EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000027920 (Gene tree)
Gene ID: 101046827
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11244 bases
Position: chrJH378315.1:593078-604321
Accession: 10898
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000022977	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.3e-42	1	1
ENSSBOP00000022960	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.5e-42	1	1
ENSSBOP00000022932	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.5e-42	1	1
ENSSBOP00000022932	DEAD	PF00270.29	3.1e-16	1	1
ENSSBOP00000022977	DEAD	PF00270.29	6.1e-12	1	1
ENSSBOP00000022960	DEAD	PF00270.29	6.9e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000039813	SKIV2L-202	3672	-	ENSSBOP00000022960	1223 (aa)	-	A0A2K6TTG7
ENSSBOT00000039830	SKIV2L-203	3378	-	ENSSBOP00000022977	1125 (aa)	-	A0A2K6TTI4
ENSSBOT00000039785	SKIV2L-201	4510	XM_003944321	ENSSBOP00000022932	1246 (aa)	XP_003944370	A0A2K6TTD4

Gene Model

Click here to download ENSSBOG00000027920's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sbq03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSBOG00000027920's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	86	35.034	ENSSBOG00000026693	MTREX	93	36.785

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.432	ENSG00000204351	SKIV2L	98	99.438	Homo_sapiens
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.746	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	62.088	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	95.024	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.024	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.208	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.677	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.459	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.817	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.301	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.656	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.306	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	61.396	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	65.831	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	66.295	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	98.796	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	98.796	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.886	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	62.008	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	98	59.632	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.808	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.944	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	94.944	Bos_taurus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	96	39.969	WBGene00008502	skih-2	99	39.785	Caenorhabditis_elegans
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	98.315	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	98.315	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.864	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	94.864	Canis_familiaris
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.783	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	94.783	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.864	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	94.864	Capra_hircus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.703	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	94.703	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	92.295	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	92.456	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	98.555	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	98.555	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.030	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	97.030	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.339	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.339	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.191	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	97.191	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	87	65.497	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	65.497	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	94	50.974	ENSCING00000005576	-	99	50.974	Ciona_intestinalis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	97.510	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	97.510	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.066	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	94.066	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.385	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	61.384	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.882	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	61.909	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.120	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	61.311	Danio_rerio
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	94	95.256	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	89.022	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	93	44.249	FBgn0039117	tst	97	44.258	Drosophila_melanogaster
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	77	91.699	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	92.931	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	89	56.957	ENSEBUG00000013680	-	95	57.810	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	93	95.349	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	95.349	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	96	94.958	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	94.958	Equus_caballus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	54	98.814	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	98.814	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.632	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	66.701	Esox_lucius
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	95.425	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	95.425	Felis_catus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	90.056	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.377	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.630	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.828	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	59.649	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.676	Gadus_morhua
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	85	57.809	ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.550	Gallus_gallus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.867	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	62.229	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.541	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.743	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	51	69.463	ENSGAGG00000015556	SKIV2L	82	73.183	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.512	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	97.512	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.727	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.847	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	91.667	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	91.827	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	89.103	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	89.263	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	98	59.967	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.967	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.348	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	60.545	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.703	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.703	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	72	60.244	ENSLACG00000002986	-	73	60.202	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.141	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.141	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.512	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	97.512	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.432	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	97.432	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.432	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	97.432	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.111	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	97.111	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.270	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.464	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.727	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.847	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	70	51.983	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	51.975	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.424	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.504	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	95.265	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	95.265	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	92.141	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.221	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.156	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	61.233	Mola_mola
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	88.070	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.070	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	59.984	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	Monopterus_albus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.585	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	93.585	Mus_caroli
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.665	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	93.665	Mus_musculus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.103	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	93.103	Mus_pahari
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.344	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	93.344	Mus_spretus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.783	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	94.783	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.579	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	93.579	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.085	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	61.452	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	93.805	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	93.805	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	78	93.805	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	93.805	Notamacropus_eugenii
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.302	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.302	Ochotona_princeps
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	92.135	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	92.135	Octodon_degus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	62.231	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.490	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.783	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	94.783	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.727	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	61.928	Oryzias_latipes
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.569	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	61.847	Oryzias_latipes_hni
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.331	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	61.526	Oryzias_latipes_hsok
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	62.272	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	62.238	Oryzias_melastigma
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.783	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	94.783	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	89.350	ENSOARG00000002411	-	100	89.350	Ovis_aries
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	96.546	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	96.546	Pan_paniscus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	95.506	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	95.506	Panthera_pardus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.944	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.944	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.512	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	97.512	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	95.981	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	95.981	Papio_anubis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.428	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.577	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.981	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	61.138	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.066	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	94.066	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	88.000	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	88.000	Phascolarctos_cinereus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.867	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	62.069	Poecilia_formosa
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.995	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	62.199	Poecilia_latipinna
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.788	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	62.149	Poecilia_mexicana
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.048	ENSPREG00000002277	skiv2l	98	59.626	Poecilia_reticulata
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	96.790	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	96.790	Pongo_abelii
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	79	93.421	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	93.830	Procavia_capensis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	96.469	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	96.469	Propithecus_coquereli
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.579	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	93.579	Pteropus_vampyrus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.482	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	60.552	Pundamilia_nyererei
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	98	61.687	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	61.687	Pygocentrus_nattereri
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.986	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	93.986	Rattus_norvegicus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	98	94.494	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	94.494	Rhinopithecus_bieti
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	97.191	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	97.191	Rhinopithecus_roxellana
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	93	37.480	YLR398C	-	93	37.559	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	87.750	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.709	Sarcophilus_harrisii
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.435	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.791	Scleropages_formosus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.213	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.427	Scophthalmus_maximus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.679	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.878	Seriola_dumerili
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.901	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.976	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	62.442	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	62.618	Sphenodon_punctatus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	94	61.841	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.949	Stegastes_partitus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	95.345	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.345	Sus_scrofa
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	75	62.389	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.138	Takifugu_rubripes
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.000	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	94	93.006	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.006	Tupaia_belangeri
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	90.048	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.048	Tursiops_truncatus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	95.506	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.506	Ursus_americanus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	93	95.521	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	95.521	Ursus_maritimus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	98	95.029	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	95.029	Vulpes_vulpes
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	58.744	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	59.015	Xenopus_tropicalis
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.859	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	61.943	Xiphophorus_couchianus
ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.362	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	61.717	Xiphophorus_maculatus