EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSSDUG00000005270 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
-
Alias
-
Full Name
-
Gene Type
protein_coding
Species
Seriola_dumerili
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
4264 bases
Position
chrBDQW01002305.1:108499-112762
Accession
-
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSSDUP00000007157MMR_HSR1PF01926.231.6e-1011
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSSDUT00000007293-2934-ENSSDUP00000007157892 (aa)--
Gene Model
Click here to download ENSSDUG00000005270's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSDUG00000005270's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSSDUG00000005270-9746.333ENSSDUG00000016851-9946.429
ENSSDUG00000005270-5745.374ENSSDUG00000023838-7443.333
ENSSDUG00000005270-6244.444ENSSDUG00000023839-8241.841
ENSSDUG00000005270-5580.503ENSSDUG00000005219-9776.099
ENSSDUG00000005270-6447.566ENSSDUG00000021707-7850.450
ENSSDUG00000005270-5173.864ENSSDUG00000016605-9174.242
ENSSDUG00000005270-6555.946ENSSDUG00000021006-9957.570
ENSSDUG00000005270-6047.162ENSSDUG00000020760-6849.275
ENSSDUG00000005270-5646.535ENSSDUG00000003676-6845.192
ENSSDUG00000005270-7858.824ENSSDUG00000009253-9959.698
ENSSDUG00000005270-6149.153ENSSDUG00000020733-8851.402
ENSSDUG00000005270-5562.452ENSSDUG00000004903-7165.899
ENSSDUG00000005270-6960.714ENSSDUG00000005095-8961.039
ENSSDUG00000005270-6252.459ENSSDUG00000023286-7353.982
ENSSDUG00000005270-5340.476ENSSDUG00000001415-7840.476
ENSSDUG00000005270-5539.070ENSSDUG00000023612-5839.070
ENSSDUG00000005270-5151.866ENSSDUG00000023613-6756.944
ENSSDUG00000005270-5987.324ENSSDUG00000009231-8886.301
ENSSDUG00000005270-5457.401ENSSDUG00000016775-9457.401
ENSSDUG00000005270-5340.476ENSSDUG00000001369-7840.476
ENSSDUG00000005270-5351.042ENSSDUG00000016459-9751.042
ENSSDUG00000005270-5654.098ENSSDUG00000016809-8052.812
ENSSDUG00000005270-5740.529ENSSDUG00000001353-9641.860
ENSSDUG00000005270-6583.509ENSSDUG00000004973-9783.480
ENSSDUG00000005270-5159.302ENSSDUG00000016791-7762.963
ENSSDUG00000005270-5044.262ENSSDUG00000018996-8444.262
ENSSDUG00000005270-6179.741ENSSDUG00000013443-8479.654
ENSSDUG00000005270-9768.339ENSSDUG00000016624-8668.562
ENSSDUG00000005270-6248.641ENSSDUG00000005123-9749.731
ENSSDUG00000005270-6153.881ENSSDUG00000023239-6855.556
ENSSDUG00000005270-6138.800ENSSDUG00000009222-8041.204
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSSDUG00000005270-7953.136ENSAPOG00000008987-9853.136Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000005270-8950.376ENSAPOG00000009034-9450.376Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000005270-6651.698ENSAPOG00000001447-8851.698Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000005270-7953.888ENSAPOG00000017368-9753.888Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000005270-9255.941ENSACIG00000005198-9355.759Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000005270-5349.817ENSACIG00000012718-9360.185Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000005270-6356.126ENSACIG00000007191-7156.126Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000005270-6472.000ENSACIG00000012648-9172.000Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000005270-5935.211ENSAOCG00000004245-8435.211Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000005270-9958.583ENSAOCG00000022545-9958.693Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000005270-7060.144ENSAOCG00000013686-9760.144Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000005270-9947.545ENSAOCG00000001095-10047.545Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000005270-6254.183ENSAPEG00000021634-8454.183Amphiprion_percula
ENSSDUG00000005270-8863.338ENSATEG00000012058-9363.174Anabas_testudineus
ENSSDUG00000005270-10045.464ENSATEG00000011336-9845.683Anabas_testudineus
ENSSDUG00000005270-9846.290ENSATEG00000011330-9946.195Anabas_testudineus
ENSSDUG00000005270-8752.345ENSATEG00000011352-8851.584Anabas_testudineus
ENSSDUG00000005270-7458.501ENSATEG00000011735-9258.501Anabas_testudineus
ENSSDUG00000005270-6258.228ENSACLG00000024836-8160.563Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-9658.285ENSACLG00000012195-9858.285Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-5359.630ENSACLG00000024854-8959.630Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-10043.452ENSACLG00000024857-9543.452Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-9742.011ENSACLG00000024859-10042.011Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-9553.986ENSACLG00000005679-9653.986Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-5457.045ENSACLG00000009780-8757.045Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-7861.125ENSACLG00000005220-9361.026Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-6563.869ENSACLG00000005669-9863.869Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-9055.995ENSACLG00000004980-9755.995Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-6075.980ENSACLG00000005066-9075.980Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-5456.357ENSACLG00000009774-7756.357Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000005270-5043.561ENSAMXG00000036745-7247.664Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000005270-5055.310ENSAMXG00000037741-9355.505Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000005270-7835.984ENSAMXG00000041224-8134.831Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000005270-5849.265ENSAMXG00000024930-9149.265Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000005270-7445.725ENSAMXG00000030783-9145.725Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000005270-9941.461ENSCVAG00000018481-9941.461Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000005270-7660.630ENSCVAG00000023267-8556.897Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000005270-7438.333ENSDARG00000086048si:ch211-229i14.29438.295Danio_rerio
ENSSDUG00000005270-9241.509ENSELUG00000015106-8345.600Esox_lucius
ENSSDUG00000005270-9644.938ENSELUG00000005405-9746.338Esox_lucius
ENSSDUG00000005270-9645.783ENSELUG00000015135-9644.016Esox_lucius
ENSSDUG00000005270-8655.185ENSELUG00000015076si:ch211-229i14.29148.303Esox_lucius
ENSSDUG00000005270-9955.571ENSFHEG00000019202-10055.712Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000005270-9252.593ENSFHEG00000011334-9452.352Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000005270-9956.276ENSFHEG00000013865-10056.276Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000005270-8856.801ENSFHEG00000000207-9559.274Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000005270-5755.556ENSFHEG00000021828-9555.556Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000005270-9656.860ENSGAFG00000015917-9856.860Gambusia_affinis
ENSSDUG00000005270-9941.121ENSGAFG00000015999-9441.121Gambusia_affinis
ENSSDUG00000005270-9748.000ENSGAFG00000015908-9348.000Gambusia_affinis
ENSSDUG00000005270-9950.279ENSGAFG00000001852-9950.336Gambusia_affinis
ENSSDUG00000005270-8352.452ENSGACG00000013107-9149.873Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000005270-9559.646ENSHBUG00000020633-9859.646Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000005270-6174.180ENSHBUG00000006928-7674.180Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000005270-5871.163ENSHBUG00000000157-7871.362Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000005270-6571.483ENSHBUG00000011156-8471.483Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000005270-6458.397ENSHBUG00000002999-9158.397Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000005270-8754.286ENSHBUG00000011672-9960.839Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000005270-5271.649ENSHBUG00000020672-9371.649Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000005270-8449.288ENSHBUG00000003015-9849.288Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000005270-8565.435ENSHBUG00000013269-8265.435Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000005270-9658.565ENSHBUG00000010247-9858.565Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000005270-9632.521ENSIPUG00000004161-9032.803Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000005270-6639.619ENSIPUG00000004131-9836.232Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000005270-9352.989ENSKMAG00000010851-9752.576Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000005270-10042.810ENSKMAG00000010293-9943.030Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000005270-7267.492ENSLBEG00000010625-9767.492Labrus_bergylta
ENSSDUG00000005270-7865.968ENSLBEG00000022878-9965.968Labrus_bergylta
ENSSDUG00000005270-6368.476ENSLBEG00000017021-9768.476Labrus_bergylta
ENSSDUG00000005270-6468.772ENSLBEG00000028623-9168.838Labrus_bergylta
ENSSDUG00000005270-6147.368ENSLBEG00000008506-6647.393Labrus_bergylta
ENSSDUG00000005270-7866.187ENSLBEG00000012647-9863.784Labrus_bergylta
ENSSDUG00000005270-6754.015ENSMAMG00000017892-7858.796Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000005270-9158.929ENSMAMG00000018175-9658.929Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000005270-9266.154ENSMAMG00000018170-9966.154Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000005270-8847.771ENSMAMG00000017884-9646.300Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000005270-8149.465ENSMAMG00000018061-9549.198Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000005270-8743.070ENSMAMG00000017906-9839.927Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000005270-8466.523ENSMAMG00000018162si:ch211-229i14.29766.911Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000005270-9842.468ENSMAMG00000017849-9943.169Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000005270-6371.321ENSMZEG00005014235-8971.756Maylandia_zebra
ENSSDUG00000005270-5357.500ENSMZEG00005027841-7957.500Maylandia_zebra
ENSSDUG00000005270-6751.342ENSMZEG00005021732-8951.342Maylandia_zebra
ENSSDUG00000005270-5366.791ENSMZEG00005002051-9165.672Maylandia_zebra
ENSSDUG00000005270-7747.672ENSMZEG00005028364-9348.402Maylandia_zebra
ENSSDUG00000005270-5359.630ENSMZEG00005021723-8459.630Maylandia_zebra
ENSSDUG00000005270-6157.384ENSMZEG00005021721-7659.155Maylandia_zebra
ENSSDUG00000005270-8148.974ENSMALG00000004282-9249.038Monopterus_albus
ENSSDUG00000005270-8657.746ENSMALG00000001082-9154.261Monopterus_albus
ENSSDUG00000005270-5162.000ENSNBRG00000014905-9358.528Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000005270-6259.756ENSNBRG00000019119-7259.756Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000005270-9959.459ENSNBRG00000003245-9759.459Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000005270-9740.536ENSNBRG00000014894-9640.536Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000005270-6766.667ENSNBRG00000003060-8565.530Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000005270-6059.563ENSONIG00000013819-9559.563Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000005270-8355.527ENSONIG00000013863-9855.913Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000005270-7464.414ENSONIG00000012315-9864.414Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000005270-6758.125ENSONIG00000000233-9954.188Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000005270-7758.680ENSONIG00000000314-9068.142Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000005270-8457.330ENSONIG00000011313-9758.333Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000005270-8843.921ENSONIG00000004482-9853.559Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000005270-6553.958ENSONIG00000014210-9653.607Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000005270-8750.733ENSONIG00000010736-9950.733Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000005270-9248.430ENSORLG00000030459-9348.792Oryzias_latipes
ENSSDUG00000005270-7060.000ENSORLG00000025924si:ch211-229i14.29953.558Oryzias_latipes
ENSSDUG00000005270-8847.750ENSORLG00000017091-9944.711Oryzias_latipes
ENSSDUG00000005270-8846.824ENSORLG00020016100-9943.913Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000005270-9247.318ENSORLG00020014225-9547.676Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000005270-6457.993ENSORLG00015004298-5357.993Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000005270-7058.173ENSORLG00015004505-9752.296Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000005270-8847.685ENSORLG00015006787-9546.387Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000005270-9952.306ENSOMEG00000007494-9552.418Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000005270-9957.067ENSOMEG00000013595-8957.085Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000005270-10043.961ENSOMEG00000003632-9944.044Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000005270-9048.020ENSOMEG00000009393-9946.583Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000005270-6553.903ENSPMGG00000002488-8753.903Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000005270-6145.060ENSPFOG00000000259-9845.060Poecilia_formosa
ENSSDUG00000005270-8548.040ENSPFOG00000001388-9847.552Poecilia_formosa
ENSSDUG00000005270-8758.503ENSPFOG00000022293-9958.844Poecilia_formosa
ENSSDUG00000005270-9940.964ENSPFOG00000000973-9940.843Poecilia_formosa
ENSSDUG00000005270-6448.764ENSPFOG00000000217-9649.066Poecilia_formosa
ENSSDUG00000005270-9350.466ENSPFOG00000024835-9850.000Poecilia_formosa
ENSSDUG00000005270-9052.593ENSPLAG00000015541-9449.659Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000005270-10055.494ENSPMEG00000002123-10055.494Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000005270-9942.903ENSPMEG00000010900-9942.903Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000005270-9051.970ENSPMEG00000003917-9849.205Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000005270-6764.835ENSPMEG00000009705-9861.684Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000005270-8956.585ENSPMEG00000008599-9856.911Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000005270-7964.437ENSPREG00000016826-9655.668Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000005270-5056.250ENSPREG00000018694-7658.333Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000005270-7754.795ENSPREG00000006470-9454.103Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000005270-8953.483ENSPREG00000017114-9850.114Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000005270-9050.358ENSPREG00000017000-9550.597Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000005270-9855.032ENSPREG00000017086-8756.908Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000005270-6465.737ENSPNYG00000019890-9365.737Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000005270-6746.142ENSPNYG00000008507-9946.250Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000005270-6370.076ENSPNYG00000023994-9570.611Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000005270-6553.184ENSPNYG00000008579-8350.746Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000005270-7562.649ENSPNYG00000004195-9962.649Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000005270-10054.783ENSPNYG00000006913-10054.658Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000005270-8349.457ENSPNYG00000008570-9649.457Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000005270-9162.620ENSPNYG00000000712-9862.620Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000005270-7660.668ENSPNYG00000003568-9959.695Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000005270-9642.779ENSPNYG00000008493-9943.144Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000005270-7241.026ENSPNAG00000026011-7540.513Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000005270-7638.753ENSPNAG00000003364si:ch211-229i14.29936.293Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000005270-6648.897ENSPNAG00000003225-8548.897Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000005270-6368.145ENSSMAG00000016994-9068.145Scophthalmus_maximus
ENSSDUG00000005270-6277.256ENSSLDG00000011692-9977.256Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000005270-7155.030ENSSLDG00000013126-9455.917Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000005270-5360.000ENSSLDG00000004473-9759.410Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000005270-7369.085ENSSLDG00000007022-8469.716Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000005270-8348.375ENSSLDG00000001533-9947.207Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000005270-5159.922ENSSLDG00000001606-7663.889Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000005270-6561.538ENSSLDG00000004233-8960.474Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000005270-7062.353ENSSLDG00000002339-9962.353Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000005270-5257.430ENSSPAG00000001365-9257.430Stegastes_partitus
ENSSDUG00000005270-9942.780ENSSPAG00000001386-9943.492Stegastes_partitus
ENSSDUG00000005270-9063.648ENSSPAG00000005977-9963.648Stegastes_partitus
ENSSDUG00000005270-8837.037ENSTRUG00000025882-8436.173Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000005270-9043.083ENSTRUG00000020623-8843.083Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000005270-5352.593ENSXCOG00000018711-8850.853Xiphophorus_couchianus
ENSSDUG00000005270-9549.888ENSXMAG00000027923-9649.888Xiphophorus_maculatus
ENSSDUG00000005270-8942.312ENSXMAG00000019889-9942.074Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us