EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000021892 (Gene tree)
Gene ID: 101045036
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 61880 bases
Position: chrJH378291.1:1144570-1206449
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000010095	GTP_EFTU	PF00009.27	4.3e-45	1	1
ENSSBOP00000010107	GTP_EFTU	PF00009.27	4.4e-45	1	1
ENSSBOP00000010144	GTP_EFTU	PF00009.27	3.1e-36	1	1
ENSSBOP00000010130	GTP_EFTU	PF00009.27	1.2e-33	1	1
ENSSBOP00000010144	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSSBOP00000010130	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSSBOP00000010095	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSSBOP00000010107	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.7e-12	1	1
ENSSBOP00000010144	EFG_IV	PF03764.18	3.2e-23	1	1
ENSSBOP00000010130	EFG_IV	PF03764.18	3.3e-23	1	1
ENSSBOP00000010095	EFG_IV	PF03764.18	3.3e-23	1	1
ENSSBOP00000010107	EFG_IV	PF03764.18	3.4e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000026901	EFTUD2-203	2880	-	ENSSBOP00000010130	959 (aa)	-	A0A2K6SRX5
ENSSBOT00000026878	EFTUD2-202	8096	-	ENSSBOP00000010107	977 (aa)	-	A0A2K6SRU2
ENSSBOT00000026915	EFTUD2-204	2829	-	ENSSBOP00000010144	942 (aa)	-	A0A2K6SRX3
ENSSBOT00000026865	EFTUD2-201	7764	XM_003943581	ENSSBOP00000010095	972 (aa)	XP_003943630	A0A2K6SRT9

Gene Model

Click here to download ENSSBOG00000021892's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sbq03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSBOG00000021892's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	53	30.380	ENSSBOG00000023252	GFM1	62	30.380
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	87	39.061	ENSSBOG00000006731	-	98	45.758
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	83	35.301	ENSSBOG00000022776	-	94	41.215

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.897	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.284	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.794	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	88.993	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.785	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	88	88.072	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.387	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.695	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	99	94.336	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.336	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	97.737	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.284	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.486	Bos_taurus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.794	Canis_familiaris
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	Capra_hircus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.588	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.971	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.971	Cavia_aperea
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.971	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.868	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.663	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	99	78.004	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.872	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.059	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	Danio_rerio
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.383	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.383	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.383	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	76	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.794	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.691	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.691	Equus_caballus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.691	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	Felis_catus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	97.942	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.177	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.255	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.045	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.770	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.181	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.765	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.765	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.358	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	96	99.466	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.770	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	94.342	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.280	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.695	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.490	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.284	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.049	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.486	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	91	84.535	ENSMOCG00000017653	-	90	84.535	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.588	ENSMOCG00000009039	-	100	99.588	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	88	93.976	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.588	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	90	90.791	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.280	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.280	Mus_caroli
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.280	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.280	Mus_musculus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.280	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	Mus_pahari
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.280	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.280	Mus_spretus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	97	99.576	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.681	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.794	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.181	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	98	97.382	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	97	97.382	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	95.988	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	Notamacropus_eugenii
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.461	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	Ochotona_princeps
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.560	ENSODEG00000018041	-	100	98.560	Octodon_degus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.284	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.872	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	Oryzias_latipes
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes_hni
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	97.737	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.737	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.486	Ovis_aries
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.897	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.897	Pan_paniscus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.794	Panthera_pardus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.794	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.897	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	100.000	Papio_anubis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	84.568	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.486	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.691	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.691	Phascolarctos_cinereus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.560	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	Pongo_abelii
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	95.679	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	Procavia_capensis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.897	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	Propithecus_coquereli
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	94.856	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	Pteropus_vampyrus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.181	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.280	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	Rattus_norvegicus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.897	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_bieti
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.897	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_roxellana
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.893	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	97	99.680	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	Sarcophilus_harrisii
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.667	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	Scleropages_formosus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.078	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.872	Scophthalmus_maximus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.387	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.490	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.152	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	Sorex_araneus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	97.634	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	Sphenodon_punctatus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.490	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.588	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	Sus_scrofa
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.461	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	87.293	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.087	Tetraodon_nigroviridis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	94.342	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	Tupaia_belangeri
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.665	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	Ursus_americanus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.794	Ursus_maritimus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.794	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.794	Vulpes_vulpes
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	97	94.883	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	81	93.586	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus