EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000013953 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 94618 bases
Position: chrGeneScaffold_5587:8072-102689
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000012629	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-08	1	2
ENSSARP00000012629	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-08	2	2
ENSSARP00000012629	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	2.7e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000013972	-	3471	-	ENSSARP00000012629	1156 (aa)	-	UPI0001581979

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSG00000170325	PRDM10	74	100.000	Homo_sapiens
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSAMEG00000002425	PRDM10	65	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSAPLG00000004858	PRDM10	68	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSANAG00000022064	PRDM10	74	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSBTAG00000019001	PRDM10	67	100.000	Bos_taurus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCJAG00000009235	PRDM10	68	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCAFG00000010164	PRDM10	68	100.000	Canis_familiaris
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCAFG00020010152	PRDM10	68	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCHIG00000026530	PRDM10	68	100.000	Capra_hircus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSTSYG00000000544	PRDM10	67	100.000	Carlito_syrichta
ENSSARG00000013953	-	62	85.393	ENSCAPG00000017296	PRDM10	67	83.862	Cavia_aperea
ENSSARG00000013953	-	63	80.662	ENSCPOG00000000389	PRDM10	67	80.469	Cavia_porcellus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCCAG00000024567	PRDM10	68	100.000	Cebus_capucinus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCATG00000040031	PRDM10	68	100.000	Cercocebus_atys
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCLAG00000014605	PRDM10	69	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCSAG00000002202	PRDM10	67	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCPBG00000026880	PRDM10	64	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCANG00000032669	PRDM10	67	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCGRG00001021647	Prdm10	68	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSCGRG00000006562	Prdm10	68	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSARG00000013953	-	50	100.000	ENSDNOG00000001366	PRDM10	57	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSDORG00000014292	Prdm10	68	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSARG00000013953	-	67	100.000	ENSEASG00005022914	PRDM10	68	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000013953	-	67	100.000	ENSECAG00000011499	PRDM10	68	100.000	Equus_caballus
ENSSARG00000013953	-	66	100.000	ENSFCAG00000004111	PRDM10	64	100.000	Felis_catus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSFALG00000004873	PRDM10	65	100.000	Ficedula_albicollis
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSFDAG00000017311	PRDM10	68	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSGALG00000033660	PRDM10	66	100.000	Gallus_gallus
ENSSARG00000013953	-	62	88.462	ENSGACG00000012293	prdm10	69	88.462	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000013953	-	68	98.077	ENSGAGG00000012523	PRDM10	67	98.077	Gopherus_agassizii
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSGGOG00000015359	PRDM10	68	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSHGLG00000001106	PRDM10	68	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSHGLG00100002350	PRDM10	68	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSSTOG00000002015	PRDM10	67	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000013953	-	59	100.000	ENSJJAG00000021493	Prdm10	62	100.000	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSLAFG00000031867	PRDM10	68	100.000	Loxodonta_africana
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSMFAG00000031008	PRDM10	68	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSMMUG00000017555	PRDM10	68	100.000	Macaca_mulatta
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSMNEG00000036493	PRDM10	68	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000013953	-	60	100.000	ENSMLEG00000042028	PRDM10	67	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSMGAG00000001112	PRDM10	65	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSMICG00000013888	PRDM10	67	100.000	Microcebus_murinus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSMOCG00000021853	Prdm10	69	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000013953	-	57	100.000	ENSMODG00000004979	PRDM10	74	100.000	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSMUSG00000042496	Prdm10	68	100.000	Mus_musculus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0033061	-	68	100.000	Mus_spretus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSMPUG00000008711	PRDM10	67	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSMLUG00000013051	PRDM10	67	100.000	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSNGAG00000000580	Prdm10	68	100.000	Nannospalax_galili
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSNLEG00000007488	PRDM10	68	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSODEG00000005309	PRDM10	70	100.000	Octodon_degus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSOANG00000000577	-	68	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSOCUG00000003736	PRDM10	67	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSOGAG00000010723	PRDM10	67	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSOARG00000014507	PRDM10	67	100.000	Ovis_aries
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSPPAG00000042881	PRDM10	68	100.000	Pan_paniscus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSPPRG00000007002	PRDM10	67	100.000	Panthera_pardus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSPTIG00000013331	PRDM10	67	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSPTRG00000004477	PRDM10	68	100.000	Pan_troglodytes
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSPANG00000017470	PRDM10	68	100.000	Papio_anubis
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSPEMG00000014985	Prdm10	68	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSPPYG00000004061	PRDM10	67	100.000	Pongo_abelii
ENSSARG00000013953	-	53	100.000	ENSPCAG00000014514	PRDM10	60	100.000	Procavia_capensis
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSPCOG00000023406	PRDM10	74	100.000	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSPVAG00000012764	PRDM10	67	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSRNOG00000007853	Prdm10	68	100.000	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSRBIG00000030924	PRDM10	68	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSRROG00000034334	PRDM10	67	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSSBOG00000008773	PRDM10	68	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSSHAG00000004503	PRDM10	66	100.000	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000013953	-	66	100.000	ENSSPUG00000001178	PRDM10	67	100.000	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSSSCG00000015243	PRDM10	67	100.000	Sus_scrofa
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSTGUG00000000530	PRDM10	68	100.000	Taeniopygia_guttata
ENSSARG00000013953	-	62	98.077	ENSTBEG00000007221	PRDM10	61	98.077	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSTTRG00000009189	PRDM10	67	100.000	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000013953	-	59	100.000	ENSUAMG00000018832	PRDM10	62	100.000	Ursus_americanus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSUMAG00000003167	PRDM10	69	100.000	Ursus_maritimus
ENSSARG00000013953	-	68	100.000	ENSVVUG00000019878	PRDM10	67	100.000	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000013953	-	66	100.000	ENSXETG00000032173	PRDM10	63	100.000	Xenopus_tropicalis