EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000004572 (Gene tree)
Gene ID: 101027775
Gene Symbol: MTRF1
Alias: MGC47721|MTTRF1|RF1
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 66017 bases
Position: chrJH378169.1:4797148-4863164
Accession: 7469
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000001003	RF-1	PF00472.20	7.1e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000005023	MTRF1-201	1864	XM_003934389	ENSSBOP00000001003	378 (aa)	XP_003934438	A0A2K6S0U3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSBOG00000004572	MTRF1	86	48.160	ENSSBOG00000024984	MTRF1L	83	48.160

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	92.857	ENSG00000120662	MTRF1	92	94.444	Homo_sapiens
ENSSBOG00000004572	MTRF1	88	59.347	ENSAPOG00000010181	mtrf1	83	59.347	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	90.212	ENSAMEG00000008696	MTRF1	85	90.212	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000004572	MTRF1	63	67.364	ENSACIG00000001495	mtrf1	96	67.364	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	57.825	ENSAOCG00000002832	mtrf1	85	57.825	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	57.294	ENSAPEG00000014844	mtrf1	85	57.294	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000004572	MTRF1	90	58.772	ENSATEG00000017403	mtrf1	82	58.772	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	68.966	ENSAPLG00000009317	MTRF1	87	68.966	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	64.800	ENSACAG00000000897	MTRF1	85	64.800	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.391	ENSANAG00000023063	-	84	88.391	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000004572	MTRF1	96	90.634	ENSANAG00000025310	-	97	90.634	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	57.784	ENSACLG00000023945	mtrf1	84	57.784	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000004572	MTRF1	61	67.532	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	67.532	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	89.683	ENSBTAG00000012260	MTRF1	85	89.683	Bos_taurus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	94.974	ENSCJAG00000017739	MTRF1	100	97.126	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	89.153	ENSCAFG00000004795	MTRF1	85	89.153	Canis_familiaris
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	89.153	ENSCAFG00020018178	MTRF1	85	89.153	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.889	ENSCHIG00000011810	MTRF1	85	88.889	Capra_hircus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	91.005	ENSTSYG00000006976	MTRF1	85	91.005	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	87.831	ENSCAPG00000013163	MTRF1	88	87.831	Cavia_aperea
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	87.566	ENSCPOG00000005264	MTRF1	85	87.566	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	96.296	ENSCCAG00000035116	MTRF1	85	96.296	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	93.386	ENSCATG00000009909	MTRF1	85	93.386	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	87.566	ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	87.566	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	92.857	ENSCSAG00000017835	MTRF1	85	92.857	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	90	79.765	ENSCHOG00000011915	-	83	79.765	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	70.933	ENSCPBG00000007969	MTRF1	83	70.933	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	92.328	ENSCANG00000040353	MTRF1	85	92.328	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	85.714	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	85	85.714	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	85.714	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	85	85.714	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	56.720	ENSCSEG00000005667	mtrf1	84	56.720	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	56.117	ENSCVAG00000021729	mtrf1	87	56.117	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	62	58.974	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	58.974	Danio_rerio
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.684	ENSDNOG00000034196	MTRF1	100	90.645	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	87.798	ENSDORG00000016429	Mtrf1	85	87.798	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	85.714	ENSETEG00000014811	MTRF1	85	85.714	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000004572	MTRF1	62	58.120	ENSEBUG00000000778	mtrf1	96	58.120	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	89.683	ENSEASG00005015715	MTRF1	85	89.683	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	88.859	ENSECAG00000014389	MTRF1	82	88.859	Equus_caballus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	67.368	ENSEEUG00000004450	-	85	67.895	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	55.135	ENSELUG00000006544	mtrf1	86	55.135	Esox_lucius
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	87.831	ENSFCAG00000031635	MTRF1	85	87.831	Felis_catus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	67.733	ENSFALG00000008036	MTRF1	93	67.733	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	87.831	ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	87.831	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	55.228	ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	55.228	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	53.495	ENSGMOG00000008608	mtrf1	97	53.495	Gadus_morhua
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	70.479	ENSGALG00000016951	MTRF1	82	70.479	Gallus_gallus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	57.027	ENSGAFG00000007093	mtrf1	84	57.027	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000004572	MTRF1	97	58.266	ENSGACG00000013728	mtrf1	96	58.266	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	82	73.633	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	73.633	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	92.593	ENSGGOG00000002529	MTRF1	85	92.593	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.360	ENSHGLG00000003210	MTRF1	85	88.360	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.360	ENSHGLG00100011843	MTRF1	85	88.360	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	54.787	ENSHCOG00000009449	mtrf1	85	54.787	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	87.566	ENSSTOG00000021682	MTRF1	85	87.566	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	86.472	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	85	86.472	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	57.867	ENSKMAG00000003231	mtrf1	83	57.867	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	61	67.672	ENSLBEG00000027169	-	93	67.672	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000004572	MTRF1	61	67.672	ENSLBEG00000023151	mtrf1	93	67.672	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	66.935	ENSLACG00000010582	MTRF1	83	66.935	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	58.933	ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	58.933	Lepisosteus_oculatus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	86.702	ENSLAFG00000022177	-	84	86.702	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	70.370	ENSLAFG00000030499	-	83	70.370	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	93.122	ENSMFAG00000037972	MTRF1	85	93.122	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	93.122	ENSMNEG00000035487	MTRF1	85	93.122	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	92.857	ENSMLEG00000033582	MTRF1	85	92.857	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	58.871	ENSMAMG00000022048	mtrf1	83	58.871	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	57.784	ENSMZEG00005017922	mtrf1	84	57.784	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	69.867	ENSMGAG00000014971	MTRF1	90	69.867	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	85.714	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	85	85.714	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	92.593	ENSMICG00000033131	MTRF1	85	92.593	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	84.392	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	85	84.392	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000004572	MTRF1	61	59.389	ENSMMOG00000013394	mtrf1	94	59.389	Mola_mola
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	77.513	ENSMODG00000014772	MTRF1	85	77.513	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	58.177	ENSMALG00000013274	mtrf1	85	58.177	Monopterus_albus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	85.067	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	84	85.067	Mus_caroli
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	86.207	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	85	86.207	Mus_musculus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	84.309	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	84	84.309	Mus_pahari
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	84.881	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	85	84.881	Mus_spretus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	88.830	ENSMPUG00000001874	MTRF1	85	88.830	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	89.153	ENSMLUG00000017237	MTRF1	85	89.153	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.360	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	85	88.360	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000004572	MTRF1	61	68.122	ENSNBRG00000004634	mtrf1	97	68.122	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	92.857	ENSNLEG00000001236	MTRF1	85	92.857	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	71.883	ENSMEUG00000001846	MTRF1	85	71.883	Notamacropus_eugenii
ENSSBOG00000004572	MTRF1	69	58.397	ENSOPRG00000006450	-	80	58.397	Ochotona_princeps
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	86.508	ENSODEG00000005782	MTRF1	85	86.508	Octodon_degus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	57.784	ENSONIG00000012476	mtrf1	97	57.784	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	83	70.886	ENSOANG00000003383	-	100	70.886	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.624	ENSOCUG00000025207	MTRF1	85	88.624	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	57.527	ENSORLG00000003225	mtrf1	84	57.527	Oryzias_latipes
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	57.527	ENSORLG00020021048	mtrf1	84	57.527	Oryzias_latipes_hni
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	57.258	ENSORLG00015020957	mtrf1	84	57.258	Oryzias_latipes_hsok
ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	57.682	ENSOMEG00000002022	mtrf1	85	57.682	Oryzias_melastigma
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	84.921	ENSOGAG00000009719	-	85	84.921	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000004572	MTRF1	86	76.380	ENSOGAG00000026411	-	100	76.380	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.360	ENSOARG00000006994	MTRF1	85	88.360	Ovis_aries
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	92.857	ENSPPAG00000000050	MTRF1	85	92.857	Pan_paniscus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.095	ENSPPRG00000009511	MTRF1	85	88.095	Panthera_pardus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	88.624	ENSPTIG00000006673	MTRF1	85	88.624	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	92.857	ENSPTRG00000005815	MTRF1	85	92.857	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	93.122	ENSPANG00000010809	MTRF1	85	93.122	Papio_anubis
ENSSBOG00000004572	MTRF1	97	56.098	ENSPKIG00000015711	mtrf1	86	56.098	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	69.681	ENSPSIG00000004773	MTRF1	84	69.681	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000004572	MTRF1	62	68.644	ENSPMGG00000006724	mtrf1	96	68.644	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	85.714	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	85	85.714	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000004572	MTRF1	84	54.006	ENSPMAG00000009849	mtrf1	97	54.303	Petromyzon_marinus
ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	76.190	ENSPCIG00000012940	MTRF1	85	76.190	Phascolarctos_cinereus
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