EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000012943 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13634 bases
Position: chrscaffold_235330:8806-22439
Accession: 101549074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000011694	MMR_HSR1	PF01926.23	3e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000012949	SRPRB-201	810	XM_004602964	ENSSARP00000011694	269 (aa)	XP_004603021	UPI000158153C

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000012943's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000012943's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.037	ENSG00000144867	SRPRB	99	93.711	Homo_sapiens
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	89.668	ENSANAG00000028236	SRPRB	100	89.668	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	93.727	ENSBTAG00000044075	SRPRB	92	93.727	Bos_taurus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	89.668	ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.668	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	92.251	ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.251	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	92.620	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	92.620	Capra_hircus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	87.454	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	87.454	Carlito_syrichta
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	80.812	ENSCPOG00000030107	SRPRB	100	80.812	Cavia_porcellus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	87.454	ENSCCAG00000033027	SRPRB	100	87.454	Cebus_capucinus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.406	ENSCATG00000033438	SRPRB	100	90.406	Cercocebus_atys
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	87.085	ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	87.085	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.406	ENSCSAG00000010699	SRPRB	100	90.406	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	81.919	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	81.919	Choloepus_hoffmanni
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	74.539	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	74.539	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	88.561	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	88.561	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000012943	SRPRB	94	89.453	ENSCGRG00000014367	Srprb	98	89.453	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	87.823	ENSDNOG00000032146	SRPRB	100	87.823	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000012943	SRPRB	86	84.483	ENSDORG00000000764	Srprb	85	86.758	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	91.882	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	91.882	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	91.882	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	91.882	Equus_caballus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	92.620	ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	92.620	Felis_catus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	86.716	ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	86.716	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.406	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	90.406	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	86.347	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	86.347	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	86.347	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	86.347	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	81.919	ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	81.919	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.406	ENSMFAG00000039758	SRPRB	100	90.406	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.406	ENSMMUG00000008918	SRPRB	100	90.406	Macaca_mulatta
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.406	ENSMNEG00000032832	SRPRB	100	90.406	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.406	ENSMLEG00000035589	SRPRB	100	90.406	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	88.930	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	88.930	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	89.299	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	89.299	Microcebus_murinus
ENSSARG00000012943	SRPRB	97	84.791	ENSMODG00000018493	SRPRB	98	84.791	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	88.192	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	88.192	Mus_caroli
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	88.192	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	88.192	Mus_musculus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	88.930	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	88.930	Mus_pahari
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	88.192	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	88.192	Mus_spretus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	92.620	ENSMPUG00000009687	SRPRB	100	92.620	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	88.192	ENSNGAG00000024311	-	100	88.192	Nannospalax_galili
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	89.668	ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	89.668	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	86.716	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	86.716	Octodon_degus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	91.882	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	91.882	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	88.561	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	88.561	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000012943	SRPRB	85	90.000	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	93.151	Ovis_aries
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.037	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	90.037	Pan_paniscus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	92.620	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	92.620	Panthera_pardus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	92.251	ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	92.251	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.037	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	90.037	Pan_troglodytes
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.037	ENSPANG00000023015	SRPRB	100	90.037	Papio_anubis
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	89.299	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	89.299	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.037	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	90.037	Pongo_abelii
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	78.967	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	78.967	Procavia_capensis
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	93.358	ENSPVAG00000011319	SRPRB	100	93.358	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.037	ENSRBIG00000027819	SRPRB	100	90.037	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.037	ENSRROG00000030536	SRPRB	100	90.037	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000012943	SRPRB	75	88.060	ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.775	ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	90.775	Sus_scrofa
ENSSARG00000012943	SRPRB	99	87.361	ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	87.732	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	84.871	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	84.871	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	91.882	ENSUAMG00000018135	SRPRB	100	91.882	Ursus_americanus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	91.513	ENSUMAG00000015817	SRPRB	100	91.513	Ursus_maritimus
ENSSARG00000012943	SRPRB	100	92.989	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	92.989	Vulpes_vulpes