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Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000030259 (Gene tree)
Gene ID: 101050568
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27057 bases
Position: chrJH378153.1:3179810-3206866
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000027739	RRM_1	PF00076.22	6.9e-34	1	2
ENSSBOP00000027739	RRM_1	PF00076.22	6.9e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000044617	MSI1-201	1134	XM_010342813	ENSSBOP00000027739	349 (aa)	XP_010341115	A0A2K6U759

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sbq03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSBOG00000030259	MSI1	52	33.149	ENSSBOG00000028814	-	60	33.149
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	68.915	ENSSBOG00000026425	MSI2	100	71.098
ENSSBOG00000030259	MSI1	74	34.483	ENSSBOG00000034299	-	94	34.615
ENSSBOG00000030259	MSI1	51	43.750	ENSSBOG00000005245	HNRNPA2B1	78	43.750
ENSSBOG00000030259	MSI1	56	41.772	ENSSBOG00000021919	DAZAP1	55	41.772
ENSSBOG00000030259	MSI1	51	44.974	ENSSBOG00000032881	HNRNPD	69	41.597
ENSSBOG00000030259	MSI1	83	36.364	ENSSBOG00000031053	RBM38	86	36.364
ENSSBOG00000030259	MSI1	50	34.104	ENSSBOG00000035723	-	58	35.294
ENSSBOG00000030259	MSI1	50	41.040	ENSSBOG00000025075	-	73	38.095

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSG00000135097	MSI1	98	100.000	Homo_sapiens
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.965	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.965	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.965	ENSAPOG00000023458	-	94	85.965	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	81.365	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.365	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000030259	MSI1	96	82.530	ENSACIG00000017754	-	79	82.530	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	77.011	ENSAOCG00000009031	-	97	77.299	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.965	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	85.965	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.965	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	85.965	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.965	ENSAPEG00000006857	-	79	85.965	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.106	ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.848	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	80.702	ENSATEG00000023779	-	93	80.702	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	97.076	ENSACAG00000002762	MSI1	94	97.076	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSANAG00000027151	MSI1	98	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000030259	MSI1	80	96.403	ENSANAG00000027901	-	92	96.403	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	ENSACLG00000011230	MSI1	94	85.380	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	ENSACLG00000000117	-	100	85.337	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	83.735	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.735	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	100.000	Bos_taurus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSCJAG00000008578	MSI1	98	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.708	ENSCAFG00000010283	MSI1	98	99.708	Canis_familiaris
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	94.269	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	94.269	Capra_hircus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	100.000	Cavia_aperea
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSCCAG00000035567	MSI1	98	100.000	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSCATG00000030019	MSI1	98	100.000	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000030259	MSI1	72	96.109	ENSCSAG00000002265	MSI1	89	96.109	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	96.199	ENSCPBG00000011349	MSI1	94	96.199	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSCGRG00001018883	Msi1	98	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.673	ENSCSEG00000005834	-	94	85.673	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	78.299	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	78.299	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	84.503	ENSCSEG00000008352	-	94	84.503	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000030259	MSI1	66	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.965	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	85.965	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000030259	MSI1	83	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	81.402	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	89.970	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.970	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.102	ENSDORG00000005610	Msi1	94	99.102	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSEASG00005004736	MSI1	98	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000030259	MSI1	100	99.713	ENSECAG00000017526	MSI1	98	100.000	Equus_caballus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	80.441	ENSELUG00000023219	MSI1	92	80.441	Esox_lucius
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	81.232	ENSELUG00000023280	-	100	80.938	Esox_lucius
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSFCAG00000011007	MSI1	98	100.000	Felis_catus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.965	ENSFHEG00000003560	-	94	85.965	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	86.257	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	86.257	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	77.778	ENSGMOG00000017838	-	94	77.778	Gadus_morhua
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	83.626	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.333	Gadus_morhua
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	96	86.792	Gallus_gallus
ENSSBOG00000030259	MSI1	95	67.868	ENSGAFG00000005860	-	90	67.868	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.217	ENSGAFG00000021522	MSI1	95	85.217	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	84.795	ENSGACG00000012679	MSI1	94	84.795	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	81.871	ENSGACG00000008674	-	94	81.871	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	96.199	ENSGAGG00000016037	MSI1	94	96.199	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	ENSHBUG00000011841	-	94	85.380	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	85.380	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.708	ENSHGLG00000012782	MSI1	98	99.708	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	83.891	ENSHCOG00000012067	-	89	83.891	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	80.938	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.938	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	83.918	ENSIPUG00000001976	msi1	95	83.918	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSJJAG00000010463	Msi1	98	100.000	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	83.626	ENSJJAG00000010643	-	94	83.333	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.088	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	85.088	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	83.578	ENSKMAG00000019877	-	100	83.578	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	ENSLBEG00000001375	-	94	85.380	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	85.380	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	87.500	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.427	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000030259	MSI1	94	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.708	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	99.708	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSMNEG00000040034	MSI1	98	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	84.795	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.795	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.965	ENSMAMG00000018426	-	94	85.965	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	ENSMZEG00005000340	-	94	85.380	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.380	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000030259	MSI1	63	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000030259	MSI1	70	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSMICG00000033181	MSI1	98	100.000	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.708	ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.708	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	81.571	ENSMMOG00000012265	-	97	81.571	Mola_mola
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	76.149	ENSMMOG00000010492	MSI1	95	76.149	Mola_mola
ENSSBOG00000030259	MSI1	94	67.771	ENSMODG00000003189	-	100	67.771	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.044	ENSMALG00000001426	-	100	85.044	Monopterus_albus
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.380	Monopterus_albus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.415	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	99.415	Mus_caroli
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.415	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	99.415	Mus_musculus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.123	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	99.123	Mus_pahari
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.415	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	99.415	Mus_spretus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	90.179	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	90.179	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000030259	MSI1	98	100.000	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000030259	MSI1	99	85.380	ENSNBRG00000000841	-	94	85.380	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000030259	MSI1	91	77.432	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.432	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000030259	MSI1	94	89.634	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	Nomascus_leucogenys
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ENSSBOG00000030259	MSI1	94	92.063	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	Ochotona_princeps
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