EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000020184 (Gene tree)
Gene ID: 101030873
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12827 bases
Position: chrJH378173.1:1462557-1475383
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000006471	SYF2	PF08231.12	2e-54	1	1
ENSSBOP00000006461	SYF2	PF08231.12	5.1e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000023198	SYF2-201	1526	XM_010345433	ENSSBOP00000006461	243 (aa)	XP_010343735	A0A2K6SGD9
ENSSBOT00000023208	SYF2-202	606	-	ENSSBOP00000006471	201 (aa)	-	A0A2K6SGE8

Gene Model

Click here to download ENSSBOG00000020184's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sbq03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSBOG00000020184's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	96.708	ENSG00000117614	SYF2	100	96.708	Homo_sapiens
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	84.475	ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000020184	SYF2	80	96.410	ENSAMEG00000010134	-	100	96.410	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000020184	SYF2	98	91.701	ENSAMEG00000010115	-	89	97.685	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	79.654	ENSACIG00000023688	syf2	86	82.326	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000020184	SYF2	89	79.186	ENSAOCG00000010912	syf2	62	83.920	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000020184	SYF2	97	80.000	ENSAOCG00000022046	syf2	92	85.185	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000020184	SYF2	97	80.000	ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.185	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000020184	SYF2	89	82.949	ENSATEG00000007745	syf2	91	83.333	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000020184	SYF2	82	88.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000020184	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000020184	SYF2	79	75.625	ENSACAG00000026777	-	96	75.625	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	98.354	ENSANAG00000032473	SYF2	100	98.354	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	81.279	ENSACLG00000019916	syf2	91	82.407	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	77.500	ENSAMXG00000004051	syf2	100	77.083	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.837	ENSBTAG00000001651	SYF2	95	97.333	Bos_taurus
ENSSBOG00000020184	SYF2	86	50.952	WBGene00019402	syf-2	90	50.711	Caenorhabditis_elegans
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	98.354	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.354	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	93.443	ENSCAFG00000012895	-	99	93.443	Canis_familiaris
ENSSBOG00000020184	SYF2	97	86.383	ENSCAFG00000030331	-	99	86.383	Canis_familiaris
ENSSBOG00000020184	SYF2	95	88.421	ENSCAFG00020021094	-	97	88.421	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	93.443	ENSCAFG00020021091	-	99	93.443	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.181	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.181	Capra_hircus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	93.004	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000020184	SYF2	81	98.485	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	Cavia_aperea
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.213	ENSCPOG00000005326	SYF2	99	93.004	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	98.765	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	98.765	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	95.885	ENSCATG00000026917	SYF2	100	95.885	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	93.443	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.443	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	96.296	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	96.296	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000020184	SYF2	74	76.243	ENSCHOG00000005273	-	100	73.889	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	88.889	ENSCPBG00000025073	SYF2	93	87.446	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000020184	SYF2	87	53.052	ENSCING00000003017	-	89	52.582	Ciona_intestinalis
ENSSBOG00000020184	SYF2	87	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	82.716	ENSCANG00000037322	SYF2	100	82.716	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	90.535	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000020184	SYF2	81	95.918	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	81.735	ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	83.486	ENSDARG00000004706	syf2	91	83.333	Danio_rerio
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	92.593	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	92.181	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	91.736	ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.736	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	57.273	FBgn0033556	CG12343	96	56.881	Drosophila_melanogaster
ENSSBOG00000020184	SYF2	94	76.419	ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.293	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000020184	SYF2	89	56.044	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.837	ENSEASG00005004224	-	88	98.148	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	81.557	ENSEASG00005004232	-	100	81.070	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	92.975	ENSECAG00000010440	-	94	97.321	Equus_caballus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.653	ENSECAG00000012023	-	88	99.074	Equus_caballus
ENSSBOG00000020184	SYF2	75	80.874	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000020184	SYF2	96	80.672	ENSELUG00000003465	syf2	100	80.672	Esox_lucius
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	92.623	ENSFCAG00000043095	-	99	92.623	Felis_catus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	93.878	ENSFCAG00000010324	-	85	93.878	Felis_catus
ENSSBOG00000020184	SYF2	84	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.593	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	67.273	ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.281	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	83.028	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	Gadus_morhua
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	87.225	ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.400	Gallus_gallus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	74.074	ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000020184	SYF2	88	83.256	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	89.333	ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.879	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	97.119	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	97.119	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	79.221	ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.407	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.623	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.623	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	83.700	ENSHGLG00000004304	-	99	79.583	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.623	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.623	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000020184	SYF2	98	77.593	ENSHCOG00000012904	syf2	70	83.721	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000020184	SYF2	91	83.258	ENSIPUG00000019859	syf2	91	84.722	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000020184	SYF2	60	97.260	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000020184	SYF2	82	97.487	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000020184	SYF2	96	77.637	ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.407	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	83.105	ENSLBEG00000014425	syf2	91	83.796	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	85.780	ENSLACG00000012064	SYF2	91	86.111	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000020184	SYF2	95	80.952	ENSLOCG00000002728	syf2	86	85.185	Lepisosteus_oculatus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.429	ENSLAFG00000023150	-	100	91.020	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000020184	SYF2	75	64.674	ENSLAFG00000030814	-	100	64.674	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	96.296	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	96.296	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	96.296	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	96.296	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	96.296	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	96.296	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	95.885	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	95.885	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000020184	SYF2	89	81.567	ENSMAMG00000010403	syf2	98	76.250	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000020184	SYF2	96	78.151	ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.311	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000020184	SYF2	82	88.945	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	90.947	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000020184	SYF2	89	97.753	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.990	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.181	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.181	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	80.365	ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.556	Mola_mola
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	88.596	ENSMODG00000013951	-	95	89.450	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	82.273	ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	Monopterus_albus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.358	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.358	Mus_caroli
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.358	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.358	Mus_musculus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.358	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.358	Mus_pahari
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.358	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.358	Mus_spretus
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	92.623	ENSMPUG00000015802	-	99	92.623	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000020184	SYF2	98	92.917	ENSMPUG00000015801	-	98	92.917	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000020184	SYF2	98	93.697	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.500	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	91.837	ENSNGAG00000007912	Syf2	99	91.837	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000020184	SYF2	96	71.250	ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.000	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	97.531	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	97.531	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	90.947	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.947	Ochotona_princeps
ENSSBOG00000020184	SYF2	96	84.120	ENSODEG00000014338	-	98	84.120	Octodon_degus
ENSSBOG00000020184	SYF2	96	93.991	ENSODEG00000017664	-	98	93.991	Octodon_degus
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	81.279	ENSONIG00000008213	syf2	91	81.944	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000020184	SYF2	83	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	93.443	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.443	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	80.176	ENSORLG00000028820	syf2	93	83.333	Oryzias_latipes
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	82.648	ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	Oryzias_latipes_hni
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	76.667	ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	83.562	ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	Oryzias_melastigma
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	92.975	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	92.975	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000020184	SYF2	80	67.692	ENSOARG00000006269	-	100	67.692	Ovis_aries
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.903	ENSOARG00000006348	-	100	91.903	Ovis_aries
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	97.119	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	97.119	Pan_paniscus
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	92.623	ENSPPRG00000001651	-	99	92.623	Panthera_pardus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	93.089	ENSPPRG00000001638	-	100	93.089	Panthera_pardus
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	96.903	ENSPTIG00000005711	-	82	96.903	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	92.213	ENSPTIG00000007036	-	99	92.213	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	97.119	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.119	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	96.296	ENSPANG00000008139	SYF2	100	96.296	Papio_anubis
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	79.583	ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.583	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSBOG00000020184	SYF2	95	86.580	ENSPSIG00000011816	SYF2	90	86.580	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000020184	SYF2	97	77.966	ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.407	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.358	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000020184	SYF2	92	93.750	ENSPCIG00000014235	SYF2	86	95.370	Phascolarctos_cinereus
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	77.489	ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.556	Poecilia_formosa
ENSSBOG00000020184	SYF2	98	74.180	ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.930	Poecilia_latipinna
ENSSBOG00000020184	SYF2	96	73.504	ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.504	Poecilia_mexicana
ENSSBOG00000020184	SYF2	89	81.481	ENSPREG00000003009	syf2	91	81.481	Poecilia_reticulata
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	97.119	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	97.119	Pongo_abelii
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	75.622	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	75.622	Propithecus_coquereli
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	80.658	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	80.658	Pteropus_vampyrus
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	81.279	ENSPNYG00000004979	syf2	91	82.407	Pundamilia_nyererei
ENSSBOG00000020184	SYF2	95	81.818	ENSPNAG00000015570	syf2	91	85.185	Pygocentrus_nattereri
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.358	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.358	Rattus_norvegicus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	93.827	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	93.827	Rhinopithecus_bieti
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	96.296	ENSRROG00000001347	SYF2	100	96.296	Rhinopithecus_roxellana
ENSSBOG00000020184	SYF2	93	92.035	ENSSHAG00000015630	-	87	93.056	Sarcophilus_harrisii
ENSSBOG00000020184	SYF2	84	93.689	ENSSHAG00000007152	-	100	93.689	Sarcophilus_harrisii
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	84.862	ENSSFOG00015023647	syf2	91	85.185	Scleropages_formosus
ENSSBOG00000020184	SYF2	96	77.311	ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	Scophthalmus_maximus
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	91	83.333	Seriola_dumerili
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	74.180	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.180	Sorex_araneus
ENSSBOG00000020184	SYF2	92	87.500	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.426	Sphenodon_punctatus
ENSSBOG00000020184	SYF2	96	78.992	ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	Stegastes_partitus
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	91.358	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.358	Sus_scrofa
ENSSBOG00000020184	SYF2	58	72.650	ENSTGUG00000001126	SYF2	85	59.412	Taeniopygia_guttata
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	75.309	ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.860	Takifugu_rubripes
ENSSBOG00000020184	SYF2	90	80.275	ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.556	Tetraodon_nigroviridis
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	69.547	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.136	Tupaia_belangeri
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.803	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	Tursiops_truncatus
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	91.393	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.393	Ursus_americanus
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	91.803	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	91.803	Ursus_maritimus
ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.213	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	Vicugna_pacos
ENSSBOG00000020184	SYF2	84	97.073	ENSVVUG00000027181	-	100	89.919	Vulpes_vulpes
ENSSBOG00000020184	SYF2	99	93.443	ENSVVUG00000027175	-	99	93.443	Vulpes_vulpes
ENSSBOG00000020184	SYF2	96	82.833	ENSXETG00000022797	syf2	94	82.833	Xenopus_tropicalis
ENSSBOG00000020184	SYF2	88	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	Xiphophorus_maculatus