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Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000007943 (Gene tree)
Gene ID: 111220804
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22923 bases
Position: chrBDQW01000074.1:567774-590696
Accession: 111220804
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000010906	IBN_N	PF03810.19	3.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000011103	-	6687	XM_022744030	ENSSDUP00000010906	890 (aa)	XP_022599751	UPI000BBE1B6D

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	87.050	ENSSDUG00000002607	TNPO2	99	87.050
ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	86.374	ENSSDUG00000001767	tnpo2	99	86.374

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSG00000083312	TNPO1	100	94.301	Homo_sapiens
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	99.438	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	99.438	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	92.873	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.984	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000007943	tnpo1	87	98.450	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.450	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	99.326	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	99.326	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	99.326	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	99.326	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	99.213	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	99.213	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	89.515	ENSAPLG00000009619	-	97	90.482	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.045	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.045	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	83.708	ENSANAG00000025351	-	99	83.708	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	58.758	ENSANAG00000027118	-	99	60.976	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.371	ENSANAG00000022453	-	99	93.371	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	96.966	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.966	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.843	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.395	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.933	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.933	Bos_taurus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.483	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.483	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	96	93.816	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.816	Canis_familiaris
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	91.461	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.461	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.820	Capra_hircus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	90.282	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.632	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.371	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.371	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.820	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.371	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.371	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.820	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	94	82.241	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.241	Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.270	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.270	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	76.543	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.982	Ciona_savignyi
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.820	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.708	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.708	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000007943	tnpo1	96	93.918	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.918	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	96.742	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.742	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.640	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.640	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.837	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.388	Danio_rerio
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	88.130	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	88.130	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	93	94.096	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.089	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	58.737	FBgn0035693	CG8219	99	58.174	Drosophila_melanogaster
ENSSDUG00000007943	tnpo1	86	95.506	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000007943	tnpo1	94	85.238	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.820	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.820	Equus_caballus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	88.889	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.671	Esox_lucius
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.820	Felis_catus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.157	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.157	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.483	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.483	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.755	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.755	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	92.945	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.945	Gadus_morhua
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.371	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.371	Gallus_gallus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.309	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.309	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.191	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	97.191	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.157	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.157	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	78.700	ENSGGOG00000022535	-	98	78.700	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.820	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	98.764	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.764	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.371	ENSHGLG00000000970	-	99	93.371	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000007943	tnpo1	96	93.458	ENSHGLG00100017090	-	99	93.458	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000007943	tnpo1	97	73.140	ENSHGLG00100000963	-	99	72.674	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.933	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.933	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.753	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.753	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	91	94.821	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.821	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000007943	tnpo1	96	87.326	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.326	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	95.169	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.169	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	97	93.187	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	93.187	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.820	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.708	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.792	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.820	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.820	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	98.989	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	98.989	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	98.315	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.315	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.708	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	90.225	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.225	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.708	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.708	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000007943	tnpo1	87	97.423	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.423	Mola_mola
ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	94.468	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.978	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.978	Monopterus_albus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.708	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	94.052	Mus_caroli
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.708	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	94.052	Mus_musculus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	94.176	Mus_pahari
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.483	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.820	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000007943	tnpo1	96	93.481	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.481	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.820	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000007943	tnpo1	87	98.191	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.191	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.820	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000007943	tnpo1	90	88.548	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.525	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.146	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	93.146	Octodon_degus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.991	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.991	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	92	94.634	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	96	87.734	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.734	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	87	97.406	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.406	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	97.632	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.632	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	97.971	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.971	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	97.745	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.745	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.820	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.933	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.933	Ovis_aries
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.820	Pan_paniscus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.820	Panthera_pardus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.820	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000007943	tnpo1	94	82.735	ENSPTRG00000047731	-	100	82.735	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.820	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.820	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.820	Papio_anubis
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	91.461	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.461	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.157	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.157	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.613	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.388	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	96	93.918	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.918	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.831	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.831	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.760	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	97.760	Poecilia_formosa
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