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Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000019551 (Gene tree)
Gene ID: 101049247
Gene Symbol: TNPO2
Alias: FLJ12155|IPO3|KPNB2B|TRN2
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23396 bases
Position: chrJH378255.1:2123549-2146944
Accession: 19998
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000006045	IBN_N	PF03810.19	3.2e-16	1	1
ENSSBOP00000006015	IBN_N	PF03810.19	8.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000022723	TNPO2-201	4906	XM_003941740	ENSSBOP00000006015	887 (aa)	XP_003941789	A0A2K6SF48
ENSSBOT00000022754	TNPO2-202	2658	-	ENSSBOP00000006045	885 (aa)	-	A0A2K6SF81

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSBOG00000019551	TNPO2	99	85.344	ENSSBOG00000029256	TNPO1	99	85.344

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	100.000	ENSG00000105576	TNPO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	93.026	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	93.026	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	82	90.897	ENSAPOG00000013185	-	96	90.897	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	96.990	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	96.990	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000019551	TNPO2	87	92.358	ENSACIG00000009586	-	100	92.358	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	87	93.126	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	92.765	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.801	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	92.801	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	93.026	ENSAOCG00000010152	-	100	93.026	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.801	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	92.801	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	93.026	ENSAPEG00000013268	-	100	93.026	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.801	ENSATEG00000019171	-	100	92.801	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.688	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	92.688	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	96.622	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	96.622	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.887	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	99.887	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	92.913	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	86.727	ENSACLG00000020672	-	100	86.839	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	91.463	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	91.353	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.662	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	99.662	Bos_taurus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	98.885	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.885	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.887	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	99.887	Canis_familiaris
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.887	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	94.983	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	94.983	Capra_hircus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.775	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.775	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000019551	TNPO2	95	97.974	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	97.974	Cavia_aperea
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.436	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	99.436	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	100.000	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	98.885	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	98.885	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.436	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.436	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	100.000	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	96.847	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	96.847	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000019551	TNPO2	98	98.851	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	98.774	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	98.774	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.887	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	99.887	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000019551	TNPO2	87	90.698	ENSCSEG00000011477	-	100	90.827	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	88.764	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	88.652	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	91.348	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	91.348	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	92.913	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	89.651	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	89.876	Danio_rerio
ENSSBOG00000019551	TNPO2	88	89.359	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	89.359	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.984	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	72.483	FBgn0024921	Tnpo	100	72.371	Drosophila_melanogaster
ENSSBOG00000019551	TNPO2	91	91.509	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	91.509	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.662	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	99.662	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.775	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	99.775	Equus_caballus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	80	90.237	ENSELUG00000016542	-	99	83.077	Esox_lucius
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.342	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	92.342	Esox_lucius
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	98.662	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	98.662	Felis_catus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.549	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	99.549	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	91.573	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	91.573	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	97	92.442	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	92.442	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	80	90.865	ENSGMOG00000014237	-	90	90.865	Gadus_morhua
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	85.090	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	85.090	Gadus_morhua
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	92.913	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	91.910	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	91.910	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	96.959	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	96.959	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSHBUG00000018317	-	100	92.913	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	92.913	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.436	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	99.436	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	97.770	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	97.770	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	91.564	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	91.564	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSHCOG00000020440	-	100	92.913	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.238	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	92.238	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.576	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	92.576	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.775	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	99.775	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	98.662	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	98.662	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.801	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	92.801	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	90.643	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	90.643	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	93.251	ENSLBEG00000005301	-	100	93.251	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	92.913	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	91.206	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	91.206	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	94.151	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	Lepisosteus_oculatus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	98.551	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.551	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	98.885	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	98.885	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	100.000	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	100.000	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000019551	TNPO2	98	99.769	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	99.769	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	93.026	ENSMAMG00000011862	-	100	93.026	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	91.121	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	91.121	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSMZEG00005007408	-	100	92.913	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	92.913	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	88.652	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	100.000	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.887	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	99.887	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000019551	TNPO2	87	87.678	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	87.419	Mola_mola
ENSSBOG00000019551	TNPO2	88	91.549	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	92.238	Mola_mola
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	96.774	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	96.774	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	91.339	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	91.676	Monopterus_albus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	92.913	Monopterus_albus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.662	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	99.662	Mus_caroli
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.662	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	100.000	Mus_musculus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.436	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	99.436	Mus_pahari
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.662	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	99.662	Mus_spretus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.887	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	99.887	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000019551	TNPO2	98	98.613	ENSMLUG00000012669	TNPO2	99	99.766	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.887	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	99.887	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	87.739	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	87.739	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.913	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	92.913	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	89.521	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	89.521	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	89.878	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	90.211	Notamacropus_eugenii
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	99.549	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	99.549	Octodon_degus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	91.982	ENSONIG00000017706	-	100	91.982	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	92.801	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	92.801	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	96.171	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	96.171	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	81.194	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	81.194	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000019551	TNPO2	56	91.000	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	Oryzias_latipes
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ENSSBOG00000019551	TNPO2	56	90.800	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	Oryzias_latipes_hni
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