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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000028650 (Gene tree)
Gene ID: 101033045
Gene Symbol: CAPRIN2
Alias: C1QDC1|EEG1|FLJ11391|FLJ22569|RNG140|caprin-2
Full Name: caprin family member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 50087 bases
Position: chrJH378123.1:20747806-20797892
Accession: 21259
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000024503	Caprin-1_C	PF12287.8	1.8e-131	1	1
ENSSBOP00000024542	Caprin-1_C	PF12287.8	1.8e-131	1	1
ENSSBOP00000024549	Caprin-1_C	PF12287.8	1.6e-103	1	2
ENSSBOP00000024549	Caprin-1_C	PF12287.8	1.6e-103	2	2
ENSSBOP00000024556	Caprin-1_C	PF12287.8	2.9e-92	1	2
ENSSBOP00000024556	Caprin-1_C	PF12287.8	2.9e-92	2	2
ENSSBOP00000024512	Caprin-1_C	PF12287.8	1.8e-86	1	2
ENSSBOP00000024512	Caprin-1_C	PF12287.8	1.8e-86	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000041363	CAPRIN2-201	4578	XM_003926623	ENSSBOP00000024503	1070 (aa)	XP_003926672	A0A2K6TXV7
ENSSBOT00000041372	CAPRIN2-202	4395	XM_010337359	ENSSBOP00000024512	1009 (aa)	XP_010335661	A0A2K6TXW3
ENSSBOT00000041416	CAPRIN2-205	2559	-	ENSSBOP00000024556	852 (aa)	-	A0A2K6TY77
ENSSBOT00000041402	CAPRIN2-203	3222	-	ENSSBOP00000024542	1073 (aa)	-	A0A2K6TXZ2
ENSSBOT00000041409	CAPRIN2-204	3075	-	ENSSBOP00000024549	1024 (aa)	-	A0A2K6TY17

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	42.697	ENSSBOG00000029900	CAPRIN1	89	43.346

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	97.798	ENSG00000110888	CAPRIN2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	68	42.322	ENSG00000135387	CAPRIN1	96	42.678	Homo_sapiens
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	73	61.111	ENSAPOG00000019808	caprin2	94	43.339	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	65	40.636	ENSAPOG00000004726	caprin1a	91	40.636	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	65	39.858	ENSAPOG00000010508	caprin1b	94	40.942	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	92.897	ENSAMEG00000009118	CAPRIN2	95	92.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.446	ENSAMEG00000008137	CAPRIN1	89	44.106	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	39.384	ENSACIG00000017913	caprin1b	90	41.887	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	77	50.000	ENSACIG00000005589	caprin2	91	50.000	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	63	41.473	ENSACIG00000005383	caprin1a	88	41.473	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	65	41.135	ENSAOCG00000003017	caprin1a	91	40.989	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	87	41.228	ENSAOCG00000013014	caprin2	100	42.493	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	64	39.927	ENSAOCG00000004574	caprin1b	89	41.155	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	64	39.927	ENSAPEG00000001227	caprin1b	89	41.155	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	65	41.135	ENSAPEG00000008548	caprin1a	91	40.989	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	64	42.066	ENSATEG00000015675	caprin1b	89	43.071	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	63	37.736	ENSATEG00000007707	caprin1a	88	39.245	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	70.290	ENSAPLG00000006703	CAPRIN2	99	70.290	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	61	42.510	ENSAPLG00000006975	CAPRIN1	93	42.510	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	60.587	ENSACAG00000012953	CAPRIN2	99	61.141	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	42.586	ENSACAG00000013621	CAPRIN1	87	42.586	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	62	30.952	ENSANAG00000034464	-	89	30.502	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.071	ENSANAG00000032811	-	97	42.678	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	97.570	ENSANAG00000035460	CAPRIN2	100	99.139	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	64	42.435	ENSACLG00000007463	caprin1b	89	42.545	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	80	43.738	ENSACLG00000015175	-	92	43.738	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	63	40.221	ENSACLG00000026749	caprin1a	88	40.684	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	65	41.016	ENSAMXG00000005142	caprin1b	92	40.441	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	63	39.711	ENSAMXG00000006601	caprin1a	83	48.223	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	78	45.035	ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.035	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.446	ENSBTAG00000016744	CAPRIN1	89	44.106	Bos_taurus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	91.963	ENSBTAG00000019373	CAPRIN2	100	91.963	Bos_taurus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	98.411	ENSCJAG00000001080	CAPRIN2	99	98.411	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.071	ENSCJAG00000010542	CAPRIN1	89	43.726	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	93.551	ENSCAFG00000010713	CAPRIN2	100	93.551	Canis_familiaris
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.446	ENSCAFG00000007104	CAPRIN1	88	44.106	Canis_familiaris
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	91.833	ENSCAFG00020018961	-	100	91.833	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.446	ENSCAFG00020004525	CAPRIN1	96	44.106	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	92.344	ENSCHIG00000026352	CAPRIN2	100	92.344	Capra_hircus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.446	ENSCHIG00000017561	CAPRIN1	89	44.106	Capra_hircus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	63	43.333	ENSTSYG00000033857	-	96	43.333	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	61	39.773	ENSTSYG00000028754	-	90	39.773	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	94.294	ENSTSYG00000008590	CAPRIN2	94	94.294	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	64	38.735	ENSCAPG00000000035	CAPRIN1	91	40.161	Cavia_aperea
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	87.297	ENSCPOG00000006625	CAPRIN2	100	91.434	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	42.322	ENSCPOG00000015734	CAPRIN1	95	42.017	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.071	ENSCCAG00000020172	-	97	42.678	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	97.196	ENSCCAG00000027709	CAPRIN2	100	98.810	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	64	34.457	ENSCCAG00000036089	-	89	34.457	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	68	39.552	ENSCCAG00000022482	-	91	39.925	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	42.322	ENSCATG00000038427	CAPRIN1	89	43.726	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	96.075	ENSCATG00000031463	CAPRIN2	100	97.024	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	42.322	ENSCLAG00000015468	-	95	41.346	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	87.179	ENSCLAG00000001513	CAPRIN2	100	92.334	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	54	38.220	ENSCLAG00000007513	-	75	38.220	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	97.477	ENSCSAG00000007446	CAPRIN2	100	97.477	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	54	41.887	ENSCSAG00000005378	CAPRIN1	93	39.498	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	88.609	ENSCHOG00000008931	CAPRIN2	95	88.609	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	41.221	ENSCPBG00000012511	CAPRIN1	93	40.614	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	97	70.791	ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	98	70.791	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	42.322	ENSCANG00000032583	CAPRIN1	96	42.678	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	98.198	ENSCANG00000035343	CAPRIN2	94	98.198	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.130	ENSCGRG00001006383	Caprin1	89	44.106	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	78.892	ENSCGRG00001002901	Caprin2	100	87.805	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.130	ENSCGRG00000012551	Caprin1	95	44.106	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	66.985	ENSCGRG00000001249	Caprin2	100	87.805	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	64	39.130	ENSCSEG00000001898	caprin1a	90	39.855	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	68	41.887	ENSCSEG00000013073	caprin1b	94	42.007	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	64	39.777	ENSCVAG00000005129	caprin1a	91	40.310	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	65	41.786	ENSCVAG00000021994	caprin1b	89	43.015	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	65	40.143	ENSDARG00000009346	caprin1a	90	40.143	Danio_rerio
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	93	42.691	ENSDARG00000020749	caprin2	99	42.691	Danio_rerio
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	63	37.868	ENSDARG00000054272	caprin1b	90	39.326	Danio_rerio
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	92	81.054	ENSDNOG00000009793	CAPRIN2	100	81.054	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.071	ENSDNOG00000031223	-	89	44.106	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	63	41.975	ENSDNOG00000037711	-	96	43.096	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	61	43.071	ENSDORG00000006566	Caprin1	84	44.106	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	71	88.596	ENSDORG00000012639	Caprin2	100	88.596	Dipodomys_ordii
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ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	93.084	ENSECAG00000000608	CAPRIN2	100	93.084	Equus_caballus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	59	42.231	ENSEEUG00000006638	CAPRIN1	94	42.231	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	64	40.152	ENSELUG00000009443	caprin1a	89	39.695	Esox_lucius
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	68	63.889	ENSELUG00000019776	caprin2	100	47.632	Esox_lucius
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	67	42.164	ENSELUG00000006003	caprin1b	92	42.164	Esox_lucius
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	63	42.387	ENSFCAG00000030411	CAPRIN1	96	42.387	Felis_catus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	93.894	ENSFCAG00000007004	CAPRIN2	98	92.290	Felis_catus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	100	66.236	ENSFALG00000009038	CAPRIN2	100	66.494	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	63	42.205	ENSFALG00000001291	CAPRIN1	86	42.966	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	66	43.446	ENSFDAG00000015466	CAPRIN1	95	41.346	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	98	82.745	ENSFDAG00000020134	CAPRIN2	100	82.956	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	63	39.544	ENSFHEG00000020227	caprin1a	89	39.544	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	65	40.000	ENSFHEG00000009076	caprin1b	91	40.809	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	78	43.925	ENSFHEG00000004435	caprin2	90	44.788	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	64	39.273	ENSGMOG00000002853	caprin1b	89	39.273	Gadus_morhua
ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	62	39.535	ENSGMOG00000008955	caprin1a	88	38.722	Gadus_morhua
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