EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000000818 (Gene tree)
Gene ID: 111232052
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: im:6912651
Full Name: uncharacterized LOC111232052
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3191 bases
Position: chrBDQW01000321.1:3702389-3705579
Accession: 111232052
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000000995	Isy1	PF06246.12	4.5e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000001042	-	1674	XM_022759401	ENSSDUP00000000995	318 (aa)	XP_022615122	UPI000BBE5D6E

Gene Model

Click here to download ENSSDUG00000000818's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSDUG00000000818's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	69.811	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	69.811	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	64.151	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	64.151	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	59.306	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	59.306	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	67.508	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	67.508	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	70.159	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	70.159	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	97	66.019	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	66.667	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	46.082	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	99	46.082	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	57.862	ENSCSEG00000007482	-	99	57.862	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	59.375	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	59.375	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	45.570	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	45.570	Danio_rerio
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	51.393	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	100	51.393	Esox_lucius
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	60.883	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	99	60.883	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	75	67.647	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	67.647	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	97	66.019	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	66.667	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	45.079	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	99	45.079	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	66.981	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	66.981	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	97	53.526	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	54.717	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	38.066	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	99	38.066	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	45.397	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	99	46.349	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	70.755	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	70.755	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	97	66.019	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	66.667	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	59.434	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	59.434	Mola_mola
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	73.899	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	91	73.899	Monopterus_albus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	97	58.900	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	59.434	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	97	66.667	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	67.296	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	58.176	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	58.176	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	58.805	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	58.805	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	59.748	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	59.748	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	60.127	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	60.127	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	41.562	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	99	41.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	50.473	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	98	50.473	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	61.562	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	61.562	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	61.250	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	61.250	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	61.875	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	61.875	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	55.031	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	55.031	Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	97	65.696	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	66.352	Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	49.051	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	99	49.051	Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	99	45.938	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	99	45.938	Scleropages_formosus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	96	75.817	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	100	76.250	Scophthalmus_maximus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	96.552	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	96.552	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	71.069	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	71.069	Stegastes_partitus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	59.561	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	59.561	Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	52.484	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	52.484	Xiphophorus_couchianus
ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	61.562	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	61.562	Xiphophorus_maculatus