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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000034467 (Gene tree)
Gene ID: 101045531
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 61910 bases
Position: chrJH378111.1:19718974-19780883
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000036921	CRM1_C	PF08767.11	3.1e-134	1	1
ENSSBOP00000036900	CRM1_C	PF08767.11	1.2e-133	1	1
ENSSBOP00000036918	CRM1_C	PF08767.11	1.3e-133	1	1
ENSSBOP00000036921	Xpo1	PF08389.12	2e-41	1	1
ENSSBOP00000036918	Xpo1	PF08389.12	3.9e-41	1	1
ENSSBOP00000036900	Xpo1	PF08389.12	5.2e-41	1	1
ENSSBOP00000036900	IBN_N	PF03810.19	3.4e-12	1	1
ENSSBOP00000036918	IBN_N	PF03810.19	3.5e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000053837	XPO1-201	4175	XM_010333731	ENSSBOP00000036900	1026 (aa)	XP_010332033	A0A2K6UYA6
ENSSBOT00000053859	XPO1-203	4005	-	ENSSBOP00000036921	960 (aa)	-	A0A2K6UYC4
ENSSBOT00000053855	XPO1-202	3171	-	ENSSBOP00000036918	1056 (aa)	-	A0A2K6UYF0

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sbq03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
sbq03013	RNA transport	KEGG
sbq05164	Influenza A	KEGG
sbq05166	Human T-cell leukemia virus 1 infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	96.545	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.250	ENSAPOG00000004984	-	100	91.970	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	85.106	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	85.638	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.336	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	95.056	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	87.553	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	88.085	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	91.170	ENSACIG00000010818	-	100	91.702	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	88.142	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	87.862	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.250	ENSAOCG00000010121	-	100	91.970	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000034467	XPO1	96	87.436	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	87.951	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.250	ENSAPEG00000007038	-	100	91.970	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.250	ENSATEG00000008816	-	100	91.970	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	87.768	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	87.488	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.145	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	94.865	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.958	ENSACAG00000002501	XPO1	100	94.678	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	96.545	ENSANAG00000020802	XPO1	100	96.545	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.063	ENSACLG00000015192	-	100	91.783	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	87.660	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	88.191	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	88.665	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	89.195	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.530	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	92.250	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.425	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	95.145	Bos_taurus
ENSSBOG00000034467	XPO1	99	50.148	WBGene00002078	xpo-1	99	49.538	Caenorhabditis_elegans
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	96.545	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	96.545	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.425	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	95.145	Canis_familiaris
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.328	ENSCAFG00020026910	XPO1	100	94.328	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.425	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	95.145	Capra_hircus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.425	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	95.145	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000034467	XPO1	54	87.568	ENSCAPG00000006454	-	100	88.829	Cavia_aperea
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	93.931	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	93.651	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	79.730	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.826	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.693	ENSCATG00000032674	XPO1	100	96.064	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.145	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	94.865	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	96.545	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	96.545	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000034467	XPO1	83	94.828	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	94.828	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.051	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	94.771	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	77.840	ENSCING00000024562	-	100	77.654	Ciona_intestinalis
ENSSBOG00000034467	XPO1	99	76.937	ENSCSAVG00000005965	-	87	90.991	Ciona_savignyi
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.250	ENSCANG00000028883	XPO1	100	92.908	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.211	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	93.931	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.211	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	93.931	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	90.000	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	90.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.157	ENSCVAG00000016788	-	100	91.877	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	87.151	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	87.115	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	89.449	ENSDARG00000078041	xpo1a	98	94.173	Danio_rerio
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.904	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	92.624	Danio_rerio
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.331	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	95.051	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000034467	XPO1	91	91.713	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	91.377	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000034467	XPO1	99	68.416	FBgn0020497	emb	99	68.322	Drosophila_melanogaster
ENSSBOG00000034467	XPO1	94	97.970	ENSETEG00000018045	XPO1	94	97.970	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000034467	XPO1	96	75.104	ENSEBUG00000012580	-	100	83.119	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.425	ENSEASG00005007223	XPO1	100	95.145	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.425	ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.828	Equus_caballus
ENSSBOG00000034467	XPO1	92	91.667	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	89.681	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	90.213	Esox_lucius
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	89.891	ENSELUG00000014306	-	99	90.435	Esox_lucius
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.425	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	95.145	Felis_catus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.958	ENSFALG00000010989	XPO1	100	94.678	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	93.557	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	93.277	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	87.675	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	87.395	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	86.275	ENSGMOG00000019063	-	100	86.275	Gadus_morhua
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	88.889	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	88.796	Gadus_morhua
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.145	ENSGALG00000029476	XPO1	100	94.865	Gallus_gallus
ENSSBOG00000034467	XPO1	96	91.040	ENSGAFG00000003355	-	98	91.555	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	87.340	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	87.872	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	87.582	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	87.302	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	91.970	ENSGACG00000002743	-	100	91.690	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.958	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	94.678	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	96.545	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	96.545	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.157	ENSHBUG00000020037	-	100	91.877	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	88.235	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	87.955	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.051	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	94.771	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.051	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	94.771	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	90.000	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	90.532	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	90.009	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	89.729	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.530	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	92.250	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.425	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	95.145	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.145	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	94.865	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	87.582	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	87.302	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	91.783	ENSKMAG00000016218	-	100	91.503	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	84.746	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	85.275	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.250	ENSLBEG00000005740	-	100	91.970	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	76.525	ENSLACG00000018213	XPO1	100	76.617	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.997	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	92.717	Lepisosteus_oculatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.051	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	94.771	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	96.545	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	96.545	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	96.545	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	96.545	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	96.545	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	96.545	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.698	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	94.698	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	88.049	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	87.768	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.063	ENSMAMG00000010568	-	100	91.783	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	92.063	ENSMZEG00005018158	-	98	91.555	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	88.235	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	87.955	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000034467	XPO1	71	91.873	ENSMGAG00000001496	-	100	92.562	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.211	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	93.931	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	95.425	ENSMICG00000027770	XPO1	100	95.145	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.491	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	94.211	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	90.822	ENSMMOG00000008001	-	99	91.355	Mola_mola
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	87.447	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	87.979	Mola_mola
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.118	ENSMODG00000002831	XPO1	100	93.838	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000034467	XPO1	93	86.397	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	86.929	Monopterus_albus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	91.783	ENSMALG00000007085	-	100	91.503	Monopterus_albus
ENSSBOG00000034467	XPO1	100	94.585	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	100.000	Mus_caroli
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