EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000026194 (Gene tree)
Gene ID: 101050922
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 44406 bases
Position: chrJH378111.1:20478812-20523217
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000019245	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-27	1	2
ENSSBOP00000019245	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-27	2	2
ENSSBOP00000019238	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.3e-27	1	2
ENSSBOP00000019238	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.3e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000036063	PAPOLG-202	2145	-	ENSSBOP00000019245	714 (aa)	-	A0A2K6TI01
ENSSBOT00000036057	PAPOLG-201	3778	XM_003922719	ENSSBOP00000019238	736 (aa)	XP_003922768	A0A2K6THV4

Gene Model

Click here to download ENSSBOG00000026194's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sbq03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSBOG00000026194's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	98	62.397	ENSSBOG00000024061	PAPOLA	91	77.621

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.234	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.861	ENSAPOG00000004798	papolg	99	72.006	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	94.715	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	94.715	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	71.469	ENSACIG00000010546	papolg	99	71.648	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.727	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.594	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.861	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.727	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	73.226	ENSATEG00000009007	papolg	79	86.774	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	98	74.359	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.200	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	80	65.074	ENSACAG00000015048	-	100	65.074	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	99.049	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	99.049	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	69.531	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.052	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	73.245	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.245	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.872	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	94.872	Bos_taurus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	99.321	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	99.321	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.142	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	92.506	Canis_familiaris
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.511	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.511	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.737	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.737	Capra_hircus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	96.491	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	96.491	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	53	91.601	ENSCAPG00000014901	-	100	91.601	Cavia_aperea
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.547	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.547	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	99.457	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	99.457	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	90	99.134	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	99.134	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.872	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	94.872	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.370	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	98.370	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	89	93.627	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.627	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	70	64.752	ENSCING00000024664	-	90	65.844	Ciona_intestinalis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	68	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.599	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	98.599	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	93.315	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	93.179	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	93.315	ENSCGRG00000005552	-	100	93.179	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	70.245	ENSCSEG00000000771	papolg	99	71.096	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	80	80.385	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	73.677	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.016	Danio_rerio
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.792	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	93.657	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	60	99.068	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	73.984	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.919	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	62	71.762	ENSEBUG00000004020	papolg	91	71.318	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	67	56.695	ENSEBUG00000005042	-	79	57.725	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.682	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	95.682	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.547	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	95.122	Equus_caballus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	83.941	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	74.260	ENSELUG00000014497	papolg	99	64.072	Esox_lucius
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.602	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	94.602	Felis_catus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	65.160	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.160	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.872	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	94.872	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	66	62.669	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.261	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	87	83.912	ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.912	Gadus_morhua
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.840	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	72.565	Gallus_gallus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	69.382	ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.868	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.170	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.340	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.505	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	98.505	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	69.531	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.182	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	94.715	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.715	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.142	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	95.142	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	71.257	ENSHCOG00000006782	papolg	89	71.123	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.665	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.933	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.816	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.816	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	60	98.834	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	98.834	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	71.295	ENSKMAG00000016439	papolg	97	70.950	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	68.462	ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.077	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	70.895	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.895	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	73.037	ENSLOCG00000016130	papolg	100	72.775	Lepisosteus_oculatus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.078	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.641	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	98.641	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.641	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	98.641	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	89.879	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	89.879	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.599	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	98.599	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.727	ENSMAMG00000010667	papolg	99	71.369	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	98	72.831	ENSMZEG00005018140	papolg	99	73.061	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	70.777	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.509	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	93.179	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	93.042	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.688	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	95.924	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.514	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.378	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.000	ENSMMOG00000008020	papolg	99	72.133	Mola_mola
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	87.265	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.265	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.861	ENSMALG00000007012	papolg	89	72.460	Monopterus_albus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.927	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.299	Mus_caroli
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.927	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	Mus_musculus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.792	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.657	Mus_pahari
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.792	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	Mus_spretus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.872	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	94.872	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	94.134	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	93.315	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.412	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.277	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	63.347	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.612	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	60	99.068	ENSNLEG00000009507	-	100	99.068	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	81	78.767	ENSMEUG00000013605	-	87	78.767	Notamacropus_eugenii
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.872	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	94.197	Ochotona_princeps
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	60	94.131	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	Octodon_degus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	65.591	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.860	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	85.389	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	85.389	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	96.356	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	96.356	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	70.385	ENSORLG00000001577	papolg	89	70.133	Oryzias_latipes
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	70.895	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.494	Oryzias_latipes_hni
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	70.385	ENSORLG00015008836	papolg	89	70.173	Oryzias_latipes_hsok
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	70.360	ENSOMEG00000001406	papolg	99	70.040	Oryzias_melastigma
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	56	93.627	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	93.627	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.602	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	94.602	Ovis_aries
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.234	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	98.234	Pan_paniscus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.602	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	94.602	Panthera_pardus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.467	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.467	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.234	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	98.234	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.444	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	94.444	Papio_anubis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	93	72.821	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	74.274	ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.859	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	79.111	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.111	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	92.906	ENSPEMG00000008960	-	100	92.769	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	98	53.981	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.919	Petromyzon_marinus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	68	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	87.450	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.450	Phascolarctos_cinereus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	69.029	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.139	Poecilia_formosa
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	69.120	ENSPLAG00000018445	papolg	89	69.485	Poecilia_latipinna
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	69.069	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.302	Poecilia_mexicana
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	68.758	ENSPREG00000010358	papolg	89	68.906	Poecilia_reticulata
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.370	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	98.370	Pongo_abelii
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	81.633	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	Procavia_capensis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	87.344	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	87.344	Propithecus_coquereli
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	89	95.170	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	95.170	Pteropus_vampyrus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	73.045	ENSPNYG00000006729	papolg	99	72.626	Pundamilia_nyererei
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	73.262	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.245	Pygocentrus_nattereri
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.387	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	93.252	Rattus_norvegicus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	92.255	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	92.255	Rhinopithecus_bieti
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	98.319	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	98.319	Rhinopithecus_roxellana
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	94	87.801	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.801	Sarcophilus_harrisii
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	64.432	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.022	Scleropages_formosus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	70.678	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.986	Scleropages_formosus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	74.722	ENSSDUG00000000912	papolg	97	74.444	Seriola_dumerili
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.594	ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.326	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	80.874	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	80.874	Sphenodon_punctatus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.448	ENSSPAG00000009004	papolg	99	72.028	Stegastes_partitus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.951	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.951	Sus_scrofa
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	75	77.256	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	77.256	Taeniopygia_guttata
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.414	ENSTRUG00000006410	papolg	99	72.414	Takifugu_rubripes
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	66.844	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.844	Tetraodon_nigroviridis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	87.891	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	87.891	Tupaia_belangeri
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	90.553	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	90.553	Tursiops_truncatus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.828	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.828	Ursus_americanus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	94.952	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	94.952	Ursus_maritimus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	91.565	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.565	Vicugna_pacos
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.142	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.142	Vulpes_vulpes
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	74.801	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.801	Xenopus_tropicalis
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	69	85.685	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.685	Xiphophorus_couchianus
ENSSBOG00000026194	PAPOLG	82	83.099	ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.099	Xiphophorus_maculatus