EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSBOG00000035892 (Gene tree)
Gene ID: 101039225
Gene Symbol: SRPRA
Alias: SR-alpha|SRP-alpha|SRPR|Sralpha
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Saimiri_boliviensis_boliviensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6308 bases
Position: chrJH378113.1:14535894-14542201
Accession: 11307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSBOP00000039768	SRP54	PF00448.22	1.8e-47	1	1
ENSSBOP00000039766	SRP54	PF00448.22	2e-47	1	1
ENSSBOP00000039768	SRP54_N	PF02881.19	1.2e-08	1	1
ENSSBOP00000039766	SRP54_N	PF02881.19	1.3e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSBOT00000056730	SRPRA-202	1833	-	ENSSBOP00000039768	610 (aa)	-	A0A2K6V6I2
ENSSBOT00000056728	SRPRA-201	3078	XM_003923525	ENSSBOP00000039766	638 (aa)	XP_003923574	A0A2K6V6J6

Gene Model

Click here to download ENSSBOG00000035892's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sbq03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSBOG00000035892's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.903	ENSG00000182934	SRPRA	100	98.903	Homo_sapiens
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.023	ENSAPOG00000017588	srpra	100	67.890	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.708	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	96.708	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	65.906	ENSACIG00000021588	srpra	100	66.058	Amphilophus_citrinellus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.988	ENSAOCG00000018884	srpra	100	68.397	Amphiprion_ocellaris
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.481	ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.406	Amphiprion_percula
ENSSBOG00000035892	SRPRA	83	86.984	ENSATEG00000023578	srpra	93	86.728	Anabas_testudineus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	94	77.833	ENSAPLG00000016079	SRPRA	100	77.997	Anas_platyrhynchos
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	77.042	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	77.385	Anolis_carolinensis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	99.687	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	99.687	Aotus_nancymaae
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.922	ENSACLG00000000518	srpra	100	67.328	Astatotilapia_calliptera
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	65.683	ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.217	Astyanax_mexicanus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.183	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	97.183	Bos_taurus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	99	47.872	WBGene00009521	F38A1.8	99	47.568	Caenorhabditis_elegans
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	99.687	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	99.687	Callithrix_jacchus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	94.671	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	94.671	Canis_familiaris
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.708	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	96.708	Canis_lupus_dingo
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.557	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	96.557	Capra_hircus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	81	98.883	ENSTSYG00000005187	SRPRA	100	96.875	Carlito_syrichta
ENSSBOG00000035892	SRPRA	95	88.962	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	97.744	Cavia_aperea
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.022	ENSCPOG00000014976	SRPRA	100	97.022	Cavia_porcellus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	99.530	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	99.530	Cebus_capucinus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.903	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	98.903	Cercocebus_atys
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.962	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.962	Chinchilla_lanigera
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.903	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.903	Chlorocebus_sabaeus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	58	98.469	ENSCHOG00000010015	-	73	98.469	Choloepus_hoffmanni
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	77.880	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	78.341	Chrysemys_picta_bellii
ENSSBOG00000035892	SRPRA	99	59.259	ENSCING00000008954	-	100	58.776	Ciona_intestinalis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	99	58.525	ENSCSAVG00000005602	-	100	59.029	Ciona_savignyi
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.649	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	97.649	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.552	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	96.552	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.552	ENSCGRG00000009892	Srpr	100	96.552	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.576	ENSCSEG00000002374	srpra	100	67.576	Cynoglossus_semilaevis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.722	ENSCVAG00000019881	srpra	100	68.140	Cyprinodon_variegatus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.768	ENSDARG00000061124	srpra	100	66.313	Danio_rerio
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	95.504	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	95.504	Dasypus_novemcinctus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.335	ENSDORG00000016719	Srpr	100	97.335	Dipodomys_ordii
ENSSBOG00000035892	SRPRA	99	51.464	FBgn0010391	Gtp-bp	100	52.080	Drosophila_melanogaster
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	93.302	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	93.302	Echinops_telfairi
ENSSBOG00000035892	SRPRA	65	70.025	ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	Eptatretus_burgeri
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.088	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	95.775	Equus_asinus_asinus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.244	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	95.931	Equus_caballus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	87.072	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	86.293	Erinaceus_europaeus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	68.550	ENSELUG00000017643	srpra	100	68.702	Esox_lucius
ENSSBOG00000035892	SRPRA	80	95.499	ENSFCAG00000030894	-	99	95.108	Felis_catus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.714	ENSFCAG00000011274	-	100	96.714	Felis_catus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	99	74.571	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.571	Ficedula_albicollis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.119	ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.119	Fukomys_damarensis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.117	ENSFHEG00000016959	srpra	100	66.971	Fundulus_heteroclitus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.547	ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.372	Gadus_morhua
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	78.120	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	78.274	Gallus_gallus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.428	ENSGAFG00000000453	srpra	100	66.917	Gambusia_affinis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.923	ENSGACG00000006550	srpra	100	67.183	Gasterosteus_aculeatus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	79.109	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	79.109	Gopherus_agassizii
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.746	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	98.746	Gorilla_gorilla
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.769	ENSHBUG00000000119	srpra	100	67.176	Haplochromis_burtoni
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.022	ENSHGLG00000001597	SRPR	100	97.022	Heterocephalus_glaber_female
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.022	ENSHGLG00100006449	SRPR	100	97.022	Heterocephalus_glaber_male
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.976	ENSHCOG00000010749	srpra	100	68.381	Hippocampus_comes
ENSSBOG00000035892	SRPRA	98	61.675	ENSIPUG00000000867	srpra	99	64.830	Ictalurus_punctatus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.962	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	97.962	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.238	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	96.238	Jaculus_jaculus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	68.120	ENSKMAG00000002280	srpra	100	68.976	Kryptolebias_marmoratus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.819	ENSLBEG00000009608	srpra	100	68.085	Labrus_bergylta
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	70.325	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	70.325	Latimeria_chalumnae
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.166	ENSLOCG00000002733	srpra	100	66.817	Lepisosteus_oculatus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	95.149	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	95.149	Loxodonta_africana
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	99.060	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	99.060	Macaca_fascicularis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	99.060	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	99.060	Macaca_mulatta
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.903	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	98.903	Macaca_nemestrina
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.903	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	98.903	Mandrillus_leucophaeus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.566	ENSMAMG00000000473	srpra	100	66.566	Mastacembelus_armatus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.922	ENSMZEG00005013432	srpra	100	67.328	Maylandia_zebra
ENSSBOG00000035892	SRPRA	94	77.888	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	78.053	Meleagris_gallopavo
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.865	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	96.865	Mesocricetus_auratus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.179	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	97.179	Microcebus_murinus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.865	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	96.865	Microtus_ochrogaster
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.287	ENSMMOG00000005019	srpra	100	67.287	Mola_mola
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	90.141	ENSMODG00000004576	-	100	89.655	Monodelphis_domestica
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.933	ENSMALG00000011343	srpra	100	68.237	Monopterus_albus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.552	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	100	96.552	Mus_caroli
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.552	ENSMUSG00000032042	Srpr	100	96.552	Mus_musculus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.708	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	100	96.708	Mus_pahari
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	92.090	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	92.090	Mus_spretus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.865	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	96.865	Mustela_putorius_furo
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	94.514	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	94.514	Myotis_lucifugus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.552	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	96.552	Nannospalax_galili
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.073	ENSNBRG00000017311	srpra	100	67.534	Neolamprologus_brichardi
ENSSBOG00000035892	SRPRA	95	98.851	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.851	Nomascus_leucogenys
ENSSBOG00000035892	SRPRA	94	90.333	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	90.000	Notamacropus_eugenii
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	90.454	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.454	Ochotona_princeps
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.395	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	96.395	Octodon_degus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.768	ENSONIG00000005324	srpra	100	67.176	Oreochromis_niloticus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.276	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	98.276	Oryctolagus_cuniculus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	86	86.032	ENSORLG00000014676	srpra	100	67.791	Oryzias_latipes
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.025	ENSORLG00020009240	srpra	100	67.791	Oryzias_latipes_hni
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.025	ENSORLG00015015405	srpra	100	67.945	Oryzias_latipes_hsok
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	68.056	ENSOMEG00000005872	srpra	100	67.994	Oryzias_melastigma
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.492	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	97.492	Otolemur_garnettii
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	92.512	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	93.136	Ovis_aries
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.903	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	98.903	Pan_paniscus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.714	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	96.714	Panthera_pardus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.557	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	96.557	Panthera_tigris_altaica
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.903	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	98.903	Pan_troglodytes
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	99.060	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	99.060	Papio_anubis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.254	ENSPKIG00000016106	srpra	100	66.770	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSBOG00000035892	SRPRA	94	77.011	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	77.176	Pelodiscus_sinensis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	68.098	ENSPMGG00000001393	srpra	100	68.098	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.022	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	97.022	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSBOG00000035892	SRPRA	99	61.017	ENSPMAG00000009559	srpra	99	60.213	Petromyzon_marinus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	89.828	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	89.984	Phascolarctos_cinereus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.273	ENSPFOG00000003114	srpra	100	68.976	Poecilia_formosa
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.968	ENSPLAG00000007323	srpra	100	68.675	Poecilia_latipinna
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.273	ENSPMEG00000015658	srpra	100	68.976	Poecilia_mexicana
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	68.326	ENSPREG00000004937	srpra	100	68.326	Poecilia_reticulata
ENSSBOG00000035892	SRPRA	89	98.684	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	98.684	Pongo_abelii
ENSSBOG00000035892	SRPRA	64	99.225	ENSPCAG00000003801	-	64	99.225	Procavia_capensis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.335	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	97.335	Propithecus_coquereli
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.082	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	96.082	Pteropus_vampyrus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.922	ENSPNYG00000012371	srpra	100	67.328	Pundamilia_nyererei
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	64.536	ENSPNAG00000013476	srpra	100	66.464	Pygocentrus_nattereri
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.022	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	97.022	Rattus_norvegicus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.746	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	98.746	Rhinopithecus_bieti
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.592	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	98.592	Rhinopithecus_roxellana
ENSSBOG00000035892	SRPRA	70	37.657	YDR292C	-	76	37.657	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSBOG00000035892	SRPRA	94	90.532	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.199	Sarcophilus_harrisii
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	64.953	ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.147	Scleropages_formosus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.407	ENSSMAG00000002783	srpra	100	65.941	Scophthalmus_maximus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.719	ENSSDUG00000013920	srpra	100	66.719	Seriola_dumerili
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.565	ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.275	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	85	100.000	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	Sorex_araneus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	77.006	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	77.160	Sphenodon_punctatus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.616	ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.527	Stegastes_partitus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.179	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.179	Sus_scrofa
ENSSBOG00000035892	SRPRA	94	74.794	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	74.794	Taeniopygia_guttata
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	65.941	ENSTRUG00000006856	srpra	100	66.972	Takifugu_rubripes
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	63.885	ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.099	Tetraodon_nigroviridis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.244	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	95.931	Tursiops_truncatus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.557	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	96.557	Ursus_americanus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	98	87.336	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	87.336	Ursus_maritimus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	72	99.225	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	99.225	Vicugna_pacos
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	96.865	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	96.865	Vulpes_vulpes
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	62.137	ENSXETG00000003920	srpra	100	62.443	Xenopus_tropicalis
ENSSBOG00000035892	SRPRA	84	87.619	ENSXCOG00000001286	srpra	100	69.556	Xiphophorus_couchianus
ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.678	ENSXMAG00000028401	srpra	100	67.674	Xiphophorus_maculatus