EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000015129 (Gene tree)
Gene ID: 101028679
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10853 bases
Position: chrJH378117.1:28496849-28507701
Accession: 24085
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000002988	MMR_HSR1	PF01926.23	4.4e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000016534	SRPRB-201	701	XM_010335793	ENSSBOP00000002988	201 (aa)	XP_010334095	A0A2K6S6J1

Gene Model

Click here to download ENSSBOG00000015129's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sbq03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSBOG00000015129's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSBOG00000015129	SRPRB	71	31.724	ENSSBOG00000016897	ARL2-SNX15	75	31.724

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	94.030	ENSG00000144867	SRPRB	100	89.130	Homo_sapiens
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	96.517	ENSANAG00000028236	SRPRB	74	96.517	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.557	ENSBTAG00000044075	SRPRB	68	88.557	Bos_taurus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	97.015	ENSCJAG00000002845	SRPRB	87	97.015	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	ENSCAFG00020027568	SRPRB	74	88.060	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	87.065	ENSCHIG00000019717	SRPRB	74	87.065	Capra_hircus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	89.552	ENSTSYG00000031948	SRPRB	74	89.552	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000015129	SRPRB	91	86.885	ENSCPOG00000030107	SRPRB	73	86.885	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	93.532	ENSCCAG00000033027	SRPRB	74	93.532	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	95.522	ENSCATG00000033438	SRPRB	91	95.055	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	ENSCLAG00000002810	SRPRB	74	88.060	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	95.522	ENSCSAG00000010699	SRPRB	74	95.522	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	82.090	ENSCHOG00000011792	SRPRB	74	82.090	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	71.642	ENSCANG00000043327	SRPRB	69	71.642	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	85.572	ENSCGRG00001018121	Srprb	74	85.572	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000015129	SRPRB	94	86.702	ENSCGRG00000014367	Srprb	72	86.702	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	90.547	ENSDNOG00000032146	SRPRB	74	90.547	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	77	88.387	ENSDORG00000000764	Srprb	60	88.387	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	89.552	ENSEASG00005003967	SRPRB	74	89.552	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	89.552	ENSECAG00000036666	SRPRB	74	89.552	Equus_caballus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	ENSFCAG00000037571	SRPRB	68	88.060	Felis_catus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	87.065	ENSFDAG00000017529	SRPRB	74	87.065	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	94.527	ENSGGOG00000027849	SRPRB	90	93.956	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	ENSHGLG00000016818	SRPRB	74	88.060	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	ENSHGLG00100018893	SRPRB	74	88.060	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000015129	SRPRB	91	87.912	ENSSTOG00000022718	SRPRB	71	87.912	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	95.522	ENSMFAG00000039758	SRPRB	91	95.055	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	95.522	ENSMMUG00000008918	SRPRB	74	95.522	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	95.522	ENSMNEG00000032832	SRPRB	91	95.055	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	95.522	ENSMLEG00000035589	SRPRB	74	95.522	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	86.070	ENSMAUG00000021695	Srprb	74	86.070	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	91.045	ENSMICG00000048959	SRPRB	74	91.045	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	94	84.656	ENSMODG00000018493	SRPRB	71	84.656	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	85.572	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	74	85.572	Mus_caroli
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	85.075	ENSMUSG00000032553	Srprb	74	85.075	Mus_musculus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	85.572	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	74	85.572	Mus_pahari
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	85.075	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	74	85.075	Mus_spretus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	87.562	ENSMPUG00000009687	SRPRB	74	87.562	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	86.567	ENSNGAG00000024311	-	74	86.567	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	94.527	ENSNLEG00000003655	SRPRB	90	93.956	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	87.562	ENSODEG00000018092	SRPRB	74	87.562	Octodon_degus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	90.050	ENSOCUG00000007623	SRPRB	74	90.050	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	91.045	ENSOGAG00000005243	SRPRB	74	91.045	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000015129	SRPRB	79	87.342	ENSOARG00000008412	SRPRB	66	87.342	Ovis_aries
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	94.527	ENSPPAG00000023940	SRPRB	90	93.956	Pan_paniscus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	ENSPPRG00000023305	SRPRB	74	88.060	Panthera_pardus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.557	ENSPTIG00000007351	SRPRB	74	88.557	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	94.527	ENSPTRG00000015413	SRPRB	90	93.956	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	94.527	ENSPANG00000023015	SRPRB	91	94.505	Papio_anubis
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	87.065	ENSPEMG00000017954	Srprb	74	87.065	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	94.030	ENSPPYG00000014115	SRPRB	74	94.030	Pongo_abelii
ENSSBOG00000015129	SRPRB	91	84.615	ENSPCAG00000013823	SRPRB	67	84.615	Procavia_capensis
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	87.562	ENSPVAG00000011319	SRPRB	74	87.562	Pteropus_vampyrus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	95.025	ENSRBIG00000027819	SRPRB	90	94.505	Rhinopithecus_bieti
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	95.025	ENSRROG00000030536	SRPRB	90	94.505	Rhinopithecus_roxellana
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	ENSSARG00000012943	SRPRB	75	88.060	Sorex_araneus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	ENSSSCG00000011639	SRPRB	74	88.060	Sus_scrofa
ENSSBOG00000015129	SRPRB	91	87.978	ENSTBEG00000006116	SRPRB	74	85.930	Tupaia_belangeri
ENSSBOG00000015129	SRPRB	91	86.813	ENSTTRG00000007802	SRPRB	67	86.813	Tursiops_truncatus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	87.562	ENSUAMG00000018135	SRPRB	74	87.562	Ursus_americanus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	87.562	ENSUMAG00000015817	SRPRB	74	87.562	Ursus_maritimus
ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	ENSVVUG00000005707	SRPRB	74	88.060	Vulpes_vulpes