EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000015422 (Gene tree)
Gene ID: 101041020
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 56716 bases
Position: chrJH378153.1:88022-144737
Accession: 22973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000003178	ResIII	PF04851.15	1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000017353	SBNO1-201	3873	XM_010342917	ENSSBOP00000003178	1290 (aa)	XP_010341219	A0A2K6S736

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSBOG00000015422	SBNO1	85	52.205	ENSSBOG00000023562	SBNO2	70	68.934

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.750	ENSG00000139697	SBNO1	96	93.750	Homo_sapiens
ENSSBOG00000015422	SBNO1	86	78.418	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	78.590	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.725	ENSAMEG00000015151	SBNO1	96	92.725	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.949	ENSACIG00000008088	sbno1	97	72.620	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.595	ENSAOCG00000014859	sbno1	95	73.071	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.595	ENSAPEG00000006069	sbno1	95	73.071	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	74.332	ENSATEG00000006667	sbno1	97	74.407	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	87.277	ENSAPLG00000015674	SBNO1	96	87.361	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000015422	SBNO1	98	84.978	ENSACAG00000015441	SBNO1	86	84.914	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	94.122	ENSANAG00000029958	-	97	93.651	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000015422	SBNO1	97	75.309	ENSACLG00000024913	sbno1	97	75.382	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	76.622	ENSAMXG00000019473	sbno1	97	76.917	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	92.852	ENSBTAG00000020505	SBNO1	97	92.215	Bos_taurus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	94.271	ENSCJAG00000016599	SBNO1	96	94.271	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.793	ENSCAFG00000007503	SBNO1	96	92.793	Canis_familiaris
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.590	ENSCAFG00020015363	SBNO1	96	93.590	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	92.628	ENSCHIG00000008382	SBNO1	96	92.628	Capra_hircus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.304	ENSTSYG00000012749	SBNO1	97	92.895	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	92.337	ENSCAPG00000000384	SBNO1	100	92.337	Cavia_aperea
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.188	ENSCPOG00000008109	SBNO1	97	92.224	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.296	ENSCCAG00000035316	SBNO1	97	91.788	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.676	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	93.122	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.188	ENSCLAG00000008995	SBNO1	97	92.224	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000015422	SBNO1	87	96.114	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	96.114	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	97	94.405	ENSCHOG00000008814	SBNO1	92	94.405	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	87.732	ENSCPBG00000025968	SBNO1	96	87.245	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	89.552	ENSCANG00000042688	-	96	89.478	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	91.964	ENSCGRG00001017470	Sbno1	97	91.964	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	91.964	ENSCGRG00000004756	Sbno1	97	91.964	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	73.109	ENSCSEG00000011919	sbno1	97	72.987	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.959	ENSCVAG00000007038	sbno1	97	73.980	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	76.331	ENSDARG00000099080	sbno1	97	76.701	Danio_rerio
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.468	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	94.519	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	88.351	ENSDORG00000015261	Sbno1	96	87.284	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000015422	SBNO1	95	90.282	ENSETEG00000005620	SBNO1	90	90.282	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000015422	SBNO1	73	64.742	ENSEBUG00000013823	sbno1	89	63.853	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.229	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	93.229	Equus_caballus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	80	98.352	ENSEEUG00000003793	SBNO1	72	98.352	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	98	75.722	ENSELUG00000002886	sbno1	96	75.870	Esox_lucius
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	93.150	ENSFCAG00000015331	SBNO1	96	93.150	Felis_catus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	87.500	ENSFALG00000009273	SBNO1	96	87.658	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	91.011	ENSFDAG00000014232	SBNO1	96	91.011	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	73.773	ENSFHEG00000007360	sbno1	97	74.066	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	97	74.734	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	75.247	Gadus_morhua
ENSSBOG00000015422	SBNO1	87	86.982	ENSGALG00000003392	SBNO1	95	86.898	Gallus_gallus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	74.439	ENSGAFG00000003960	sbno1	97	74.478	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000015422	SBNO1	97	75.267	ENSGACG00000015633	sbno1	99	75.344	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	86.914	ENSGAGG00000001065	SBNO1	97	86.766	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.601	ENSGGOG00000015000	SBNO1	97	93.127	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000015422	SBNO1	97	71.272	ENSHBUG00000011910	sbno1	97	71.384	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.262	ENSHGLG00000014165	-	97	92.262	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000015422	SBNO1	90	78.656	ENSHCOG00000003246	sbno1	92	70.840	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	76.068	ENSIPUG00000015830	Sbno1	95	76.141	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.006	ENSSTOG00000023221	SBNO1	97	92.668	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	92.480	ENSJJAG00000001741	Sbno1	96	92.480	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	74.143	ENSKMAG00000009696	sbno1	98	74.887	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	74.265	ENSLBEG00000007623	sbno1	97	73.787	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	77.646	ENSLACG00000017227	SBNO1	95	79.680	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	78.408	ENSLOCG00000005725	sbno1	94	78.556	Lepisosteus_oculatus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.331	ENSLAFG00000002135	SBNO1	96	92.331	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.676	ENSMFAG00000031429	SBNO1	96	93.676	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.676	ENSMMUG00000011496	SBNO1	96	93.676	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	94.887	ENSMLEG00000033260	SBNO1	97	94.351	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	73.465	ENSMAMG00000005473	sbno1	97	73.611	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	87.351	ENSMGAG00000003274	SBNO1	97	87.509	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	91.815	ENSMICG00000006573	-	97	91.314	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	88.633	ENSMOCG00000009390	Sbno1	97	91.320	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000015422	SBNO1	97	70.526	ENSMMOG00000008691	sbno1	96	71.053	Mola_mola
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	89.501	ENSMODG00000012470	SBNO1	95	89.501	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.609	ENSMALG00000001056	sbno1	97	73.116	Monopterus_albus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	91.958	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	99.561	Mus_caroli
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	92.107	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	99.561	Mus_musculus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	92.256	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	99.561	Mus_pahari
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	91.884	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	99.561	Mus_spretus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.080	ENSMPUG00000001658	SBNO1	96	93.080	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	92.480	ENSMLUG00000017159	SBNO1	96	92.480	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.857	ENSNGAG00000012620	Sbno1	96	92.857	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000015422	SBNO1	97	73.873	ENSNBRG00000019189	sbno1	97	73.959	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.575	ENSNLEG00000001502	SBNO1	97	93.170	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000015422	SBNO1	62	84.810	ENSMEUG00000008768	-	88	85.443	Notamacropus_eugenii
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	89.153	ENSOPRG00000011054	SBNO1	96	89.079	Ochotona_princeps
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.262	ENSODEG00000009997	SBNO1	97	92.262	Octodon_degus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	73.260	ENSONIG00000015348	sbno1	96	73.504	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	98	90.923	ENSOCUG00000002441	SBNO1	91	90.923	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.813	ENSORLG00000001593	sbno1	97	73.105	Oryzias_latipes
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	73.012	ENSORLG00020015216	sbno1	97	73.231	Oryzias_latipes_hni
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.939	ENSORLG00015002726	sbno1	97	73.158	Oryzias_latipes_hsok
ENSSBOG00000015422	SBNO1	98	74.444	ENSOMEG00000019313	sbno1	96	74.370	Oryzias_melastigma
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	92.416	ENSOARG00000004404	SBNO1	96	92.416	Ovis_aries
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.601	ENSPPAG00000024635	SBNO1	97	93.051	Pan_paniscus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	93.150	ENSPPRG00000022092	SBNO1	96	93.150	Panthera_pardus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.155	ENSPTIG00000017803	SBNO1	97	93.155	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.676	ENSPTRG00000005597	SBNO1	97	93.127	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.601	ENSPANG00000011640	SBNO1	97	93.127	Papio_anubis
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	76.963	ENSPKIG00000001441	sbno1	97	76.889	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSBOG00000015422	SBNO1	91	83.428	ENSPSIG00000009256	-	96	83.428	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	86.741	ENSPSIG00000009572	-	97	86.792	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	91.815	ENSPEMG00000016087	Sbno1	97	91.815	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	89.129	ENSPCIG00000010985	SBNO1	97	88.746	Phascolarctos_cinereus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	74.069	ENSPFOG00000005069	sbno1	97	74.325	Poecilia_formosa
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	73.923	ENSPLAG00000015015	sbno1	97	74.361	Poecilia_latipinna
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	74.015	ENSPMEG00000021212	sbno1	97	74.142	Poecilia_mexicana
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	73.723	ENSPREG00000017746	sbno1	97	73.980	Poecilia_reticulata
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.378	ENSPPYG00000005084	SBNO1	96	93.378	Pongo_abelii
ENSSBOG00000015422	SBNO1	88	88.676	ENSPCAG00000008634	SBNO1	85	88.626	Procavia_capensis
ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	92.857	ENSPCOG00000024277	SBNO1	97	92.372	Propithecus_coquereli
ENSSBOG00000015422	SBNO1	86	91.071	ENSPVAG00000015304	SBNO1	83	91.071	Pteropus_vampyrus
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	74.513	ENSPNYG00000004291	sbno1	96	74.533	Pundamilia_nyererei
ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	76.250	ENSPNAG00000015622	sbno1	97	75.900	Pygocentrus_nattereri
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