EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000035145 (Gene tree)
Gene ID: 104650757
Gene Symbol: SRP54
Alias: -
Full Name: signal recognition particle 54
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 72122 bases
Position: chrJH378115.1:3850400-3922521
Accession: 11301
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000038166	SRP54	PF00448.22	2.4e-78	1	1
ENSSBOP00000038183	SRP54	PF00448.22	2.4e-78	1	1
ENSSBOP00000038166	SRP54_N	PF02881.19	3.5e-14	1	1
ENSSBOP00000038183	SRP54_N	PF02881.19	2.8e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000055091	SRP54-202	1229	XM_010334951	ENSSBOP00000038143	213 (aa)	XP_010333253	A0A2K6V1V0
ENSSBOT00000055130	SRP54-204	6434	XM_010335359	ENSSBOP00000038183	474 (aa)	XP_010333661	A0A2K6V1Z4
ENSSBOT00000055086	SRP54-201	1327	XM_010334950	ENSSBOP00000038140	236 (aa)	XP_010333252	A0A2K6V202
ENSSBOT00000055113	SRP54-203	1509	-	ENSSBOP00000038166	502 (aa)	-	A0A2K6V1X4

Gene Model

Click here to download ENSSBOG00000035145's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sbq03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSBOG00000035145's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSG00000100883	SRP54	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSAPOG00000011314	srp54	94	95.570	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSAMEG00000015544	SRP54	94	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000035145	SRP54	88	94.272	ENSACIG00000022831	srp54	92	93.443	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSAOCG00000019401	srp54	94	95.570	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSAPEG00000001977	srp54	100	95.570	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.992	ENSATEG00000013877	srp54	94	95.992	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000035145	SRP54	95	97.908	ENSAPLG00000010125	SRP54	96	97.908	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000035145	SRP54	92	95.622	ENSACAG00000010631	-	100	95.622	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000035145	SRP54	69	81.873	ENSACAG00000001124	-	100	81.873	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	98.523	ENSACAG00000002103	-	94	98.523	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSANAG00000022133	SRP54	96	99.189	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSACLG00000015866	srp54	94	95.781	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.359	ENSAMXG00000032669	SRP54	94	95.359	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSBTAG00000019085	SRP54	94	100.000	Bos_taurus
ENSSBOG00000035145	SRP54	98	72.650	WBGene00009012	F21D5.7	94	72.650	Caenorhabditis_elegans
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSCJAG00000006581	SRP54	98	99.777	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSCAFG00000013331	SRP54	94	100.000	Canis_familiaris
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSCAFG00020023427	SRP54	94	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSCHIG00000026345	SRP54	94	100.000	Capra_hircus
ENSSBOG00000035145	SRP54	94	88.090	ENSTSYG00000035333	-	93	84.989	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	ENSTSYG00000002680	-	98	99.554	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000035145	SRP54	94	61.957	ENSCAPG00000008780	SRP54	95	61.752	Cavia_aperea
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.578	ENSCPOG00000003691	SRP54	94	99.578	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000035145	SRP54	89	99.762	ENSCCAG00000024179	SRP54	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSCATG00000034083	SRP54	98	99.777	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSCLAG00000015076	SRP54	94	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSCSAG00000015575	SRP54	94	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000035145	SRP54	95	87.140	ENSCHOG00000008986	SRP54	94	87.140	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.156	ENSCPBG00000026195	SRP54	94	99.156	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	81.435	ENSCING00000007380	-	94	81.435	Ciona_intestinalis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSCANG00000028532	SRP54	98	99.777	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.578	ENSCGRG00001009525	-	94	99.578	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000035145	SRP54	75	99.437	ENSCGRG00000009453	-	82	99.437	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	94.726	ENSCSEG00000012392	srp54	94	94.726	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSCVAG00000010395	srp54	94	95.570	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSDARG00000098367	srp54	94	95.781	Danio_rerio
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSDNOG00000032525	SRP54	94	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000035145	SRP54	88	83.971	ENSDORG00000005159	-	92	83.333	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000035145	SRP54	96	77.363	FBgn0010747	Srp54k	92	76.923	Drosophila_melanogaster
ENSSBOG00000035145	SRP54	88	58.373	ENSETEG00000012102	-	99	58.373	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.578	ENSETEG00000016307	-	94	99.578	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	87.131	ENSEBUG00000009437	-	94	87.131	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSEASG00005002057	SRP54	94	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000035145	SRP54	99	99.786	ENSECAG00000018042	SRP54	92	99.786	Equus_caballus
ENSSBOG00000035145	SRP54	94	88.143	ENSEEUG00000001511	SRP54	89	88.143	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	94.937	ENSELUG00000003395	srp54	94	94.937	Esox_lucius
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	ENSFCAG00000032033	SRP54	94	99.789	Felis_catus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	98.734	ENSFALG00000005995	SRP54	94	98.734	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSFDAG00000016767	SRP54	94	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.148	ENSFHEG00000004263	srp54	94	95.148	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	90.084	ENSGMOG00000011391	srp54	99	90.084	Gadus_morhua
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	98.734	ENSGALG00000023135	SRP54	94	98.734	Gallus_gallus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSGAFG00000011586	srp54	94	95.781	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.148	ENSGACG00000004181	srp54	94	95.148	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.156	ENSGAGG00000014766	SRP54	94	99.156	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSGGOG00000002926	SRP54	98	99.777	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSHBUG00000005678	srp54	94	95.781	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSHGLG00000002850	SRP54	94	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	68.211	ENSHGLG00100007281	-	93	68.211	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSHGLG00100005263	SRP54	94	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	94.093	ENSHCOG00000021127	srp54	94	94.093	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	94.937	ENSIPUG00000001420	srp54	94	94.937	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSSTOG00000016023	SRP54	94	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000035145	SRP54	93	76.591	ENSJJAG00000016404	-	100	76.591	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	94.515	ENSJJAG00000013417	-	94	94.515	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.148	ENSKMAG00000007707	srp54	94	95.148	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSLBEG00000018690	srp54	94	95.570	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSLBEG00000021122	srp54	94	95.570	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSLACG00000017890	SRP54	94	95.781	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	96.624	ENSLOCG00000009440	srp54	94	96.624	Lepisosteus_oculatus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSLAFG00000012007	SRP54	94	100.000	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSMFAG00000044371	SRP54	98	99.777	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSMMUG00000015073	FAM177A1	98	99.777	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSMNEG00000006947	SRP54	98	99.777	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSMLEG00000042251	SRP54	98	99.777	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSMAMG00000004803	srp54	94	95.781	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSMZEG00005027528	srp54	94	95.781	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	93.697	ENSMGAG00000012481	SRP54	94	93.697	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	ENSMAUG00000014447	-	94	99.789	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSMICG00000010270	SRP54	96	99.189	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000035145	SRP54	93	99.773	ENSMOCG00000000948	-	100	99.773	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000035145	SRP54	88	93.765	ENSMMOG00000020303	srp54	93	92.941	Mola_mola
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	ENSMODG00000012925	-	94	99.789	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	ENSMODG00000023150	-	94	99.789	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000035145	SRP54	87	95.157	ENSMALG00000009163	srp54	93	94.299	Monopterus_albus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	MGP_CAROLIEiJ_G0017754	-	94	99.789	Mus_caroli
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	ENSMUSG00000112449	Srp54b	94	99.789	Mus_musculus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	98.945	ENSMUSG00000079108	Srp54c	94	98.945	Mus_musculus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	ENSMUSG00000073079	Srp54a	94	99.789	Mus_musculus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	MGP_PahariEiJ_G0029510	-	94	99.789	Mus_pahari
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSMPUG00000016302	SRP54	94	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.367	ENSMLUG00000008958	SRP54	94	99.367	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	89.241	ENSNGAG00000019806	-	93	89.241	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000035145	SRP54	93	95.682	ENSNBRG00000006000	srp54	100	95.682	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSNLEG00000003496	SRP54	98	99.777	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000035145	SRP54	65	100.000	ENSMEUG00000000138	-	71	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSODEG00000004865	SRP54	94	100.000	Octodon_degus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSONIG00000011768	srp54	94	95.781	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSOANG00000014051	SRP54	94	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.367	ENSOCUG00000007838	SRP54	94	99.367	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSORLG00000010027	srp54	94	95.570	Oryzias_latipes
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSORLG00020001878	srp54	94	95.570	Oryzias_latipes_hni
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSORLG00015021866	srp54	94	95.570	Oryzias_latipes_hsok
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.359	ENSOMEG00000020952	srp54	94	95.359	Oryzias_melastigma
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSOGAG00000012188	SRP54	94	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSOARG00000007160	SRP54	94	100.000	Ovis_aries
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSPPAG00000017434	SRP54	98	99.777	Pan_paniscus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	98.734	ENSPPRG00000014047	SRP54	98	98.438	Panthera_pardus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	ENSPTIG00000000744	SRP54	90	99.789	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSPTRG00000006259	FAM177A1	98	99.777	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSPANG00000023853	SRP54	98	99.777	Papio_anubis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSPKIG00000001953	srp54	94	95.570	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	98.945	ENSPSIG00000006476	SRP54	94	98.945	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000035145	SRP54	91	92.558	ENSPMGG00000004127	srp54	95	91.781	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	86.076	ENSPEMG00000019634	-	94	86.076	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	88.397	ENSPMAG00000006078	-	94	88.397	Petromyzon_marinus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.789	ENSPCIG00000016175	SRP54	94	99.789	Phascolarctos_cinereus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSPFOG00000008870	srp54	94	95.781	Poecilia_formosa
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSPLAG00000009889	srp54	94	95.781	Poecilia_latipinna
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSPMEG00000008601	srp54	94	95.781	Poecilia_mexicana
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSPREG00000004505	srp54	94	95.781	Poecilia_reticulata
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	94.515	ENSPPYG00000005739	SRP54	94	94.515	Pongo_abelii
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSPCAG00000006268	SRP54	94	95.570	Procavia_capensis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	97.895	ENSPCOG00000022473	SRP54	96	96.964	Propithecus_coquereli
ENSSBOG00000035145	SRP54	61	100.000	ENSPVAG00000010056	SRP54	77	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSPNYG00000009717	srp54	94	95.781	Pundamilia_nyererei
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSPNAG00000008544	srp54	94	95.570	Pygocentrus_nattereri
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.578	ENSRNOG00000032776	Srp54a	94	99.578	Rattus_norvegicus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSRROG00000041292	SRP54	98	99.777	Rhinopithecus_roxellana
ENSSBOG00000035145	SRP54	85	54.146	YPR088C	SRP54	90	48.880	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSBOG00000035145	SRP54	72	100.000	ENSSHAG00000000671	SRP54	100	100.000	Sarcophilus_harrisii
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	96.203	ENSSFOG00015013920	srp54	94	96.203	Scleropages_formosus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	89.286	ENSSMAG00000002441	srp54	94	89.286	Scophthalmus_maximus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.359	ENSSDUG00000018586	srp54	94	95.359	Seriola_dumerili
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.148	ENSSLDG00000010476	srp54	94	95.148	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSSARG00000002744	SRP54	94	100.000	Sorex_araneus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	99.156	ENSSPUG00000013101	SRP54	94	99.156	Sphenodon_punctatus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.570	ENSSPAG00000002354	srp54	94	95.570	Stegastes_partitus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSSSCG00000001955	SRP54	94	100.000	Sus_scrofa
ENSSBOG00000035145	SRP54	95	97.908	ENSTGUG00000011945	-	96	97.908	Taeniopygia_guttata
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	94.726	ENSTRUG00000007057	srp54	94	94.726	Takifugu_rubripes
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	94.304	ENSTNIG00000002589	srp54	94	94.304	Tetraodon_nigroviridis
ENSSBOG00000035145	SRP54	94	91.499	ENSTBEG00000011409	SRP54	100	91.499	Tupaia_belangeri
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	89.241	ENSTTRG00000000928	SRP54	94	89.241	Tursiops_truncatus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSUMAG00000011234	SRP54	94	100.000	Ursus_maritimus
ENSSBOG00000035145	SRP54	94	99.775	ENSVPAG00000005668	SRP54	95	98.894	Vicugna_pacos
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	100.000	ENSVVUG00000019962	SRP54	94	100.000	Vulpes_vulpes
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	81.132	ENSXETG00000012290	srp54	94	81.132	Xenopus_tropicalis
ENSSBOG00000035145	SRP54	87	95.642	ENSXCOG00000004658	srp54	92	94.774	Xiphophorus_couchianus
ENSSBOG00000035145	SRP54	100	95.781	ENSXMAG00000018315	srp54	94	95.781	Xiphophorus_maculatus