EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSARG00000014109 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: NOP53
Alias: GLTSCR2|PICT-1|PICT1
Full Name: NOP53 ribosome biogenesis factor
Gene Type: protein_coding
Species: Sorex_araneus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10089 bases
Position: chrGeneScaffold_1441:500-10588
Accession: 4333
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSARP00000012769	Nop53	PF07767.11	2.1e-71	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSART00000014123	NOP53-201	1401	-	ENSSARP00000012769	467 (aa)	-	UPI0001580540

Gene Model

Click here to download ENSSARG00000014109's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSARG00000014109's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.769	ENSG00000105373	NOP53	91	92.000	Homo_sapiens
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.471	ENSAPOG00000006446	nop53	72	46.765	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.392	ENSAMEG00000015214	NOP53	83	78.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSARG00000014109	NOP53	72	45.349	ENSACIG00000002467	nop53	96	47.093	Amphilophus_citrinellus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.765	ENSAOCG00000007002	nop53	72	47.059	Amphiprion_ocellaris
ENSSARG00000014109	NOP53	72	47.059	ENSAPEG00000024564	nop53	72	47.353	Amphiprion_percula
ENSSARG00000014109	NOP53	68	47.222	ENSATEG00000021860	nop53	71	48.476	Anabas_testudineus
ENSSARG00000014109	NOP53	60	57.877	ENSACAG00000011362	-	99	57.534	Anolis_carolinensis
ENSSARG00000014109	NOP53	72	74.713	ENSANAG00000007933	NOP53	76	75.291	Aotus_nancymaae
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.552	ENSACLG00000011832	nop53	72	47.126	Astatotilapia_calliptera
ENSSARG00000014109	NOP53	72	47.175	ENSAMXG00000014883	nop53	73	48.415	Astyanax_mexicanus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	79.083	ENSBTAG00000021192	NOP53	75	79.370	Bos_taurus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	78.846	ENSCJAG00000011385	NOP53	83	79.539	Callithrix_jacchus
ENSSARG00000014109	NOP53	81	82.927	ENSCAFG00000004080	NOP53	82	78.571	Canis_familiaris
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.179	ENSCHIG00000009393	NOP53	83	80.870	Capra_hircus
ENSSARG00000014109	NOP53	81	80.488	ENSTSYG00000036631	NOP53	82	73.077	Carlito_syrichta
ENSSARG00000014109	NOP53	72	77.971	ENSCAPG00000013148	NOP53	87	77.391	Cavia_aperea
ENSSARG00000014109	NOP53	82	79.545	ENSCPOG00000015665	NOP53	82	79.545	Cavia_porcellus
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.500	ENSCCAG00000025477	NOP53	82	79.883	Cebus_capucinus
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.500	ENSCATG00000032842	NOP53	82	80.000	Cercocebus_atys
ENSSARG00000014109	NOP53	82	79.545	ENSCLAG00000001860	NOP53	81	79.545	Chinchilla_lanigera
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.500	ENSCSAG00000002928	NOP53	82	80.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	60.290	ENSCPBG00000009047	NOP53	82	60.290	Chrysemys_picta_bellii
ENSSARG00000014109	NOP53	53	39.080	ENSCING00000021395	-	61	39.464	Ciona_intestinalis
ENSSARG00000014109	NOP53	71	33.811	ENSCSAVG00000006009	-	77	34.195	Ciona_savignyi
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.500	ENSCANG00000039648	NOP53	81	80.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	82.000	ENSCGRG00001019033	Nop53	83	82.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSARG00000014109	NOP53	72	44.543	ENSCSEG00000014834	nop53	72	44.737	Cynoglossus_semilaevis
ENSSARG00000014109	NOP53	72	48.116	ENSCVAG00000005940	nop53	72	48.116	Cyprinodon_variegatus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	47.839	ENSDARG00000100452	nop53	99	49.457	Danio_rerio
ENSSARG00000014109	NOP53	72	80.175	ENSDNOG00000005165	NOP53	75	79.592	Dasypus_novemcinctus
ENSSARG00000014109	NOP53	54	32.075	FBgn0030061	CG1785	55	31.698	Drosophila_melanogaster
ENSSARG00000014109	NOP53	72	45.294	ENSEBUG00000012747	nop53	74	44.412	Eptatretus_burgeri
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.769	ENSEASG00005004345	NOP53	79	80.769	Equus_asinus_asinus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.769	ENSECAG00000026850	NOP53	79	80.769	Equus_caballus
ENSSARG00000014109	NOP53	70	90.625	ENSEEUG00000005287	NOP53	70	90.625	Erinaceus_europaeus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	48.986	ENSELUG00000001525	nop53	73	49.855	Esox_lucius
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.805	ENSFCAG00000010861	NOP53	82	81.250	Felis_catus
ENSSARG00000014109	NOP53	82	79.592	ENSFDAG00000010478	NOP53	80	79.592	Fukomys_damarensis
ENSSARG00000014109	NOP53	72	49.415	ENSFHEG00000017763	nop53	70	49.415	Fundulus_heteroclitus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	43.188	ENSGMOG00000014299	nop53	72	43.491	Gadus_morhua
ENSSARG00000014109	NOP53	72	51.389	ENSGALG00000039473	NOP53	59	53.977	Gallus_gallus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	47.384	ENSGAFG00000013301	nop53	76	48.696	Gambusia_affinis
ENSSARG00000014109	NOP53	72	45.217	ENSGACG00000005766	nop53	71	45.217	Gasterosteus_aculeatus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	72.727	ENSGGOG00000024728	-	74	77.101	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.769	ENSGGOG00000005462	NOP53	85	80.769	Gorilla_gorilla
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.802	ENSHBUG00000023625	nop53	76	47.384	Haplochromis_burtoni
ENSSARG00000014109	NOP53	83	78.324	ENSHGLG00000018240	NOP53	83	77.168	Heterocephalus_glaber_female
ENSSARG00000014109	NOP53	63	84.800	ENSHGLG00100015613	NOP53	78	81.600	Heterocephalus_glaber_male
ENSSARG00000014109	NOP53	72	42.857	ENSHCOG00000017133	nop53	73	43.296	Hippocampus_comes
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.857	ENSIPUG00000008154	nop53	64	48.968	Ictalurus_punctatus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	79.300	ENSSTOG00000022092	NOP53	83	78.717	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSARG00000014109	NOP53	81	90.244	ENSJJAG00000007854	Nop53	82	83.333	Jaculus_jaculus
ENSSARG00000014109	NOP53	68	46.483	ENSKMAG00000020756	nop53	71	46.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	45.977	ENSLBEG00000011432	nop53	72	45.977	Labrus_bergylta
ENSSARG00000014109	NOP53	72	50.289	ENSLACG00000018320	NOP53	87	50.867	Latimeria_chalumnae
ENSSARG00000014109	NOP53	72	51.594	ENSLOCG00000014178	nop53	74	52.601	Lepisosteus_oculatus
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.500	ENSMFAG00000045103	NOP53	82	81.050	Macaca_fascicularis
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.500	ENSMMUG00000013348	NOP53	89	92.000	Macaca_mulatta
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.500	ENSMNEG00000042540	NOP53	79	80.758	Macaca_nemestrina
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.500	ENSMLEG00000032475	NOP53	82	76.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	48.387	ENSMAMG00000012652	nop53	72	48.974	Mastacembelus_armatus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.802	ENSMZEG00005005033	nop53	78	47.522	Maylandia_zebra
ENSSARG00000014109	NOP53	82	84.000	ENSMAUG00000012617	Nop53	82	84.000	Mesocricetus_auratus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	79.942	ENSMICG00000005580	NOP53	76	80.233	Microcebus_murinus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	86.000	ENSMOCG00000008367	Nop53	82	86.000	Microtus_ochrogaster
ENSSARG00000014109	NOP53	72	45.000	ENSMMOG00000006515	nop53	72	45.294	Mola_mola
ENSSARG00000014109	NOP53	72	70.414	ENSMODG00000008721	NOP53	67	70.118	Monodelphis_domestica
ENSSARG00000014109	NOP53	72	48.547	ENSMALG00000020350	nop53	75	47.965	Monopterus_albus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	82.000	MGP_CAROLIEiJ_G0029218	Nop53	99	77.005	Mus_caroli
ENSSARG00000014109	NOP53	83	82.000	ENSMUSG00000041560	Nop53	82	82.000	Mus_musculus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	75.072	MGP_PahariEiJ_G0021074	-	99	75.806	Mus_pahari
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.000	MGP_SPRETEiJ_G0030298	Nop53	99	76.471	Mus_spretus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	78.000	ENSMPUG00000004456	NOP53	83	78.286	Mustela_putorius_furo
ENSSARG00000014109	NOP53	53	83.200	ENSMLUG00000027066	-	99	78.947	Myotis_lucifugus
ENSSARG00000014109	NOP53	80	86.111	ENSNGAG00000019894	Nop53	83	78.846	Nannospalax_galili
ENSSARG00000014109	NOP53	72	43.440	ENSNBRG00000002057	nop53	74	44.023	Neolamprologus_brichardi
ENSSARG00000014109	NOP53	83	82.000	ENSNLEG00000003143	NOP53	82	82.000	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000014109	NOP53	69	63.830	ENSNLEG00000028326	-	78	63.914	Nomascus_leucogenys
ENSSARG00000014109	NOP53	72	58.065	ENSMEUG00000002525	-	93	58.065	Notamacropus_eugenii
ENSSARG00000014109	NOP53	72	76.705	ENSODEG00000006707	NOP53	81	78.098	Octodon_degus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	47.278	ENSONIG00000016624	nop53	72	47.564	Oreochromis_niloticus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	47.041	ENSORLG00000008659	nop53	73	47.076	Oryzias_latipes
ENSSARG00000014109	NOP53	72	47.041	ENSORLG00020019916	nop53	73	46.291	Oryzias_latipes_hni
ENSSARG00000014109	NOP53	72	48.521	ENSORLG00015001315	nop53	71	49.123	Oryzias_latipes_hsok
ENSSARG00000014109	NOP53	72	47.093	ENSOMEG00000018244	nop53	71	47.384	Oryzias_melastigma
ENSSARG00000014109	NOP53	81	90.000	ENSOGAG00000024300	NOP53	84	84.000	Otolemur_garnettii
ENSSARG00000014109	NOP53	69	59.654	ENSOARG00000011414	NOP53	80	76.923	Ovis_aries
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.769	ENSPPAG00000002927	-	83	80.769	Pan_paniscus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	72.754	ENSPPAG00000029337	-	86	73.043	Pan_paniscus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.769	ENSPPAG00000032995	-	84	80.769	Pan_paniscus
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.805	ENSPPRG00000008954	NOP53	82	82.979	Panthera_pardus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	72.754	ENSPTRG00000052493	-	86	73.043	Pan_troglodytes
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.769	ENSPTRG00000011215	NOP53	83	80.769	Pan_troglodytes
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.769	ENSPTRG00000043520	-	83	80.769	Pan_troglodytes
ENSSARG00000014109	NOP53	83	80.000	ENSPANG00000002964	NOP53	82	80.000	Papio_anubis
ENSSARG00000014109	NOP53	72	50.145	ENSPKIG00000000127	nop53	72	48.980	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.667	ENSPMGG00000021579	nop53	74	46.821	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSARG00000014109	NOP53	83	78.846	ENSPEMG00000006856	Nop53	83	78.846	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSARG00000014109	NOP53	72	69.795	ENSPCIG00000016718	NOP53	73	68.915	Phascolarctos_cinereus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	48.266	ENSPFOG00000002839	nop53	72	48.276	Poecilia_formosa
ENSSARG00000014109	NOP53	72	48.266	ENSPLAG00000006675	nop53	72	48.276	Poecilia_latipinna
ENSSARG00000014109	NOP53	72	48.256	ENSPMEG00000009589	nop53	72	48.555	Poecilia_mexicana
ENSSARG00000014109	NOP53	72	43.605	ENSPREG00000008711	nop53	72	43.605	Poecilia_reticulata
ENSSARG00000014109	NOP53	83	78.846	ENSPPYG00000010181	NOP53	81	78.846	Pongo_abelii
ENSSARG00000014109	NOP53	72	80.175	ENSPCAG00000007692	NOP53	73	80.175	Procavia_capensis
ENSSARG00000014109	NOP53	81	89.744	ENSPCOG00000016124	NOP53	80	78.846	Propithecus_coquereli
ENSSARG00000014109	NOP53	64	82.692	ENSPVAG00000014671	NOP53	65	82.692	Pteropus_vampyrus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.802	ENSPNYG00000001341	nop53	72	47.384	Pundamilia_nyererei
ENSSARG00000014109	NOP53	72	50.289	ENSPNAG00000012520	nop53	73	51.453	Pygocentrus_nattereri
ENSSARG00000014109	NOP53	83	76.923	ENSRNOG00000013023	Nop53	82	80.000	Rattus_norvegicus
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.500	ENSRBIG00000036427	NOP53	82	80.000	Rhinopithecus_bieti
ENSSARG00000014109	NOP53	81	87.500	ENSRROG00000042298	NOP53	82	80.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSARG00000014109	NOP53	72	80.175	ENSSBOG00000033115	NOP53	82	80.466	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSARG00000014109	NOP53	72	68.328	ENSSHAG00000002239	NOP53	84	68.622	Sarcophilus_harrisii
ENSSARG00000014109	NOP53	72	50.888	ENSSFOG00015007062	gltscr2	72	51.479	Scleropages_formosus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.532	ENSSMAG00000000212	nop53	72	47.110	Scophthalmus_maximus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	45.614	ENSSDUG00000010575	nop53	72	46.765	Seriola_dumerili
ENSSARG00000014109	NOP53	72	45.614	ENSSLDG00000000140	nop53	72	46.765	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.459	ENSSPUG00000004420	NOP53	75	47.025	Sphenodon_punctatus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	45.882	ENSSPAG00000000318	nop53	78	46.176	Stegastes_partitus
ENSSARG00000014109	NOP53	81	90.244	ENSSSCG00000022774	NOP53	82	82.692	Sus_scrofa
ENSSARG00000014109	NOP53	72	46.512	ENSTRUG00000004944	nop53	72	46.512	Takifugu_rubripes
ENSSARG00000014109	NOP53	63	85.600	ENSTBEG00000008708	NOP53	63	84.000	Tupaia_belangeri
ENSSARG00000014109	NOP53	81	92.308	ENSTTRG00000011831	NOP53	83	80.769	Tursiops_truncatus
ENSSARG00000014109	NOP53	81	90.244	ENSUAMG00000028254	NOP53	83	82.692	Ursus_americanus
ENSSARG00000014109	NOP53	52	77.470	ENSVVUG00000023365	NOP53	60	77.470	Vulpes_vulpes
ENSSARG00000014109	NOP53	68	61.947	ENSXETG00000002782	nop53	75	48.968	Xenopus_tropicalis
ENSSARG00000014109	NOP53	72	48.547	ENSXCOG00000004436	nop53	73	48.547	Xiphophorus_couchianus
ENSSARG00000014109	NOP53	72	49.419	ENSXMAG00000002589	nop53	76	48.837	Xiphophorus_maculatus