EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000030587 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: APOBEC1
Alias: APOBEC-1|BEDP|CDAR1|HEPR
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15870 bases
Position: chrJH378349.1:315624-331493
Accession: 604
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000028393	APOBEC_N	PF08210.11	1.6e-28	1	1
ENSSBOP00000028393	APOBEC_C	PF05240.14	1.5e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000045273	APOBEC1-201	531	-	ENSSBOP00000028393	177 (aa)	-	A0A2K6U925

Gene Model

Click here to download ENSSBOG00000030587's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSBOG00000030587's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	51	36.264	ENSSBOG00000035758	AICDA	57	36.264
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	72	32.061	ENSSBOG00000030005	APOBEC3H	79	30.357
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	61	33.036	ENSSBOG00000029091	-	54	33.036
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	62	44.595	ENSSBOG00000032780	-	60	44.595

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	90.173	ENSG00000111701	APOBEC1	73	90.173	Homo_sapiens
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	99	76.136	ENSAMEG00000007098	APOBEC1	74	76.136	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	96	40.351	ENSACAG00000028578	-	93	40.351	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	94.220	ENSANAG00000027743	APOBEC1	70	94.220	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	75.145	ENSBTAG00000014683	APOBEC1	73	75.145	Bos_taurus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	95.349	ENSCJAG00000005398	APOBEC1	78	95.349	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	79.191	ENSCAFG00000013901	APOBEC1	73	79.191	Canis_familiaris
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	79.651	ENSCAFG00020003511	APOBEC1	72	79.651	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	75.000	ENSCHIG00000011898	APOBEC1	77	69.832	Capra_hircus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	75	81.955	ENSTSYG00000029141	APOBEC1	94	81.955	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	70.349	ENSCAPG00000015882	-	80	70.349	Cavia_aperea
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	68.786	ENSCPOG00000033068	APOBEC1	73	68.786	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	95.954	ENSCCAG00000022258	APOBEC1	73	95.954	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	92.486	ENSCATG00000021613	APOBEC1	70	92.486	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	69.942	ENSCLAG00000014645	APOBEC1	75	69.942	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	80	93.662	ENSCSAG00000009817	APOBEC1	74	93.662	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	94	48.521	ENSCPBG00000017398	-	74	48.521	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	99	49.153	ENSCPBG00000014335	-	72	49.153	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	96	47.674	ENSCPBG00000014331	-	71	47.674	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	93	48.795	ENSCPBG00000014327	-	62	48.795	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	93	50.000	ENSCPBG00000014328	-	73	50.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	93.064	ENSCANG00000038359	APOBEC1	75	93.064	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	69.364	ENSCGRG00001011130	Apobec1	76	69.364	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	69.364	ENSCGRG00000008644	Apobec1	76	69.364	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	82.659	ENSDNOG00000010926	APOBEC1	73	82.659	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	66.860	ENSDORG00000023717	Apobec1	80	66.860	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	78.161	ENSETEG00000004867	APOBEC1	74	78.161	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	82.659	ENSEASG00005015951	APOBEC1	73	82.659	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	80	83.803	ENSECAG00000017163	APOBEC1	74	83.803	Equus_caballus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	67.630	ENSEEUG00000009112	-	77	67.630	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	75	67.424	ENSEEUG00000007530	-	63	67.424	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	80.925	ENSFCAG00000009350	APOBEC1	73	80.925	Felis_catus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	80	47.552	ENSFALG00000007257	-	70	47.552	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	90	56.604	ENSFDAG00000018470	APOBEC1	76	56.604	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	96	44.444	ENSGAGG00000021744	-	67	44.444	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	96	44.318	ENSGAGG00000021745	-	64	44.318	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	96	47.953	ENSGAGG00000006624	-	62	47.953	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	94	54.167	ENSGAGG00000011837	-	86	54.167	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	90	52.469	ENSGAGG00000004947	-	76	56.557	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	62.428	ENSHGLG00000001495	APOBEC1	73	62.428	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	62.428	ENSHGLG00100002187	APOBEC1	73	62.428	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	79	77.698	ENSSTOG00000021971	APOBEC1	100	79.592	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	75.723	ENSJJAG00000022108	Apobec1	76	75.723	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	78.613	ENSLAFG00000030837	APOBEC1	78	78.613	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	92.486	ENSMFAG00000000277	APOBEC1	74	93.662	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	91.908	ENSMNEG00000029670	APOBEC1	73	91.908	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	92.486	ENSMLEG00000036301	APOBEC1	73	92.486	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	69.364	ENSMAUG00000022167	Apobec1	78	69.364	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	78.613	ENSMICG00000043645	APOBEC1	75	78.613	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	55	70.408	ENSMOCG00000016170	-	87	70.408	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	70.520	ENSMODG00000018004	APOBEC1	73	70.520	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	69.942	ENSMUSG00000040613	Apobec1	87	69.388	Mus_musculus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	68.786	MGP_PahariEiJ_G0022580	-	88	66.355	Mus_pahari
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	69.942	MGP_SPRETEiJ_G0029857	Apobec1	87	69.388	Mus_spretus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	75.145	ENSMPUG00000017532	APOBEC1	73	75.145	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	71.098	ENSNGAG00000022607	Apobec1	76	71.098	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	90.751	ENSNLEG00000005342	APOBEC1	73	90.751	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	68.208	ENSMEUG00000013406	APOBEC1	73	68.208	Notamacropus_eugenii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	63.953	ENSOPRG00000009508	-	95	63.953	Ochotona_princeps
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	55	69.388	ENSODEG00000001157	-	100	69.388	Octodon_degus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	76.301	ENSOCUG00000025736	APOBEC1	65	76.301	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	78.613	ENSOGAG00000026415	APOBEC1	73	78.613	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	75.000	ENSOARG00000002072	APOBEC1	72	75.000	Ovis_aries
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	81.503	ENSPPAG00000027657	APOBEC1	71	81.503	Pan_paniscus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	80.347	ENSPPRG00000012182	APOBEC1	73	80.347	Panthera_pardus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	80.347	ENSPTIG00000020280	APOBEC1	73	80.347	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	91.329	ENSPTRG00000004614	APOBEC1	73	91.329	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	93.064	ENSPANG00000021027	APOBEC1	73	93.064	Papio_anubis
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	47.977	ENSPSIG00000012568	-	75	47.977	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	76	48.624	ENSPSIG00000012791	-	75	48.624	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	68.786	ENSPEMG00000023841	Apobec1	76	68.786	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	72.254	ENSPCIG00000023973	APOBEC1	73	72.254	Phascolarctos_cinereus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	90.751	ENSPPYG00000004228	APOBEC1	70	90.751	Pongo_abelii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	80.347	ENSPCAG00000008733	APOBEC1	93	80.347	Procavia_capensis
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	100	80.791	ENSPCOG00000013957	APOBEC1	78	80.791	Propithecus_coquereli
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	75	83.459	ENSPVAG00000010709	APOBEC1	57	83.459	Pteropus_vampyrus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	68.786	ENSRNOG00000015411	Apobec1	76	68.786	Rattus_norvegicus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	92.486	ENSRBIG00000031161	APOBEC1	73	92.486	Rhinopithecus_bieti
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	92.486	ENSRROG00000033576	APOBEC1	74	93.662	Rhinopithecus_roxellana
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	72.254	ENSSHAG00000008925	APOBEC1	76	72.254	Sarcophilus_harrisii
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	66.860	ENSSARG00000000032	-	100	66.860	Sorex_araneus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	74	70.992	ENSSARG00000011972	-	99	70.992	Sorex_araneus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	99	41.573	ENSSPUG00000009044	-	68	41.573	Sphenodon_punctatus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	99	78.977	ENSSSCG00000000668	APOBEC1	75	78.977	Sus_scrofa
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	81	50.345	ENSTGUG00000013118	-	99	50.345	Taeniopygia_guttata
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	97	76.744	ENSTBEG00000010043	APOBEC1	73	76.744	Tupaia_belangeri
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	78.613	ENSTTRG00000014015	APOBEC1	93	78.613	Tursiops_truncatus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	99	76.136	ENSUAMG00000011636	APOBEC1	72	76.136	Ursus_americanus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	99	76.136	ENSUMAG00000016552	APOBEC1	72	76.136	Ursus_maritimus
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	77.457	ENSVPAG00000001343	APOBEC1	73	77.457	Vicugna_pacos
ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	79.769	ENSVVUG00000010522	APOBEC1	73	79.769	Vulpes_vulpes