EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000012889 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5568 bases
Position: chrGeneScaffold_2222:47267-52834
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000011639	SYF2	PF08231.12	1.6e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000012886	SYF2-201	735	-	ENSSARP00000011639	244 (aa)	-	UPI0001580D45

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000012889's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000012889's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	ENSG00000117614	SYF2	100	74.590	Homo_sapiens
ENSSARG00000012889	SYF2	91	65.315	ENSAPOG00000001174	syf2	99	62.656	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000012889	SYF2	64	92.308	ENSAMEG00000010134	-	81	92.357	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000012889	SYF2	97	73.950	ENSAMEG00000010115	-	98	73.950	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000012889	SYF2	95	61.207	ENSACIG00000023688	syf2	91	61.207	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000012889	SYF2	92	59.821	ENSAOCG00000010912	syf2	69	59.821	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000012889	SYF2	99	62.656	ENSAOCG00000022046	syf2	98	63.675	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000012889	SYF2	99	62.656	ENSAPEG00000018858	syf2	92	62.656	Amphiprion_percula
ENSSARG00000012889	SYF2	89	63.594	ENSATEG00000007745	syf2	99	60.581	Anabas_testudineus
ENSSARG00000012889	SYF2	64	86.538	ENSAPLG00000016435	SYF2	78	86.624	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000012889	SYF2	64	82.803	ENSACAG00000013653	-	77	82.803	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000012889	SYF2	64	73.418	ENSACAG00000026777	-	95	73.418	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	ENSANAG00000032473	SYF2	100	74.590	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000012889	SYF2	91	61.712	ENSACLG00000019916	syf2	99	59.336	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000012889	SYF2	100	61.475	ENSAMXG00000004051	syf2	100	61.475	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.102	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	75.424	Bos_taurus
ENSSARG00000012889	SYF2	63	49.677	WBGene00019402	syf-2	66	49.032	Caenorhabditis_elegans
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	74.590	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000012889	SYF2	92	67.556	ENSCAFG00000030331	-	96	67.556	Canis_familiaris
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.984	ENSCAFG00000012895	-	100	73.984	Canis_familiaris
ENSSARG00000012889	SYF2	64	92.994	ENSCAFG00020021094	-	83	92.994	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.984	ENSCAFG00020021091	-	100	73.984	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.820	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	75.820	Capra_hircus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.410	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	75.410	Carlito_syrichta
ENSSARG00000012889	SYF2	64	95.484	ENSCAPG00000010006	SYF2	79	95.513	Cavia_aperea
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.541	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	72.541	Cavia_porcellus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.000	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	75.000	Cebus_capucinus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.361	ENSCATG00000026917	SYF2	100	73.361	Cercocebus_atys
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.694	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	74.694	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.361	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	73.361	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000012889	SYF2	74	60.773	ENSCHOG00000005273	-	100	60.773	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000012889	SYF2	92	69.778	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	68.103	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000012889	SYF2	64	54.717	ENSCING00000003017	-	66	54.088	Ciona_intestinalis
ENSSARG00000012889	SYF2	64	53.459	ENSCSAVG00000006627	-	73	53.459	Ciona_savignyi
ENSSARG00000012889	SYF2	100	61.475	ENSCANG00000037322	SYF2	100	61.475	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.541	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	72.541	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000012889	SYF2	64	92.949	ENSCGRG00000005095	Syf2	76	92.994	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000012889	SYF2	89	61.468	ENSCSEG00000000117	syf2	95	60.793	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000012889	SYF2	91	62.443	ENSCVAG00000019543	syf2	99	59.751	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000012889	SYF2	96	61.765	ENSDARG00000004706	syf2	100	61.765	Danio_rerio
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.286	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	74.286	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.102	ENSDORG00000001274	Syf2	100	75.102	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000012889	SYF2	64	59.119	FBgn0033556	CG12343	70	59.119	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000012889	SYF2	89	58.796	ENSETEG00000015729	SYF2	100	58.261	Echinops_telfairi
ENSSARG00000012889	SYF2	64	57.325	ENSEBUG00000015402	syf2	74	57.325	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000012889	SYF2	100	66.803	ENSEASG00005004232	-	100	66.803	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000012889	SYF2	99	73.251	ENSEASG00005004224	-	99	73.251	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.694	ENSECAG00000012023	-	100	74.694	Equus_caballus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.541	ENSECAG00000010440	-	100	72.541	Equus_caballus
ENSSARG00000012889	SYF2	75	56.831	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	56.831	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000012889	SYF2	91	66.516	ENSELUG00000003465	syf2	93	66.516	Esox_lucius
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.797	ENSFCAG00000043095	-	100	74.797	Felis_catus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.286	ENSFCAG00000010324	-	85	74.286	Felis_catus
ENSSARG00000012889	SYF2	64	85.350	ENSFALG00000000460	SYF2	92	66.522	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.951	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	72.951	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000012889	SYF2	91	76.786	ENSFHEG00000007238	syf2	99	76.786	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000012889	SYF2	88	66.047	ENSGMOG00000019138	syf2	96	66.047	Gadus_morhua
ENSSARG00000012889	SYF2	92	69.778	ENSGALG00000013639	SYF2	96	66.390	Gallus_gallus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	58.607	ENSGAFG00000019435	syf2	100	58.607	Gambusia_affinis
ENSSARG00000012889	SYF2	88	65.116	ENSGACG00000007305	syf2	98	61.966	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000012889	SYF2	92	70.222	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	68.534	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	74.590	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000012889	SYF2	93	61.373	ENSHBUG00000020477	syf2	100	61.373	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000012889	SYF2	92	71.429	ENSHGLG00000004304	-	96	70.435	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000012889	SYF2	99	72.428	ENSHGLG00000014393	SYF2	99	72.428	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000012889	SYF2	99	72.428	ENSHGLG00100014722	SYF2	99	72.428	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000012889	SYF2	98	60.581	ENSHCOG00000012904	syf2	79	60.581	Hippocampus_comes
ENSSARG00000012889	SYF2	99	62.810	ENSIPUG00000019859	syf2	99	62.810	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000012889	SYF2	64	94.231	ENSJJAG00000013301	Syf2	74	94.268	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000012889	SYF2	99	59.751	ENSKMAG00000013856	syf2	99	59.751	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000012889	SYF2	90	63.927	ENSLBEG00000014425	syf2	99	60.996	Labrus_bergylta
ENSSARG00000012889	SYF2	89	66.972	ENSLACG00000012064	SYF2	92	66.972	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000012889	SYF2	100	62.295	ENSLOCG00000002728	syf2	95	62.295	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.469	ENSLAFG00000023150	-	100	73.469	Loxodonta_africana
ENSSARG00000012889	SYF2	50	57.258	ENSLAFG00000030814	-	71	58.462	Loxodonta_africana
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.770	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	73.770	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.361	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	73.770	Macaca_mulatta
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.770	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	73.770	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.361	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	73.361	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	57.377	ENSMAMG00000010403	syf2	97	58.506	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000012889	SYF2	99	59.336	ENSMZEG00005006429	syf2	99	59.336	Maylandia_zebra
ENSSARG00000012889	SYF2	64	86.538	ENSMGAG00000002019	SYF2	79	86.624	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.541	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	72.541	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000012889	SYF2	90	77.273	ENSMICG00000016191	SYF2	100	77.273	Microcebus_murinus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.770	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	73.770	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000012889	SYF2	91	60.811	ENSMMOG00000002396	syf2	93	60.811	Mola_mola
ENSSARG00000012889	SYF2	93	68.860	ENSMODG00000013951	-	99	68.860	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000012889	SYF2	100	59.592	ENSMALG00000010706	syf2	100	60.000	Monopterus_albus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.951	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	72.951	Mus_caroli
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.951	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	72.951	Mus_musculus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.951	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	72.951	Mus_pahari
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.951	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	72.951	Mus_spretus
ENSSARG00000012889	SYF2	98	72.803	ENSMPUG00000015801	-	97	72.803	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.984	ENSMPUG00000015802	-	100	73.984	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000012889	SYF2	98	73.333	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	73.333	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.390	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	74.390	Nannospalax_galili
ENSSARG00000012889	SYF2	99	52.846	ENSNBRG00000010720	syf2	99	52.846	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	74.590	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.951	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	72.951	Ochotona_princeps
ENSSARG00000012889	SYF2	100	67.347	ENSODEG00000014338	-	100	67.347	Octodon_degus
ENSSARG00000012889	SYF2	96	73.932	ENSODEG00000017664	-	98	73.932	Octodon_degus
ENSSARG00000012889	SYF2	91	61.712	ENSONIG00000008213	syf2	99	59.336	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000012889	SYF2	64	87.898	ENSOANG00000009552	SYF2	78	87.898	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000012889	SYF2	99	73.663	ENSOCUG00000013050	SYF2	99	74.074	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000012889	SYF2	91	63.514	ENSORLG00000028820	syf2	94	64.384	Oryzias_latipes
ENSSARG00000012889	SYF2	91	63.514	ENSORLG00020018333	syf2	94	63.514	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000012889	SYF2	97	61.181	ENSORLG00015014665	syf2	96	61.638	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000012889	SYF2	99	59.917	ENSOMEG00000013911	syf2	99	59.917	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.286	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	74.286	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.494	ENSOARG00000006348	-	100	74.494	Ovis_aries
ENSSARG00000012889	SYF2	64	62.420	ENSOARG00000006269	-	81	60.510	Ovis_aries
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	74.590	Pan_paniscus
ENSSARG00000012889	SYF2	97	75.527	ENSPPRG00000001638	-	96	75.527	Panthera_pardus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.797	ENSPPRG00000001651	-	100	74.797	Panthera_pardus
ENSSARG00000012889	SYF2	89	76.852	ENSPTIG00000005711	-	80	77.064	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.797	ENSPTIG00000007036	-	100	74.797	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	74.590	Pan_troglodytes
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.770	ENSPANG00000008139	SYF2	100	73.770	Papio_anubis
ENSSARG00000012889	SYF2	100	61.066	ENSPKIG00000008130	syf2	94	64.706	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000012889	SYF2	95	67.672	ENSPSIG00000011816	SYF2	90	67.672	Pelodiscus_sinensis
ENSSARG00000012889	SYF2	97	59.746	ENSPMGG00000008755	syf2	92	59.746	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.361	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	73.361	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000012889	SYF2	92	72.768	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	68.400	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000012889	SYF2	95	60.345	ENSPFOG00000004116	syf2	95	60.345	Poecilia_formosa
ENSSARG00000012889	SYF2	95	60.345	ENSPLAG00000006691	syf2	98	60.345	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000012889	SYF2	97	57.627	ENSPMEG00000011684	syf2	100	57.627	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000012889	SYF2	89	62.037	ENSPREG00000003009	syf2	100	58.403	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	74.590	Pongo_abelii
ENSSARG00000012889	SYF2	100	62.295	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.295	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000012889	SYF2	100	63.265	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	63.265	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000012889	SYF2	91	61.712	ENSPNYG00000004979	syf2	99	59.336	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000012889	SYF2	100	63.525	ENSPNAG00000015570	syf2	100	63.525	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.951	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	72.951	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	71.311	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	71.311	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.770	ENSRROG00000001347	SYF2	100	73.770	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.180	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	74.180	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000012889	SYF2	100	67.470	ENSSHAG00000015630	-	100	68.273	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000012889	SYF2	64	91.720	ENSSHAG00000007152	-	76	91.720	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000012889	SYF2	100	61.633	ENSSFOG00015023647	syf2	100	61.633	Scleropages_formosus
ENSSARG00000012889	SYF2	99	58.506	ENSSMAG00000009867	syf2	99	58.506	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000012889	SYF2	89	63.761	ENSSDUG00000013072	syf2	100	59.836	Seriola_dumerili
ENSSARG00000012889	SYF2	89	63.761	ENSSLDG00000012677	syf2	98	60.924	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000012889	SYF2	99	64.876	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	64.876	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000012889	SYF2	96	60.084	ENSSPAG00000009626	syf2	100	60.084	Stegastes_partitus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.694	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	74.694	Sus_scrofa
ENSSARG00000012889	SYF2	91	62.162	ENSTRUG00000001499	syf2	89	62.162	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000012889	SYF2	91	61.435	ENSTNIG00000016912	syf2	100	61.435	Tetraodon_nigroviridis
ENSSARG00000012889	SYF2	100	54.918	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	54.098	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.000	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	75.000	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.764	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	72.764	Ursus_americanus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.171	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	73.171	Ursus_maritimus
ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.180	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	74.180	Vicugna_pacos
ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.984	ENSVVUG00000027175	-	100	73.984	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000012889	SYF2	64	92.949	ENSVVUG00000027181	-	100	71.888	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000012889	SYF2	95	65.517	ENSXETG00000022797	syf2	93	65.517	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000012889	SYF2	88	62.326	ENSXMAG00000022698	syf2	99	58.091	Xiphophorus_maculatus