EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000034573 (Gene tree)
Gene ID: 101029792
Gene Symbol: SRP9
Alias: -
Full Name: signal recognition particle 9
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12661 bases
Position: chrJH378142.1:1544690-1557350
Accession: 11304
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000036903	SRP9-21	PF05486.12	1.2e-12	1	1
ENSSBOP00000036906	SRP9-21	PF05486.12	1.4e-05	1	1
ENSSBOP00000036910	SRP9-21	PF05486.12	0.00011	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000053847	SRP9-204	249	-	ENSSBOP00000036910	83 (aa)	-	A0A2K6UYB5
ENSSBOT00000053840	SRP9-201	1524	XM_010340887	ENSSBOP00000036903	86 (aa)	XP_010339189	A0A2K6UYD5
ENSSBOT00000053842	SRP9-202	192	-	ENSSBOP00000036905	63 (aa)	-	A0A2K6UYB1
ENSSBOT00000053843	SRP9-203	201	-	ENSSBOP00000036906	66 (aa)	-	A0A2K6UYA9

Gene Model

Click here to download ENSSBOG00000034573's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sbq03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSBOG00000034573's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	94.186	ENSG00000143742	SRP9	100	94.186	Homo_sapiens
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	77.907	ENSAPOG00000006089	srp9	100	77.907	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSAMEG00000014744	SRP9	100	90.698	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	55.814	ENSACIG00000022298	srp9	100	55.814	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	77.907	ENSAOCG00000014643	srp9	100	77.907	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	77.907	ENSAPEG00000004398	srp9	100	77.907	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSATEG00000014339	srp9	100	79.070	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000034573	SRP9	81	84.286	ENSAPLG00000015368	SRP9	100	84.286	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	86.047	ENSACAG00000005788	SRP9	100	86.047	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	100.000	ENSANAG00000022626	SRP9	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSACLG00000018392	srp9	100	79.070	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSAMXG00000010366	srp9	100	79.070	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSBTAG00000033322	SRP9	100	90.698	Bos_taurus
ENSSBOG00000034573	SRP9	88	52.632	WBGene00013984	ZK512.4	100	52.632	Caenorhabditis_elegans
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	100.000	ENSCJAG00000040095	SRP9	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSCAFG00000016162	SRP9	100	90.698	Canis_familiaris
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSCAFG00020003285	SRP9	100	90.698	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSCHIG00000006407	SRP9	100	90.698	Capra_hircus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSTSYG00000026832	SRP9	100	90.698	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	91.860	ENSCPOG00000033454	SRP9	100	91.860	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	97.674	ENSCCAG00000034464	SRP9	100	97.674	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	96.512	ENSCATG00000041813	SRP9	100	96.512	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	93.023	ENSCLAG00000001368	-	100	93.023	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000034573	SRP9	99	83.529	ENSCLAG00000017687	-	99	83.529	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSCHOG00000006096	-	100	90.698	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000034573	SRP9	71	93.617	ENSCHOG00000012912	-	100	59.302	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000034573	SRP9	58	88.000	ENSCHOG00000008435	-	100	88.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	87.209	ENSCPBG00000011999	SRP9	100	87.209	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	96.512	ENSCANG00000030765	-	100	96.512	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	95.349	ENSCANG00000012015	-	100	95.349	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	93.023	ENSCGRG00001008910	Srp9	100	93.023	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000034573	SRP9	74	89.062	ENSCGRG00000009651	Srp9	84	89.062	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	77.907	ENSCSEG00000018438	srp9	100	77.907	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	80.233	ENSCVAG00000001083	srp9	100	80.233	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	77.907	ENSDARG00000042851	srp9	100	77.907	Danio_rerio
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSDNOG00000013412	-	100	90.698	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000034573	SRP9	85	41.096	FBgn0035827	Srp9	95	41.096	Drosophila_melanogaster
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	81.395	ENSETEG00000012291	SRP9	100	81.395	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000034573	SRP9	98	66.667	ENSEBUG00000009080	srp9	100	66.667	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSECAG00000033839	SRP9	100	90.698	Equus_caballus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	83.721	ENSEEUG00000001344	SRP9	100	83.721	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	81.395	ENSELUG00000001506	srp9	100	81.395	Esox_lucius
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSFCAG00000010275	SRP9	62	90.698	Felis_catus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	83.721	ENSFALG00000011689	SRP9	100	83.721	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	94.186	ENSFDAG00000020469	SRP9	100	94.186	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	80.233	ENSFHEG00000011666	srp9	100	80.233	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	77.907	ENSGMOG00000003565	srp9	100	77.907	Gadus_morhua
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	84.884	ENSGALG00000026009	SRP9	100	84.884	Gallus_gallus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	80.233	ENSGAFG00000009506	srp9	100	80.233	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	76.744	ENSGACG00000004110	srp9	100	76.744	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	87.209	ENSGAGG00000017129	SRP9	100	87.209	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	94.186	ENSGGOG00000011555	SRP9	100	94.186	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSHBUG00000021430	srp9	100	79.070	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000034573	SRP9	93	95.000	ENSHGLG00000020925	-	100	95.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	86.047	ENSHGLG00000020168	-	100	86.047	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000034573	SRP9	81	87.143	ENSHGLG00000019830	-	100	87.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000034573	SRP9	98	82.143	ENSHGLG00000006535	-	99	82.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSHGLG00000002329	SRP9	100	90.698	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000034573	SRP9	95	87.805	ENSHGLG00100016521	-	100	87.805	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	86.047	ENSHGLG00100020800	-	100	86.047	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000034573	SRP9	98	82.143	ENSHGLG00100009760	-	99	82.143	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	94.186	ENSHGLG00100019986	-	100	94.186	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	75.581	ENSHGLG00100011806	-	100	75.581	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	54.651	ENSHCOG00000006978	srp9	100	54.651	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	80.233	ENSIPUG00000020674	srp9	100	80.233	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSSTOG00000026827	SRP9	100	90.698	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	89.535	ENSJJAG00000016583	Srp9	100	89.535	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	80.233	ENSKMAG00000014117	srp9	100	80.233	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSLBEG00000020620	srp9	100	79.070	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	83.721	ENSLACG00000007546	SRP9	100	83.721	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	82.558	ENSLOCG00000015903	srp9	100	82.558	Lepisosteus_oculatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSLAFG00000004081	SRP9	100	90.698	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	96.512	ENSMFAG00000002641	SRP9	100	96.512	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	96.512	ENSMMUG00000000134	SRP9	100	96.512	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	96.512	ENSMNEG00000043512	SRP9	100	96.512	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	96.512	ENSMLEG00000037309	SRP9	100	96.512	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSMAMG00000004755	srp9	100	79.070	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSMZEG00005015517	srp9	100	79.070	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	84.884	ENSMGAG00000008061	SRP9	100	84.884	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	93.023	ENSMAUG00000017552	Srp9	100	93.023	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	87.209	ENSMICG00000030104	-	100	87.209	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	93.023	ENSMOCG00000012590	Srp9	100	93.023	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	75.862	ENSMMOG00000014838	srp9	100	75.862	Mola_mola
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSMODG00000025664	SRP9	100	90.698	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	76.744	ENSMALG00000004262	srp9	100	76.744	Monopterus_albus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	95.349	MGP_CAROLIEiJ_G0014997	Srp9	100	95.349	Mus_caroli
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	95.349	ENSMUSG00000026511	Srp9	100	95.349	Mus_musculus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	93.023	MGP_PahariEiJ_G0028229	Srp9	100	93.023	Mus_pahari
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	95.349	MGP_SPRETEiJ_G0015797	Srp9	100	95.349	Mus_spretus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	89.535	ENSMLUG00000014914	SRP9	100	89.535	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	94.186	ENSNGAG00000019936	Srp9	100	94.186	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSNBRG00000010915	srp9	100	79.070	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	94.186	ENSNLEG00000013740	SRP9	100	94.186	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSOPRG00000012133	SRP9	100	90.698	Ochotona_princeps
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	85.227	ENSODEG00000010125	-	76	85.227	Octodon_degus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	88.372	ENSODEG00000015075	-	100	88.372	Octodon_degus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	77.907	ENSONIG00000011409	srp9	100	77.907	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	89.535	ENSOANG00000001472	SRP9	100	89.535	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSOCUG00000010791	SRP9	100	90.698	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	75.581	ENSORLG00020003090	srp9	100	75.581	Oryzias_latipes_hni
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	75.581	ENSORLG00015001636	srp9	89	75.581	Oryzias_latipes_hsok
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	76.744	ENSOMEG00000020548	srp9	100	76.744	Oryzias_melastigma
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	91.860	ENSOGAG00000031299	-	100	91.860	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	91.860	ENSOGAG00000001752	-	100	91.860	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	94.186	ENSPPAG00000042680	SRP9	100	94.186	Pan_paniscus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSPPRG00000011732	SRP9	100	90.698	Panthera_pardus
ENSSBOG00000034573	SRP9	71	88.525	ENSPTIG00000014838	SRP9	71	88.525	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	94.186	ENSPTRG00000002038	SRP9	100	94.186	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	96.512	ENSPANG00000030164	SRP9	100	96.512	Papio_anubis
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	77.907	ENSPKIG00000015012	srp9	100	77.907	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	87.209	ENSPSIG00000014842	SRP9	100	87.209	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	54.651	ENSPMGG00000002318	srp9	100	54.651	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	93.023	ENSPEMG00000022774	Srp9	100	93.023	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSPCIG00000017399	SRP9	100	90.698	Phascolarctos_cinereus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	80.233	ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	Poecilia_reticulata
ENSSBOG00000034573	SRP9	97	93.976	ENSPPYG00000000174	SRP9	100	93.976	Pongo_abelii
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSPCAG00000014886	SRP9	100	90.698	Procavia_capensis
ENSSBOG00000034573	SRP9	71	85.246	ENSPCOG00000021743	-	98	85.246	Propithecus_coquereli
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	69.663	ENSPCOG00000012531	-	100	69.663	Propithecus_coquereli
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSPVAG00000008142	SRP9	100	90.698	Pteropus_vampyrus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSPNYG00000010536	srp9	100	79.070	Pundamilia_nyererei
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	77.907	ENSPNAG00000008264	srp9	100	77.907	Pygocentrus_nattereri
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	93.023	ENSRNOG00000003211	Srp9	100	93.023	Rattus_norvegicus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	96.512	ENSRBIG00000040480	SRP9	100	96.512	Rhinopithecus_bieti
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	96.512	ENSRROG00000028703	SRP9	100	96.512	Rhinopithecus_roxellana
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSSHAG00000013504	SRP9	100	90.698	Sarcophilus_harrisii
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	Scleropages_formosus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSSMAG00000001318	srp9	100	79.070	Scophthalmus_maximus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSSDUG00000008772	srp9	100	79.070	Seriola_dumerili
ENSSBOG00000034573	SRP9	87	84.000	ENSSLDG00000019141	srp9	95	84.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	63.953	ENSSPUG00000014436	SRP9	100	63.953	Sphenodon_punctatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSSPAG00000017244	srp9	100	79.070	Stegastes_partitus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSSSCG00000031664	-	100	90.698	Sus_scrofa
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	83.721	ENSTGUG00000004123	SRP9	100	83.721	Taeniopygia_guttata
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	77.907	ENSTRUG00000024107	srp9	100	77.907	Takifugu_rubripes
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	Tetraodon_nigroviridis
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	88.372	ENSTBEG00000005634	SRP9	100	88.372	Tupaia_belangeri
ENSSBOG00000034573	SRP9	71	88.525	ENSTTRG00000010081	SRP9	98	88.525	Tursiops_truncatus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSUAMG00000020489	SRP9	100	90.698	Ursus_americanus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSUMAG00000015908	SRP9	100	90.698	Ursus_maritimus
ENSSBOG00000034573	SRP9	71	88.525	ENSVPAG00000001698	SRP9	98	88.525	Vicugna_pacos
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	ENSVVUG00000002065	SRP9	100	90.698	Vulpes_vulpes
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSXCOG00000000662	srp9	100	79.070	Xiphophorus_couchianus
ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	ENSXMAG00000029514	srp9	100	79.070	Xiphophorus_maculatus