPKIG00000016106	srpra	82	80.488	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000012434	SRPRA	80	72.912	ENSPSIG00000012009	SRPRA	80	72.912	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	80.488	ENSPMGG00000001393	srpra	81	80.488	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSPEMG00000018279	Srpr	81	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000012434	SRPRA	83	82.051	ENSPMAG00000009559	srpra	78	82.051	Petromyzon_marinus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSPCIG00000010207	SRPRA	81	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	ENSPFOG00000003114	srpra	82	85.366	Poecilia_formosa
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	ENSPLAG00000007323	srpra	82	85.366	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	ENSPMEG00000015658	srpra	82	85.366	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	ENSPREG00000004937	srpra	82	85.366	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000012434	SRPRA	74	100.000	ENSPPYG00000004045	SRPRA	79	100.000	Pongo_abelii
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSPCOG00000025726	SRPRA	83	100.000	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSPVAG00000000993	SRPRA	81	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSPNYG00000012371	srpra	81	82.927	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	80.488	ENSPNAG00000013476	srpra	81	80.488	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSRNOG00000010543	Srpra	81	100.000	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSRBIG00000008702	SRPRA	85	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSRROG00000029494	SRPRA	85	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSSBOG00000035892	SRPRA	85	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000012434	SRPRA	80	86.279	ENSSHAG00000009168	SRPRA	92	85.744	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000012434	SRPRA	85	78.049	ENSSFOG00015008837	srpra	79	78.049	Scleropages_formosus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	ENSSMAG00000002783	srpra	80	85.366	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSSDUG00000013920	srpra	79	82.927	Seriola_dumerili
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSSLDG00000008601	srpra	76	82.927	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	83.333	ENSSPUG00000018221	SRPRA	81	83.333	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSSPAG00000005103	srpra	82	82.927	Stegastes_partitus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSSSCG00000015227	SRPRA	81	100.000	Sus_scrofa
ENSSARG00000012434	SRPRA	80	70.165	ENSTGUG00000000815	SRPRA	80	69.857	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSTRUG00000006856	srpra	81	82.927	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	ENSTNIG00000010316	srpra	80	82.927	Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSTTRG00000001558	SRPRA	81	100.000	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSUAMG00000005510	SRPRA	81	100.000	Ursus_americanus
ENSSARG00000012434	SRPRA	80	85.072	ENSUMAG00000002269	SRPRA	79	84.867	Ursus_maritimus
ENSSARG00000012434	SRPRA	58	93.478	ENSVPAG00000001077	SRPRA	58	93.478	Vicugna_pacos
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	ENSVVUG00000020094	SRPRA	81	100.000	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	87.179	ENSXETG00000003920	srpra	81	87.179	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000012434	SRPRA	72	85.366	ENSXCOG00000001286	srpra	82	85.366	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	ENSXMAG00000028401	srpra	83	85.366	Xiphophorus_maculatus